Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 386,450 (bp)   Positions: 611
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.011
.03
0
.033
.75
.463
.179
.235
.233
.007
.071
.024
.002
.053
.088
.068
.532
.075
.381
.233
.156
.617
.045
.026
.031
.096
.093
.023
.058
0
.654
.039
--
.002
.101
.003
.023
.313
.537
.36
.002
.003
.113
.015
.182
.009
.995
.004
.024
--
--
--
--
--
.03
.377
.071
.053
.463
.403
.997
.284
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.05
.001
.015
--
--
.487
.97
0
.001
.16
.735
.165
.421
.372
--
--
.148
.019
--
.003
.042
.056
.019
.008
.003
.01
.001
.008
.105
--
--
--
.118
.294
.016
.154
--
--
--
--
--
--
--
.156
.331
.096
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.274
.455
.474
.379
.048
.01
.065
.059
.047
.001
.102
.041
.077
.078
.071
.08
.016
.007
.64
.221
--
--
.006
.087
.031
.01
.026
.284
.018
.134
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.301
.862
--
.001
.874
1
1
.901
.04
.247
.012
.15
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.006
.072
.002
.181
.019
.001
.054
.004
.074
.013
.006
.003
.002
.006
.108
.019
.576
--
0
--
.092
.019
.076
.034
.006
.006
.005
.022
.029
.047
.174
.189
.02
.406
.221
.035
--
--
--
--
--
--
--
.034
.394
.038
.006
.094
.003
.031
.227
.208
.068
--
--
.012
.092
.008
.002
.135
.232
.787
.362
--
.111
.166
.028
.01
.011
.109
.009
.019
.335
.007
.013
.05
.022
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.744
--
.02
.002
.002
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.258
.041
.111
.564
.018
.002
.216
.036
.049
.02
.002
.905
.897
.001
.01
.015
.019
.028
.121
.053
.028
.012
.191
.019
.157
.09
.073
--
.032
.028
.16
.003
--
.012
.045
.03
.89
.511
.057
.034
.515
.036
.031
.619
.008
.04
--
--
--
--
--
--
.197
.019
.003
.013
.006
.033
0
.002
--
--
--
.037
.074
--
.022
--
--
.022
.004
.02
.719
.111
.174
.002
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.031
.279
.268
.11
.011
.027
.037
.12
.007
.015
.184
.069
.012
.015
.001
.075
.076
.062
.06
.03
.67
.327
.003
--
--
--
.214
.014
.006
.069
.003
.021
.132
.007
.227
.018
.095
.039
.029
.01
.004
.004
.013
.018
.108
.998
--
0
.05
.007
.051
.014
.005
.249
--
.109
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.098
.022
.039
--
--
.012
--
.011
.049
--
--
.035
--
0
--
.011
.008
.09
--
--
--
--
.205
.065
--
.014
--
--
--
--
--
.021
.051
.002
.104
.105
.717
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.144
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
--
--
--
--
.012
.007
.679
.03
0
--
--
--
--
.997
.409
.108
.086
.002
--
.104
--
0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.035
.001
.007
.03
.048
.032
.316
.005
0
.015
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
T
T
C
C
A
A
G
C
G
A
C
C
A
C
G
T
C
T
A
T
C
C
T
G
C
A
T
A
4
4
C
3
A
G
T
G
C
G
C
C
C
G
T
C
3
C
2
G
6
A
T
A
G
C
A
C
G
T
A
A
G
T
C
T
T
C
G
A
A
A
G
A
C
G
T
C
G
C
3
A
G
C
T
A
G
T
C
G
C
A
A
2
G
C
A
T
A
T
G
G
T
T
C
T
T
T
2
T
T
A
A
C
C
A
A
T
C
T
T
C
G
G
T
G
C
G
T
G
G
T
C
G
C
A
C
T
T
G
T
C
G
G
C
G
C
G
T
A
C
G
G
A
G
G
T
G
T
C
A
C
T
A
T
T
A
T
T
T
T
A
T
A
T
C
G
A
A
G
T
C
C
A
T
T
T
A
C
T
A
A
A
A
A
T
C
C
C
T
C
C
C
C
C
A
C
C
A
22
T
C
T
G
T
2
T
G
T
T
A
2
7
C
G
C
T
4
C
A
G
G
A
T
C
G
G
G
T
A
T
T
G
A
T
A
T
C
T
C
C
G
A
