Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 269,229 (bp)   Positions: 560
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.047
.021
.09
.151
.961
.003
.0
--
.006
.02
.011
.004
.009
.001
.039
.005
.024
.001
.001
.99
.99
.0
.002
.004
.022
--
--
.118
.113
.006
.003
.004
.01
.015
.049
.724
.013
.001
.024
.132
.001
.004
.007
.001
.0
.004
.007
.167
.004
.086
.336
.004
.029
.0
.154
1.0
.0
.005
.0
.0
.001
.001
.001
.002
.033
.028
.001
.0
.008
.0
.002
.158
.476
.009
--
.134
--
.001
.0
.0
.01
.081
.152
.023
.001
.002
.003
.001
--
--
--
.009
.069
.132
.141
.003
.001
.099
.108
.001
.26
.02
.015
.386
.004
.004
.0
.156
--
--
.0
.001
.0
.0
.01
.0
--
--
--
.047
.282
.021
.981
.607
.492
.813
.039
.0
.011
.369
.002
.001
.01
.001
.0
.089
.003
.014
.502
.495
.495
.438
.015
.025
--
--
.0
.032
.002
.005
.014
.028
.194
.002
.002
.022
.432
.001
.0
.005
.005
--
--
--
.0
.058
.052
.235
.038
.024
.008
.247
.123
.001
.02
.01
.004
.013
.025
.01
.051
.019
.004
.012
--
.036
.004
.188
.001
.117
.043
.009
.063
.022
.03
.008
.001
.009
.001
.0
.003
.0
.0
.007
.0
.001
.006
.002
.018
.004
.001
.001
.001
.004
.001
.533
.157
.023
.029
.029
.01
.159
.029
.003
.001
.0
.319
.045
.025
.025
.026
.04
.007
.002
.001
.0
.072
.155
.006
.005
.216
.104
.255
.004
.985
.002
.003
.036
--
--
--
.0
.026
.155
.006
.981
.007
.003
.107
.007
.083
.07
.003
.264
.006
.002
.011
.006
.003
.487
.035
.003
.315
.052
.099
.128
.566
.001
.408
.003
--
.344
.312
.005
--
.012
.001
.002
.078
.071
.001
.001
.044
.035
.114
.249
.005
.011
.01
--
.777
.783
.438
--
.038
.038
.0
.638
.006
.045
.611
.035
.015
.069
.002
--
--
--
.085
.0
.004
.119
.003
.006
.154
.022
.003
.005
.001
.028
.028
.025
.334
.071
.286
.255
.452
.898
.221
.039
.004
.0
.219
.002
.0
.0
.115
.003
.002
.004
.165
.004
.074
.126
.008
.02
--
--
--
.001
.001
.007
.024
--
.002
--
--
--
.0
.077
.176
.002
.177
.0
.0
.064
.074
.929
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.131
.0
.092
.094
.261
.669
.602
.375
.121
.008
.001
.003
.001
.001
.001
.068
.045
.001
.239
.012
.003
.003
.125
.065
.0
.02
.005
--
--
--
.017
.073
.012
.491
.001
.036
.022
.876
.011
--
--
--
--
.003
.032
.002
.06
.002
.004
.73
.002
.027
.197
.0
.001
.058
.025
.0
.052
.001
.022
.003
.003
.019
.062
.179
.257
.003
.994
.002
.023
.013
.049
.224
.357
.606
.524
.027
.011
.088
.005
--
--
--
.004
.013
--
.002
.003
.003
.012
.068
.276
.29
.023
--
.01
.047
.109
.651
.038
.014
.014
.155
.007
.025
.018
--
--
--
--
.133
.009
.0
.003
.01
.0
.006
.855
.851
.003
1.0
.977
