Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 80,555 (bp)   Positions: 406
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.057
.004
.0
.6
.003
.94
.955
.899
.021
.969
--
--
--
--
--
--
--
--
.009
.004
.254
--
.001
.015
.002
.24
.001
.998
.025
.029
.004
.284
.027
--
--
.001
.284
.006
--
--
.0
.0
.226
.011
.002
.001
.004
.004
.0
.045
.089
.005
.954
.986
.996
.837
.375
.03
.178
.001
.001
.0
.045
.002
.084
.002
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.052
.011
.0
.083
.006
.002
.059
.0
.003
.001
.003
.001
.186
.001
.032
.045
.003
.004
.004
.077
.502
.555
.0
.003
.002
.002
.427
.001
.136
.055
.004
.03
.013
.11
.007
.072
.003
.005
.009
.014
.018
.012
.282
.006
.0
.0
.0
.01
.003
.002
.003
.013
.0
.0
.2
.001
.005
.003
.007
.047
.035
.042
.112
.141
.176
.011
.043
.019
.177
.167
.028
.066
.053
.011
.24
.005
.148
.195
.124
.003
.019
.01
.002
--
--
.001
.0
.0
.0
.003
.182
.047
.046
.036
.221
.466
.428
.103
.012
.016
.03
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.234
.007
.004
.009
.004
.079
.746
.003
.001
.002
.001
.002
.001
.002
.0
.0
.001
.012
.001
.0
.001
.002
.019
.001
.971
.974
.13
.17
.0
.004
.0
.001
.0
.0
--
--
--
--
--
.013
.0
.0
.0
.0
.002
.004
.027
.004
.006
.038
.171
.049
.013
.016
.01
.01
--
.039
.529
.006
.003
.0
.15
.0
.001
.173
.007
.003
.012
.993
.78
.997
.986
.991
.993
.241
.019
.067
.005
.001
.006
.0
.177
.0
.051
.03
.036
.002
.063
.005
.008
.0
.006
.0
.001
.218
.052
.576
.054
.032
.018
.025
.003
.071
.001
.003
.006
.001
.002
.001
.001
.001
.001
.001
.101
.003
.006
.306
.001
.001
.002
.002
.001
.001
.012
.052
.056
.0
.008
.005
.004
.002
.002
.001
.002
.0
.006
.012
.0
.001
.081
.033
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
C
G
T
T
T
16
14
G
A
A
T
G
G
A
C
T
A
G
T
C
T
T
A
G
G
G
C
T
T
T
T
T
C
A
C
G
A
G
C
G
A
A
A
G
A
C
8
G
A
A
C
T
A
A
A
T
9
A
G
2
A
A
A
G
A
A
G
A
3
T
T
C
A
A
A
3
A
C
A
2
A
A
G
T
T
A
C
C
T
G
T
2
T
G
T
C
T
A
A
T
G
G
C
A
T
T
T
C
C
C
A
T
A
A
C
G
G
G
C
C
G
A
C
T
A
A
G
C
C
C
C
T
C
A
G
G
T
G
G
G
A
A
G
G
A
A
C
2
14
C
A
G
T
A
C
T
A
A
C
G
T
T
2
2
G
T
A
C
T
G
T
7
G
G
A
G
G
T
G
A
A
A
G
C
T
G
A
A
G
G
T
A
C
C
A
G
T
C
T
T
G
G
C
A
C
G
A
G
C
G
G
A
A
C
C
C
T
T
G
C
A
G
T
A
G
C
T
3
C
A
A
A
A
A
C
T
A
A
C
G
G
A
T
C
G
G
C
G
A
G
G
C
C
A
T
A
G
G
G
A
T
A
A
T
T
A
T
C
G
A
G
A
C
A
G
T
C
T
G
A
C
T
G
A
A
G
A
T
8
6
T
G
A
T
C
T
G
C
G
A
T
C
C
G
G
G
A
G
G
T
G
A
C
T
C
G
G
A
G
C
T
4
C
T
C
G
G
T
A
A
G
C
T
T
G
G
C
G
12
C
A
G
C
G
C
C
T
T
G
T
C
A
A
T
T
T
G
G
A
A
T
G
T
T
A
C
T
T
C
C
G
C
C
A
4
T
A
G
G
T
C
C
G
T
A
C
A
C
C
C
G
C
A
G
T
T
C
G
T
A
4
A
G
G
A
C
  189,564,264
  189,565,078
  189,565,579
  189,567,079
  189,567,619
  189,568,219
  189,568,221
  189,568,404
  189,569,304
  189,569,937
  189,572,244
  189,572,303
  189,572,548
  189,572,570
  189,572,578
  189,572,691
  189,572,716
  189,574,082
  189,575,707
  189,575,879
  189,576,043
  189,576,181
  189,577,643
  189,578,553
  189,578,751
  189,580,042
  189,580,865
  189,583,073
  189,583,975
  189,584,171
  189,584,264
  189,585,097
  189,585,243
  189,587,489
  189,587,630
