Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 159,766 (bp)   Positions: 204
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.012
.454
.847
.105
.057
.023
.237
.007
--
.486
.263
.058
.055
.0
--
.454
--
.345
.75
.146
.083
.712
.687
.688
.16
.196
--
--
--
--
.046
.008
.044
.024
.534
.001
.001
.528
--
.025
.02
.013
.081
.238
.018
.021
.052
.007
.005
.004
.741
.453
.427
.146
.071
.115
.002
--
--
.001
.003
.003
--
--
--
--
--
.001
.001
--
.001
.006
.004
.234
.0
.991
.043
--
--
--
--
--
--
.096
.442
.997
.007
.013
.148
.069
.121
.13
.056
.006
--
--
--
--
--
.102
.317
.001
--
--
--
--
.056
--
--
.621
.01
.008
.117
.004
.0
.658
.021
.01
.004
.999
.974
.97
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.258
.979
.074
.021
.192
.352
.009
.175
.17
.295
.053
--
.019
.272
.07
.05
.091
.097
.136
.001
--
--
.31
.361
.096
.001
.014
.058
.048
.777
.144
.155
.055
.216
.277
.011
.001
.005
.018
.052
.043
.009
.012
1.0
--
.061
.024
.003
.112
.0
.202
.106
.13
.003
.0
.117
.019
.005
.0
.001
1.0
.663
.849
.008
.008
.325
.174
.99
.004
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
Stim1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
A
T
G
C
C
G
T
4
T
T
A
T
C
A
T
T
C
C
C
G
G
A
A
G
C
C
C
G
C
C
C
A
A
C
G
C
A
A
A
A
A
G
T
C
2
C
T
T
T
C
T
T
T
A
G
A
C
T
A
2
T
C
C
T
C
C
C
G
2
G
6
4
C
T
C
T
G
G
A
C
A
A
A
T
G
G
A
G
2
4
2
G
C
C
A
C
T
C
G
C
T
5
G
G
G
G
T
3
T
T
A
T
A
T
T
A
G
G
6
8
4
C
C
2
A
C
T
G
T
T
G
G
G
G
12
A
T
A
A
C
15
A
A
C
C
T
G
C
A
2
8
A
T
C
C
2
24
C
G
G
T
G
2
A
T
T
A
4
G
G
3
T
A
A
12
A
G
G
A
G
A
A
C
C
A
T
A
A
T
G
C
A
A
G
C
A
T
C
G
G
T
C
A
  173,562,394
  173,565,515
  173,568,120
  173,568,179
  173,569,939
  173,570,274
  173,570,627
  173,570,901
  173,573,407
  173,573,728
  173,575,031
  173,577,964
  173,577,966
  173,578,434
  173,578,941
  173,579,427
  173,579,830
  173,580,106
  173,580,160
  173,582,085
  173,582,644
  173,585,317
  173,585,329
  173,585,331
  173,586,020
  173,587,274
  173,589,627
  173,590,522
  173,590,586
  173,590,596
  173,591,593
  173,593,044
  173,594,336
  173,595,541
  173,595,644
  173,598,998
  173,599,106
  173,600,309
  173,602,485
  173,602,725
  173,603,466
  173,603,521
  173,603,562
  173,605,456
  173,606,680
  173,606,681
  173,606,697
  173,607,958
  173,607,960
  173,607,962
  173,608,413
  173,612,447
  173,612,850
  173,612,935
  173,613,191
  173,613,199
  173,613,692
  173,615,679
  173,615,690
  173,617,129
  173,618,189
  173,618,190
  173,619,054
  173,619,058
  173,619,062
  173,619,157
  173,619,161
  173,621,404
  173,621,758
  173,622,696
  173,625,648
  173,626,626
  173,626,628
  173,626,836
  173,627,617
  173,628,211
  173,629,237
  173,630,527
  173,630,532
  173,630,640
  173,630,923
  173,630,964
  173,631,839
  173,632,327
  173,633,623
  173,634,175
  173,634,268
  173,635,507
  173,637,968
  173,638,511
  173,639,146
  173,639,148
  173,640,020
  173,641,143
  173,641,977
  173,641,992
  173,643,093
  173,643,269
  173,644,034
  173,644,704
  173,644,829
  173,645,204
  173,647,145
  173,647,184
  173,647,185
  173,647,190
  173,647,373
  173,647,395
  173,647,842
  173,648,263
  173,649,276
  173,650,829
  173,651,785
  173,653,396
  173,653,425
  173,654,322
  173,655,596
  173,656,383
  173,656,876
  173,662,108
  173,662,226
  173,662,230
  173,663,022
  173,664,802
  173,664,803
  173,664,896
  173,670,215
  173,670,268
  173,670,363
  173,670,400
  173,670,401
  173,670,439
  173,670,600
  173,670,613
  173,670,788
  173,671,748
  173,673,658
  173,673,905
  173,676,339
  173,676,551
  173,676,984
  173,677,317
  173,677,357
  173,677,359
  173,677,368
  173,677,796
  173,677,910
  173,678,040
  173,679,306
  173,680,165
  173,680,556
  173,680,563
  173,680,586
  173,680,588
  173,681,260
  173,681,264
  173,681,289
  173,681,325
  173,681,348
  173,681,421
  173,681,676
  173,682,420
  173,683,137
  173,683,166
  173,683,424
  173,684,005
  173,684,009
  173,686,780
  173,687,412
  173,687,868
  173,688,810
  173,688,915
  173,689,295
  173,690,769
  173,692,914
  173,693,166
  173,693,732
  173,694,669
  173,695,499
  173,696,419
  173,696,659
  173,700,394
  173,700,403
  173,701,914
  173,702,717
  173,706,191
  173,706,224
  173,706,855
  173,707,609
  173,710,894
  173,711,720
  173,712,889
  173,713,582
  173,714,271
  173,714,739
  173,715,516
  173,715,658
  173,716,601
  173,718,349
  173,718,631
  173,718,807
  173,719,252
  173,719,494
  173,720,894
2
G
C
T
T
T
A
T/3
-
G
C
6/-
T/2
C/2
G
T/-
6
G
T
5
A
A
G
G
C
3
2
A
G/A
T
T
T
A/G
G
T
A
-
G
2
G
G
T
-
-
C/T
2/-
C/G
T/A
T/A
T/A
T
2
-
C
A/G
G/A
G
3
T/3
-
2/-
T/-
C/T
C/T
T/C
C/T
C/T
T
A
-
A
6/-
4/-
T
C
T
A
2
-
A/G
C/G
G
C
G
G
A
G/-
2
A
-
4/-
2/-
C
2
CT/3
AT/4
T
2
2
A
T
C
-
G/C
G/C
G/C
5
T/C
-
2
G
-
C
-
A
C
G
A
T
-
8/-
4/-
T
3
2/-
-
2
C
A
C
C
G/A
G/A
G/A
A
-
C
-
T
G
3
-
A/4
4
C/3
2
A
10
-
G
-
-
A/C
T/C
C/G
C/A
-
-
C/G
T
A
C
10
2/-
2
G
G
G
-
A
A
-
C
-
G
-
C
-
A
G
A
G
5
T
T
C
5
G
A/G
C
A
T
C
9
2
-
2
?
T
A
C
C
T
2