Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 2,466 (bp)   Positions: 457
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.001
.002
.001
.001
.002
.01
.038
.072
.998
.961
.997
.118
.349
.0
.002
.003
.001
.153
.004
.135
.004
.02
.013
.145
.05
.002
--
.0
.001
.0
.04
.147
.002
.001
.008
.001
.006
.001
.092
.018
.0
.003
.6
.016
.0
.0
.009
.0
.0
.023
.059
.027
.001
.0
.002
.0
.002
.001
.001
.063
--
.012
.018
.004
.005
.0
.022
.0
.245
.001
.001
.0
.082
.99
.019
.001
.352
.995
.016
.002
.27
.001
.012
.017
.012
.0
.001
.215
.006
.489
.013
.971
.993
.001
.004
.256
.01
.01
.0
.0
.0
.008
.0
.209
.005
.02
.002
.001
.0
.002
.001
.005
.0
.054
.0
.045
.001
.01
.001
.003
.068
.014
--
--
--
--
--
--
.015
.002
.013
.001
.0
.114
.515
.011
.001
.012
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.002
.991
.024
.002
.034
.078
.127
.252
--
.369
.004
.001
.32
1.0
.044
.821
.004
.0
.311
.07
.001
.0
.048
.008
.192
.01
.001
.001
--
.001
.0
.0
.0
.003
.001
.024
.018
.017
.005
.031
.114
.003
.971
.0
.0
.01
.007
.004
.003
.0
.056
.016
--
--
.061
.07
.018
.009
.003
.134
.072
.037
.029
.004
.016
.021
--
--
.003
.016
.01
.028
.006
.014
.081
.007
.008
.029
.084
.002
.006
.037
.0
.002
.002
.002
.002
.019
.22
.001
.006
.065
.559
.604
.007
.001
.778
.95
.001
.001
.03
.048
.096
.012
.027
.009
.004
.42
.0
.0
.027
.095
.141
.265
.019
.018
.032
.06
.023
--
--
--
.362
.008
.003
.034
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.007
.002
.009
.006
.011
.002
.708
--
.014
.009
.048
.065
.12
.183
.004
.22
.164
.009
--
.129
.0
.456
.042
.05
.26
.025
.024
.014
.001
.004
.002
.179
.021
.001
.009
.0
.008
.02
.089
.001
.892
.017
.03
.008
.046
.052
.098
--
--
--
--
--
.034
.008
.339
.059
.019
.067
.0
.086
.001
.196
.003
.0
.0
.014
.037
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.015
.327
.004
.247
.23
.148
.077
.005
.008
.015
.0
.001
.008
.0
.008
.007
.001
.167
.0
.009
.004
.675
.733
.054
.103
--
.005
.047
.002
.003
--
.004
.154
.024
.221
.0
.003
.0
.014
.021
.0
.001
.001
.004
--
.134
--
--
.005
.047
.045
.506
.0
.002
.057
.056
.0
.102
.024
.028
.256
.112
.087
.013
.051
.0
.006
.014
.871
.008
.002
.024
.091
.254
.058
.001
.004
.008
.024
.002
.036
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sema3e
G
T
A
C
A
C
T
C
A
G
A
T
A
T
G
T
T
A
G
C
T
T
C
A
G
A
T
T
T
T
A
G
G
G
A
A
T
A
C
C
T
T
C
G
T
C
C
A
G
C
A
C
C
A
A
T
C
G
A
A
G
G
T
A
C
A
C
C
C
T
G
C
T
G
C
G
A
G
G
A
C
A
C
A
T
T
T
T
A
C
A
G
G
T
C
C
C
A
G
C
G
T
G
G
A
T
C
T
T
C
A
T
A
A
C
C
C
C
T
T
A
G
T
A
A
C
C
C
A
A
A
A
G
C
G
C
C
A
C
A
T
T
G
A
G
G
C
A
A
G
G
G
T
G
T
A
A
G
G
A
C
T
C
A
T
G
C
G
G
12
G
T
T
A
A
A
10
T
C
G
G
T
C
T
C
C
T
G
G
G
7
C
T
C
G
A
G
A
A
A
T
C
C
T
A
A
T
T
C
G
C
C
G
A
G
G
A
