Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 152,043 (bp)   Positions: 494
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.819
.525
.021
.003
.495
.005
.001
.019
.018
.061
.039
.004
.011
--
--
--
--
--
.278
.185
.016
.117
--
--
--
.056
.052
.136
.053
.203
--
--
--
--
--
.031
.047
.187
.202
--
--
--
--
--
--
--
.451
.048
.248
.037
.348
.084
.034
.139
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.006
.001
.942
.821
.073
.998
.115
.006
.0
.0
.0
.023
.003
.051
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.043
.021
.003
--
--
--
--
--
.105
.003
.004
--
.086
.009
--
--
--
--
--
--
--
--
.191
.465
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.001
.0
.0
.0
.97
.004
.007
.017
.554
.002
.038
.874
.16
.0
.003
.013
.031
.014
--
--
.002
.059
.152
.003
.038
.004
.012
--
.12
.002
.003
.179
.181
.093
.074
.205
.171
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.861
.014
.096
.016
.001
.086
.083
.065
.006
.021
.0
.01
.3
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.054
.001
.001
.201
.009
.01
.0
.0
.0
.069
.007
.061
.035
.028
.166
.207
.001
.006
.017
.003
.028
.014
.0
.056
.0
.002
.004
.0
.282
.177
.822
.004
.013
.002
.0
.008
.007
--
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.039
.113
.002
.018
.011
.002
.004
.142
.01
.007
.007
.003
.01
.022
.468
.03
.003
.01
.001
--
.056
.033
.033
.045
.028
--
--
--
.199
.21
.032
.014
--
.018
.0
.003
.001
.979
.0
.201
.188
.182
.569
.106
.032
.556
.047
.008
.11
.0
.03
.001
.038
.033
.038
.031
.02
.0
.425
.0
.005
.001
.135
.105
.068
.019
.171
.001
.002
.001
.391
--
--
.005
.029
.009
.005
.134
.003
--
.003
.013
--
--
--
--
.001
.032
.044
.045
.0
.0
.95
.482
.181
.879
.002
.002
.0
.046
.026
.015
.68
.755
.764
.037
.01
.012
.312
.0
.088
.123
.48
.156
.027
.008
--
--
.091
.066
.004
.044
.165
.024
.129
.001
.0
.002
--
--
.251
.288
.471
.607
.785
.923
--
--
--
--
--
--
.006
.0
--
.19
.195
.181
.544
--
--
.037
.04
.396
.509
.118
.587
--
--
.056
.033
.002
.202
.007
.002
.05
.028
.018
.004
.08
.009
.069
.152
--
.001
.006
.01
.0
.005
.008
--
--
.003
.524
.013
.02
.008
.002
.04
.035
.001
.0
.0
.001
.016
.036
.013
.011
--
.02
.006
.003
.002
.002
.066
.036
.458
.456
.244
.017
.0
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
Saxo1
T
C
A
G
A
T
C
C
G
G
C
C
T
A
A
T
G
T
G
T
A
T
4
A
G
A
C
3
G
A
G
A
A
A
A
T
T
C
G
20
G
C
A
5
T
C
T
A
2
A
T
T
G
C
T
T
C
2
C
C
G
C
A
A
A
A
G
C
A
A
T
A
G
T
5
A
3
T
A
T
2
C
G
C
4
A
C
T
G
G
G
A
A
T
C
A
G
G
G
C
G
G
C
C
T
G
A
G
C
A
C
A
A
C
G
G
A
A
A
A
A
A
T
G
A
T
T
T
G
T
T
8
T
T
A
A
A
G
G
A
A
C
A
C
T
A
C
G
A
A
G
C
A
T
G
T
A
G
A
T
C
C
A
G
T
T
C
A
C
G
T
A
T
A
C
C
G
T
T
G
A
C
C
C
C
T
G
3
T
A
T
T
12
A
G
G
T
G
T
T
A
A
C
G
C
G
C
T
C
5
T
2
A
C
C
C
A
T
A
C
C
T
A
G
T
G
T
A
G
T
A
A
G
A
T
T
T
T
G
A
G
C
G
3
G
A
4
C
A
T
12
4
G
A
C
C
C
T
A
G
C
G
G
A
G
C
C
A
G
G
G
T
A
G
