Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 208,063 (bp)   Positions: 421
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.0
.502
.004
.007
.962
.998
.038
.003
.002
.037
.04
.0
.0
.008
.969
.864
.02
.978
.975
.002
.003
.027
.0
.003
.03
.0
.001
.001
.01
.005
.008
.003
.003
.001
.002
.241
.041
.004
.001
.01
.0
--
.0
.997
.01
.011
.018
.006
.008
.007
.162
.003
.493
.173
.185
--
--
--
--
--
--
.239
.127
.036
.03
.018
.044
.745
.749
.0
.007
.034
--
--
.001
.0
.017
.002
.152
.441
.0
.002
.061
.109
.0
.0
.0
.0
.0
.08
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.016
.007
.0
.085
.02
.001
.965
.777
.781
.102
.0
.0
.0
.002
.053
.003
.005
.014
.005
.0
.002
.0
.015
.024
.0
.001
.001
.0
.001
.005
.0
.274
.0
.0
.002
.001
.0
.005
.009
.003
.0
.001
.006
.002
.029
.03
.197
.196
.08
.076
.015
.004
.391
.106
.015
.007
.001
.01
.013
.19
.442
.017
.0
.967
.03
.188
.05
.007
.006
.038
.178
.171
.043
.003
.109
.0
.014
.293
.001
.783
.039
.034
.019
.001
.005
.004
.075
.317
.014
.0
--
.206
--
.0
.049
.001
.004
.0
.007
.001
.0
.012
.002
.072
--
--
--
--
--
.005
.004
--
--
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.025
.009
.001
.312
.087
.0
.519
.665
.003
.066
.009
.215
.323
.077
.035
.003
.209
.001
.0
.0
.005
.007
.003
.002
.001
.003
.001
.004
.169
.001
.001
.018
.003
.001
.001
.167
--
.001
.0
.0
.05
.0
--
.15
.012
.044
.728
.037
.002
.095
.006
.626
.944
.0
.062
.021
.0
.0
--
.019
.033
.001
.965
.996
.995
.0
.001
.028
.079
.012
.412
.0
.001
.0
.211
.002
--
--
--
.072
.003
.039
.036
.008
.002
.001
.001
.004
.004
.01
.0
.004
.021
.0
.001
.009
.045
.003
.018
.005
.009
.002
.011
.002
.004
.0
.0
.0
.0
.089
.001
.012
.024
.001
.0
.033
.001
.0
.029
.001
.585
--
.049
.001
.045
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.003
.095
.055
--
--
.097
.999
.002
.008
.0
.01
.001
.001
.0
.001
.001
.002
.002
.001
.004
.005
.979
.0
.004
.0
.0
.001
.0
.002
.443
.118
.009
.286
.027
.001
.012
.114
.499
.058
.031
.003
.001
.006
.0
.001
.005
.001
.007
.002
.013
.001
.016
.03
.102
.002
.002
.487
.653
.029
.003
.941
.043
.001
.372
.762
.97
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102552122
LOC102552122
LOC102552122
LOC102552122
LOC102552122
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
Sh3pxd2a
A
A
C
A
G
C
A
A
C
C
C
G
10
A
T
C
C
A
A
C
3
A
C
C
C
G
G
C
T
C
G
T
C
A
C
G
C
T
A
A
C
A
C
A
G
G
G
2
T
G
T
A
T
T
A
C
C
C
G
4
A
A
G
G
T
C
A
G
3
T
4
A
A
C
16
14
T
C
C
T
A
T
T
A
T
G
A
C
A
T
C
C
C
C
C
A
A
C
T
A
T
C
T
A
A
T
22
2
2
6
A
T
A
A
C
C
A
A
G
G
A
T
A
G
A
G
C
G
A
C
G
G
T
A
4
A
C
A
2
T
A
T
A
C
G
T
A
37
2
G
T
2
A
G
T
T
C
G
9
G
G
T
T
C
T
A
G
2
C
2
C
C
G
6
C
G
3
C
C
A
4
3
T
2
T
C
8
10
8
T
A
G
T
A
T
A
C
G
C
G
C
A
A
A
T
A
A
T
A
8
4
T
2
G
A
A
T
G
A
G
2
26
30
C
A
T
C
G
G
C
G
C
T
A
C
C
T
2
C
5
A
C
T
C
A
C
G
A
A
T
G
A
A
T
G
C
A
G
G
G
12
T
A
T
20
A
C
A
G
A
T
T
T
C
C
T
G
T
5
A
A
2
G
G
T
A
C
C
A
A
G
2
A
G
C
8
G
C
G
T
2
A
A
T
G
2
C
G
A
A
G
C
C
G
A
C
C
16
14
2
T
G
A
T
G
C
A
G
C
A
A
G
T
G
G
12
C
C
G
A
G
C
C
A
G
G
T
A
G
G
T
C
3
T
T
C
C
T
C
C
C
G
C
C
A
3
G
C
T
A
C
A
C
A
C
A
T
A
G
A
A
C
T
C
A
G
A
2
G
A
A
C
G
G
A
C
G
C
T
T
T
A
4
G
G
A
A
A
A
C
G
C
A
A
C
C
G
18
T
A
C
  274,471,355
  274,471,759
  274,473,373
  274,475,875
  274,477,425
  274,477,457
  274,477,884
  274,478,310
  274,480,037
  274,480,735
  274,480,759
  274,480,988
  274,481,251
  274,481,832
  274,483,634
