Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 110,684 (bp)   Positions: 305
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.026
.369
.809
.991
.996
.006
.002
.003
.003
.009
.0
.003
.0
.003
.001
.054
.485
.003
.006
.031
.037
.038
.027
.019
.135
.001
.002
.046
.408
.026
.025
.012
.024
.009
.001
.002
.0
.001
.181
.0
.028
.011
.015
.002
.076
.078
.0
.004
.0
.0
.001
.002
.079
.007
.001
.0
.007
.676
.003
.008
.0
.002
.041
.0
.0
.001
.002
.026
.0
.006
.0
.0
1.0
.0
.001
.0
.044
.0
.0
.029
.165
.33
.029
.403
.627
.05
.002
.013
.001
.014
.001
.012
.0
.012
.003
.003
.009
.001
.0
.015
.004
.319
.063
.01
.012
.019
.002
.001
.424
.108
.015
.066
.065
.003
.04
--
--
--
--
--
.002
.0
.017
.005
.001
.014
.006
.013
.294
.432
.05
.209
.976
.992
.001
.026
.001
.106
.043
.006
.007
.003
.171
.026
.096
.103
.203
.212
.211
.187
.087
.065
.031
.033
.017
.002
.035
.001
.017
.001
.76
.003
.654
.94
--
--
.002
.002
.007
.001
.013
.003
.007
.002
.0
.0
.033
.023
.823
.027
.003
.018
.283
.389
.07
--
--
--
--
--
.0
.001
.005
--
--
.004
.01
.0
.047
.008
.003
.006
.05
.645
.021
.001
.001
.031
.036
.022
.009
.012
.002
.078
.2
.222
.001
.032
.706
.055
.002
1.0
.012
.025
.031
.044
.906
.191
.006
.028
.073
.002
.0
.0
.025
.079
.019
--
--
--
.001
.01
.007
.001
.001
.01
.001
.006
.088
.003
.009
--
--
--
.003
--
--
--
--
--
--
.0
.069
.0
.001
.001
.052
.0
.0
.001
.127
.138
.177
--
--
--
--
--
--
.055
.037
--
--
.003
.018
.011
.011
.019
.035
.002
.022
--
.002
.001
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
Sipa1l1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
A
C
G
2
G
T
T
G
A
T
A
T
9
C
G
T
21
C
A
T
G
T
A
G
T
G
A
C
C
A
C
T
C
A
A
A
T
G
A
G
C
A
A
G
C
A
G
G
G
G
T
G
C
G
T
G
C
G
G
A
A
T
C
A
A
G
C
6
G
T
G
A
G
C
C
G
G
T
T
G
T
T
G
C
G
A
G
A
G
C
T
A
C
T
C
G
A
2
C
G
C
C
C
A
4
T
5
G
C
A
G
G
C
G
4
2
A
C
A
G
T
C
10
G
C
C
C
T
C
G
A
G
C
A
G
T
A
T
G
6
G
T
T
A
8
T
G
G
G
T
G
A
T
G
T
T
T
C
C
G
G
T
G
A
T
T
C
A
6
C
A
C
A
G
C
T
T
T
C
A
G
C
6
G
2
4
G
G
T
T
2
G
G
A
A
A
A
T
C
T
G
G
T
A
C
T
T
G
T
T
G
C
A
A
C
G
A
G
G
G
T
G
G
A
A
G
C
A
A
G
T
2
A
G
A
T
C
C
G
C
C
T
9
C
G
G
G
C
T
T
T
T
T
2
6
C
C
C
C
G
C
C
C
G
A
T
C
C
T
C
A
C
C
T
T
2
G
T
2
T
A
C
G
G
G
G
C
C
G
A
A
T
T
2
A
6
6
C
2
4
C
T
8
  114,194,058
  114,194,533
  114,195,054
  114,196,392
  114,196,438
  114,197,027
  114,197,140
  114,198,177
  114,198,369
  114,198,450
  114,198,590
  114,198,662
  114,198,821
  114,198,839
  114,198,927
  114,198,968
  114,199,003
  114,199,263
  114,199,701
  114,200,010
  114,200,013
  114,200,234
  114,200,883
  114,201,004
  114,201,753
  114,201,776
  114,202,457
  114,202,807
  114,203,159
  114,203,192
  114,203,497
  114,203,691
  114,203,764
  114,203,822
  114,204,387
  114,204,661
  114,204,727
  114,204,783
  114,205,122
  114,205,917
  114,205,933
  114,205,982
  114,206,064
  114,206,840
  114,206,984
  114,206,987
  114,207,307
  114,207,413
  114,207,492
  114,207,576
  114,207,750
  114,207,755
  114,207,881
  114,208,236
  114,209,620
  114,209,754
  114,209,832
  114,210,301
  114,210,410
  114,210,856
  114,211,511
  114,211,672
  114,211,679
  114,211,810
  114,212,058
  114,212,333
  114,212,438
  114,212,952
  114,212,992
  114,213,257
  114,214,110
  114,214,139
  114,214,366
  114,214,494
  114,214,874
  114,215,105
  114,215,281
  114,215,428
  114,215,641
  114,215,838
  114,215,920
  114,216,268
  114,216,497
  114,216,510
  114,216,725
  114,216,915
  114,217,220
  114,217,227
  114,217,471
  114,217,836
  114,218,271
  114,218,289
  114,218,645
  114,219,458
  114,219,723
  114,219,772
  114,219,799
  114,219,804
  114,220,211
