Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 80,555 (bp)   Positions: 512
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.159
.129
.0
.004
.0
.012
.0
.011
.6
.029
.228
.003
.022
.674
.704
.0
.0
.004
.001
.086
.632
.672
.023
.015
.02
.033
.025
.001
.002
.001
.153
.0
.054
.014
.001
.007
.003
.0
.0
.001
.003
.003
.0
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.159
.189
.001
.11
.0
.002
.0
.009
.06
.007
.016
.003
.004
.055
.133
.254
.001
--
--
--
--
--
--
--
.061
.004
.025
.002
.389
.068
.026
.397
.001
.04
.792
.37
.0
.0
.005
.0
.002
.007
.002
.007
.017
.002
.007
.0
.003
.002
.001
.005
.001
.001
.009
.046
.005
.991
.099
.998
.033
.009
.284
.002
.027
.626
.284
.004
.343
.0
.0
.001
.226
.011
.001
.0
.004
.004
1.0
.001
.001
.001
.017
.034
.0
.005
.911
.954
.998
.994
.978
.004
.03
.0
.006
.001
.037
.0
.033
.008
.002
.002
.13
.159
.162
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.046
.011
.0
.083
.006
.004
.002
.059
.0
.001
.003
.001
.186
.001
.032
.045
.085
.003
.001
.0
.003
.002
.002
.427
.001
.136
.055
.011
.004
.03
.013
.1
.007
.003
.005
.017
.009
.018
.012
.282
.002
.006
.0
.0
.0
.01
.003
.002
.002
.013
.0
.0
.0
.2
.001
.005
.003
.007
.121
.047
.112
.141
.176
.011
.043
.019
.177
.028
.03
.066
.053
.011
.004
.005
.148
.195
.003
.019
.017
.01
--
.001
.0
.0
.0
.003
.001
.983
.003
.0
.182
.007
.047
.046
.036
.466
.012
.016
.03
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.234
.007
.009
.004
.746
.003
.083
.057
.002
.001
.002
.001
.125
.002
.0
.0
.0
.002
.012
.001
.0
.059
.019
.001
.971
.005
.13
.0
.004
.001
.0
.0
--
--
--
--
.013
.0
.0
.0
.004
.027
.103
.004
.038
.171
.085
.049
.013
.016
.011
.01
.01
--
.039
.002
.0
.15
.003
.0
.001
.173
.004
.993
.997
.986
.991
.999
.241
.031
.019
.067
.005
.006
.177
.0
.051
.03
.002
.005
.0
.009
.006
.029
.0
.001
.236
.052
.057
.018
.126
.025
.003
.071
.003
.006
.001
.002
.001
.001
.001
.001
.003
.101
.003
.001
.004
.002
.002
.009
.001
.001
.012
.02
.052
.0
.008
.005
.002
.002
.001
.002
.0
.006
.0
.012
.0
.001
.0
.081
.0
.367
.033
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
Si
T
T
T
A
C
T
A
C
T
T
G
4
T
C
28
26
C
G
C
C
T
2
6
G
G
T
C
A
T
C
T
G
G
T
T
T
T
T
T
A
T
A
2
A
T
C
C
A
G
T
G
T
A
A
T
C
G
G
A
C
A
A
A
C
T
T
A
A
T
T
T
C
A
G
G
A
T
T
G
G
2
T
A
T
G
C
G
A
A
T
G
T
A
G
T
6
G
C
C
A
T
T
G
A
G
C
T
T
G
A
A
C
G
G
A
G
C
T
A
G
T
C
G
T
G
A
A
G
G
C
4
C
G
A
C
G
C
T
C
A
4
A
G
T
C
T
C
A
T
T
A
C
A
C
T
A
A
T
A
G
G
4
G
G
2
A
G
A
C
C
G
T
A
9
A
A
A
T
A
A
C
A
T
A
C
T
G
A
T
G
A
G
2
T
T
C
A
T
A
A
4
A
C
G
A
A
G
T
A
T
A
C
T
G
T
2
T
G
T
C
C
C
G
C
A
T
T
T
C
C
C
C
A
T
T
A
G
G
T
G
C
A
A
G
C
T
A
A
G
C
T
C
C
G
G
T
A
G
G
T
G
G
G
A
G
G
A
A
C
2
C
T
A
G
T
G
C
T
A
C
G
A
T
4
G
T
A
C
A
A
G
T
C
G
A
T
7
G
A
T
G
A
A
A
G
C
G
A
A
G
G
T
A
C
C
G
T
T
T
T
C
C
3
G
C
G
A
A
C
T
C
A
C
C
T
T
G
C
A
T
A
G
C
T
C
3
C
A
A
A
A
A
C
C
T
A
A
C
G
G
G
A
T
C
G
C
G
A
G
C
T
