Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 88,891 (bp)   Positions: 332
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.179
.99
.094
.0
.955
.287
.003
.025
.002
.009
.118
.002
.325
.114
.007
.019
.064
.146
.082
.44
.003
--
--
--
--
--
--
.058
.005
.047
.001
.0
.164
.301
.018
.018
.033
.007
.006
.54
.088
.017
.004
.081
.195
.026
.0
.016
.018
.022
.023
.017
.088
.053
.281
.04
--
.107
.018
.016
.278
.426
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.143
--
.039
.025
.181
.097
.032
.013
.004
.0
.074
.067
--
.006
.001
.005
.989
.0
.066
.094
.091
.028
.347
.032
--
--
--
--
.056
.022
.147
.063
.002
.002
.402
.082
.022
.042
--
.277
.013
.313
.357
.063
.039
.144
.012
.166
.155
.22
.275
.116
.089
--
.05
.031
.063
.026
--
--
--
.117
.144
.032
.003
.016
.146
.085
.005
.086
--
--
.118
.192
.064
.003
.998
.008
.102
.028
.278
--
--
.632
.481
.003
.011
--
--
.048
.007
.007
.001
.054
.146
.996
.064
.36
.494
.957
.993
.995
.954
.981
.975
.955
.94
.89
.884
.96
.994
.949
.994
.902
.086
.219
.283
.632
.82
.709
.611
.575
.311
.97
.949
.95
.905
.911
.625
.269
.118
.097
.155
.422
.126
.009
.007
.021
.015
.002
.0
.001
.012
--
.051
--
--
.494
.001
.059
.054
.002
.27
.283
.289
.308
--
--
--
.015
.046
.066
.052
.073
.056
.131
.248
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.026
.041
.028
--
--
--
.116
.41
.462
.37
.84
.014
.032
.035
--
--
--
.274
.282
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.01
.038
.042
.058
.082
.969
.029
.002
--
--
--
--
--
--
.001
.548
.005
.001
.08
.019
--
--
--
--
.002
.162
.067
.017
--
--
--
.373
.015
--
.348
.021
.101
.101
.167
.264
.992
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
Scp2
C
A
G
A
C
A
C
G
C
A
C
A
T
G
G
A
T
A
T
G
G
G
G
T
C
G
C
C
A
A
A
G
T
10
G
A
A
C
A
C
G
A
A
T
G
C
C
3
T
9
4
3
6
G
T
A
T
C
T
A
T
7
A
A
T
T
A
T
A
A
A
G
T
T
C
A
G
G
G
G
4
T
5
T
13
A
C
A
A
G
C
A
G
A
G
G
C
C
G
T
G
G
C
C
T
T
C
C
4
3
A
C
C
G
T
G
A
A
T
A
A
T
G
G
T
G
T
A
C
T
2
C
G
T
C
C
T
A
C
A
T
C
A
A
C
2
C
G
T
T
2
T
C
G
C
G
14
C
G
G
G
A
C
A
C
C
C
G
T
T
G
G
A
A
A
A
A
A
G
C
C
G
A
T
A
A
G
G
T
T
T
A
C
A
T
T
A
G
G
A
C
T
A
G
T
A
A
T
G
T
T
G
C
A
T
G
4
A
T
C
C
C
T
3
T
T
12
C
A
A
T
A
C
G
T
C
T
C
T
A
T
G
A
A
G
G
C
C
G
C
4
C
C
G
C
G
T
C
G
A
A
C
4
3
G
A
T
G
G
G
G
C
T
T
T
4
2
A
2
T
T
C
C
4
C
A
T
3
T
T
G
C
2
2
2
T
A
A
A
4
A
G
G
C
A
G
T
C
T
C
T
T
C
T
T
A
C
C
C
C
C
C
A
T
T
A
C
T
A
G
G
G
  131,495,986
  131,496,081
  131,496,130
  131,496,589
  131,497,035
  131,497,659
  131,497,709
  131,498,194
  131,498,220
  131,498,375
  131,498,599
  131,498,758
  131,499,564
  131,500,005
  131,500,083
  131,500,093
  131,500,320
  131,500,539
  131,500,655