1.0
.0
.015
.0
.015
.023
.009
.236
.003
.003
.0
.08
.047
.001
.001
.001
.007
.039
.037
.002
.0
.694
.305
.073
.065
.223
.014
--
.006
.001
.001
.023
.003
.958
.409
.065
.047
.006
.0
.012
.001
.0
.422
--
.0
.076
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
Shroom3
T
C
12
10
T
C
A
G
G
A
C
C
T
G
21
A
T
3
C
G
T
T
T
A
T
C
T
A
G
9
4
C
T
C
A
A
C
A
G
G
C
C
T
C
G
G
G
C
A
G
T
G
A
C
A
C
A
A
A
T
T
A
T
G
2
C
C
C
C
G
T
C
C
G
C
C
G
A
C
C
T
C
G
T
T
C
A
C
A
8
6
G
T
G
A
G
A
G
G
80
T
A
A
T
T
C
G
T
T
T
C
C
A
T
T
G
T
G
18
4
C
G
T
T
G
G
C
T
C
A
A
G
C
4
C
C
C
G
C
T
A
A
C
T
4
2
A
G
G
C
T
A
A
12
8
A
A
T
A
C
C
4
T
T
G
A
A
3
3
A
C
C
C
G
G
T
A
T
G
122
8
C
C
12
C
A
T
C
A
T
C
T
A
T
A
9
G
C
T
T
5
G
2
A
A
A
G
2
T
T
G
4
A
A
T
A
3
C
A
C
G
A
T
G
G
A
C
A
A
G
A
A
A
T
G
A
C
C
3
A
A
2
2
T
G
G
C
A
T
G
126
A
G
G
C
A
A
A
T
9
G
G
C
T
A
6
A
A
C
2
A
G
4
C
T
G
A
C
T
A
A
2
C
G
G
2
G
A
G
T
11
24
C
T
4
2
G
A
C
A
T
2
C
C
C
G
T
A
G
T
C
6
4
A
A
2
10
C
A
T
T
T
G
A
C
G
A
3
A
10
2
6
4
A
G
T
2
C
G
T
A
A
12
T
T
G
A
C
C
A
T
T
G
A
C
C
2
T
T
T
G
G
7
C
A
G
G
A
G
T
C
C
24
T
T
C
G
A
G
T
G
G
T
A
C
G
C
G
C
A
T
C
G
C
A
A
C
T
A
C
A
4
2
C
C
G
C
C
T
T
A
A
T
C
A
G
G
T
8
T
G
A
T
G
2
A
8
A
C
T
C
C
A
A
G
T
G
T
T
G
C
A
A
T
C
C
3
T
G
C
C
T
T
G
T
C
C
A
G
4
4
2
C
A
2
T
T
T
C
A
2
G
69
G
C
G
27
C
C
T
T
7
C
A
T
C
G
A
A
A
T
T
A
A
A
C
G
A
T
T
G
A
A
C
C
G
C
T
G
G
A
A
C
A
G
T
4
G
A
A
G
G
A
G
C
12
C
C
G
A
G
T
G
A
A
G
T
G
G
A
14
T
T
7
C
G
C
T
11
T
G
C
4
10
C
C
A
A
C
A
  16,548,004
  16,548,101
  16,548,363
  16,548,365
  16,548,411
  16,548,534
  16,549,227
  16,549,783
  16,549,840
  16,549,858
  16,549,863
  16,549,874
  16,549,931
  16,550,114
  16,550,462
  16,550,491
  16,550,522
  16,550,687
  16,550,727
  16,550,760
  16,550,790
  16,551,201
  16,551,254
  16,551,372
  16,551,569
  16,551,737
  16,551,881
  16,552,182
  16,552,184
  16,552,242
  16,552,252
  16,552,350
  16,552,502
  16,552,642
  16,552,682
  16,553,094
  16,553,358
  16,553,587
  16,553,605
  16,553,616
  16,553,879
  16,554,074
  16,554,093
  16,554,128
  16,554,483
  16,554,509
  16,554,579
  16,554,750
  16,555,589
  16,555,619
  16,555,801
  16,556,190
  16,556,362
  16,556,603
  16,556,700
  16,557,233
  16,557,406
  16,557,853
  16,558,071
  16,558,089
  16,558,184
  16,558,206
  16,558,233
  16,558,240
  16,558,300
  16,558,301
  16,558,697
  16,558,701
  16,558,807
  16,559,057
  16,559,146
  16,559,148
  16,559,159
  16,559,454
  16,560,111
  16,560,366
  16,560,539
  16,560,794
  16,560,818
  16,560,982
  16,561,321
  16,561,349