G
C
G
G
T
C
T
G
10
G
C
T
C
C
G
A
G
G
A
G
C
A
G
C
T
G
A
G
G
T
T
T
G
A
C
A
T
T
C
T
T
C
A
T
C
G
A
T
T
C
A
G
T
C
G
T
C
T
C
C
G
C
T
T
T
T
C
T
T
T
4
C
A
T
G
T
A
2
A
G
A
G
2
3
T
A
G
A
T
6
A
A
T
T
T
T
T
A
A
T
A
G
A
G
A
T
G
5
200
T
G
G
G
C
C
T
11
A
G
A
T
G
G
G
G
T
A
A
T
G
G
C
C
A
T
T
T
T
2
19
C
4
20
T
T
14
A
G
A
C
A
T
4
A
3
2
C
C
A
2
A
A
C
3
G
T
C
A
T
T
2
T
C
6
T
A
2
C
A
T
C
A
2
G
C
A
C
C
A
C
C
T
A
A
T
A
A
A
C
G
A
G
G
A
3
G
T
A
C
G
A
G
T
G
G
T
C
A
2
G
  108,756,823
  108,757,246
  108,757,582
  108,758,564
  108,758,780
  108,759,017
  108,759,368
  108,759,981
  108,760,072
  108,760,245
  108,760,515
  108,760,936
  108,760,971
  108,761,418
  108,761,422
  108,761,432
  108,761,433
  108,761,442
  108,761,769
  108,761,774
  108,761,983
  108,761,998
  108,762,214
  108,762,238
  108,762,294
  108,762,448
  108,762,629
  108,762,889
  108,762,909
  108,762,936
  108,763,132
  108,763,486
  108,763,732
  108,763,749
  108,767,865
  108,768,067
  108,768,320
  108,768,411
  108,768,837
  108,769,018
  108,769,117
  108,769,556
  108,769,878
  108,769,984
  108,770,128
  108,770,716
  108,771,740
  108,771,886
  108,772,855
  108,772,967
  108,773,025
  108,773,062
  108,773,498
  108,773,570
  108,774,127
  108,774,417
  108,774,524
  108,774,711
  108,774,981
  108,775,545
  108,776,061
  108,777,291
  108,779,703
  108,779,794
  108,779,839
  108,780,023
  108,780,156
  108,780,354
  108,780,436
  108,780,696
  108,780,859
  108,780,893
  108,781,264
  108,781,334
  108,782,918
  108,782,929
  108,782,932
  108,782,935
  108,782,952
  108,784,066
  108,784,433
  108,784,436
  108,784,872
  108,784,956
  108,785,295
  108,785,356
  108,785,464
  108,785,941
  108,786,684
  108,786,831
  108,786,842
  108,786,971
  108,787,087
  108,787,273
  108,787,392
  108,787,568
  108,787,631
  108,787,681
  108,788,270
  108,789,388
  108,789,671
  108,789,860
  108,789,949
  108,789,994
  108,790,024
  108,790,308
  108,791,455
  108,792,184
  108,792,794
  108,792,924
  108,793,174
  108,793,506
  108,793,579
  108,793,729
  108,793,744
  108,793,896
  108,794,257
  108,794,325
  108,794,489
  108,794,532
  108,801,625
  108,801,639
  108,801,708
  108,801,822
  108,808,647
  108,808,764
  108,808,771
  108,809,117
  108,810,198
  108,810,535
  108,810,558
  108,810,950
  108,811,123
  108,811,441
  108,811,539
  108,811,572
  108,811,908
  108,811,910
  108,811,919
  108,812,670
  108,812,731
  108,812,964
  108,813,276
  108,814,276
  108,814,316
  108,815,035
  108,815,102
  108,815,175
  108,815,312
  108,815,327
  108,816,206
  108,816,360
  108,817,363
  108,817,484
  108,817,705
  108,818,447
  108,825,698
  108,825,767
  108,826,358
  108,832,479
  108,832,528
  108,832,840
  108,832,960
  108,833,173
  108,833,537
  108,834,217
  108,834,659
  108,834,743