A
G
C
A
T
A
A
T
T
A
C
G
G
A
G
C
A
G
A
C
A
T
G
A
C
A
T
G
A
C
A
T
A
C
T
A
T
T
C
55
G
T
C
A
G
G
A
G
T
G
G
A
T
C
T
G
G
A
G
G
C
6
4
A
G
G
T
T
A
A
C
T
G
C
G
6
C
A
A
G
C
C
T
T
G
T
A
T
T
A
G
T
G
A
6
T
C
A
C
C
T
T
C
G
C
C
A
4
T
A
G
G
T
G
2
A
C
T
A
C
C
G
C
C
A
G
T
C
G
T
A
4
G
A
G
G
10
A
A
C
C
  189,563,518
  189,564,400
  189,564,405
  189,565,180
  189,565,349
  189,565,579
  189,565,749
  189,566,350
  189,566,696
  189,567,079
  189,567,212
  189,567,324
  189,567,619
  189,568,183
  189,568,207
  189,568,209
  189,568,798
  189,568,866
  189,568,964
  189,569,473
  189,569,562
  189,569,865
  189,569,879
  189,570,003
  189,570,430
  189,570,433
  189,570,496
  189,570,512
  189,570,552
  189,570,623
  189,570,626
  189,570,755
  189,570,811
  189,570,984
  189,571,141
  189,571,255
  189,571,273
  189,571,369
  189,571,387
  189,571,433
  189,571,440
  189,571,505
  189,571,530
  189,571,669
  189,571,744
  189,571,838
  189,571,929
  189,571,993
  189,572,009
  189,572,044
  189,572,136
  189,572,142
  189,572,148
  189,572,212
  189,572,223
  189,572,243
  189,572,303
  189,572,548
  189,572,570
  189,572,578
  189,572,618
  189,572,645
  189,572,716
  189,572,720
  189,572,730
  189,572,790
  189,572,922
  189,572,933
  189,573,171
  189,573,295
  189,573,395
  189,573,495
  189,573,580
  189,573,592
  189,573,593
  189,573,619
  189,573,858
  189,574,074
  189,574,082
  189,574,160
  189,574,415
  189,574,426
  189,574,445
  189,574,453
  189,574,462
  189,574,536
  189,574,573
  189,574,574
  189,574,646
  189,574,666
  189,574,866
  189,574,904
  189,574,911
  189,574,929
  189,575,046
  189,575,297
  189,575,531
  189,575,847
  189,575,879
  189,575,934
  189,575,987
  189,576,043
  189,576,076
  189,576,108
  189,576,151
  189,576,158
  189,576,181
  189,576,317
  189,576,318
  189,576,396
  189,576,419
  189,576,447
  189,576,549
  189,576,613
  189,576,776
  189,577,106
  189,577,170
  189,577,254
  189,577,643
  189,577,761
  189,577,929
  189,578,156
  189,578,177
  189,578,188
  189,578,391
  189,578,570
  189,578,593
  189,578,737
  189,578,751
  189,578,804
  189,579,012
  189,579,557
  189,579,659
  189,580,097
  189,580,194
  189,580,261
  189,580,865
  189,580,938
  189,581,139
  189,581,428
  189,581,739
  189,581,880
  189,582,094
  189,582,669
  189,582,785
  189,583,073
  189,584,004
  189,584,790
  189,585,097
  189,585,394
  189,586,475
  189,587,991
  189,588,192
  189,588,364
  189,589,054
  189,589,179
  189,589,180
  189,589,527
  189,589,591
  189,589,774
  189,590,124
  189,590,494
  189,590,574
  189,590,641
  189,590,823
  189,590,975
  189,591,033
  189,591,034
  189,591,239
  189,591,284
  189,591,567
  189,591,585
  189,592,222
  189,592,224
  189,592,234
  189,592,236
  189,592,238
  189,592,251
  189,592,551
  189,592,684
  189,592,871
  189,593,367
