Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,430 (bp)   Positions: 267
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.018
.001
.005
.0
.0
.004
.003
.006
.019
.37
.004
.141
.0
.008
.011
.06
--
--
--
.091
.085
.005
.0
.005
.038
.017
.0
.004
.011
.336
.089
.106
.006
.101
--
--
--
--
.0
.024
.002
.125
.672
.001
.014
.019
.107
.104
.0
.001
.007
.0
.025
.009
.005
.001
.033
.004
.0
.088
.002
.003
.31
.024
.968
.98
.001
.04
.338
.004
.001
.001
.017
.004
.0
.001
.001
.001
.001
.001
.046
.0
.05
.072
.041
.03
.016
.013
.005
.061
.011
.001
.001
.011
.015
--
--
--
--
--
--
--
.016
.005
.036
.123
.0
.178
.682
.723
.014
.007
.003
.005
.0
.013
.03
.105
.039
.001
.001
.001
.002
.021
.057
.056
.062
.537
--
--
--
.017
.46
.035
--
.065
.736
.807
--
.206
.023
.061
--
--
.002
.064
.012
.0
.046
.003
--
.015
.017
.159
.012
.668
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.416
--
.969
.018
.014
.01
.032
--
.009
.001
--
.001
.051
.002
.001
.0
.148
.029
.002
.002
.002
.346
.542
.07
.001
.046
--
--
--
--
.127
.069
.064
--
--
--
.022
.683
.0
.004
.077
.0
.068
.004
.01
--
.065
--
.095
.006
--
--
.06
.086
.286
.0
.002
.016
.001
.024
.165
.202
.01
--
.128
.787
.345
.353
.329
.283
.126
.143
.511
.018
.001
.118
.006
.06
.635
.049
.17
.181
.407
.402
.078
.031
.002
.004
.001
.0
.001
.259
.099
--
--
.153
.364
.92
.037
.052
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
C
T
A
C
T
G
T
C
T
T
G
G
T
C
C
T
6
5
G
T
A
T
T
T
C
C
C
C
T
T
T
A
G
T
G
G
C
G
T
A
T
C
3
2
A
C
A
G
A
G
C
38
A
T
C
118
T
T
T
C
C
A
T
C
A
T
C
T
5
C
A
T
A
C
G
G
C
C
T
T
C
C
A
3
T
C
C
G
G
C
A
T
C
T
T
T
A
T
C
G
T
A
G
2
G
A
A
G
C
5
G
C
G
T
G
C
T
A
T
T
G
T
T
T
G
T
T
39
A
A
A
C
C
A
C
G
C
C
4
C
A
3
G
A
C
G
G
C
T
G
A
T
T
G
A
T
2
A
7
C
A
G
A
G
G
C
A
C
T
A
G
A
G
T
C
C
C
C
A
C
2
T
T
C
G
T
T
G
C
A
G
G
52
T
T
A
A
A
G
T
G
C
A
A
G
C
A
T
A
2
C
T
3
G
G
A
T
T
A
A
C
A
G
G
G
C
C
G
G
T
A
2
A
A
T
G
G
A
G
T
C
T
C
4
G
T
T
C
G
2
C
C
T
C
T
G
C
T
4
T
A
A
G
A
A
C
G
  16,471,176
  16,471,483
  16,471,672
  16,472,299
  16,473,307
  16,473,660
  16,473,676
  16,474,409
  16,474,530
  16,474,741
  16,474,886
  16,475,362
  16,475,951
  16,476,016
  16,476,069
  16,476,075
  16,476,106
  16,476,107
  16,476,198
  16,476,598
  16,476,879
  16,477,295
  16,477,451
  16,477,465
  16,477,558
  16,477,710
  16,478,689
  16,479,123
  16,479,273
  16,479,469
  16,479,630
  16,479,782
  16,479,813
  16,481,185
  16,481,405
  16,481,435
  16,481,447
  16,481,448
  16,481,891
  16,481,914
  16,482,010
  16,482,219
  16,482,625
  16,482,734
  16,482,755
  16,483,155
  16,483,327
  16,483,328
  16,483,941
  16,484,199
  16,484,277
  16,484,869
  16,484,923
  16,485,073
  16,485,147
  16,485,149
  16,485,600
  16,485,735
  16,486,449
  16,486,690
  16,486,750
  16,486,751
  16,486,896
  16,487,042
  16,487,818
  16,487,860
  16,488,081
  16,489,024
  16,489,428
  16,489,740
  16,489,742
  16,489,743
  16,490,187
  16,490,269
  16,490,918
  16,492,014
  16,492,132
  16,492,306
  16,492,356
  16,492,442
  16,492,647
  16,493,602