  16,561,577
  16,561,772
  16,562,128
  16,562,638
  16,562,893
  16,563,159
  16,563,679
  16,563,698
  16,563,700
  16,564,247
  16,564,306
  16,564,372
  16,564,488
  16,564,532
  16,564,624
  16,564,739
  16,564,755
  16,565,339
  16,565,767
  16,565,835
  16,565,906
  16,566,046
  16,566,259
  16,566,287
  16,566,410
  16,566,867
  16,567,401
  16,567,417
  16,568,158
  16,568,409
  16,568,618
  16,568,706
  16,569,353
  16,569,749
  16,570,123
  16,570,160
  16,570,206
  16,570,566
  16,571,302
  16,572,419
  16,572,490
  16,572,698
  16,572,704
  16,572,712
  16,572,876
  16,572,907
  16,572,988
  16,574,950
  16,575,240
  16,576,085
  16,576,177
  16,576,514
  16,576,529
  16,578,265
  16,578,349
  16,579,031
  16,579,293
  16,579,297
  16,579,302
  16,579,352
  16,579,600
  16,580,678
  16,581,137
  16,581,139
  16,581,296
  16,582,179
  16,582,181
  16,582,183
  16,582,187
  16,582,190
  16,582,316
  16,582,522
  16,582,989
  16,583,796
  16,583,808
  16,584,031
  16,584,155
  16,584,163
  16,584,731
  16,585,258
  16,585,291
  16,585,388
  16,585,576
  16,585,842
  16,586,020
  16,586,065
  16,586,375
  16,586,389
  16,586,498
  16,586,960
  16,587,079
  16,587,656
  16,587,958
  16,589,164
  16,589,298
  16,589,829
  16,590,261
  16,590,364
  16,590,761
  16,590,887
  16,591,013
  16,591,256
  16,592,097
  16,592,424
  16,592,453
  16,592,550
  16,593,328
  16,594,352
  16,594,426
  16,594,515
  16,594,701
  16,594,731
  16,595,309
  16,595,466
  16,596,374
  16,596,553
  16,596,888
  16,597,185
  16,597,350
  16,597,356
  16,597,358
  16,597,433
  16,597,473
  16,597,544
  16,597,638
  16,597,695
  16,597,764
  16,598,642
  16,598,665
  16,598,776
  16,598,831
  16,598,986
  16,599,555
  16,599,840
  16,599,913
  16,600,214
  16,600,243
  16,600,262
  16,600,304
  16,600,527
  16,600,615
  16,600,795
  16,600,917
  16,601,167
  16,601,367
  16,601,520
  16,601,641
  16,601,645
  16,601,646
  16,601,896
  16,601,970
  16,602,170
  16,602,577
  16,602,589
  16,602,680
  16,602,808
  16,602,937
  16,603,001
  16,603,138
  16,603,262
  16,603,280
  16,603,428
  16,603,510
  16,603,697
  16,603,836
  16,603,903
  16,604,111
  16,604,118
  16,604,225
  16,604,538
  16,604,783
  16,604,829
  16,605,275
  16,605,452
  16,606,096
  16,606,101
  16,606,571
  16,607,196
  16,607,267
  16,607,273
  16,607,603
  16,608,399
  16,609,009
  16,609,708
  16,610,414
  16,610,708
  16,610,840
  16,612,242
  16,613,161
  16,617,684
  16,619,180