  189,588,072
  189,588,192
  189,588,403
  189,588,563
  189,588,885
  189,589,179
  189,589,180
  189,589,591
  189,589,774
  189,590,277
  189,590,463
  189,590,490
  189,590,574
  189,591,030
  189,591,189
  189,591,275
  189,591,585
  189,592,224
  189,592,226
  189,592,228
  189,592,241
  189,592,243
  189,592,551
  189,592,669
  189,592,946
  189,593,367
  189,593,786
  189,594,081
  189,594,097
  189,594,110
  189,594,445
  189,594,727
  189,594,864
  189,594,911
  189,595,096
  189,595,097
  189,595,240
  189,595,332
  189,595,456
  189,595,565
  189,595,575
  189,595,576
  189,595,649
  189,595,689
  189,595,802
  189,596,427
  189,596,516
  189,596,531
  189,596,581
  189,596,691
  189,596,823
  189,596,877
  189,596,944
  189,597,016
  189,597,080
  189,597,208
  189,597,236
  189,597,414
  189,597,495
  189,597,505
  189,597,765
  189,598,076
  189,598,097
  189,598,112
  189,598,122
  189,598,133
  189,598,474
  189,598,538
  189,598,539
  189,598,738
  189,598,785
  189,599,229
  189,599,271
  189,599,302
  189,599,370
  189,599,569
  189,599,638
  189,599,697
  189,599,834
  189,599,861
  189,600,065
  189,600,066
  189,600,441
  189,600,463
  189,600,468
  189,600,493
  189,600,557
  189,600,621
  189,600,637
  189,600,806
  189,600,894
  189,600,929
  189,601,032
  189,601,218
  189,601,317
  189,601,318
  189,601,627
  189,601,803
  189,601,950
  189,602,197
  189,602,246
  189,602,270
  189,602,400
  189,602,477
  189,602,624
  189,602,625
  189,602,723
  189,602,730
  189,602,759
  189,602,826
  189,602,830
  189,602,947
  189,603,189
  189,603,195
  189,603,450
  189,603,460
  189,603,525
  189,603,550
  189,603,661
  189,603,694
  189,603,716
  189,603,760
  189,603,883
  189,603,985
  189,604,025
  189,604,199
  189,604,201
  189,604,211
  189,604,219
  189,604,509
  189,604,533
  189,604,585
  189,604,593
  189,604,934
  189,605,227
  189,605,598
  189,605,600
  189,605,606
  189,605,611
  189,605,638
  189,605,643
  189,605,671
  189,605,750
  189,605,780
  189,605,934
  189,606,012
  189,606,107
  189,606,268
  189,606,320
  189,606,321
  189,606,479
  189,606,547
  189,606,638
  189,606,715
  189,606,765
  189,606,790
  189,606,865
  189,606,884
  189,606,897
  189,606,962
  189,606,985
  189,607,100
  189,607,374
  189,607,380
  189,607,381
  189,607,382
  189,607,494
  189,607,524
  189,607,529
  189,607,530
  189,607,535
  189,607,539
  189,607,612
  189,607,613
  189,607,628
  189,607,634
  189,607,657
  189,607,664
  189,607,810
  189,607,925
  189,608,171
  189,608,323
  189,608,406
  189,608,523
  189,608,542
  189,608,563
  189,608,594
  189,608,756
  189,608,942
  189,608,944
  189,608,956
  189,608,957
  189,609,098
  189,609,128
  189,609,150
  189,609,203
  189,609,213
  189,609,308
  189,609,374
  189,609,530
  189,609,619
  189,609,658
  189,609,659
  189,609,685
  189,609,700
  189,609,769
  189,609,775
  189,609,802
  189,609,836
  189,609,848
  189,609,936
  189,609,985
  189,609,986
  189,610,003
  189,610,032