  274,484,162
  274,484,324
  274,484,330
  274,485,829
  274,486,368
  274,486,369
  274,487,708
  274,488,725
  274,488,884
  274,488,921
  274,489,114
  274,489,426
  274,489,614
  274,490,007
  274,490,142
  274,490,540
  274,491,866
  274,492,907
  274,493,235
  274,493,279
  274,494,207
  274,494,789
  274,495,477
  274,495,875
  274,496,594
  274,496,605
  274,498,310
  274,500,068
  274,500,385
  274,501,807
  274,502,714
  274,503,324
  274,503,545
  274,503,795
  274,503,908
  274,505,006
  274,505,394
  274,505,620
  274,505,704
  274,505,842
  274,505,889
  274,505,924
  274,505,990
  274,506,020
  274,506,042
  274,506,057
  274,506,151
  274,506,239
  274,506,385
  274,506,407
  274,507,063
  274,507,159
  274,507,217
  274,507,225
  274,507,461
  274,507,462
  274,508,177
  274,508,272
  274,508,493
  274,508,516
  274,508,518
  274,508,761
  274,509,158
  274,509,285
  274,509,341
  274,510,012
  274,510,015
  274,510,498
  274,511,480
  274,512,710
  274,512,821
  274,513,480
  274,513,844
  274,514,306
  274,514,541
  274,514,998
  274,515,200
  274,515,344
  274,515,406
  274,515,905
  274,515,955
  274,515,975
  274,516,181
  274,516,739
  274,516,830
  274,517,108
  274,517,494
  274,517,846
  274,518,387
  274,518,456
  274,518,529
  274,519,122
  274,519,163
  274,519,180
  274,519,499
  274,519,855
  274,519,923
  274,520,348
  274,520,710
  274,520,761
  274,520,860
  274,520,959
  274,520,994
  274,521,122
  274,521,296
  274,521,385
  274,521,403
  274,521,539
  274,522,020
  274,522,423
  274,523,606
  274,525,548
  274,526,569
  274,526,616
  274,528,317
  274,530,221
  274,530,820
  274,531,126
  274,531,407
  274,534,859
  274,536,538
  274,536,978
  274,537,112
  274,537,138
  274,537,140
  274,537,279
  274,537,860
  274,538,077
  274,538,149
  274,538,298
  274,538,648
  274,538,701
  274,538,704
  274,538,882
  274,538,961
  274,538,999
  274,539,163
  274,539,242
  274,539,595
  274,540,314
  274,540,860
  274,541,224
  274,541,306
  274,541,380
  274,541,410
  274,541,422
  274,541,560
  274,541,960
  274,542,810
  274,544,140
  274,545,087
  274,545,298
  274,546,044
  274,547,906
  274,548,668
  274,549,088
  274,549,089
  274,551,128
  274,551,721
  274,551,851
  274,552,694
  274,552,756
  274,552,763
  274,556,276
  274,557,602
  274,558,498
  274,558,499
  274,558,501
  274,559,515
  274,560,860
  274,563,288
  274,563,667
  274,563,765
  274,571,401
  274,577,018
  274,579,882
  274,580,036
  274,582,129
  274,584,917
  274,585,025
  274,585,047
  274,585,412
  274,586,785
  274,586,841
  274,586,893
  274,586,908
  274,587,247
  274,587,427
  274,587,480
  274,587,700
  274,587,709
  274,587,780
  274,587,892
  274,587,957
  274,588,107
  274,588,141
  274,588,279
  274,588,309
  274,589,316
  274,589,750
  274,589,818
  274,589,821
  274,589,910
  274,589,932
  274,590,217
  274,590,260
  274,590,304
  274,590,404
  274,590,837
  274,590,838
  274,591,023
  274,591,134
  274,591,865
  274,591,898
  274,592,128
  274,592,166
  274,592,275
  274,592,428
  274,592,686
  274,592,739
  274,592,880
  274,593,041
  274,593,431
  274,593,646
  274,593,770
  274,593,913
  274,593,986
  274,595,142
  274,595,155
  274,595,207
  274,595,380
  274,595,395
  274,595,918
  274,595,931
  274,595,969
  274,595,993