  131,501,942
  131,501,983
  131,502,068
  131,502,168
  131,502,682
  131,502,900
  131,502,935
  131,502,941
  131,503,080
  131,503,103
  131,503,197
  131,503,363
  131,503,750
  131,503,885
  131,503,896
  131,503,931
  131,504,107
  131,504,134
  131,504,780
  131,504,781
  131,504,929
  131,504,996
  131,505,130
  131,506,820
  131,506,841
  131,507,132
  131,507,165
  131,507,572
  131,507,706
  131,507,707
  131,507,709
  131,507,713
  131,507,718
  131,508,197
  131,508,422
  131,508,994
  131,509,010
  131,509,233
  131,510,075
  131,510,836
  131,511,031
  131,511,095
  131,511,663
  131,511,979
  131,512,024
  131,512,032
  131,512,063
  131,512,071
  131,512,079
  131,512,087
  131,512,095
  131,512,103
  131,514,222
  131,514,666
  131,514,716
  131,516,840
  131,519,104
  131,519,122
  131,519,693
  131,520,645
  131,520,668
  131,522,129
  131,522,421
  131,522,673
  131,522,784
  131,523,077
  131,523,091
  131,524,078
  131,524,269
  131,524,507
  131,524,664
  131,524,678
  131,524,701
  131,526,581
  131,526,615
  131,527,143
  131,527,819
  131,527,917
  131,527,990
  131,528,092
  131,528,423
  131,528,440
  131,528,525
  131,528,773
  131,529,030
  131,529,099
  131,529,256
  131,529,496
  131,529,615
  131,529,629
  131,529,728
  131,529,880
  131,529,911
  131,530,480
  131,530,484
  131,530,562
  131,530,573
  131,530,683
  131,530,706
  131,531,064
  131,531,107
  131,531,317
  131,531,325
  131,531,334
  131,531,346
  131,531,460
  131,531,757
  131,531,765
  131,531,920
  131,531,960
  131,532,752
  131,532,762
  131,533,185
  131,533,628
  131,533,916
  131,533,941
  131,533,960
  131,533,982
  131,534,064
  131,534,077
  131,534,228
  131,534,355
  131,534,582
  131,534,750
  131,535,022
  131,535,085
  131,535,594
  131,535,657
  131,535,948
  131,536,500
  131,536,709
  131,536,769
  131,537,141
  131,537,448
  131,537,499
  131,537,673
  131,538,438
  131,538,479
  131,538,625
  131,539,272
  131,539,512
  131,539,749
  131,539,784
  131,540,279
  131,540,443
  131,540,528
  131,540,792
  131,540,870
  131,540,899
  131,541,002
  131,541,118
  131,541,201
  131,541,229
  131,541,233
  131,541,251
  131,541,280
  131,541,281
  131,541,303
  131,541,364
  131,541,396
  131,541,562
  131,541,566
  131,541,571
  131,541,589
  131,541,602
  131,541,622
  131,541,702
  131,541,706
  131,541,707
  131,541,713
  131,541,817
  131,541,826
  131,541,838
  131,541,845
  131,541,933
  131,542,096
  131,542,106
  131,542,108
  131,542,125
  131,542,133
  131,542,145
  131,542,152
  131,542,162
  131,542,164
  131,542,209
  131,542,231
