Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,430 (bp)   Positions: 380
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.018
.001
.051
.005
.0
.0
.004
.003
.006
.019
.37
.004
.141
.0
.008
.008
--
.091
.085
.005
.0
.005
.038
.017
.0
.004
.011
.336
.089
.106
.041
.101
--
--
--
.0
.024
.002
.672
.019
.107
.104
.001
.0
.001
.071
.009
.005
.43
.004
.0
.088
.31
.002
.968
.98
.04
.291
.38
.017
.004
.001
.001
.001
.001
.001
.046
.05
.013
.004
.061
.001
.001
.169
.006
.001
.007
.408
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.019
.005
.036
.965
.123
.0
.682
.723
.014
.007
.005
.0
.013
.03
.105
.039
.003
.001
.001
.002
.021
.057
.056
.062
.537
.568
.593
--
--
--
--
--
--
.017
.035
--
.922
.95
.965
.992
.979
.805
.807
.822
.148
.206
.023
.072
.0
.0
--
.064
.012
.046
--
.004
.015
.017
.012
.668
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
--
.018
.014
--
.009
.051
.002
.001
.0
.029
.002
.002
.002
.346
.542
.064
.001
.046
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.268
.127
.064
.534
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
--
--
--
--
.068
.427
.005
.003
.0
.068
.001
.004
.274
.065
.006
.398
.4
--
.095
.006
--
.06
.086
.082
.0
.001
.0
.0
.196
.698
.001
.047
.001
.024
.006
.736
.033
.257
.165
.032
.01
.774
.073
--
--
.128
.787
.457
.367
.614
.126
.143
.025
--
--
--
--
.384
.024
.087
.027
.001
.004
.007
.027
.004
.01
.045
.001
.004
.003
.333
.284
.118
.029
.013
.006
.007
.646
.028
.004
.003
.019
.019
.006
.061
.11
.596
.06
.039
.124
.013
.042
.005
.004
.022
.17
.225
.347
.407
.539
.488
.078
.066
.028
.031
.038
.0
.002
.001
.088
.004
.16
.043
.003
.002
.0
.001
.156
.001
.001
.259
.024
.066
.037
.408
.166
.037
--
.219
.018
.002
.438
--
--
.135
.094
.093
.008
--
--
.084
.003
.153
.184
.365
.006
--
--
.3
.35
.617
.847
.001
.003
.036
.005
.202
.0
.004
.002
.0
--
--
--
.001
.0
.001
.0
.0
.03
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
Specc1l
C
T
G
A
C
T
G
T
C
T
T
G
G
T
C
C
6
T
A
T
T
T
C
C
C
C
T
T
T
A
C
T
G
C
G
T
A
T
3
C
A
G
C
A
G
T
T
C
C
T
T
C
T
C
A
T
T
2
2
A
C
C
G
C
T
T
C
A
G
G
C
T
10
G
5
C
4
T
T
A
T
A
T
C
G
T
A
G
C
2
G
C
A
A
C
5
G
C
T
G
C
T
A
T
3
G
T
T
T
G
T
T
39
C
A
A
A
A
T
A
A
C
A
C
G
G
T
G
G
A
C
G
C
C
A
3
G
G
G
G
G
T
A
A
T
T
A
T
C
T
7
C
C
A
G
A
G
G
A
T
A
G
T
C
A
C
2
T
C
G
T
T
G
T
A
G
T
T
G
T
G
G
G
G
G
G
G
G
6
T
A
T
T
A
A
C
T
T
9
A
G
A
A
A
A
G
T
A
4
G
G
2
T
C
T
C
A
T
G
A
T
T
T
T
G
C
G
G
A
T
A
A
C
C
G
C
15
5
G
G
G
G
C
T
T
A
C
C
G
A
A
G
G
T
A
G
A
G
G
G
C
T
A
G
5
C
G
A
A
A
T
G
C
C
G
9
T
T
T
T
T
T
T
2
A
A
G
A
G
A
G
C
T
G
A
T
C
G
A
T
T
G
T
T
2
T
T
C
T
T
2
C
2
C
C
G
C
A
T
T
T
A
7
A
T
T
C
C
16
C
A
C
G
T
G
T
C
2
C
G
4
A
A
A
C
G
G
C
4
T
G
A
A
A
C
A
A
G
G
10
T
C
A
C
G
A
C
A
C
T
G
C
C
T
3
A
A
G
T
G
  16,471,176
  16,471,483
  16,471,656
  16,471,672
  16,472,299
  16,473,307
  16,473,660
  16,473,676
  16,474,409
  16,474,530
  16,474,741