G
C
T
T
T
5
G
G
C
T
12
T
C
T
T
G
C
A
T
G
G
T
G
A
A
T
T
8
T
A
T
T
A
C
T
A
C
T
G
T
G
C
C
T
T
C
T
C
C
G
G
C
T
T
C
4
A
T
3
A
C
T
C
C
C
A
9
G
C
G
C
T
C
9
T
G
G
C
T
C
A
A
C
A
A
G
G
G
C
T
C
G
A
C
T
A
T
T
C
A
T
G
2
G
T
T
C
C
C
T
4
T
A
A
A
A
C
T
T
C
A
C
G
T
T
A
T
T
7
G
T
A
T
C
2
C
A
G
T
C
A
C
A
T
A
C
C
C
G
A
T
G
A
C
C
G
3
6
G
C
A
A
A
A
A
C
G
G
G
A
3
C
C
T
C
T
G
C
A
T
G
G
C
T
C
T
T
A
T
A
C
C
A
A
C
A
T
T
T
5
A
G
T
C
A
C
G
A
C
T
T
T
C
G
G
T
G
C
T
A
G
C
A
G
C
A
A
C
T
G
A
C
G
T
T
C
C
A
C
A
T
C
T
T
A
A
G
G
G
C
T
T
A
T
A
A
T
A
A
A
C
9
C
A
20
G
C
C
G
C
G
T
G
C
T
C
A
2
C
G
A
C
C
C
C
T
T
C
C
T
T
A
C
T
A
T
G
A
T
G
31
T
A
A
8
3
A
T
C
A
A
C
T
A
A
C
C
G
T
T
T
T
T
T
T
A
A
A
C
G
G
A
C
G
T
C
G
T
G
C
T
A
A
G
A
C
C
A
A
A
A
C
A
A
T
C
T
G
  108,375,357
  108,375,525
  108,375,558
  108,375,576
  108,375,861
  108,376,407
  108,376,614
  108,376,969
  108,377,137
  108,377,238
  108,377,255
  108,377,315
  108,377,584
  108,377,921
  108,377,949
  108,378,231
  108,378,921
  108,379,011
  108,379,214
  108,379,561
  108,380,310
  108,380,894
  108,382,296
  108,382,301
  108,383,724
  108,384,344
  108,384,347
  108,384,366
  108,384,382
  108,386,196
  108,387,043
  108,387,664
  108,387,758
  108,387,940
  108,388,309
  108,388,513
  108,388,995
  108,390,922
  108,391,413
  108,391,557
  108,391,649
  108,391,652
  108,391,743
  108,392,654
  108,393,984
  108,394,446
  108,394,580
  108,396,594
  108,396,701
  108,397,271
  108,397,477
  108,397,706
  108,398,358
  108,398,769
  108,399,095
  108,399,240
  108,399,490
  108,399,606
  108,399,726
  108,399,798
  108,401,092
  108,401,635
  108,401,737
  108,402,708
  108,402,842
  108,402,953
  108,402,986
  108,404,492
  108,404,723
  108,404,776
  108,404,899
  108,405,251
  108,405,425
  108,405,755
  108,405,829
  108,406,037
  108,406,097
  108,406,477
  108,408,027
  108,408,046
  108,408,887
  108,408,979
  108,409,729
  108,409,979
  108,410,177
  108,410,374
  108,410,404
  108,410,479
  108,411,077
  108,412,123
  108,412,371
  108,412,714
  108,413,285
  108,413,649
  108,414,534
  108,415,314
  108,415,784
  108,417,393
  108,417,530
  108,417,533
  108,417,557
  108,417,653
  108,418,376
  108,419,158
  108,419,792
  108,419,860
  108,419,914
  108,420,157
  108,420,323
  108,420,913
  108,420,997
  108,422,020
  108,422,413
  108,423,320
  108,423,816
  108,423,885
  108,424,150
  108,424,208
  108,424,331
  108,424,339
  108,424,425
  108,427,745
  108,427,746
  108,427,761
  108,428,084
  108,428,158
  108,428,165
  108,428,166
  108,428,293
  108,431,977
  108,431,992
  108,432,736
  108,433,061
  108,433,288
  108,433,552
  108,433,568
  108,433,582
  108,433,695
  108,433,740
  108,433,791
  108,433,964
  108,434,043
  108,434,130
  108,434,264
  108,434,275
  108,434,433
  108,434,438
  108,434,502
  108,434,605
  108,434,755
  108,435,615
  108,435,726
  108,435,986
  108,436,255
  108,436,287
  108,437,216
  108,437,842
  108,438,223
  108,438,312
  108,438,317
  108,438,651
  108,438,902
  108,439,008
  108,439,945
  108,439,948
  108,440,362
  108,440,376
  108,440,560
  108,441,826
  108,441,991
  108,442,959
  108,443,335
  108,443,569
  108,443,771
  108,451,185
  108,451,481
  108,451,656
  108,451,675
