Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly Rnor_5.0

Conservation

Genes ( + )

Genes ( - )

Rnor 5.0

LE/OrlBarth (UDEL)

--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.046	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.96	.997	1.0	.999	.994	.996	.724	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.065	.07	.807	.822	.988	.939	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.0	.015	.011	.009	.09	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	.159	1.0	1.0	.001	.0	.177	.984	.005	.004	.679	.001	.005	.074	.04	.002	.018	.011	.025	--	.003	.008	.412	.031	.0	.001	.302	.025	.001	.003	.0	.004	.001	.025	.265	.001	.006	.001	.002	.008	.124	.024	.109	.901	.003	.0	.001	.548	.552	.004	.314	.0	.007	.323	.915	.0	.0	.02	.002	.0	.002	.012	.0	.084	.014	.022	.005	.001	.004	--	--	--	--	--	.001	.006	.197	.093	.01	--	--	--	--	.0	.302	.538	.001	.011	.004	.005	.003	1.0	.869	.076	.025	.029	.053	.87	.435	.0	.0	.001	.002	.041	.002	.0	.002	.015	.007	.018	.001	.0	.002	.0	.006	.219	.01	.0	.551	.109	.001	.004	.001	.012	.236	.593	.87	.861	.007	.002	.004	.039	.017	.008	.063	.041	.503	.98	.143	.001	.442	.04	.422	.897	.706	.0	.013	.0	.0	.0	.085	.0	.001	.015	.005	.001	.001	.009	.006	.003	.001	.01	.015	.003	.011	.013	.003	.003	.002	.006	.002	--	--	.046	.001	.001	.001	.003	.494	.505	.001	.002	.009	.004	.007	.04	.383	.101	.258	.906	.001	.274	.001	.293	.269	.001	.052	.035	.381	.003	.013	.0	.158	.001	--	--	--	--	--	.054	.091	.109	.006	.0	.015	.005	.002	.005	.104	--	--	--	--	--	--	.181	.057	.016	.002	.0	.002	.028	.001	.075	.01	.011	--	--	.098	.281	.08	.961	.007	.149	.004	.002	.001	.012	.027	.09	.04	.048	.039	.002	.201	.066	.141	.005	.001	.012	.069	.057	.173	.002	.002	.005	.0	--	.177	.217	.001	.122	.093	.017	.0	.003	.302	.049	.34	.513	.002	.001	.003	.0	.008	--	--	.588	.002	.003	.006	.0	.001	.022	.032	.002	.009	.021	.01	.0	.0	.0	.187	.002	.001	.002	.0	.004	.0	.0	.001	.005	.041	.0	.001	.0	.002	.017	.001	.0	.023	.977	.998	.991	.005	.467	.001	.005	.003	.012	.0	.001	.003	.004
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	Schip1										Schip1										Schip1										Schip1										Schip1										Schip1
G	A	T	A	T	G	G	C	A	G	A	G	T	A	T	A	G	A	A	5	A	G	G	T	A	A	A	T	G	C	G	C	A	G	2	T	G	T	C	C	A	T	C	C	G	G	T	G	A	G	G	C	A	A	A	A	C	T	C	G	G	T	G	G	C	C	A	T	T	T	A	C	T	T	A	C	G	G	A	A	C	G	C	G	A	A	T	G	G	T	G	G	T	G	G	A	G	T	A	G	A	T	C	A	T	C	A	G	A	C	A	A	T	A	A	A	T	T	C	A	T	C	C	G	T	A	G	G	C	2	G	C	G	G	T	G	A	A	T	G	T	A	A	G	A	T	G	C	G	C	A	G	G	G	C	T	A	G	A	G	G	C	A	T	G	C	C	C	C	C	T	T	A	G	C	G	T	G	G	4	T	C	A	C	T	A	C	C	A	A	T	A	A	G	G	T	G	G	G	C	G	T	G	T	G	T	C	C	C	C	T	T	A	G	C	G	T	A	A	C	T	C	A	A	G	C	G	A	A	G	A	C	C	A	A	C	A	G	A	A	T	T	A	T	G	G	G	A	G	G	T	G	3	T	A	C	C	G	T	T	T	C	G	A	C	G	5	A	C	G	T	T	G	T	T	G	G	G	C	G	T	3	G	A	C	A	G	G	A	T	G	G	C	T	C	A	T	6	G	A	T	C	A	3	T	A	G	C	A	G	T	C	A	T	C	G	T	G	T	A	C	G	C	C	G	G	T	A	T	T	C	A	G	A	A	T	G	A	T	A	T	C	A	2	A	A	T	G	T	3	A	G	T	T	C	G	3	A	14	T	C	T	T	A	4	T	A	G	T	T	A	G	C	G	G	C	C	T	A	T	T	A	A	G	C	A	C	C	C	G	A	A	T	T	A	A	A	G	A	A	G	T	A	G	C	C	G	C	G	A	A	G	C	C	A	8	G	A	C	C	T	G	A	C	3	G	C	G	2	G	A	G	G	T	T	C	G	T	C	C	C	T	T	A	T	G	A	A	C	A	G	A	G	C	T	A	C	A	C	G	T	T	G	T	A	G	C	T	G	G	C	G	A	G	G	G	C	T	C	T	A	A	A	C	T	T	A	C	C	C	G	T	C	A	T	T	G	A	C	T	T	G	A	G	A	C	G	A	G	T	C	4	A	G	G	G	T	G	C	A	G	C	G	C	A	A	T	A	C	G	G	G	19	G	T	A	C	A	2	T	G	C	T	T	G	C	T	C	G	G	C	A	G	C