  114,220,613
  114,220,752
  114,220,998
  114,221,333
  114,221,784
  114,222,620
  114,222,807
  114,223,008
  114,223,218
  114,223,364
  114,223,390
  114,223,544
  114,223,578
  114,223,639
  114,223,836
  114,223,919
  114,224,784
  114,224,794
  114,224,799
  114,224,954
  114,225,579
  114,226,695
  114,226,713
  114,226,757
  114,226,794
  114,226,853
  114,226,864
  114,226,984
  114,227,025
  114,227,051
  114,227,097
  114,227,158
  114,227,333
  114,228,006
  114,228,137
  114,228,369
  114,228,871
  114,229,220
  114,229,336
  114,229,735
  114,229,837
  114,229,905
  114,230,236
  114,230,407
  114,231,163
  114,231,196
  114,231,441
  114,231,487
  114,231,494
  114,231,497
  114,231,501
  114,232,014
  114,232,525
  114,232,565
  114,233,213
  114,233,457
  114,233,734
  114,233,770
  114,234,530
  114,234,633
  114,234,706
  114,234,939
  114,235,004
  114,235,090
  114,235,593
  114,235,726
  114,235,877
  114,236,186
  114,236,353
  114,236,453
  114,236,557
  114,236,584
  114,237,122
  114,237,133
  114,237,748
  114,237,910
  114,237,913
  114,239,439
  114,239,969
  114,240,510
  114,240,794
  114,241,028
  114,241,823
  114,241,916
  114,242,164
  114,242,175
  114,242,184
  114,242,189
  114,242,191
  114,242,221
  114,242,478
  114,243,525
  114,243,559
  114,243,862
  114,243,879
  114,243,941
  114,246,114
  114,246,115
  114,247,318
  114,249,510
  114,249,919
  114,250,132
  114,250,649
  114,250,794
  114,252,188
  114,252,827
  114,253,181
  114,253,934
  114,254,335
  114,254,337
  114,254,589
  114,255,154
  114,257,804
  114,258,460
  114,260,229
  114,260,619
  114,260,627
  114,262,285
  114,262,343
  114,263,880
  114,263,930
  114,264,793
  114,265,887
  114,266,572
  114,267,196
  114,267,214
  114,267,263
  114,270,379
  114,270,608
  114,272,369
  114,274,507
  114,274,773
  114,274,815
  114,276,021
  114,276,587
  114,277,812
  114,277,974
  114,278,155
  114,279,175
  114,279,176
  114,279,191
  114,279,928
  114,280,137
  114,281,730
  114,282,311
  114,282,499
  114,282,894
  114,282,982
  114,283,617
  114,284,837
  114,285,042
  114,286,280
  114,288,360
  114,288,364
  114,288,368
  114,288,372
  114,288,665
  114,288,671
  114,288,684
  114,288,690
  114,288,700
  114,288,706
  114,292,183
  114,293,331
  114,293,658
  114,293,661
  114,293,907
  114,293,921
  114,294,077
  114,294,340
  114,294,574
  114,295,415
  114,295,422
  114,295,429
  114,295,879
  114,295,882
  114,295,979
  114,296,025
  114,296,161
  114,296,162
  114,296,858
  114,296,887
  114,297,881
  114,297,965
  114,298,086
  114,298,266
  114,298,359
  114,298,392
  114,298,397
  114,298,427
  114,298,450
  114,298,551
  114,299,683
  114,301,648
  114,301,785
  114,302,625
  114,302,927
  114,302,931
  114,302,932
  114,302,971
  114,302,976
  114,303,009
  114,303,025
  114,303,058
  114,303,096
  114,303,159
A
T
G
T
A
-
C
3
-
8/9
G
A
G
A
-
T
T
C
-
C/2
C
C
-
C
3
2
C
T
G
A
T
C
-
C
T
T
G
G
17
A
G
A
T
3
A/2
11
T
2
A
C
2
T
G
-
A
A
C
A
A
A
T
7
A/G
C
T
C
G
C
G
-
T
C
C
C
A
T
T
A
C
C
C
A
A
C
A
A
A
G
A
G
A
2
-
G
T
-
T
A
C
-
T
A
T
T
T
G
-
C
-
A
T
-
-
T
-
-
4/-
-
G
T
-
A
C
-
-
G/A
T
A
A
2
A
A
G
A
G
G
A
C
G
3
A
6/-
A
C
C
-
-
T/2
G/C
G/C
A
C
A
C
G
A
C
C
-
T
T
T
A
C
A
T
C
2
T
G
-
G
G
T
G
T
T
C
C
C
T
G
A
5/3
6/-
G/5
2/-
4/-
G/T
C
C
C
-
A
T
G
C
2
G
C
T
C
T
A
C
C
13
3
T/3
A
A
C
A
T
A/G
A/G
T
A
-
A
A
T
9
A
T
G
G
C
T
G
G
A
C
-
G
A
2
A
G
T
C
T
T
A
-
CT/3
A
T
A
A
C
G
G
G
G
-
-
C/T
T
3/T
T
A
T
C/-
C/G
G/A
A/-
C
-
T
A
T
G
T
T
T/C
2
2/-
G/-
11
-
C
-
A
A
T
T
A
2
T
T
G
G
C
C
-
A/G
6/-
6/-
C/5
2/-
4/-
T
3
-