  108,452,128
  108,452,138
  108,452,509
  108,452,568
  108,454,057
  108,454,107
  108,454,290
  108,454,416
  108,454,684
  108,454,800
  108,455,450
  108,455,532
  108,455,933
  108,455,935
  108,456,056
  108,456,577
  108,457,180
  108,457,234
  108,457,284
  108,457,658
  108,458,222
  108,458,250
  108,458,801
  108,458,857
  108,459,093
  108,459,511
  108,459,550
  108,459,670
  108,459,895
  108,459,986
  108,460,800
  108,460,802
  108,461,286
  108,462,901
  108,463,057
  108,463,497
  108,466,114
  108,466,349
  108,466,540
  108,467,045
  108,467,394
  108,467,398
  108,467,409
  108,468,033
  108,468,036
  108,468,347
  108,470,386
  108,470,958
  108,471,470
  108,472,088
  108,472,363
  108,472,775
  108,473,613
  108,473,776
  108,473,800
  108,473,810
  108,473,811
  108,473,819
  108,473,829
  108,473,842
  108,473,859
  108,473,870
  108,473,875
  108,473,953
  108,474,021
  108,474,454
  108,474,557
  108,476,267
  108,476,709
  108,476,931
  108,476,943
  108,477,504
  108,478,157
  108,478,347
  108,478,471
  108,478,814
  108,478,954
  108,479,173
  108,479,930
  108,480,927
  108,480,985
  108,481,024
  108,481,036
  108,481,102
  108,481,195
  108,481,248
  108,481,481
  108,481,499
  108,481,717
  108,482,023
  108,482,470
  108,482,702
  108,482,784
  108,482,844
  108,483,118
  108,483,686
  108,483,715
  108,483,791
  108,484,064
  108,484,153
  108,484,856
  108,485,071
  108,485,114
  108,485,898
  108,486,353
  108,486,355
  108,486,602
  108,487,151
  108,487,280
  108,487,757
  108,488,192
  108,488,852
  108,489,029
  108,489,873
  108,490,714
  108,490,771
  108,490,772
  108,490,821
  108,490,872
  108,490,941
  108,491,047
  108,491,528
  108,492,689
  108,493,238
  108,493,677
  108,493,686
  108,493,863
  108,494,387
  108,495,142
  108,495,938
  108,496,372
  108,496,578
  108,496,696
  108,497,050
  108,497,076
  108,498,344
  108,498,443
  108,498,452
  108,498,517
  108,498,533
  108,498,551
  108,498,927
  108,499,142
  108,499,576
  108,499,950
  108,500,806
  108,500,969
  108,501,033
  108,501,079
  108,501,971
  108,501,993
  108,502,039
  108,502,221
  108,502,222
  108,502,354
  108,502,359
  108,502,724
  108,503,355
  108,503,751
  108,503,893
  108,504,052
  108,504,869
  108,507,055
  108,507,169
  108,507,702
  108,507,786
  108,508,771
  108,509,588
  108,512,314
  108,512,534
  108,512,780
  108,513,281
  108,514,717
  108,514,892
  108,514,988
  108,515,002
  108,515,179
  108,515,423
  108,515,536
  108,515,639
  108,515,772
  108,515,945
  108,516,271
  108,516,421
  108,516,763
  108,517,321
  108,517,462
  108,517,763
  108,518,748
  108,518,750
  108,518,753
  108,519,404
  108,519,785
  108,521,328
  108,521,659
  108,521,904
  108,523,849
  108,525,335
  108,525,430
  108,526,385
  108,526,406
  108,527,699
  108,527,708
  108,527,729
  108,527,974
  108,528,353
  108,528,521
  108,528,739
  108,529,268
  108,529,427
  108,530,627
  108,530,743
  108,531,134
  108,532,514
  108,533,820
  108,533,823
  108,533,946
  108,533,965
  108,534,869
  108,535,096
  108,535,515
  108,536,202
  108,536,316
  108,536,569
  108,536,970
  108,537,110
  108,537,930
  108,538,614
  108,538,993
