Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 92,088 (bp)   Positions: 309
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.385
.969
.972
.997
.997
.841
.826
.812
.522
.599
.868
.844
.379
.204
.852
.127
.255
.625
.98
.974
.623
.392
.003
.021
.033
.062
.668
.241
.977
.545
--
--
.779
.86
.975
.917
.921
.631
.375
.115
.995
.998
.109
.969
.001
.012
.014
.0
.008
.027
--
--
.013
.025
.028
.08
.0
.0
.016
.01
.003
--
.002
.005
.02
.003
.029
.002
.437
--
--
--
--
.841
.098
--
--
.002
.015
.01
.01
.033
.001
--
.0
.004
.108
.063
.006
.012
--
--
.259
.0
.194
.766
.848
.009
.059
.002
.087
.508
.15
.038
.003
.146
.172
.812
.423
.072
.009
.003
.082
.028
--
--
.01
.002
.013
.009
.065
.252
.001
--
--
--
--
--
--
.013
.011
.001
.01
.013
.069
.32
.008
.009
.006
.011
.007
.034
.423
.016
.075
.105
.186
.018
--
--
.024
.005
.004
.009
.013
.13
.115
.009
.159
.191
.397
.811
.271
.284
.019
.251
.283
.028
.058
.0
.005
.109
.0
.165
.001
.016
.006
.007
.281
.075
--
--
.009
.021
--
--
.017
.008
--
--
--
--
.034
--
--
.009
.059
.023
.033
.045
--
.007
.205
.013
.014
.131
.002
.008
.002
.029
.021
.003
.0
.007
.001
.001
.208
.006
.009
.0
.019
.0
.004
.667
.171
.17
.114
.05
--
--
--
--
--
.125
.027
.032
.084
.139
.416
.427
.002
.062
.001
.972
.018
.379
.726
--
.292
.001
.03
.006
--
.539
--
--
.224
.06
.561
.09
.002
.002
.06
.069
.007
.009
.0
.001
.004
.865
.801
.006
.012
.336
.032
.797
.0
.009
.008
.984
.001
.011
.003
.016
.005
.051
.0
.0
.002
.002
.026
.018
.008
.004
.003
.008
.004
.006
.0
.152
.0
.059
.009
.0
.0
.002
.915
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
Smurf1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
G
G
G
A
T
G
G
T
G
G
T
G
A
A
G
T
G
G
A
A
G
G
A
A
C
G
G
A
C
A
A
C
G
C
A
T
G
A
T
G
C
A
G
T
C
A
A
C
G
2
C
C
A
G
A
A
G
T
T
A
T
C
A
T
G
C
G
T
G
A
C
G
C
G
G
2
4
A
A
A
C
A
A
A
A
A
T
24
G
G
T
C
C
C
T
T
T
A
A
C
G
T
G
C
C
C
T
C
C
A
C
C
T
G
C
T
G
A
C
A
C
A
T
C
T
G
A
T
C
A
A
A
11
T
A
A
C
C
T
G
C
G
T
G
A
A
2
A
T
26
A
C
A
A
12
C
G
T
A
T
A
A
G
C
T
A
T
C
16
A
C
G
T
T
T
G
C
C
T
T
A
A
C
T
T
T
T
C
A
C
G
4
T
A
G
G
G
G
A
T
A
G
A
A
T
A
T
G
G
T
G
A
A
C
A
C
T
G
T
G
G
A
T
C
C
T
A
A
C
A
T
C
2
G
A
A
T
A
G
3
T
T
T
A
A
A
6
G
A
G
A
3
A
A
T
A
T
G
C
C
2
G
2
T
A
G
G
T
A
G
A
10
C
G
G
A
G
G
G
T
T
T
C
C
G
3
T
A
G
T
T
G
A
G
G
T
A
C
T
T
T
2
A
A
T
T
T
  13,499,303
  13,499,309
  13,499,333
  13,526,239
  13,526,242
  13,526,255
  13,526,256
  13,526,280
  13,526,283
  13,526,298
  13,526,362
  13,526,377
  13,526,406
  13,526,419
  13,526,541
  13,526,664
  13,526,828
  13,526,853
  13,526,901
  13,526,911
  13,527,113
  13,527,180
  13,527,224
  13,527,236
  13,527,344
  13,527,360
  13,527,361
  13,527,385
  13,527,467
  13,527,483
  13,527,742
  13,527,769
  13,527,810
  13,527,830
  13,527,854
  13,527,864
  13,527,880
  13,527,909
  13,527,910
  13,527,963
  13,527,975
  13,527,998
  13,528,073
  13,528,074
  13,528,096
  13,528,238
  13,528,818
  13,529,779
  13,529,852
  13,531,083
  13,532,360
  13,532,689
  13,532,830
  13,532,864
  13,532,873
  13,532,877
  13,532,981
  13,533,128
  13,533,929
  13,533,935
  13,533,962
  13,534,024
  13,534,372
  13,534,454
  13,534,941
  13,535,517
  13,535,667
  13,535,672
  13,535,777
  13,535,862
  13,536,633
  13,536,972
  13,536,973
  13,536,976
  13,537,115
  13,537,235
  13,537,434
  13,537,518
  13,537,572
  13,537,629
  13,537,644
  13,537,771
  13,538,529
  13,538,788
  13,539,124
  13,539,246
  13,540,177
  13,540,883
  13,540,997
  13,541,061
  13,541,715
  13,541,808
  13,541,930
  13,541,953
  13,542,252
  13,542,664
  13,542,736