191,615,785	191,615,897	191,615,904	191,615,988	191,616,291	191,616,425	191,616,470	191,616,699	191,616,759	191,617,032	191,617,064	191,617,088	191,617,406	191,617,418	191,618,382	191,618,383	191,618,421	191,618,456	191,618,668	191,618,679	191,618,687	191,618,721	191,618,797	191,618,903	191,618,993	191,619,073	191,619,140	191,619,217	191,619,284	191,619,294	191,619,308	191,619,432	191,619,486	191,619,532	191,619,559	191,619,666	191,619,720	191,619,940	191,619,960	191,620,142	191,620,232	191,620,338	191,620,420	191,620,421	191,620,444	191,620,658	191,620,714	191,620,736	191,620,769	191,620,915	191,621,090	191,621,147	191,621,218	191,621,230	191,621,299	191,621,485	191,621,605	191,621,962	191,623,551	191,623,821	191,624,941	191,625,037	191,625,373	191,625,949	191,626,676	191,628,134	191,629,232	191,629,545	191,629,561	191,629,715	191,629,850	191,629,920	191,629,961	191,629,969	191,629,971	191,630,224	191,630,398	191,630,674	191,630,764	191,630,816	191,630,853	191,630,951	191,631,131	191,631,229	191,631,230	191,631,887	191,632,234	191,632,249	191,632,258	191,632,274	191,632,284	191,632,422	191,632,509	191,632,510	191,632,676	191,632,677	191,632,829	191,632,898	191,633,119	191,633,130	191,633,136	191,633,519	191,633,546	191,633,615	191,633,805	191,633,807	191,633,824	191,633,825	191,634,074	191,634,122	191,634,457	191,634,774	191,634,932	191,635,167	191,635,277	191,635,450	191,635,610	191,635,659	191,635,797	191,635,869	191,635,919	191,635,985	191,636,148	191,636,157	191,636,162	191,636,457	191,637,603	191,637,928	191,638,286	191,638,555	191,639,149	191,640,731	191,640,745	191,640,924	191,641,147	191,641,345	191,641,355	191,641,538	191,641,676	191,641,900	191,642,251	191,642,612	191,642,645	191,643,302	191,643,321	191,643,333	191,643,342	191,643,363	191,643,374	191,643,382	191,643,389	191,643,409	191,643,416	191,643,444	191,643,483	191,643,490	191,643,506	191,643,567	191,643,693	191,643,791	191,643,795	191,643,806	191,644,134	191,644,441	191,644,777	191,644,911	191,645,534	191,645,687	191,646,002	191,646,028	191,646,254	191,646,418	191,646,434	191,646,614	191,646,804	191,646,956	191,647,183	191,647,438	191,647,440	191,647,513	191,647,535	191,647,601	191,647,650	191,647,678	191,647,782	191,647,935	191,647,936	191,648,084	191,648,269	191,648,435	191,648,561	191,648,565	191,648,783	191,648,962	191,648,978	191,649,119	191,649,149	191,649,177	191,649,351	191,649,404	191,649,728	191,650,164	191,650,171	191,650,498	191,650,731	