Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 202,876 (bp)   Positions: 393
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.452
.909
.049
.003
.001
.002
.007
.0
.009
.003
.013
.026
.002
--
.002
.0
.001
.132
.006
.0
.123
--
.012
.012
.0
.041
.001
.004
.178
.388
.221
.013
.0
.052
.0
.0
.003
.004
.0
.037
.686
.093
.016
.007
.555
.053
.779
--
--
--
.056
.012
--
.07
.004
.004
--
.181
.015
.375
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.025
--
.097
.0
--
--
--
--
--
.127
.137
.016
.0
.005
--
.838
.464
.467
.447
.107
.431
.011
.072
.053
.019
.555
.174
.586
.047
--
.033
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.331
.001
.069
.111
.004
.043
.006
.001
.156
.486
--
.932
--
--
.023
.001
.22
.014
.421
--
.097
.085
.137
.266
.196
.075
--
--
--
.015
.102
.008
.007
.001
.026
.469
.564
.103
.474
.026
.015
.007
.992
--
--
.999
--
.158
.99
.959
.883
.091
.351
--
--
.0
.2
.0
.006
.334
.002
.001
.305
.047
--
--
--
--
.046
.065
.154
.074
--
.052
.168
.005
.044
.025
.023
.446
.406
--
--
.186
.179
.05
.058
.001
.01
.011
--
--
.07
.026
.092
.031
.011
.014
--
--
--
.005
.008
.009
.001
.004
.052
.006
--
--
--
--
--
--
.035
.006
.008
.013
.026
.016
--
--
--
.023
.002
.062
.114
--
.205
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.091
.132
.003
--
--
.013
.052
.011
--
.003
.004
--
--
--
--
.233
.08
.035
.204
.01
.006
.056
.686
.367
--
--
--
.007
.003
.0
.001
.108
.001
.002
.003
.024
.002
.073
.136
.744
.012
.001
.383
.846
.085
.657
--
--
--
.293
.611
.019
.463
.977
.284
.998
.026
.108
.09
.282
--
--
--
--
--
.071
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.05
.027
.536
.013
.027
.014
.009
.002
--
--
--
--
--
--
.023
.043
--
.235
.0
.004
.001
.024
.026
.041
.134
.682
.004
.144
.002
--
--
--
.333
.003
.034
.039
.478
.146
.033
.0
.0
--
--
--
.363
.721
.038
.0
.058
.338
.019
--
.001
.119
.002
.001
.0
.005
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
Scaper
T
C
G
T
G
G
G
20
C
2
G
C
T
T
A
18
T
G
G
C
A
A
C
C
G
C
C
A
A
G
C
G
T
4
C
C
C
C
T
C
G
T
T
A
A
G
G
A
C
G
C
G
C
G
A
3
C
A
T
T
T
G
C
C
C
A
T
T
C
T
10
T
C
T
A
T
A
G
2
T
A
T
T
C
G
A
C
T
2
2
A
T
3
G
T
T
C
T
A
C
G
G
G
A
A
G
G
C
C
G
T
A
A
C
G
G
G
A
T
A
T
C
C
T
A
C
C
A
T
T
G
G
T
T
C
A
G
G
G
8
G
A
T
T
A
T
T
C
A
T
C
A
T
A
C
C
T
T
C
G
A
A
G
G
3
A
T
10
G
C
A
G
A
C
T
A
C
T
G
A
G
A
A
G
A
A
C
A
C
A
G
T
A
G
G
A
A
T
T
C
A
T
8
T
2
12
T
C
4
T
C
C
T
T
C
T
A
A
A
A
C
T
2
G
G
G
T
G
A
4
A
T
T
T
G
A
3
T
T
C
T
G
G
C
A
A
G
C
A
C
A
T
C
G
C
A
T
G
A
C
12
T
G
A
C
A
C
G
A
G
T
T
T
A
A
C
T
G
A
T
C
C
C
T
G
G
A
C
G
119
G
2
A
C
T
T
C
T
T
2
A
G
T
T
T
G
A
2
C
A
A
G
T
A
A
A
T
5
T
C
T
A
G
T
2
T
G
A
T
T
C
A
T
C
A
T
C
C
G
T
T
A
C
G
C
T
A
G
G
C
T
A
A
G
C
A
C
G
G
14
A
C
2
C
A
G
A
C
G
G
A
C
T
G
A
T
T
T
C
T
G
T
C
T
C
26
C
T
G
T
2
C
T
  58,705,536
  58,707,719
  58,707,782
  58,707,823
  58,709,221
  58,710,233
  58,710,246
  58,710,425
  58,711,653
  58,714,978
  58,715,392
  58,715,982