  16,494,091
  16,494,095
  16,494,102
  16,494,104
  16,494,106
  16,494,108
  16,494,113
  16,494,131
  16,494,227
  16,494,730
  16,496,642
  16,496,666
  16,497,150
  16,497,518
  16,497,812
  16,497,942
  16,497,944
  16,497,946
  16,497,948
  16,497,988
  16,498,411
  16,498,648
  16,498,814
  16,499,355
  16,499,498
  16,499,552
  16,499,620
  16,499,873
  16,500,419
  16,500,425
  16,500,484
  16,500,495
  16,500,659
  16,500,690
  16,500,714
  16,500,794
  16,500,830
  16,501,179
  16,501,323
  16,501,385
  16,501,874
  16,502,785
  16,502,956
  16,503,011
  16,503,222
  16,503,345
  16,503,719
  16,503,923
  16,504,171
  16,504,578
  16,504,660
  16,504,750
  16,505,133
  16,505,611
  16,505,879
  16,505,976
  16,506,848
  16,507,410
  16,507,905
  16,508,029
  16,508,447
  16,508,477
  16,509,040
  16,509,202
  16,509,270
  16,510,018
  16,510,223
  16,511,207
  16,511,349
  16,512,852
  16,513,145
  16,513,453
  16,513,551
  16,513,703
  16,515,122
  16,515,142
  16,515,258
  16,515,721
  16,515,732
  16,515,934
  16,516,271
  16,517,609
  16,517,806
  16,517,988
  16,518,307
  16,519,350
  16,519,703
  16,519,839
  16,520,050
  16,520,288
  16,520,960
  16,521,409
  16,522,113
  16,522,234
  16,522,469
  16,522,590
  16,522,673
  16,522,678
  16,522,681
  16,524,363
  16,524,571
  16,524,686
  16,524,690
  16,525,031
  16,525,543
  16,525,806
  16,525,820
  16,526,093
  16,526,406
  16,526,842
  16,526,846
  16,526,988
  16,527,189
  16,528,074
  16,528,313
  16,528,315
  16,528,677
  16,528,680
  16,528,753
  16,529,288
  16,529,790
  16,530,680
  16,531,940
  16,532,266
  16,533,703
  16,534,249
  16,534,515
  16,535,245
  16,535,308
  16,535,476
  16,535,944
  16,536,293
  16,537,715
  16,538,233
  16,538,404
  16,539,453
  16,540,418
  16,540,843
  16,540,998
  16,545,329
  16,546,412
  16,547,344
  16,548,088
  16,549,865
  16,549,904
  16,550,596
  16,551,522
  16,552,130
  16,552,613
  16,552,961
  16,553,030
  16,553,183
  16,553,188
  16,553,271
  16,553,272
  16,554,908
  16,555,247
  16,555,735
  16,555,958
  16,559,172
  16,559,791
  16,560,361
  16,561,938
  16,562,085
  16,562,086
  16,562,599
  16,562,607
  16,562,866
  16,562,893
  16,564,092
  16,565,064
  16,565,829
  16,565,926
  16,566,213
  16,566,353
  16,569,194
  16,571,040
  16,571,169
  16,571,499
  16,571,508
  16,575,805
  16,576,242
  16,576,258
  16,576,659
  16,576,811
T
C
G
T
C
A
C
A
A
C
A
A
7
T
T
3
6/-
5/-
A
C
G
C
C
C
G
T
T
T
C
C
C
T
7
A
13
T
T
2
A
G
G
T
-
2/-
C
A
2
8
G
A
A
-
T
C
-
-
G
C
3
2
T
G
C
T
-
3
T
C
-
T
T
A
9
T
A
2
T
T
C
C
T
A
3
-
A
T
A
-
T
-
13
C
25
29
C
A
C
C
3
5
5
-
T
-
A
G
G
A
T
-
A
T
A
A
A
T
G
-
C
-
A
G
C
C
A
A
C
-
G
A/G
-
T
A
T
A
A
11
C/3
-
-
G
-
3
-
T
G/2
T
T
G
A
G
C
C
A
G
C
-
T
-
T
G
2
G
A
A
2
G
T
C
T
A
C
11
G
2
4
2
4
2
2
-
C
10
G
C
C
C
8
4
G
A
G/A
52/-
T/2
C
-
35
T
A
C
A
2
T
G
C
5
G
C
-
-
T
C
-
A
C
G
2
C
G
T
C/2
A/-
A
A
T
T
2
G/2
G/2
13
2
-
3
G
G
4
A
25
A
-
21
A
T
-
A
-
A
T
A
-
2
A
G
A
C
7
G
C
-
-
T
G
2
A/-
C
A
G/T