Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 101,685 (bp)   Positions: 233
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.0
.0
.008
.995
.93
.006
.001
.006
.0
.032
.002
.0
.069
.311
.026
.002
.0
.048
.794
.191
.0
.0
.0
.015
.01
.006
.021
.0
.128
--
--
--
.002
.041
.008
.037
.053
.363
.0
.005
.01
.02
.015
.04
.037
.074
.001
.142
.0
.178
.028
.0
.0
.0
.025
.717
--
--
--
--
.032
.004
.009
.0
.0
.046
.0
--
--
--
.129
.11
.021
.007
.002
--
--
.048
.0
.006
--
--
.661
.0
.999
.0
.848
.018
.008
.0
.001
.484
.002
.054
.0
.004
.002
.001
.0
.003
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.042
.101
.001
.008
.001
.0
.001
.135
.78
.002
.002
.001
.0
.034
.014
.4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.078
.446
.103
.008
.027
.08
--
.063
.01
.0
.005
.013
.078
.006
.0
.0
.004
.003
.009
.019
.002
.22
.183
.027
.112
--
.009
.006
.0
.0
.001
.006
.004
.0
.006
.006
.001
.002
.002
.26
.003
.003
.001
.027
.109
--
--
--
.082
.069
.132
.034
.042
.13
.11
.044
.061
.004
.019
.246
.072
.056
.003
.072
.086
.028
.014
.544
.003
.008
.001
.047
.004
.005
.009
.006
.001
.0
.004
.073
.059
.102
.0
.022
.001
.849
.001
.011
.004
.807
.396
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
Scn7a
T
T
C
G
T
G
G
A
T
A
T
C
G
A
G
C
A
T
A
C
102
G
G
G
T
A
A
C
C
A
C
C
T
A
A
G
C
A
2
C
T
C
G
G
G
G
A
A
T
T
G
A
G
G
C
A
G
A
G
4
C
G
G
G
T
C
A
C
8
T
T
G
A
T
3
G
G
G
G
A
A
G
C
G
A
G
T
A
A
3
T
C
C
C
A
A
C
T
C
C
A
A
A
C
C
C
2
G
A
G
A
C
C
G
C
T
C
G
T
T
C
C
T
A
G
A
T
C
T
C
A
C
G
G
C
A
G
G
A
G
G
G
T
G
C
C
A
G
A
C
C
T
C
G
C
T
C
G
C
T
C
G
T
T
G
A
G
G
A
G
G
A
T
T
C
A
C
C
T
T
C
A
C
C
T
T
C
C
A
T
C
T
C
G
G
A
G
T
T
C
G
T
G
G
C
A
A
G
G
A
T
A
3
A
A
A
A
C
A
A
G
T
A
G
11
A
G
C
G
G
C
T
C
  59,396,600
  59,396,726
  59,396,731
  59,396,874
  59,397,707
  59,397,771
  59,398,243
  59,398,358
  59,398,471
  59,398,870
  59,398,888
  59,399,683
  59,399,688
  59,399,715
  59,400,014
  59,400,272
  59,400,688
  59,400,982
  59,401,105
  59,401,186
  59,401,708
  59,402,126
  59,402,356
  59,403,098
  59,403,383
  59,403,508
  59,403,881
  59,403,991
  59,404,162
  59,405,358
  59,406,171
  59,406,287
  59,406,511
  59,407,314
  59,407,843
  59,408,312
  59,408,887
  59,409,345
  59,409,525
  59,409,666
  59,410,262
  59,410,870
  59,412,984
  59,413,041
  59,413,230
  59,413,487
  59,413,526
  59,414,093
  59,415,305
  59,416,905
  59,417,271
  59,418,430
  59,418,493
  59,418,645
  59,418,753
  59,418,771
  59,419,732
  59,424,741
  59,424,848
  59,425,507
  59,425,786
  59,426,598
  59,426,997
  59,428,118
  59,428,453
  59,431,692
  59,431,966
  59,432,302
  59,436,896
  59,437,961
  59,438,617