  16,619,423
  16,621,058
  16,635,262
  16,636,657
  16,637,177
  16,637,239
  16,640,527
  16,640,818
  16,666,198
  16,671,918
  16,679,774
  16,681,457
  16,682,366
  16,682,734
  16,682,797
  16,686,691
  16,687,297
  16,693,945
  16,693,960
  16,695,082
  16,695,084
  16,700,783
  16,700,785
  16,707,875
  16,707,882
  16,707,885
  16,708,633
  16,712,467
  16,712,468
  16,713,500
  16,718,676
  16,724,488
  16,724,492
  16,729,915
  16,729,989
  16,730,842
  16,730,847
  16,730,935
  16,731,987
  16,731,989
  16,732,015
  16,732,052
  16,732,793
  16,732,796
  16,732,928
  16,735,232
  16,737,533
  16,737,669
  16,738,425
  16,738,802
  16,738,828
  16,764,517
  16,764,581
  16,765,110
  16,765,404
  16,765,723
  16,766,163
  16,766,164
  16,766,167
  16,766,215
  16,766,758
  16,766,796
  16,766,962
  16,767,038
  16,767,253
  16,768,259
  16,769,286
  16,769,661
  16,769,669
  16,769,755
  16,770,257
  16,770,571
  16,770,575
  16,770,703
  16,771,111
  16,771,392
  16,771,404
  16,771,612
  16,771,642
  16,771,659
  16,771,661
  16,771,860
  16,771,903
  16,772,565
  16,772,570
  16,772,571
  16,773,098
  16,773,105
  16,773,123
  16,773,224
  16,773,411
  16,773,504
  16,774,769
  16,774,821
  16,774,834
  16,775,941
  16,775,991
  16,776,728
  16,777,477
  16,777,550
  16,778,255
  16,778,267
  16,778,468
  16,778,504
  16,780,122
  16,781,183
  16,781,187
  16,781,188
  16,781,284
  16,781,306
  16,781,307
  16,781,330
  16,781,405
  16,781,425
  16,781,478
  16,781,559
  16,781,620
  16,781,735
  16,781,962
  16,782,006
  16,782,008
  16,782,029
  16,782,067
  16,782,089
  16,782,121
  16,782,153
  16,782,270
  16,782,430
  16,782,532
  16,782,570
  16,782,571
  16,782,575
  16,783,201
  16,783,299
  16,783,425
  16,783,517
  16,783,535
  16,784,333
  16,784,336
  16,784,678
  16,784,955
  16,785,169
  16,785,354
  16,785,465
  16,785,569
  16,785,571
  16,785,572
  16,785,762
  16,785,784
  16,785,821
  16,785,977
  16,786,088
  16,786,095
  16,786,148
  16,786,260
  16,786,371
  16,786,565
  16,786,604
  16,786,674
  16,786,729
  16,786,806
  16,787,010
  16,787,086
  16,787,102
  16,787,149
  16,787,311
  16,787,537
  16,788,104
  16,788,197
  16,788,395
  16,788,755
  16,789,545
  16,789,596
  16,789,603
  16,789,684
  16,789,775
  16,789,810
  16,790,071
  16,790,205
  16,790,434
  16,791,383
  16,792,070
  16,792,087
  16,792,103
  16,793,401
  16,793,739
  16,794,315
  16,794,884
  16,794,886
  16,795,002
  16,795,443