  189,593,770
  189,593,786
  189,593,910
  189,594,039
  189,594,097
  189,594,445
  189,594,467
  189,594,481
  189,594,485
  189,594,727
  189,594,912
  189,595,096
  189,595,097
  189,595,240
  189,595,332
  189,595,427
  189,595,456
  189,595,565
  189,595,574
  189,595,577
  189,595,649
  189,595,780
  189,596,427
  189,596,516
  189,596,531
  189,596,581
  189,596,589
  189,596,691
  189,596,823
  189,596,877
  189,597,016
  189,597,080
  189,597,208
  189,597,236
  189,597,414
  189,597,495
  189,597,505
  189,597,593
  189,597,765
  189,597,980
  189,598,474
  189,598,538
  189,598,539
  189,598,738
  189,598,785
  189,599,229
  189,599,271
  189,599,302
  189,599,360
  189,599,370
  189,599,569
  189,599,638
  189,599,700
  189,599,834
  189,600,065
  189,600,066
  189,600,218
  189,600,441
  189,600,468
  189,600,489
  189,600,557
  189,600,602
  189,600,621
  189,600,637
  189,600,806
  189,600,894
  189,600,929
  189,601,032
  189,601,124
  189,601,218
  189,601,318
  189,601,425
  189,601,463
  189,601,627
  189,601,950
  189,602,197
  189,602,246
  189,602,270
  189,602,400
  189,602,455
  189,602,477
  189,602,723
  189,602,730
  189,602,759
  189,602,826
  189,602,830
  189,602,947
  189,603,189
  189,603,450
  189,603,452
  189,603,460
  189,603,525
  189,603,550
  189,603,562
  189,603,694
  189,603,716
  189,603,760
  189,603,985
  189,604,025
  189,604,096
  189,604,199
  189,604,213
  189,604,509
  189,604,533
  189,604,585
  189,604,593
  189,604,670
  189,604,728
  189,604,850
  189,604,934
  189,604,963
  189,605,227
  189,605,332
  189,605,598
  189,605,600
  189,605,606
  189,605,638
  189,605,750
  189,605,780
  189,605,934
  189,606,012
  189,606,107
  189,606,268
  189,606,320
  189,606,478
  189,606,547
  189,606,638
  189,606,715
  189,606,765
  189,606,790
  189,606,865
  189,606,884
  189,606,897
  189,606,985
  189,607,100
  189,607,380
  189,607,381
  189,607,452
  189,607,524
  189,607,530
  189,607,537
  189,607,612
  189,607,613
  189,607,628
  189,607,657
  189,607,664
  189,607,682
  189,607,825
  189,607,925
  189,607,971
  189,608,171
  189,608,232
  189,608,323
  189,608,406
  189,608,523
  189,608,542
  189,608,563
  189,608,756
  189,608,942
  189,608,944
  189,608,956
  189,608,957
  189,608,991
  189,609,098
  189,609,128
  189,609,150
  189,609,203
  189,609,213
  189,609,308
  189,609,374
  189,609,530
  189,609,572
  189,609,619
  189,609,658
  189,609,659
  189,609,685
  189,609,700
  189,609,750
  189,609,769
  189,609,775
  189,609,802
  189,609,836
  189,609,848
  189,609,985
  189,609,986
  189,610,003
  189,610,048
  189,610,219
  189,610,277
  189,610,310
  189,610,456
  189,610,933
  189,611,010
  189,611,108
  189,611,131
  189,611,147
  189,611,177
  189,611,205
  189,611,273
  189,611,329
  189,611,345
  189,611,550
  189,611,589