  58,716,819
  58,717,595
  58,719,002
  58,720,482
  58,721,848
  58,722,101
  58,723,019
  58,723,984
  58,724,594
  58,728,320
  58,730,257
  58,730,261
  58,730,274
  58,730,340
  58,731,157
  58,732,199
  58,733,419
  58,736,871
  58,738,607
  58,739,686
  58,740,352
  58,742,125
  58,745,610
  58,747,345
  58,748,685
  58,749,021
  58,749,069
  58,750,225
  58,751,340
  58,752,521
  58,754,096
  58,758,905
  58,758,999
  58,759,569
  58,760,660
  58,761,082
  58,761,162
  58,761,222
  58,762,125
  58,762,431
  58,763,596
  58,763,929
  58,764,316
  58,764,337
  58,764,497
  58,766,253
  58,766,717
  58,767,840
  58,768,490
  58,769,155
  58,769,638
  58,770,098
  58,770,597
  58,774,341
  58,774,886
  58,775,208
  58,775,407
  58,775,482
  58,776,162
  58,776,192
  58,779,042
  58,780,185
  58,780,760
  58,781,893
  58,783,331
  58,783,374
  58,783,812
  58,783,815
  58,783,988
  58,784,331
  58,786,458
  58,786,520
  58,787,349
  58,790,130
  58,790,719
  58,790,797
  58,790,799
  58,790,804
  58,791,431
  58,791,583
  58,792,688
  58,793,417
  58,794,364
  58,795,313
  58,795,442
  58,795,655
  58,797,454
  58,797,954
  58,798,896
  58,799,092
  58,801,161
  58,806,764
  58,806,804
  58,807,782
  58,807,835
  58,807,975
  58,807,981
  58,808,016
  58,810,826
  58,811,059
  58,811,530
  58,826,991
  58,828,550
  58,829,844
  58,832,630
  58,832,984
  58,832,998
  58,834,640
  58,836,461
  58,963,974
  58,964,927
  58,965,106
  58,965,806
  58,969,810
  58,973,434
  58,975,116
  58,978,564
  58,978,673
  58,979,787
  58,979,823
  58,980,173
  58,980,630
  58,984,081
  58,989,537
  58,989,681
  58,989,848
  58,989,857
  58,997,169
  58,999,384
  59,000,178
  59,000,279
  59,004,059
  59,004,132
  59,004,529
  59,005,048
  59,005,083
  59,005,278
  59,005,769
  59,005,798
  59,005,975
  59,006,492
  59,006,573
  59,006,976
  59,007,183
  59,008,158
  59,009,526
  59,009,732
  59,010,438
  59,011,008
  59,011,689
  59,012,831
  59,012,833
  59,012,835
  59,013,111
  59,013,128
  59,013,629
  59,013,654
  59,015,305
  59,015,693
  59,016,377
  59,017,408
  59,017,542
  59,017,945
  59,018,676
  59,019,095
  59,019,982
  59,021,835
  59,022,029
  59,022,790
  59,023,211
  59,023,416
  59,023,422
  59,024,132
  59,024,186
  59,024,548
  59,025,384
  59,025,901
  59,026,345
  59,027,064
  59,027,405
  59,028,938
  59,029,748
  59,031,036
  59,031,550
  59,031,630
  59,032,533
  59,032,601
  59,032,950
  59,032,982
  59,033,603
  59,033,949
  59,036,347
  59,036,502
  59,036,539
  59,038,295
  59,038,406
  59,038,475
  59,038,993
  59,039,027
  59,039,123
  59,040,735
  59,042,094
  59,042,140
  59,043,288
  59,043,289
  59,043,906
  59,046,628
  59,047,358
  59,047,446
  59,047,754
  59,049,487
  59,050,771
  59,050,774
  59,051,373
  59,053,202
  59,053,745
  59,054,074
  59,054,633
  59,055,178
  59,055,185
  59,055,290
  59,055,653