  108,538,999
  108,539,512
  108,539,641
  108,539,647
  108,539,911
  108,540,131
  108,540,207
  108,540,362
  108,540,514
  108,540,544
  108,540,757
  108,540,765
  108,540,813
  108,541,055
  108,541,130
  108,542,010
  108,542,014
  108,542,021
  108,542,054
  108,542,276
  108,545,977
  108,549,400
  108,550,421
  108,550,604
  108,551,511
  108,551,739
  108,552,468
  108,553,757
  108,554,182
  108,554,718
  108,556,319
  108,556,465
  108,556,603
  108,557,168
  108,557,843
  108,558,011
  108,558,228
  108,558,657
  108,558,665
  108,558,673
  108,559,049
  108,559,135
  108,561,944
  108,562,178
  108,564,498
  108,567,329
  108,567,934
  108,570,714
  108,574,966
  108,575,503
  108,575,525
  108,575,593
  108,577,908
  108,578,395
  108,579,505
  108,581,670
  108,583,119
  108,584,131
  108,584,212
  108,584,504
  108,584,559
  108,584,828
  108,585,119
  108,587,200
  108,588,224
  108,588,705
  108,588,764
  108,589,003
  108,590,455
  108,590,497
  108,590,868
  108,592,179
  108,592,459
  108,593,003
  108,596,213
  108,597,486
  108,598,900
  108,598,963
  108,605,098
  108,605,446
  108,606,255
  108,607,574
  108,607,657
  108,610,246
  108,611,945
  108,614,005
  108,615,832
  108,616,225
  108,619,258
  108,622,592
  108,623,533
  108,624,807
  108,625,384
  108,640,490
  108,644,787
  108,645,128
  108,648,843
  108,649,819
  108,652,153
  108,654,095
  108,654,737
  108,659,022
  108,660,132
  108,661,863
  108,661,864
  108,661,865
  108,661,893
  108,662,361
  108,665,015
  108,666,450
  108,666,631
  108,670,878
  108,671,437
  108,675,106
  108,675,162
  108,675,173
  108,675,250
  108,675,254
  108,675,504
  108,675,505
  108,675,585
  108,675,764
  108,675,857
  108,675,859
  108,675,864
  108,675,883
  108,675,942
  108,675,953
  108,675,954
  108,676,034
  108,676,044
  108,676,054
  108,676,066
  108,676,069
  108,676,089
  108,679,675
  108,679,680
  108,686,911
  108,689,781
  108,691,238
  108,691,743
  108,692,004
  108,692,835
  108,701,626
  108,706,306
  108,708,036
  108,710,680
  108,711,751
  108,714,048
  108,714,091
  108,714,909
  108,716,536
  108,718,526
  108,722,497
  108,722,634
  108,724,554
  108,724,612
  108,727,266
  108,730,029
  108,730,501
  108,733,405
  108,736,180
  108,736,191
  108,736,192
  108,736,247
  108,736,277
  108,736,537
  108,736,582
  108,736,599
  108,736,639
  108,737,168
  108,737,861
  108,742,278
  108,742,402
  108,742,954
  108,743,346
  108,743,825
  108,745,109
  108,745,116
  108,745,124
  108,745,141
  108,745,251
  108,748,385
  108,748,488
  108,749,934
  108,750,092
  108,750,471
  108,750,483
  108,750,594
  108,750,597
  108,750,677
  108,750,678
  108,750,687
  108,750,724
  108,750,733
  108,750,734
  108,750,735
  108,751,023
  108,751,223
  108,751,490
  108,755,785
  108,755,879
  108,756,421
  108,756,695
T
T
C
2
A
T
G
2
-
T
A
G
T
T
T
A
2
C
-
2
C
2
G
T
C
2/G
A/C
2
C
G
-
-
G
-
G
C
C
A
T
A
-
-
T
A
C
-
-
-
-
A
-
T
C
G
A
T
T
T
2
5
G
G
T
2
T
A
C
A
A
G
T
G
A
G
T
2
C
G
A
A
-
5
2
A
-
-
A
G
T
T
T
5
-
-
A
T
T
C
-
C
2
A
C
C
T
G
C
A
-
C
C
T
G
T
2
-
G
G
A
C
A
T/C
A/G
A/G
C/T
C/G
T/C
A/G
A/T
A
C
A
T
T
5
C
T
A
C
T
A
-
T
A
A
-
T
C
C
G
T
A
T
G
A
C
A
T
C
A
G
T
C
G
-
A
2