  16,474,886
  16,475,362
  16,475,951
  16,476,016
  16,476,068
  16,476,106
  16,476,598
  16,476,879
  16,477,295
  16,477,451
  16,477,465
  16,477,558
  16,477,710
  16,478,689
  16,479,123
  16,479,273
  16,479,469
  16,479,630
  16,479,782
  16,480,084
  16,481,185
  16,481,435
  16,481,447
  16,481,448
  16,481,891
  16,481,914
  16,482,010
  16,482,625
  16,483,155
  16,483,327
  16,483,328
  16,483,891
  16,483,941
  16,484,199
  16,484,902
  16,485,073
  16,485,147
  16,485,266
  16,485,735
  16,486,449
  16,486,690
  16,486,896
  16,487,263
  16,487,818
  16,487,860
  16,489,024
  16,489,422
  16,489,437
  16,490,187
  16,490,269
  16,490,340
  16,492,014
  16,492,132
  16,492,356
  16,492,442
  16,492,647
  16,494,091
  16,494,108
  16,494,112
  16,494,131
  16,494,730
  16,495,143
  16,496,622
  16,496,634
  16,496,642
  16,496,663
  16,496,877
  16,497,150
  16,497,409
  16,497,518
  16,497,812
  16,497,942
  16,497,944
  16,497,946
  16,497,948
  16,497,988
  16,498,411
  16,498,434
  16,498,648
  16,498,814
  16,498,864
  16,499,355
  16,499,498
  16,499,620
  16,499,873
  16,500,419
  16,500,425
  16,500,495
  16,500,659
  16,500,690
  16,500,714
  16,500,794
  16,500,830
  16,501,177
  16,501,323
  16,501,385
  16,501,874
  16,502,785
  16,502,956
  16,503,011
  16,503,222
  16,503,345
  16,503,351
  16,503,355
  16,503,719
  16,503,919
  16,503,923
  16,503,954
  16,504,065
  16,504,171
  16,504,578
  16,504,750
  16,505,133
  16,505,915
  16,505,920
  16,505,925
  16,505,932
  16,505,952
  16,505,973
  16,505,976
  16,505,977
  16,506,641
  16,507,410
  16,507,905
  16,508,027
  16,508,075
  16,508,078
  16,508,447
  16,509,202
  16,509,270
  16,510,223
  16,511,349
  16,512,637
  16,512,852
  16,513,145
  16,513,551
  16,513,703
  16,514,604
  16,515,237
  16,515,258
  16,515,273
  16,515,721
  16,515,732
  16,515,934
  16,516,271
  16,517,609
  16,517,806
  16,518,307
  16,519,703
  16,519,839
  16,520,960
  16,521,409
  16,522,590
  16,522,673
  16,522,678
  16,522,681
  16,524,571
  16,524,686
  16,524,690
  16,525,031
  16,525,543
  16,525,806
  16,525,821
  16,526,093
  16,526,406
  16,526,841
  16,526,845
  16,526,846
  16,526,849
  16,526,850
  16,526,858
  16,526,862
  16,526,866
  16,526,870
  16,526,874
  16,526,878
  16,526,882
  16,526,889
  16,526,988
  16,527,571
  16,527,738
  16,528,030
  16,528,074
  16,528,315
  16,528,410
  16,528,672
  16,528,680
  16,528,766
  16,528,771
  16,528,779
  16,528,787
  16,528,790
  16,528,811
  16,528,814
  16,528,826
  16,529,370
  16,530,680
  16,531,994
  16,532,002
  16,532,003
  16,532,015
  16,532,161
  16,532,354
  16,532,781
  16,533,298
  16,533,703
  16,534,249
  16,534,384
  16,534,515
  16,535,444
  16,535,476
  16,535,494
  16,535,713
  16,535,722
  16,535,982
  16,536,293
  16,537,715
  16,538,233