  59,446,515
  59,446,526
  59,447,177
  59,447,789
  59,448,465
  59,449,081
  59,452,305
  59,456,422
  59,456,972
  59,458,307
  59,458,973
  59,460,513
  59,460,907
  59,462,395
  59,462,751
  59,462,998
  59,463,315
  59,463,349
  59,463,363
  59,463,392
  59,463,415
  59,463,619
  59,463,645
  59,463,673
  59,464,568
  59,466,553
  59,467,973
  59,467,989
  59,468,880
  59,469,325
  59,470,088
  59,470,992
  59,470,997
  59,472,829
  59,473,225
  59,473,778
  59,474,216
  59,474,280
  59,475,025
  59,475,719
  59,475,793
  59,476,071
  59,476,369
  59,476,732
  59,477,021
  59,477,054
  59,477,278
  59,477,787
  59,478,098
  59,478,106
  59,478,502
  59,478,714
  59,478,774
  59,478,989
  59,479,072
  59,479,120
  59,479,227
  59,479,449
  59,479,478
  59,479,884
  59,480,182
  59,480,301
  59,480,312
  59,480,323
  59,480,340
  59,480,422
  59,480,436
  59,480,490
  59,480,509
  59,480,593
  59,481,083
  59,481,101
  59,481,216
  59,481,299
  59,482,051
  59,482,264
  59,482,671
  59,483,163
  59,483,658
  59,483,685
  59,483,765
  59,483,975
  59,484,521
  59,484,621
  59,484,622
  59,484,956
  59,484,993
  59,485,182
  59,485,815
  59,485,820
  59,486,458
  59,486,464
  59,486,537
  59,486,667
  59,486,897
  59,487,449
  59,487,609
  59,487,701
  59,487,709
  59,487,930
  59,488,041
  59,488,445
  59,488,600
  59,488,897
  59,489,142
  59,489,395
  59,489,539
  59,489,935
  59,490,195
  59,490,301
  59,490,444
  59,490,544
  59,490,622
  59,490,906
  59,490,973
  59,490,985
  59,491,041
  59,491,308
  59,491,317
  59,491,355
  59,491,399
  59,491,421
  59,491,465
  59,491,617
  59,491,712
  59,491,789
  59,491,794
  59,491,976
  59,492,112
  59,492,166
  59,492,185
  59,492,208
  59,492,547
  59,492,715
  59,492,831
  59,492,885
  59,493,103
  59,493,150
  59,493,620
  59,493,927
  59,494,070
  59,494,160
  59,494,276
  59,494,562
  59,494,724
  59,494,877
  59,494,878
  59,495,207
  59,495,371
  59,495,395
  59,495,403
  59,495,425
  59,495,643
  59,496,561
  59,496,619
  59,496,683
  59,496,744
  59,496,755
  59,496,773
  59,496,804
  59,496,880
  59,496,932
C
C
T
C
C
C
G/C
G
C
T
C
T
T
2
T
T
G
3
2
A
-
T
A
C
A
A/C
G
T
A
2
T
C/T
C
G
G
A
T
G
-
T
C
A
-
A
G/2
2
G
G
C
C
T
G
T
C
T
2
2
C
A
-
C/G
2
T
A
A
C/2
A/G
T
-
5
C
A
-
C
3/-
A
A
T
T
T
G
A
2
G/2
-
A
G
-
G
-
C
3
T
T
G
G
G
-
-
T
T
-
G
C/T
T
5
-
A
A/-
C
G
T
T
A
A
-
G
A
C
G
T
C/T
G
G
T
G
T/C
T
C
T
G
G
A
G/3
T
C
-
G/A
-
2
-
A
C
A
A
T
G
T
G
T
T
G
T
A
G
C
C/T
A
A
2
C/T
T
C
-
A
G
T
A
T
A
A
T
C
C
T
T
T
T
C
-
A
G
T
T
-
C
T
C/T
G
-
G
C
T
A
A
T
T
A
G
C/T
C
A
A
T
G
G
G
T
G/A
G
C
A/T
-
T
2
G
6
11
G
C
A
C
A/-
T
-
G
A
G
A
A
T
-
A