  189,610,048
  189,610,189
  189,610,219
  189,610,240
  189,610,277
  189,610,310
  189,610,430
  189,610,434
  189,610,456
  189,611,010
  189,611,108
  189,611,131
  189,611,147
  189,611,177
  189,611,205
  189,611,273
  189,611,284
  189,611,329
  189,611,345
  189,611,399
  189,611,550
  189,611,589
  189,612,210
  189,612,211
  189,612,227
  189,612,249
  189,612,263
  189,612,360
  189,612,629
  189,612,653
  189,612,712
  189,613,025
  189,613,082
  189,613,171
  189,613,523
  189,613,815
  189,614,009
  189,614,419
  189,614,686
  189,614,688
  189,615,006
  189,615,037
  189,615,557
  189,615,582
  189,615,789
  189,616,005
  189,616,094
  189,616,170
  189,616,636
  189,616,653
  189,616,707
  189,617,081
  189,617,117
  189,618,118
  189,618,408
  189,618,798
  189,618,813
  189,618,820
  189,619,105
  189,619,157
  189,619,168
  189,619,235
  189,619,283
  189,619,336
  189,619,453
  189,619,539
  189,619,996
  189,620,248
  189,620,513
  189,620,599
  189,620,830
  189,620,891
  189,621,026
  189,621,953
  189,622,245
  189,622,506
  189,622,590
  189,623,359
  189,623,453
  189,623,805
  189,623,996
  189,624,074
  189,624,693
  189,624,878
  189,624,968
  189,625,207
  189,625,215
  189,625,296
  189,625,309
  189,625,445
  189,625,863
  189,626,010
  189,626,027
  189,626,343
  189,626,907
  189,627,027
  189,627,301
  189,627,385
  189,627,503
  189,628,108
  189,628,135
  189,628,585
  189,628,647
  189,628,672
  189,629,197
  189,629,312
  189,630,287
  189,630,873
  189,630,939
  189,630,955
  189,631,009
  189,631,365
  189,631,485
  189,631,512
  189,631,813
  189,632,895
  189,632,933
  189,633,035
  189,633,373
  189,633,399
  189,633,447
  189,633,873
  189,633,959
  189,633,988
  189,634,002
  189,634,304
  189,634,685
  189,634,687
  189,635,247
  189,636,055
  189,636,159
  189,636,182
  189,636,757
  189,636,865
  189,636,985
  189,637,091
  189,637,580
  189,637,776
  189,637,841
  189,638,745
  189,639,026
  189,639,132
  189,639,175
  189,639,181
  189,639,360
  189,640,162
  189,640,403
  189,640,646
  189,640,712
  189,640,831
  189,641,067
  189,641,526
  189,641,810
  189,641,930
  189,642,420
  189,643,177
A
G/2
C
C
C
16/-
14/-
A
-
A/G
C
C
A
G
G
C
4
11
C
T
-
C
G
T
A
A
T
G
A
A
A
-
G
G
T
A
G
C
T
A
T
T
-
2
G
G
-
C
A/2
2
A
21
G
G
G
-
-
2
T
-
8
G
G
T
-
G
A
T
-
G
C
T
C
C
C
-
3
T
T
-
G
T
T
A
C
C
T
T
C
A
C
-
C
C
C
T
C
T
G
2
A
C
T
G
C
G
C
T
T
T
G
C
C
G
T
A
T
A
T
T
3
30
A
A
C
G
A
A
A
T
G
A
G
C
2
T
-
T
C
-
T
T
A
A
G
C
G
-
-
-
G
C
C
2
T
3
T
C
T
A
C
C
-
-
T
A
G
T
C
A
A
-
3
A
C
A
A
A
A
G
G
C
T
G
A
A
T
10
A
T
G
G
T
T
G
A
C
T
C
C
A
A
A
G
T
A
-
A
T
A
2
G
G
A
A
A
C
G
A
T
T
A
C
-
T
-
A
-
A
G
T
C
G
G
A
A
-
G
T
C
A
G
C
A
A
T
T
A
G
A
A
T
G
T
C
-
A
T
T
C
G
G
5
A
A
G
64
G
A
G
A
G
A
C
A
-
A
A
A
T
T
C
-
G
G
A
C
A
8/-
-
3
7
G
C
T
C
T
T
T
C
A
T
A
A
7
A
T
4
T
-
A
T
T
G
2
2
T
G
T
A
3
-
T
A
T
C
A
C
C
-
A
T
C
3
C
A
T
G/T
-
T
T
2
G
A
A
A
3
C
A
99
5
T
C
C
2
C
A
A
G
11
-
T
C
-
G
T
G
A
A
G
T
T
2
T
-
C
2
11
T
C
G
G
2
T/-
C
2
T
A
G
T
T
T
G
T
G
C
T
T
G
G
-
G
A
A
G
T