  16,539,453
  16,540,418
  16,540,429
  16,540,998
  16,541,326
  16,541,574
  16,541,828
  16,543,251
  16,543,260
  16,545,328
  16,546,127
  16,547,344
  16,548,088
  16,548,292
  16,548,754
  16,548,988
  16,549,737
  16,549,865
  16,550,566
  16,550,596
  16,550,609
  16,551,206
  16,551,469
  16,551,541
  16,552,130
  16,552,613
  16,552,966
  16,553,018
  16,553,104
  16,553,271
  16,553,272
  16,553,337
  16,553,615
  16,553,646
  16,553,698
  16,553,706
  16,553,882
  16,554,026
  16,554,062
  16,554,170
  16,554,361
  16,555,360
  16,555,402
  16,555,508
  16,555,513
  16,555,576
  16,555,727
  16,555,735
  16,555,742
  16,555,890
  16,556,326
  16,556,353
  16,556,409
  16,556,436
  16,556,512
  16,556,775
  16,557,116
  16,557,488
  16,557,984
  16,558,358
  16,558,379
  16,558,383
  16,559,099
  16,559,172
  16,559,233
  16,559,284
  16,559,417
  16,559,791
  16,559,799
  16,560,420
  16,560,665
  16,560,683
  16,561,356
  16,561,378
  16,562,061
  16,562,085
  16,562,090
  16,562,101
  16,562,599
  16,562,823
  16,562,827
  16,562,866
  16,562,867
  16,562,892
  16,562,893
  16,562,971
  16,564,055
  16,564,092
  16,564,319
  16,564,877
  16,565,064
  16,565,248
  16,565,661
  16,565,825
  16,565,843
  16,565,926
  16,565,970
  16,566,074
  16,566,202
  16,566,210
  16,566,353
  16,567,060
  16,567,136
  16,567,195
  16,567,384
  16,568,209
  16,568,611
  16,568,942
  16,569,122
  16,569,166
  16,569,242
  16,569,430
  16,569,840
  16,569,841
  16,570,576
  16,570,895
  16,570,896
  16,570,919
  16,571,039
  16,571,040
  16,571,414
  16,571,443
  16,571,499
  16,572,457
  16,572,592
  16,573,342
  16,573,700
  16,573,701
  16,573,753
  16,573,754
  16,573,763
  16,573,841
  16,574,438
  16,574,439
  16,574,882
  16,575,025
  16,575,152
  16,575,304
  16,575,358
  16,575,401
  16,575,444
  16,575,543
  16,575,562
  16,575,606
  16,576,158
  16,576,371
  16,576,388
  16,576,404
  16,576,811
  16,576,886
  16,576,893
T
C
2
G
T
C
A
C
A
A
C
A
A
7
T
-
6/-
C
G
C
C
C
G
T
T
T
C
C
C
T
T
A
T
T
2
A
G
G
-
A
2
8
A
G
A
-
C
T
T
C
3
2
C
T
-
3
C
2/-
2/-
5
T
T
2
T
C
C
T
-
G/-
G/T
-
C
-
G/-
-
C/T
4/-
C
C
-
A
C
C
3
5
5
-
T
T
-
A
T
G
G
T
-
A
T
A
A
T
G
-
C
-
A
G
C
C
A
A
C
-
-
-
G
A/G
G
T/C
G
-
T
T
A
?
G/C
T/-
G/A
G/-
A/G
C/T
G/A
G
-
G
-
C
C
3
2
T
G
G
T
C
C
G
C
T
G
-
C/A
T
G
2
G
A
A
G
C
T
11
G
4
2
2
-
10
G
C
C
C
8
-
G
A
C
T/C
G/A
T/C
G/A
G/A
G/A
G/A
G/A
A
A
A
-
2
G
C
G
A/-
T
T
5
C
-
-
G/A
A/G
A/G
A/G
A/G
G/A
C
G
-
G/C
G/C
-
G
A
G
T
G
C
A
-
C
C
G
T/A
5
C/T
A
C
G
C
G
G
C/2
T
A
C/4
-
-
3
T
A
T
G
G
A
C
T
C/T
G/2
A/2
C
A
2
5/3
2
C
A/G
C
2
A
T
C
G
G/-
5/-
A
A
G
G
T
2
A
T
T
A
-
-
9
C
C
C
C
C
-
3
G
-
G
A
G
A
T
A
C
G
C
T
A
C
C
-
A
-
5
-
A
T/A
T
A
C
-
C/2
-
C/2
2
A
A
-
C
G
C
G
-
T/5
C
C
T
T
-
G
C
T
T
C
A
A
A
-
3
A
-
G
G
G
T
A
A
C/2
4/-
C
T
T
G
5
A
C
5
G/T
G/T
-
G
G
G
3
A
G
2
4
G
2
A
T
T
C
-
G
G
T
3/4
5