191,650,889	191,651,314	191,651,397	191,651,710	191,651,763	191,651,770	191,651,861	191,651,904	191,651,945	191,652,003	191,652,200	191,652,294	191,652,296	191,652,630	191,652,727	191,652,781	191,653,099	191,653,533	191,653,823	191,654,419	191,654,427	191,654,559	191,654,619	191,654,803	191,654,913	191,655,308	191,656,061	191,656,127	191,656,244	191,656,940	191,657,485	191,657,805	191,657,904	191,658,172	191,658,714	191,659,623	191,659,826	191,660,035	191,660,317	191,660,467	191,660,481	191,660,791	191,660,846	191,661,924	191,662,712	191,662,826	191,662,927	191,662,982	191,663,169	191,663,222	191,663,241	191,663,277	191,663,303	191,663,322	191,663,359	191,663,409	191,663,559	191,663,572	191,664,284	191,664,438	191,664,568	191,664,829	191,665,082	191,665,084	191,665,127	191,665,884	191,666,000	191,666,202	191,666,485	191,666,721	191,667,304	191,667,838	191,667,938	191,668,347	191,668,350	191,669,387	191,671,908	191,672,836	191,673,320	191,674,506	191,674,511	191,675,119	191,677,869	191,678,799	191,679,421	191,680,647	191,682,272	191,683,974	191,684,546	191,687,669	191,688,949	191,689,249	191,689,281	191,689,653	191,689,753	191,690,018	191,690,332	191,696,173	191,708,351	191,708,614	191,708,897	191,709,039	191,709,094	191,709,203	191,709,213	191,709,298	191,709,562	191,709,620	191,709,720	191,710,383	191,710,531	191,710,721	191,710,916	191,711,038	191,711,052	191,711,318	191,711,340	191,711,548	191,711,599	191,712,344	191,712,348	191,712,579	191,712,993	191,713,106	191,713,125	191,713,570	191,714,587	191,714,628	191,714,645	191,715,322	191,715,371	191,716,403	191,716,674	191,716,795	191,716,829	191,717,086	191,717,093	191,717,522	191,717,649	191,717,758	191,717,795	191,717,900	191,718,067	191,719,069	191,719,076	191,719,092	191,719,169	191,719,255	191,719,269	191,719,851	191,720,280	191,721,192	191,721,372	191,722,752	191,723,433	191,723,713	191,723,727	191,723,754	191,723,811	191,724,445	191,724,591	191,724,616	191,725,660	191,725,724	191,725,866	191,726,467	191,726,792	191,727,103	191,727,400	191,727,403	191,727,467	191,727,730	191,727,740	191,727,757	191,727,909	191,727,917	191,728,039	191,728,205	191,728,270	191,728,280	191,728,282	191,728,518	191,728,948	191,729,007	191,729,452	191,729,454	191,729,489	191,729,499	191,730,357	191,730,697	191,731,179	191,733,498	191,734,672	191,735,725	191,735,961	191,737,812	191,738,104	191,741,637	191,743,461	191,744,098	191,744,499	191,745,284	191,745,483	191,747,011	191,748,702	191,748,812	191,751,038	191,751,932	191,753,144	191,753,145	191,754,103	191,755,603	191,757,031	191,757,747	191,759,828	191,760,320	191,760,427	191,760,625	191,760,680	191,761,693	191,761,704	191,761,727	191,761,734	191,761,869	191,761,936	191,762,200	191,762,320	191,765,416	191,766,137	191,766,431	191,766,441	191,766,529	191,766,936	191,767,606	191,768,268	191,768,578	191,768,605	191,768,654	