  59,056,286
  59,056,414
  59,056,703
  59,058,249
  59,058,389
  59,058,396
  59,058,436
  59,060,143
  59,061,237
  59,061,927
  59,062,021
  59,062,416
  59,062,968
  59,063,320
  59,063,953
  59,064,325
  59,065,952
  59,065,988
  59,066,047
  59,066,213
  59,066,354
  59,067,475
  59,067,535
  59,071,292
  59,071,310
  59,071,635
  59,072,288
  59,072,795
  59,072,982
  59,073,831
  59,074,025
  59,074,161
  59,074,855
  59,075,030
  59,075,031
  59,079,189
  59,079,554
  59,079,961
  59,086,119
  59,086,567
  59,086,663
  59,086,701
  59,086,983
  59,087,030
  59,087,047
  59,087,624
  59,087,879
  59,087,957
  59,088,788
  59,089,148
  59,089,171
  59,092,300
  59,092,313
  59,092,451
  59,092,462
  59,092,497
  59,092,713
  59,092,718
  59,092,728
  59,093,262
  59,093,790
  59,094,110
  59,094,517
  59,094,967
  59,095,003
  59,095,739
  59,096,845
  59,097,084
  59,097,554
  59,097,784
  59,099,182
  59,099,183
  59,100,042
  59,100,880
  59,101,035
  59,101,155
  59,101,450
  59,103,059
  59,103,083
  59,103,101
  59,104,196
  59,104,607
  59,104,800
  59,105,332
  59,106,184
  59,106,260
  59,108,051
  59,108,291
  59,108,529
  59,113,425
  59,114,325
  59,114,478
  59,114,514
  59,116,219
  59,116,317
  59,116,424
  59,116,605
  59,116,699
  59,116,767
  59,117,674
  59,118,321
  59,118,322
  59,124,374
  59,124,419
  59,124,556
  59,124,613
  59,124,802
  59,125,016
  59,131,153
  59,131,484
  59,131,733
  59,131,791
  59,131,830
  59,131,979
  59,132,082
  59,133,097
  59,134,179
  59,134,725
  59,135,136
  59,135,167
  59,135,176
  59,135,602
  59,135,604
  59,136,400
  59,137,371
  59,139,079
  59,140,379
  59,140,915
  59,141,570
  59,143,760
  59,145,798
  59,149,182
  59,149,467
  59,150,455
  59,151,261
  59,151,581
  59,151,644
  59,152,008
  59,153,183
  59,153,313
  59,153,317
  59,155,086
  59,155,096
  59,155,528
  59,156,594
  59,157,432
  59,158,201
  59,158,249
  59,159,091
  59,159,313
  59,160,359
  59,160,944
  59,161,286
  59,161,600
  59,161,620
  59,162,166
  59,162,205
  59,162,662
  59,162,663
C
2
2
-
C
2
2
-
T
-
A
T
G
-
G
-
C
T
5
T
T
2
T
T
A
5
3
2
2
A
G
C
C
-
T
T
3
T
C
T
A
G
C
2
-
A
A
G
T
T
T
A
2
5
G
-
T
G
C
G
C
A
T
-
A
G
A
C
2
C
-
C
-
C
C
C
A/-
G/A
-
A
G
G
G
2
A
G
T
-
-
-
G
C
-
A
-
C
A
2
G
A
A
9
A
G
G
A
C
T
T
6
2
T
T
A
T
A
A
2
G
T
C
A
G
C
G
A
T
G
G
C
C
T
C
2
T
-
A
A
A
-
A
2
C
2
G
-
C
G
-
A
A
G
2
11
A
T
C
C
T
T
3
G
3
T
-
G
C
-
A
T
13
5
G
T
C
-
T
C
C
G
A
-
-
T
T
T
G
2
T
G
A
C
C
T
A
G
-
-
2
A
2
C
-
C
-
-
C
T
-
G
2
T
G
G
T
A
T
-
T
G
T
C
-
T
A
T
C
T
C
-
G
C
-
C
A
3
-
C
C
G
C
C
A
3
T
C
C
T
G
G
2
C
T
A
A
G
A
7
C
G
-
C
A
-
A
T
A
C
C
G/A
T/C
T/C
C
C
-
A
C
A
G
C
T
T
T
C
T
A
C
A
2
-
A
-
T
T
C
A
T
2
C
-
T
T
C
G
T/C
G/A
2
-
T
G
G
3
-
2
G
G
A
-
C
A
C
G
T
-
-
C
-
G
C
G
T
-
A
T
C
A
G
T
C
G
2
T
G
A
T
2
G
T
T
T
A
-
2
A
A
T
T
A
C
-
G
T
-
C/T
C
A
T
T
2
C
-
T
C
A
G
C
-
C
T
C
A
C
T
C
G
-
-
C
G/C
A
-
G
A