C
A
A
T
A
A
A
A
T
C
T
C
A
C
G
C
T
G
A
A
C
G
G
T
A
T
A
T
T
T
6
C
G
C
4
C
4
T
G
A
C
G
G
A
C
C
G
A
A
A
A
C
T
A
A
A
T
T
T
A
C
2
G
2
A
G
A
T
C
T
T
A
G
G
C
A
C
T
A
6
G
G
A
C
A
G
T
T
T
C
G
T
G
A
G
G
T
A
A
T
C
C
T
C
G
T
T
A
C
A
T
T
A
C
C
C
G
G
T
G
C
A
A
T
A
A
C
T
G
A
G
T
A
G
T
T
G
G
A
C
A
T
G
T
G
G
C
G
C
11
C
T
A
C
T
T
C
G
G
G
C
A
A
G
T
C
A
T
A
T
C
A
T
C
G
G
G
G
A
A
T
A
G
G
G
G
A
G
T
A
A
13
A
C
C
C
A
C
A
G
T
A
C
A
A
T
T
T
4
T
T
G
G
G
A
A
A
A
C
A
6
C
G
C
C
2
T
A
A
C
A
G
T
T
A
G
T
A
G
C
  17,288,512
  17,288,619
  17,288,622
  17,288,723
  17,288,768
  17,288,813
  17,288,880
  17,289,639
  17,289,649
  17,289,897
  17,289,908
  17,290,421
  17,291,045
  17,291,098
  17,291,405
  17,291,406
  17,291,447
  17,291,619
  17,291,704
  17,291,770
  17,292,347
  17,292,943
  17,293,399
  17,293,434
  17,293,634
  17,293,854
  17,293,894
  17,294,241
  17,295,107
  17,295,391
  17,295,393
  17,296,035
  17,296,511
  17,297,046
  17,297,138
  17,297,446
  17,297,475
  17,297,518
  17,297,549
  17,297,834
  17,297,869
  17,297,964
  17,298,027
  17,298,091
  17,298,277
  17,298,308
  17,298,479
  17,298,882
  17,298,903
  17,298,996
  17,299,371
  17,299,717
  17,300,336
  17,300,396
  17,300,397
  17,300,405
  17,300,906
  17,301,405
  17,301,759
  17,302,041
  17,302,815
  17,303,022
  17,303,178
  17,303,402
  17,304,006
  17,304,128
  17,304,239
  17,304,308
  17,304,325
  17,304,376
  17,304,420
  17,304,453
  17,304,586
  17,304,633
  17,304,738
  17,305,126
  17,305,492
  17,305,542
  17,305,941
  17,306,084
  17,306,115
  17,306,391
  17,306,494
  17,306,656
  17,306,758
  17,306,911
  17,306,985
  17,307,039
  17,307,174
  17,307,195
  17,307,302
  17,307,315
  17,307,358
  17,307,446
  17,307,680
  17,307,750
  17,309,460
  17,309,703
  17,309,728
  17,310,002
  17,310,131
  17,310,211
  17,310,265
  17,310,700
  17,311,232
  17,311,367
  17,311,384
  17,311,482
  17,311,597
  17,311,649
  17,311,669
  17,311,705
  17,311,788
  17,311,794
  17,311,818
  17,312,254
  17,312,270
  17,312,359
  17,312,808
  17,312,849
  17,312,933
  17,313,061
  17,313,099
  17,313,150
  17,313,209
  17,313,492
  17,313,624
  17,313,627
  17,313,694
  17,315,249
  17,315,373
  17,315,416
  17,315,450
  17,315,584
  17,315,650
  17,315,724
  17,315,873
  17,316,046
  17,316,059
  17,316,065
  17,316,323
  17,316,647
  17,316,675
  17,317,038
  17,317,086
  17,317,225
  17,317,272
  17,317,296
  17,317,309
  17,317,375
  17,317,599
  17,317,662
  17,317,892
  17,317,934
  17,318,079
  17,318,347
  17,318,351
  17,318,358
  17,318,378
  17,318,437
  17,318,583
  17,318,885
  17,319,007
  17,319,064
  17,319,229
  17,319,278
  17,319,470
  17,319,559