  108,836,522
  108,836,558
  108,836,613
  108,836,794
  108,837,123
  108,837,598
  108,837,669
  108,837,784
  108,838,147
  108,838,350
  108,838,894
  108,839,419
  108,839,982
  108,840,242
  108,841,069
  108,841,070
  108,841,261
  108,841,420
  108,841,639
  108,841,641
  108,842,643
  108,842,945
  108,842,964
  108,843,494
  108,844,262
  108,844,977
  108,845,405
  108,845,514
  108,845,515
  108,845,516
  108,845,658
  108,845,840
  108,845,962
  108,846,180
  108,846,182
  108,846,204
  108,846,216
  108,846,235
  108,847,770
  108,848,549
  108,848,689
  108,850,192
  108,850,204
  108,850,951
  108,851,021
  108,851,130
  108,851,383
  108,851,435
  108,851,902
  108,851,928
  108,852,185
  108,852,271
  108,852,571
  108,852,844
  108,852,898
  108,852,899
  108,853,094
  108,853,213
  108,853,775
  108,853,954
  108,854,835
  108,854,892
  108,855,067
  108,855,799
  108,855,909
  108,856,913
  108,857,239
  108,857,296
  108,857,738
  108,857,942
  108,857,948
  108,858,157
  108,858,213
  108,858,376
  108,858,533
  108,858,541
  108,858,551
  108,858,687
  108,859,278
  108,859,703
  108,859,827
  108,859,830
  108,860,040
  108,860,060
  108,860,313
  108,860,362
  108,860,364
  108,860,479
  108,860,586
  108,861,134
  108,861,183
  108,861,248
  108,861,572
  108,861,726
  108,861,796
  108,861,956
  108,862,491
  108,862,665
  108,862,892
  108,863,115
  108,863,165
  108,863,251
  108,863,279
  108,863,438
  108,863,550
  108,863,853
  108,863,855
  108,863,961
  108,864,392
  108,864,395
  108,864,413
  108,864,505
  108,864,532
  108,864,919
  108,864,940
  108,864,983
  108,865,200
  108,865,318
  108,865,361
  108,865,479
  108,865,495
  108,865,609
  108,865,629
  108,865,637
  108,865,880
  108,865,913
  108,865,921
  108,866,229
  108,866,290
  108,866,628
  108,866,715
  108,866,974
  108,867,345
  108,867,558
  108,867,876
  108,868,089
  108,868,406
  108,868,410
  108,868,431
  108,868,595
  108,868,687
  108,868,751
  108,868,756
  108,868,763
  108,868,857
  108,869,058
  108,869,201
  108,869,312
  108,869,586
  108,869,717
  108,869,951
  108,870,211
  108,870,911
  108,870,948
  108,871,175
  108,871,695
  108,871,737
  108,872,180
  108,872,352
  108,872,604
  108,872,770
  108,873,063
  108,873,892
  108,873,964
  108,874,469
  108,874,851
  108,875,071
  108,875,524
  108,875,527
  108,875,692
  108,875,809
  108,875,868
  108,876,982
  108,877,365
  108,877,503
  108,877,683
  108,878,001
  108,878,004
  108,878,052
  108,878,078
  108,878,198
  108,878,514
  108,879,066
  108,879,129
  108,879,448
  108,879,791
  108,879,832
  108,879,898
  108,880,099
  108,880,263
  108,880,277
  108,880,854
  108,881,106
  108,881,556
  108,882,300
  108,882,407
  108,882,622
  108,882,627
  108,882,640
  108,882,641