  189,612,039
  189,612,112
  189,612,211
  189,612,227
  189,612,248
  189,612,263
  189,612,297
  189,612,360
  189,612,629
  189,612,653
  189,612,785
  189,612,977
  189,613,025
  189,613,082
  189,613,171
  189,613,472
  189,614,009
  189,614,419
  189,614,683
  189,614,877
  189,615,006
  189,615,557
  189,615,582
  189,616,005
  189,616,170
  189,616,403
  189,616,636
  189,616,707
  189,617,117
  189,617,268
  189,618,118
  189,618,798
  189,618,813
  189,618,820
  189,619,157
  189,619,168
  189,619,211
  189,619,235
  189,619,336
  189,619,453
  189,619,488
  189,619,539
  189,619,996
  189,620,248
  189,620,473
  189,620,513
  189,620,599
  189,620,799
  189,620,891
  189,621,669
  189,622,506
  189,622,590
  189,622,851
  189,623,359
  189,623,453
  189,623,805
  189,624,020
  189,624,855
  189,625,207
  189,625,215
  189,625,296
  189,625,315
  189,625,445
  189,625,545
  189,625,863
  189,626,010
  189,626,027
  189,626,907
  189,627,301
  189,627,385
  189,627,503
  189,628,108
  189,628,585
  189,628,672
  189,629,312
  189,630,042
  189,630,287
  189,630,410
  189,630,873
  189,630,939
  189,630,956
  189,631,009
  189,631,552
  189,631,813
  189,632,006
  189,632,895
  189,632,933
  189,633,035
  189,633,399
  189,633,447
  189,633,873
  189,633,959
  189,633,988
  189,634,002
  189,634,304
  189,634,685
  189,634,689
  189,635,247
  189,636,055
  189,636,757
  189,636,864
  189,636,985
  189,637,091
  189,637,209
  189,637,580
  189,637,776
  189,637,841
  189,638,596
  189,638,745
  189,639,132
  189,639,175
  189,639,181
  189,640,162
  189,640,403
  189,640,646
  189,640,712
  189,640,831
  189,641,067
  189,641,343
  189,641,526
  189,641,810
  189,641,930
  189,642,151
  189,642,420
  189,642,559
  189,642,675
  189,643,177
C
C
C
C
T
C
T
T
A
C
A
-
C
T
28/-
-
T
T
2
T
C
-
-
A
A
A
A
G
A
A
C
T
T
A
C
A
C
A
G
G
G
G
-
G
C
T
T
G
T
C
C
3
G
T
A
A
C
A
G
G
C
G
4
T
A
4
G
G
G
A
G
A
-
A
A
G
C
-
11
A
-
11
-
2
T
G
2
T
C
C
A
A
-
A
C
-
T
-
T
G
C
-
A
G
T
-
C
-
A
2
C
T
A
A
G
C
T
C
G
A
A
T
T
A
2
G
4
A
A
A
-
T
A
G
T
A
T
C
A
G
-
G
A
C
A
G
A
C
-
C
T
T
G
G
C
T
T
A
-
2
A
-
C
A
2/-
T
G/3
A/-
A
T
T
25/21
-
-
G
G
G
A
2
G
A
8
C
G
T
C
T
G
7
A
3
A
2/-
G
C
T
C
A
C
C
-
3
T
A
G
T
T
A
C
C
C
T
C
A
C
-
C
C
C
G
T
T
C
T
G
C
G
C
T
T
T
T
G
C
G
G
A
T
G
A
T
G
30
2
A
A
C
G
A
A
-
A
G
-
A
A
C
2
T
-
T
A
C
T
A
A
G
C
G
-
T
A
G
C
C
T
T
3
T
T
A
C
C
-
T
A
G
T
G
-
A
C
T
A
G
A
-
3
C
A
A
G
G
C
T
G
C
T
10
A
T
G
G
T
T
A
C
C
C
G
A
T
-
A
T
A
G
G
A
A
A
C
A
T
C
G
A
T
T
C
-
T
-
A
T
-
A
G
T
C
G
G
A
T
A
-
G
T
C
2
A
G
C
A
A
T
A
G
A
G
C
-
T
G
C
G
G
5
A
A
G
G
A
A
G
A
T
C
A
2
A
G
A
A
T
2
T
C
-
G
T
C
A
5
T
21
G
C
C
T
-
T
A
A
G
A
A
T
2
-
A
T
T
G
2
A
2
T
G
T
T
A
-
-
G
C
A
C
C
C
-
A
-
A
T
T
-
T
G
T
3/GT
G
A
3
C
A
99
T
C
C
G
A
7
A
G
-
-
2
G
T
T
G
A
G
T
T
2
T
-
C
2
9
T
C
2
-
C
2
2
T
A
G
T
T
T
G
T
C
T
T
G
G
-
T
G
A
A
10/-
G
G
T
T