  13,542,741
  13,542,756
  13,543,031
  13,543,616
  13,543,750
  13,543,800
  13,543,969
  13,544,071
  13,544,182
  13,544,295
  13,544,481
  13,544,820
  13,544,901
  13,545,017
  13,545,246
  13,545,352
  13,545,376
  13,545,492
  13,545,599
  13,545,918
  13,545,949
  13,546,194
  13,546,203
  13,546,250
  13,546,439
  13,546,971
  13,547,345
  13,547,405
  13,547,456
  13,547,483
  13,547,485
  13,547,493
  13,547,494
  13,547,499
  13,547,635
  13,547,636
  13,547,761
  13,547,783
  13,547,796
  13,547,897
  13,547,956
  13,548,058
  13,548,155
  13,548,246
  13,548,247
  13,548,270
  13,548,292
  13,548,328
  13,548,391
  13,548,460
  13,548,609
  13,548,731
  13,548,840
  13,549,375
  13,549,377
  13,549,455
  13,550,346
  13,550,539
  13,550,654
  13,550,655
  13,550,755
  13,550,799
  13,551,309
  13,551,676
  13,551,782
  13,552,325
  13,552,839
  13,552,890
  13,553,036
  13,553,651
  13,553,845
  13,554,165
  13,554,168
  13,554,392
  13,554,792
  13,554,845
  13,555,162
  13,555,970
  13,556,173
  13,556,731
  13,557,140
  13,557,154
  13,557,196
  13,557,386
  13,557,444
  13,557,467
  13,557,617
  13,558,237
  13,558,252
  13,558,735
  13,558,765
  13,559,019
  13,559,089
  13,559,104
  13,559,253
  13,559,354
  13,559,359
  13,559,805
  13,560,000
  13,560,060
  13,560,981
  13,561,015
  13,561,867
  13,562,107
  13,562,110
  13,562,388
  13,562,752
  13,562,813
  13,562,932
  13,563,680
  13,563,714
  13,563,743
  13,563,778
  13,563,786
  13,563,955
  13,564,439
  13,564,642
  13,564,694
  13,564,740
  13,564,748
  13,564,777
  13,565,232
  13,565,622
  13,565,952
  13,566,176
  13,566,292
  13,566,524
  13,566,613
  13,566,688
  13,566,778
  13,566,781
  13,566,791
  13,566,804
  13,567,109
  13,567,110
  13,567,158
  13,567,164
  13,567,181
  13,567,242
  13,567,367
  13,567,549
  13,567,555
  13,567,598
  13,567,761
  13,567,771
  13,568,262
  13,568,601
  13,569,703
  13,569,927
  13,570,268
  13,570,283
  13,570,288
  13,571,307
  13,571,446
  13,571,515
  13,571,906
  13,571,912
  13,572,008
  13,572,294
  13,572,487
  13,572,932
  13,573,029
  13,573,145
  13,573,423
  13,574,549
  13,575,160
  13,575,161
  13,575,171
  13,575,172
  13,575,234
  13,575,642
  13,577,191
  13,577,254
  13,577,973
  13,578,131
  13,578,140
  13,580,815
  13,580,835
  13,581,248
  13,582,419
  13,582,493
  13,582,872
  13,583,819
  13,583,880
  13,583,997
  13,584,290
  13,584,567
  13,584,722
  13,584,800
  13,585,450
  13,585,614
  13,585,793
  13,586,810
  13,586,994
  13,587,006
  13,587,174
  13,587,462
  13,587,523
  13,587,524
  13,587,525
  13,587,600
  13,587,894
  13,587,910
  13,588,042
  13,588,486
  13,588,658
  13,589,048
  13,589,688
  13,589,913
  13,590,023
  13,590,198
  13,590,755
C
-
-
G/A
G/T
A/G
T/C
G/A
G/T
C
G/A
G/A
T/G
G/A
A/G
A/G
G/A
T/C
G/A
G/A
A/G
A/G
G/T
G/A
A/G
A/G
C/T
G/A
G/A
A/G
C/T
A/G
A/G
C/T
G/T
C/T
G
C
G/A
A/G
T/C
A
C/T
A/G
G/A
C
G
G
G
T
A
2/-
7
6
A/T
G/T
C
G
A
C
C
-
C
C/T
G
C
A
T
A
C
A
A/G
C/T
G/A
C/T
2
A
-
-
G
G
T
T
G
G
3
C
C
C
-
A
A
T/-
CT/T
T
T
2
G
C
C
G
T
A
T/7
A
T
T
T
C
3
T
G
T
A
C
-
T
G
A
-
T
G
T
G
C
-
C
A
G
C
T
G
T
G
11/-
T/3
C
G
T
T
C
A
T
2
C
A
G
T
-
-
-
-
G
T
C
A/T
-
T
A
C
G
G
C
T
A
5
C
G
14
C/G
-
G
T
A
C
C
G
G/A
C/T
C/5
T/2
T/C
G
-
T
G
5
13
G
T
G
T
G/T
-
C
G
A
C
A
A
G
C
G
A
C
G
2
-
2
A
C
C
A
-
G
4
C
G
A
A
A
A
-
G
C
CT/3
T
C
C
G
T
T
C
T
-
A
G
G
G
G
2
3/-
2
C
C
5
A/3
A/C
6/-
A
-
A
T
-
7
G
G
C
3
-
T
T
2/-
G/-
2/-
T/-
T
A
A
C
A/G
G/-
A/G
-
C/T
A
A
T
A
3
A
C
C
G
T
T
A
-
C
G
C
G
C
A
5
2
4
16
G
T
G
G
C
-
G
G
C
C
C