  131,542,512
  131,542,528
  131,542,529
  131,542,540
  131,542,547
  131,542,557
  131,542,945
  131,542,948
  131,543,613
  131,556,241
  131,556,375
  131,556,959
  131,559,472
  131,559,540
  131,560,053
  131,560,077
  131,560,078
  131,560,113
  131,560,812
  131,560,822
  131,560,828
  131,560,846
  131,561,146
  131,561,221
  131,561,227
  131,561,365
  131,561,379
  131,561,473
  131,561,499
  131,561,689
  131,561,897
  131,562,241
  131,562,467
  131,563,156
  131,563,294
  131,563,741
  131,563,972
  131,564,038
  131,564,389
  131,564,534
  131,564,625
  131,564,643
  131,564,646
  131,564,705
  131,564,927
  131,565,456
  131,565,511
  131,565,528
  131,565,740
  131,566,101
  131,566,123
  131,566,778
  131,567,163
  131,567,277
  131,567,299
  131,567,899
  131,568,339
  131,568,410
  131,568,411
  131,568,668
  131,568,669
  131,569,044
  131,569,052
  131,569,054
  131,569,058
  131,569,062
  131,569,142
  131,569,150
  131,569,224
  131,569,276
  131,569,305
  131,569,343
  131,569,359
  131,569,363
  131,569,384
  131,569,431
  131,569,456
  131,569,520
  131,569,555
  131,569,564
  131,569,571
  131,569,639
  131,569,654
  131,569,656
  131,569,661
  131,569,669
  131,569,670
  131,569,688
  131,569,689
  131,569,690
  131,570,009
  131,570,184
  131,570,243
  131,570,319
  131,571,176
  131,571,312
  131,571,737
  131,571,918
  131,571,921
  131,571,922
  131,572,575
  131,572,788
  131,573,047
  131,573,122
  131,573,257
  131,573,703
  131,573,751
  131,573,796
  131,573,800
  131,573,831
  131,574,145
  131,574,359
  131,574,368
  131,574,733
  131,575,756
  131,575,913
  131,576,158
  131,578,825
  131,579,030
  131,579,039
  131,580,169
  131,580,385
  131,580,753
  131,581,433
  131,581,451
  131,582,634
  131,584,225
T
A/C
G/A
G
T
G
A
A
T
G
T
G
C
C
C
-
3
G
C
A
C
T
T
C
T
-/4
-
T
G
G
G
A
C
-
A
G
G
T
G
T
A
T
G
C
A
T
T
-
-
-
-
3/-
-
A
A
G
2
T
G
G
G
-
T
A/T
A
T/A
A/T
T/A
A/T
A/T
A/T
A
3
3
G
G
4/5
A
4
G/A
-
T/G
-
-
-
2
2
G
G
A
4/3
-
C
G
A
G/C
C/2
T
A
3
2
A
G
3
C
A
T
A
-
-
G
T
T
A
G
A
-
-
3
G
T
3
A
2
T/G
A
C
G
C/T
-
-
T
C
C
T
T
C
-
C/3
G
C
A
G
7
T
-
-
A
-
G
-
G
T
C
T
A
14/-
3
A
C
A
C
T
C
T
T
T
T
C
C
T
G/T
A/T
G
G
G
G
G
A
C/T
C/T
G/T
G
T/A
G
A/G
2
3
T/C
4
T/G
A/G
C/T
G
T/C
T/C
A/C
G/A
G/A
A/G
C/T
C
C
G/A
C
G
G
T/C
G/A
T/C
T/C
C
C/2
G
C
T
-
G
2
A
T
G
C
-
T/G
T/G
-
T
4
A/-
A
-
T
A
A
G
C
T
T/A
G
C
T
G
C
A
10
C/T
C/T
A
A
-
A
T
T
C/T
G/A
C
C/T
A
T
C
T
-
3/-
T
T
T/C
C
G/C
G/C
G/C
C/3
G
C
3
4/-
2/-
A/3
2/-
3
A
T
C/3
4/-
C/T
A/G
-
3/-
-
-
-
-
2/-
2/-
2/-
C
-
G
G
-
T
A
4
C/T
A/3
A
C
5
C
T
C
C
T
C
C
G
T
T
T
A
3
2
T
-
-
G
5
3/5
-
G/-
G/2
C