Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 177,189 (bp)   Positions: 323
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.105
.015
.0
.496
.045
.0
.008
.012
.443
.001
.803
.578
.014
.013
.25
.093
.0
.032
.0
.33
.089
.253
.08
.999
.309
.046
.0
.05
.012
.995
--
.052
.007
.0
.205
--
.014
.044
.088
.001
.004
.0
.002
.022
.002
.035
.029
.141
.005
.004
.812
.022
--
--
--
--
--
.215
.018
.021
.011
.054
.071
.525
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.14
.004
.004
.019
.131
.002
.018
.073
.042
.108
.006
.087
.003
.173
.016
.075
.047
.008
.001
.11
.295
.315
.054
.096
.132
.14
.098
.018
.013
.042
.256
.224
--
--
--
.001
.503
.006
.015
.002
.182
.162
.132
.006
.0
.008
.141
.061
.158
.034
.0
.012
.573
.009
.234
.027
.128
--
--
.322
.0
.006
.217
--
--
--
.23
.187
.19
.149
.04
.002
.002
.017
.025
.203
.169
.176
.004
.031
.001
.001
.002
.723
.005
.09
.0
.865
.124
.007
.079
.193
--
.006
.1
.07
.016
--
.019
.0
.026
.037
.06
.023
.019
.004
.0
.002
.027
.027
.047
--
--
.003
.044
.024
.062
.009
.005
.008
.085
.287
.001
.008
.004
.013
--
--
.041
.028
.986
1.0
.998
1.0
.004
.035
.0
.147
.001
.002
.015
.002
--
.008
--
--
--
--
.027
.0
--
--
.9
.201
--
.013
.71
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.375
.013
.732
.01
.004
.064
.032
.0
.009
.013
--
--
--
.121
.013
.965
.003
--
--
.222
.001
.0
.043
.002
.0
.038
.251
.003
.007
.012
.025
.071
.004
.009
.002
.002
.0
.003
.005
.012
.014
.154
.035
.01
.026
.043
.457
.038
--
--
--
.044
.092
.033
.006
.018
.16
.194
.044
.059
.03
.308
.0
.001
.001
.004
.033
.963
.929
.007
.018
.017
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pcgf5l1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
Rps6ka5
T
C
A
T
G
A
T
G
5
T
T
G
G
C
C
4
A
G
C
G
C
A
20
G
2
T
T
C
A
A
A
T
C
C
G
A
C
A
A
G
G
T
C
A
A
T
A
4
G
G
A
A
2
C
T
T
C
T
8
6
T
T
T
G
C
A
T
C
A
T
G
C
G
G
A
A
T
C
C
A
16
12
T
G
T
G
G
T
T
8
C
C
8
T
5
C
7
C
G
G
T
G
G
A
C
G
C
T
A
A
C
A
A
A
C
G
T
A
G
T
C
T
G
T
A
T
T
A
T
G
T
T
G
G
C
C
G
T
2
C
G
T
G
A
C
G
4
G
A
T
A
A
C
C
C
G
A
T
C
G
G
G
T
A
C
A
4
T
A
A
T
T
G
12
A
A
A
G
2
T
T
G
G
C
G
G
G
G
8
G
G
C
G
G
G
G
C
T
C
A
C
G
T
4
3
2
T
T
A
C
T
G
G
A
A
G
G
A
T
3
A
A
G
A
T
T
A
A
T
T
C
C
A
G
G
G
G
A
G
C
A
A
C
G
T
G
G
T
C
G
T
C
A
G
C
T
A
C
C
T
C
T
C
C
T
T
T
G
A
G
T
G
T
A
A
T
T
A
C
T
A
C
G
T
T
4
G
T
A
A
205
A
4
T
G
G
A
G
C
2
T
A
4
G
C
A
C
G
A
G
G
A
G
G
G
G
A
C
2
G
16
14
G
  133,782,802
  133,782,914
  133,783,510
  133,784,572
  133,786,409
  133,787,616
  133,788,018
  133,790,082
  133,791,145
  133,791,513
  133,792,470
  133,792,745
  133,793,187
  133,793,514
  133,793,842
  133,793,857
  133,793,929
  133,793,951
  133,794,283
  133,794,386
  133,795,425
  133,796,194
  133,798,204
  133,801,227
  133,802,148
  133,802,389
  133,802,457
  133,803,288
  133,803,639
  133,803,894
  133,804,127
  133,804,401
  133,806,696
  133,807,024
  133,810,929
  133,811,272
  133,811,535
  133,813,769
  133,814,991
  133,817,576
  133,817,668
  133,819,143
  133,819,224
  133,819,253
  133,819,550
  133,820,053
  133,821,086
  133,821,441
  133,822,308
  133,822,320
  133,822,417
  133,823,683
  133,824,050
  133,824,550