  108,882,712
  108,883,093
  108,883,165
  108,883,291
  108,883,307
  108,883,417
  108,883,873
  108,884,173
  108,884,188
  108,884,503
  108,884,697
  108,884,724
  108,884,876
  108,885,110
  108,885,116
  108,885,126
  108,885,342
  108,885,345
  108,885,347
  108,885,573
  108,885,637
  108,885,776
  108,885,965
  108,886,215
  108,886,403
  108,886,574
  108,886,600
  108,886,628
  108,886,696
  108,886,706
  108,886,954
  108,887,140
  108,887,198
  108,887,228
  108,887,331
  108,887,586
  108,887,684
  108,887,729
  108,887,740
  108,887,891
  108,888,160
  108,888,176
  108,888,479
  108,888,975
  108,889,638
  108,889,646
  108,889,680
  108,889,695
  108,889,708
  108,889,738
  108,890,101
  108,890,118
  108,890,149
  108,890,166
  108,890,260
  108,890,345
  108,890,358
  108,890,499
  108,890,696
  108,890,883
  108,890,885
  108,890,936
  108,891,081
  108,891,342
  108,891,344
  108,891,404
  108,891,405
  108,891,469
  108,891,502
  108,891,848
  108,892,132
  108,892,212
  108,892,341
  108,892,398
  108,892,465
  108,892,469
  108,893,653
  108,893,900
  108,894,164
  108,894,397
  108,895,331
  108,895,380
  108,895,614
  108,895,679
  108,897,155
  108,897,589
  108,897,915
  108,898,130
  108,898,304
  108,898,308
  108,898,309
  108,898,493
  108,898,643
  108,899,125
  108,899,259
  108,899,482
  108,899,901
  108,900,135
  108,901,000
  108,901,214
  108,901,639
  108,901,661
  108,902,025
  108,902,027
  108,902,417
  108,902,449
  108,902,483
  108,902,549
  108,902,574
  108,902,576
  108,902,578
  108,902,592
  108,902,953
  108,903,002
  108,903,081
  108,903,087
  108,903,095
  108,903,113
  108,903,125
  108,903,314
  108,903,558
  108,903,930
  108,904,475
  108,904,707
  108,906,142
  108,908,182
C
G
G
-
G
A
G
T
A
2
T
T
A
T
G
C
A
G
A
C
G
G
-
G
A
G
T
-
T
C
A
G
G
T
G
G
G
3
A
-
A
T
G
-
G
T
3
-
-
-
C
C
A
T
C
C
A
-
T
A
-
T
2
-
G
T
T
T
T
C
A
T
A
3
-
-
-
A
G
A
-
A
A
T
-
G
C/2
C
C
A
A
G
G
A
T
G
C
G/-
G/2
C/-
A
T
G
G
2
A
G
A
T
G
A
G
2
A
A
A
G
-
C
6
-
T
G
A
10
C
C
G
3
C
G
-
C
A
G
G
2
A
4
G
C
T
-
T
C
G
T
A
2
C
4
2
G
C
T
C
-
A
G
3
T
T
-
A
G
C
A
G
-
G/-
C
G
A
C
40
T
T
C
C
2
11
T
4
2
G
G
-
-
C
G
-
A
-
G
A
T
A
A
C
A
2
G
T
A
T
A
T
G
T
-
C
-
G
A
T
T
C
C
G
T
T
C
3
T
4
A
-
T
5
C
T
G
T
2
C
C
C
C
A
G
T
CA/3
A
-
T
T
-
T
3
C
-
-
A
G
G
2
T
C
G
T
G
A
23
C
T
T
G
G
A
T
A
2
2
A
A
3
T
A
39
T
2
A
-
T
T
G
T
A
A
-
A
A
T
T
G
20
19
A
G
C
G
2
T
A
A
-
2
G
T
T
C
A
T
-
29
T
G
C
G
A
-
C
C
T
C
A
C
T
A
C
T
G
T
2
2
T
C
2
C
A
T
C
C
C
-
4
C
C
A
C
C
-
G
A
T
-
-
-
A
-
A
G
C
-
G
T
A
A
G
C
C
T
G
A
G
A
G
A
G
C
A
5/-
200/-
T/-
A
3
A
A
4
25
-
C
2
G
C
A
A
A
A
C
C
G
C
A
A
7
T
T
C
C
2
C
-
-
T
-
-
C
G
-
C
A
8
5
5
C
-
-
-
-
T
2
8
2/-
A/-
11
T
-
A
2
T
5
G
C
-
C
T
-
C
G
-
T
T
A
2
3
-
C
2
G
T
T
G
A
T
5
2
G
G
G
2
9
T
A
G
A
-
6
-
A
G
-
T
-
T
2
C
C
A
2
C/6
G
-
G/3