  16,795,608
  16,796,075
  16,796,083
  16,796,378
  16,797,693
  16,797,932
  16,797,948
  16,798,644
  16,798,782
  16,798,895
  16,799,095
  16,799,101
  16,799,184
  16,799,540
  16,799,548
  16,799,578
  16,799,604
  16,799,637
  16,799,729
  16,799,747
  16,799,772
  16,799,871
  16,799,959
  16,799,996
  16,800,107
  16,800,156
  16,800,223
  16,800,272
  16,800,281
  16,800,367
  16,800,444
  16,800,457
  16,800,520
  16,800,556
  16,800,595
  16,800,691
  16,800,702
  16,800,835
  16,800,838
  16,800,970
  16,800,973
  16,801,014
  16,801,402
  16,801,549
  16,801,714
  16,801,913
  16,801,959
  16,802,041
  16,802,047
  16,802,067
  16,802,225
  16,802,421
  16,802,426
  16,802,669
  16,803,330
  16,803,349
  16,803,439
  16,803,577
  16,803,820
  16,803,913
  16,803,980
  16,804,354
  16,804,532
  16,804,597
  16,804,708
  16,804,836
  16,804,929
  16,804,976
  16,805,193
  16,805,288
  16,805,534
  16,806,036
  16,806,164
  16,806,393
  16,806,463
  16,809,091
  16,809,259
  16,809,604
  16,809,606
  16,809,608
  16,810,114
  16,810,310
  16,810,534
  16,810,707
  16,810,775
  16,811,175
  16,811,776
  16,811,880
  16,811,972
  16,811,978
  16,812,181
  16,812,925
  16,813,315
  16,815,546
  16,815,710
  16,816,939
C
T
12/-
-
C
T
C
-
C
G
T
T
A
A
-
G
A
-
T
A
C
C
C
G
C
T
A
C
T
-
-
T
C
A
G
G
T
T
A
A
T
T
A
T
A
A
7
T
C
2
C
T
3
T
T
T
G
-
4
C
C
G
C
A
-
6
G
T
-
A
C
G
T
A
T
3
A
G
T
G
C
T
A
C
C
T
24
A
G
8/-
6/-
A
13
A
G
A
G
3
6
-
A
G
G
C
C
T
A
C
2
2
T
T
T
C
2
C
A
3
-
-
T
A
C
C
A
A
G
C
T
G
C
A
T
-
T
A
T
A
T
C
G
3
T
C
4/-
-
G
G/8
G/11
C/31
T/16
A/-
-
-
8/-
T
C
2
G
T
T
-
3
3
2
T
-
-
-
C
A
-
T
A
A
C
C
2
A
-
-
T
T
-
T
G
C
T
2
C
T
C
6
A
G
-
A
T
C
C
-
T
-
C
C
G
A
-
C
C
T
-
G
-
C
G
-
T
G
2
A
57
16
C
A
T
T
G
G
2
C
C
G
C
A
G
T
-
-
G
G
-
-
C
A
C
T
G
C
A
-
G
A
A
T
G
G
G
C
-
3
C
A
C
3
-
-
C
T
2/-
2
3
4/-
2
T/-
35
21
T
C
3
T
2/-
4
A
G/2
-
9
A/285
A
C
-
-
C/2
T/-
4/-
2/-
2
2
2
2
T/25
-
C/9
7
T
5
G
2
C
C
3/5
6/-
4/-
A/17
T
-
-
T
G
C
C
A
A
C
T
A
G
-
G
10/-
2/-
6/-
-
G
10
G
-
A
2
2
G
C
12/-
C
-
T
G
T
G
2
C
T/7
G/A
A/5
T
A
-
2
3
C
A
A
-
C/-
G
2
T
-
A
C
T
A
24/-
C
C
T
A
C
A
C
A
A
C
G
A
T
T
A
A
G
C
2
A
A
G
G
-
A
G
T
G
-
-
11/9
T
A
T
G
C
C
G
C
2
G
C
2
A
T/5
8/-
T/26
C
G
C
A
-
G
-
C
T
C
T
T
G
C
A
4
6
C
C
A
C/3
-
G
C
T
-
-
G
A
T
T
A
3
A
C
-
T
G
A
-
4/-
2/-
T
G
-
A
C
G
T
-
-
G/C
69/-
A
T
T
-
T
T
C
A
-
T
G
C
T
A
G
G
G
A
A
G
C
C
T
A
G
C
C
A
2
3
T
T
A
T
C
A
-
G
2
A
G
2
A
-
T
G
G
A
A
G
A
T
-
G
T
A
G
A
C
A
C
C
A
G
A
A
G
-
-
3
-
T
A
T
-
-
C
T
T
-
-
T
T
G
2
A
G