  17,319,932
  17,320,627
  17,320,638
  17,320,757
  17,320,812
  17,320,979
  17,321,710
  17,321,995
  17,322,175
  17,322,257
  17,322,456
  17,323,006
  17,323,571
  17,324,157
  17,324,158
  17,324,190
  17,325,428
  17,325,443
  17,325,480
  17,325,483
  17,325,484
  17,325,550
  17,326,426
  17,326,454
  17,326,577
  17,327,436
  17,327,601
  17,327,804
  17,327,952
  17,328,009
  17,328,150
  17,328,207
  17,328,364
  17,328,612
  17,328,952
  17,329,339
  17,329,389
  17,329,408
  17,329,655
  17,329,723
  17,329,806
  17,329,826
  17,330,048
  17,330,055
  17,330,128
  17,330,158
  17,330,193
  17,330,204
  17,330,237
  17,332,717
  17,332,743
  17,332,848
  17,332,873
  17,333,116
  17,333,152
  17,333,189
  17,333,281
  17,333,313
  17,333,350
  17,333,351
  17,333,361
  17,333,651
  17,333,968
  17,334,392
  17,334,706
  17,334,754
  17,334,788
  17,335,136
  17,335,481
  17,335,533
  17,335,667
  17,335,694
  17,336,012
  17,336,281
  17,339,262
  17,339,385
  17,339,668
  17,339,902
  17,340,047
  17,340,241
  17,340,263
  17,340,484
  17,340,926
  17,341,200
  17,341,269
  17,341,523
  17,341,537
  17,341,559
  17,341,583
  17,341,645
  17,342,144
  17,342,253
  17,342,489
  17,342,878
  17,342,977
  17,344,161
  17,344,752
  17,344,863
  17,344,864
  17,345,445
  17,346,094
  17,346,099
  17,346,511
  17,346,536
  17,346,544
  17,346,924
  17,347,593
  17,349,015
  17,349,111
  17,349,739
  17,349,796
  17,349,825
  17,349,838
  17,349,839
  17,350,637
  17,350,800
  17,350,932
  17,350,933
  17,350,938
  17,351,474
  17,351,861
  17,352,008
  17,352,058
  17,353,060
  17,353,070
  17,353,150
  17,353,206
  17,353,219
  17,353,645
  17,354,137
  17,354,271
  17,354,718
  17,354,763
  17,355,012
  17,355,488
  17,355,815
  17,355,936
  17,356,784
  17,356,948
  17,357,361
  17,359,134
  17,360,010
  17,360,227
  17,360,299
  17,360,355
  17,360,503
  17,360,617
  17,360,739
  17,361,587
  17,362,024
  17,362,034
  17,362,221
  17,362,523
  17,363,383
  17,363,673
  17,363,869
  17,364,000
  17,364,051
  17,364,115
  17,364,187
  17,364,570
  17,364,612
  17,364,928
  17,365,124
  17,365,324
  17,365,423
  17,365,635
  17,365,650
  17,365,700
  17,366,041
  17,366,048
  17,366,696
  17,366,733
  17,366,786
  17,366,933
  17,367,125
  17,367,223
  17,367,408
  17,367,727
  17,368,293
  17,368,363
  17,368,527
  17,369,148
  17,369,501
  17,369,768
  17,370,070
  17,370,294
  17,370,469
  17,370,527
  17,370,598
  17,370,599
  17,370,727
  17,370,965
  17,372,258
  17,372,263
  17,372,338
  17,372,391
  17,372,550
  17,372,556
  17,372,558
  17,372,587
  17,372,759
  17,372,972
  17,373,215
  17,373,281