  274,596,361
  274,596,366
  274,596,404
  274,596,821
  274,597,414
  274,597,555
  274,598,167
  274,599,273
  274,599,475
  274,599,779
  274,600,627
  274,600,629
  274,600,650
  274,600,707
  274,600,990
  274,602,092
  274,602,419
  274,602,584
  274,602,899
  274,603,308
  274,603,766
  274,603,877
  274,604,881
  274,604,966
  274,605,004
  274,606,057
  274,606,823
  274,607,092
  274,607,116
  274,607,871
  274,607,872
  274,637,020
  274,637,434
  274,637,441
  274,637,683
  274,637,945
  274,637,960
  274,638,665
  274,639,165
  274,639,186
  274,640,109
  274,640,213
  274,640,396
  274,641,416
  274,641,539
  274,641,751
  274,642,116
  274,642,247
  274,643,026
  274,644,090
  274,644,093
  274,644,095
  274,644,284
  274,644,777
  274,645,163
  274,645,164
  274,645,609
  274,646,243
  274,647,538
  274,648,338
  274,648,703
  274,648,705
  274,649,213
  274,649,350
  274,649,600
  274,649,647
  274,649,676
  274,649,678
  274,650,225
  274,650,240
  274,650,535
  274,650,552
  274,650,597
  274,650,634
  274,651,008
  274,651,080
  274,651,493
  274,651,951
  274,652,042
  274,652,123
  274,652,434
  274,653,032
  274,653,145
  274,655,144
  274,655,615
  274,655,849
  274,656,634
  274,657,627
  274,657,688
  274,657,711
  274,657,918
  274,658,419
  274,658,430
  274,658,814
  274,659,963
  274,660,215
  274,660,925
  274,661,044
  274,661,051
  274,661,471
  274,661,509
  274,661,797
  274,662,429
  274,663,513
  274,663,717
  274,663,724
  274,664,069
  274,664,196
  274,664,412
  274,664,524
  274,664,916
  274,665,453
  274,665,471
  274,665,498
  274,665,656
  274,665,755
  274,665,922
  274,665,930
  274,666,032
  274,666,759
  274,666,866
  274,666,897
  274,666,959
  274,666,993
  274,667,111
  274,667,268
  274,667,416
  274,667,419
  274,667,823
  274,667,844
  274,668,137
  274,668,153
  274,669,338
  274,669,496
  274,669,778
  274,669,813
  274,669,963
  274,670,447
  274,670,577
  274,670,975
  274,671,023
  274,671,716
  274,672,655
  274,673,223
  274,673,243
  274,673,378
  274,673,661
  274,673,786
  274,673,789
  274,673,801
  274,673,803
  274,673,836
  274,673,840
  274,673,915
  274,674,187
  274,674,219
  274,674,378
  274,674,856
  274,675,407
  274,675,637
  274,675,928
  274,675,938
  274,676,013
  274,676,543
  274,676,598
  274,676,722
  274,676,778
  274,677,318
  274,677,346
  274,677,482
G
G
T
C
A
T
G
G
7/5
T
T
12
-
2
C
T
T
T
T
C/13
3/-
9
G
T
-
A
A
T
2
T
A
C
-
C
T
C
T
C
T
2
G
G
5
-
-
3
A
2/-
C
A
C
G
C
C
3
A
A
T
2
4/-
A/C
3
C
A
T/60
T
C
-
-
T/7
-
G
G
A
16/-
14/-
G
T
3
C
7
69
10
G
3
A
G
A
G
C
T
T
T
T
11
G
G
T
C
G
A
T
C
G
2
C
-
-
-
-
G
C
G
2
G
A
G
G
A
A
C
C
G
A
G
C
T
A
G
T
C
A
C
G
-
G
3/5
G
-
C
G
C
G
T
A
C
-
-
-
A
C
-
C
A
C
C
A
A
-
3
6
-
C
T
C
A/74
A
2/-
A
-
C/5
A
25
-
G
A
-
A
A
2
4/-
-
T/-
-
7/3
G
8/-
-
-
C
3
A
C
-
C
G
T
A
T
C
10
C
G
G
A
T
C
2
G
-
-
C
-
A
7
G
15
A
7
5
2/-
-
30/-
13
G
C
G
A
A
T
-
A
C
G
T
T
3
-
T
-
C
T
2
T
C
G
A
G
G
C
A
G
C
C
C
T
G
A
A
5
-
-
G
C
-
G
T
A/29
A
G
C
C
6
T
3
11
7
G
-
C
A/2
-
G/25
A
3
G
T
T
G
G
A
-
A/-
A
T
-
C
A
A
C
-
G
G
C
A
2/-
-
A
C
G
A
T
A
11/15
G
T
A
-
14/-
-
C
-
G
C
A
T
G
A
T
G
G
C
G
A
C
-
T
-
4
G
A
G
T
G
C
2
C
7
C
A
C
2
-
C
C
-
T
G
3
3
9/11
A
T
A
G
-
A
A
C
2
G
G
G
G
G
T
A
G
A
2
G
-
A
T
G
C
G
-
-
G
C
7
A
T
G
C/5
A
G
G
C
C
C
-
A
2
5
G
A/3
C
T
A
T
G
G
T
T
A
18/-
C
G
T