191,769,024	191,769,043	191,769,562	191,769,627	191,770,324	191,771,271	191,771,381	191,771,486	191,771,518	191,771,671	191,771,775	191,771,888	191,771,893	191,772,626	191,772,801	191,773,055	191,773,489	191,773,508	191,773,627	191,774,182	191,774,639	191,774,645	191,775,488	191,775,489	191,775,533	191,775,573	191,775,609	191,775,779	191,775,804	191,775,863	191,775,946	191,776,235	191,776,377	191,776,437	191,778,897	191,778,907	191,779,917	191,779,930	191,780,221	191,780,262	191,782,083	191,782,085	191,782,094	191,784,021	191,786,580	191,786,887	191,786,931	191,787,889	191,787,946	191,788,778	191,789,472	191,791,408	191,792,020	191,792,493	191,793,461	191,793,943	191,794,334	191,794,518	191,794,703	192,262,390	192,262,589	192,262,773	192,263,662	192,263,705	192,264,222	192,264,449	192,264,481	192,264,508	192,265,563	192,266,653	192,266,949	192,267,033	192,267,055	192,267,203	192,267,296	192,267,346	192,267,384	192,268,429	192,269,246	192,269,271	192,269,330	192,269,356	192,269,682	192,269,683	192,269,696	192,269,735	192,269,775	192,270,041	192,270,048	192,270,073	192,270,126	192,270,145	192,270,211	192,270,232	192,270,867	192,271,306	192,271,326	192,272,075	192,272,207	192,272,302	192,272,351	192,272,518	192,272,845	192,273,011	192,273,741	192,273,788	192,274,262	192,274,300	192,274,354	192,274,986	192,275,405
G/A	A/G	T/A	A/C	T/A	G/A	G/T	C/T	A/T	G/A	A/G	G/A	T/C	A/G	T/A	A/G	G/A	A/T	A/2	5/-	A/-	G/A	G/C	T/-	A/G	A/C	A/C	T/2	G/C	C/A	G/A	C/T	A/T	G/C	2/-	T/G	G/A	T/A	C/G	C/G	A/G	T/C	C/G	C/T	G/A	G/C	T/A	G/C	A/T	G/A	G/A	C/T	A/T	A/G	A/2	A/G	C/T	T/A	T	A	A	G	7	A	-	A	G	T/C	T/G	T/C	A/T	C/T	T/C	T/-	A/T	C/T	G/A	G/A	A/G	A/G	C/T	G/T	C/T	G/-	A/-	A/T	T/A	G/T	G/A	T/C	G/T	G/A	T/2	G/2	G/T	A/T	G/C	T/A	A/T	G/T	A/C	T/A	C/23	A/C	T/A	C/T	A/2	G/2	A/C	C/T	A/T	A/G	T/A	A/G	A/G	A/C	T/C	T/G	C/T	A/G	T/C	C/2	C/A	G/A	T/G	A/3	G/A	A	2	-	A	C/A	G/T	G/C	T/A	G/C	A/G	A/G	T/G	G/A	T/C	A/C	A/C	G/A	A/T	T/C	G/A	C/T	G/C	C/T	A/T	G/T	G/A	G/A	C/A	T/A	A/T	G/T	A/C	G/A	G/C	C/A	A/G	T/C	G/T	C/G	C/A	C/A	C/T	C/T	T/G	T/C	A/T	G/C	C/G	G/A	T/C	G/A	G/A	4/-	T/C	C/T	A/G	C/G	T/C	A/-	C/-	C/T	A/C	A/G	T/A	A/G	A/C	G/T	G/A	T/C	G/A	G/A	G/A	C/A	G/T	T/A	G/A	T/A	G/A	T/G	C/G	C/T	C/T	C/G	T/C	T/C	A/T	G/A	C/A	G/A	T/G	A/T	A/G	C/A	T/G	T	2	T	A	T	A	G	C	C	C	T	T	T	G	T	G	C	G	T	G	C	G	C	A	A	5	G	T	A	C	A	-	C	G	T	T	A	C	C	C	-	C	2	T	C	-	G	T	-	-	C	A	-	C	A	A	A	-	C	C	-	A	T	8	C	14	A	-	C	A	T	T	G	A	C	C	-	A	G	A	A	T	-	C	G	A	T	2	A	A	A	C	-	T	A	C	A	A	C	T	A	T	T	A	A	C	C	C	3	T	G	T	G	G	-	A	G	-	-	C	T	G	-	G	G	C	A	C	-	G	G/-	C	C	T	A	-	-	-	C	A	C	C	-	-	C	G	A	C	G	G	A	T	A	A	T	G	A	G	C	2	G	G	A	T	G	A	T	T	T	G	T	C	A	4	T	G	A	-	G	A	G	C	A	A	T	2	T	A	C	C	A	-	A	G	-	A	G	T	T	-	A	G	3	-	C	A	A	-	A	G	A	A	C	C	A	A	C	G	T	G	C	G	G	C	A	G	A/G	T	G	A	A/G	T	T	C	C	G	C	T	-	C	A	A	G	G	A	G	C	C	A	T	A	T	A	T	T	T	C	T	C	G	G	G	-	A	-	-	T	T	T	5	C	T	T	C	G	C	C	T	C	A	A	G	A	5	C/5	A	G	2	C	5	-	C	A	-	A	C	A	A	G	A	T	A	T	G	G	A	G	T	T	A	A	-	A	G	G	T	C	-	C	A	T	C	C	A	T	2	T	A	A	T	T	A	T