  17,373,336
  17,373,480
  17,373,493
  17,373,633
  17,373,772
  17,373,902
  17,373,987
  17,373,988
  17,373,993
  17,374,091
  17,374,583
  17,374,716
  17,375,281
  17,375,471
  17,375,475
  17,376,021
  17,376,160
  17,376,496
  17,376,814
  17,377,383
  17,377,466
  17,377,696
  17,378,255
  17,378,423
  17,379,852
  17,379,862
  17,379,946
  17,380,067
  17,380,126
  17,386,136
  17,386,191
  17,387,699
  17,387,962
  17,388,062
  17,388,141
  17,388,172
  17,388,437
  17,388,672
  17,389,333
  17,389,600
  17,390,243
  17,390,356
  17,391,160
  17,391,407
  17,391,582
  17,391,601
  17,391,711
  17,391,955
  17,393,146
  17,394,525
  17,395,608
  17,397,304
  17,397,505
  17,397,560
  17,399,831
  17,401,115
  17,401,586
  17,402,224
  17,402,225
  17,402,755
  17,403,489
  17,403,503
  17,403,611
  17,404,044
  17,404,078
  17,404,083
  17,404,526
  17,406,049
  17,406,388
  17,407,293
  17,408,301
  17,408,333
  17,408,508
  17,408,551
  17,408,564
  17,408,576
  17,408,634
  17,408,872
  17,409,154
  17,409,160
  17,409,165
  17,410,451
  17,410,798
  17,560,872
G/A
2
T
G
A/G
T
G
2
18
A
G
T/C
C
T/A
T
G
A
G
A
T
T/C
C
T
A/G
2
G
C
-
C
T/2
A/4
A
A
A
T
C
C
G
T
T
C
C
A
A
C
C/T
T
-
G/T
C/T
A/G
C/T
C/A
A/G
A/G
T/G
C/T
G/T
A/T
A/G
G/C
G/11
T/C
5
C/T
G
C/T
C/T
C/T
C
A
G
C
A
C/T
A
G
G/A
G/A
2
C/T
A/G
C/G
A/T
C
T/5
T/C
T/G
A/-
C/-
A/G
A
G/2
T/C
C/T
C/T
T
A/T
G/2
C/T
G/A
T/C
G/A
G/C
A/G
T/C
T
T/A
T/C
C/2
A/G
T/C
A/T
A/G
C/A
C/T
C/2
C/T
T/G
C
A/G
G/A
T/G
G
G
C/T
C/A
C/T
A/G
A/T
A/T
A/C
G/A
C/T
G/A
C/G
C/T
T
C/T
A/T
T/C
G
G/2
A/G
G/A
A
C/A
A/G
A/G
G/T
G/A
G/T
T/G
G/A
T/C
A/G
A/G
G/A
G/T
A/G
C/A
T/6
3
A/G
T/C
G/A
C/T
G/C
G/A
12/-
G/3
T/C
T/G
A/2
A/C
A/C
10/-
T/C
C/T
G/A
G/A
T/C
C/T
T/C
C/T
C/A
T/G
G/A
G/A
G/A
7/-
T
T/3
C/T
G/A
A/G
G/T
A/-
A/-
A/T
T/C
C/3
C/T
T/C
A/G
A/2
T/2
T/C
C/T
G/A
C/T
C/T
G/T
A/G
A
G/T
G
C/T
A/G
A/4
T/G
A/3
A/G
A/C
A/G
T/C
C/G
T/G
C/A
A/-
C/T
G/C
C/T
T/A
G/A
A/G
A/C
C/T
G/A
G/A
T/C
A/T
C
2
A
G
C
6/-
C/T
G/T
C/A
4/-
C/T
-
T/G
G/A
A/G
C/7
G/A
A
G
C/A
C/T
G/A
A/G
-
A/T
G
C/A
T/C
A/C
-
A/T
C
T/A
T/2
A/C
C/T
-
G/A
2/-
A/G
C
A/C
T/G
C/G
C
C
G
A
A
T
C
T
C
G
-
G/A
A
G
C/A
G
A
G
-
3
-
A
3
A
A/-
T
G/A
T/G
A/T
A/G
T/-
C/T
C/T
T/-
C/A
G/A
T/G
T/C
A/G
C/T
A/-
T/C
T/9
A/G
C/3
C/-
C/T
C
G/T
T/C
G/C
C/T
G
2
T/2
C
A/C
C/G
T/C
G/A
A/G
G/2
T/A
A/-
G/A
T/C
T/G
G/-
G/C
A/T
C/T
A/2
T/2
G/2
T/A
G/C
G/C
C/A
G/T
C/T
11/-
C/A
T/C
A/-
C/A
T/C
A
C/A
G/A
G/A
G/T
C/T
A/G
A/G
G/A
T/C
C/T
A/G
C
A/C
T/A
C/T
A/G
T/A
A
G/T
G/A
G/A
G/2
A/G
A/G
T/G
C
G/A
G/C
G/2
G/T
A/G
2
T/5
A/3
A/G
13/-
A/G
C/T
C/T
C/A
A/G
C/G
A/T
G/T
T/C
A/G
C/T
A/G
C
A
C
C
4/-
C
T/2
A
G/A
A
G
G
G
G
T
A/4
6/-
C/G
G/A
C/T
C/A
-
T/C
A/G
C
A
A/G
G/C
C
G
A/G
G/A
T/-
A/C
G/2
T