  133,824,569
  133,824,576
  133,824,580
  133,824,963
  133,827,323
  133,827,325
  133,827,331
  133,827,408
  133,827,557
  133,827,758
  133,827,883
  133,828,633
  133,828,769
  133,829,967
  133,831,354
  133,831,355
  133,831,372
  133,831,393
  133,831,395
  133,831,398
  133,831,405
  133,832,023
  133,832,896
  133,833,563
  133,833,982
  133,834,101
  133,834,360
  133,834,963
  133,835,046
  133,835,337
  133,835,364
  133,835,403
  133,835,869
  133,835,957
  133,836,277
  133,836,305
  133,836,883
  133,836,990
  133,837,949
  133,838,160
  133,838,298
  133,838,387
  133,838,394
  133,838,527
  133,840,116
  133,840,955
  133,842,255
  133,843,028
  133,843,438
  133,843,733
  133,843,886
  133,843,924
  133,843,928
  133,843,948
  133,844,238
  133,844,239
  133,844,687
  133,844,931
  133,844,932
  133,845,044
  133,845,069
  133,847,976
  133,848,158
  133,850,673
  133,851,157
  133,851,347
  133,852,219
  133,853,109
  133,854,079
  133,854,349
  133,854,415
  133,855,210
  133,857,481
  133,857,734
  133,857,861
  133,858,983
  133,860,276
  133,861,204
  133,862,459
  133,863,255
  133,865,455
  133,865,856
  133,866,523
  133,866,733
  133,868,445
  133,868,448
  133,868,783
  133,869,507
  133,869,511
  133,870,814
  133,874,301
  133,874,310
  133,874,316
  133,874,526
  133,874,536
  133,874,537
  133,874,561
  133,874,570
  133,874,580
  133,874,582
  133,874,597
  133,874,601
  133,874,613
  133,874,622
  133,874,624
  133,874,786
  133,874,844
  133,875,588
  133,876,827
  133,878,016
  133,878,456
  133,878,770
  133,878,868
  133,879,104
  133,880,368
  133,880,630
  133,881,933
  133,887,681
  133,888,410
  133,889,014
  133,889,986
  133,893,224
  133,894,226
  133,898,152
  133,898,977
  133,899,970
  133,900,370
  133,901,781
  133,901,783
  133,901,797
  133,901,817
  133,901,818
  133,901,824
  133,901,826
  133,901,828
  133,901,840
  133,901,842
  133,901,845
  133,902,039
  133,902,051
  133,905,123
  133,905,139
  133,907,113
  133,907,895
  133,908,169
  133,908,257
  133,908,326
  133,908,412
  133,909,006
  133,910,938
  133,911,052
  133,911,053
  133,912,215
  133,912,689
  133,912,703
  133,913,257
  133,914,118
  133,914,255
  133,914,729
  133,914,765
  133,914,959
  133,915,934
  133,916,020
  133,916,192
  133,917,013
  133,917,117
  133,917,526
  133,917,569
  133,917,926
  133,918,315
  133,918,596
  133,918,707
  133,918,746
  133,918,783
  133,918,784
  133,919,780
  133,919,924
  133,921,602
  133,921,651
  133,921,925
  133,922,109
  133,922,525
  133,922,955
  133,923,855
  133,926,507
  133,926,825
  133,927,540
  133,927,654
  133,927,685
  133,927,969
  133,928,227
  133,928,934
  133,929,691
  133,929,913
  133,929,980
  133,931,867
  133,933,013
  133,933,097
  133,934,039
  133,935,140
  133,936,384
  133,936,751
  133,938,292
  133,938,954
  133,938,969
  133,939,036
  133,944,753
  133,944,858
  133,944,866
  133,945,534
  133,945,975
  133,946,032
  133,948,124
  133,948,376
  133,948,390
  133,949,299
  133,949,385
  133,949,494
  133,949,522
  133,949,593
  133,949,731
  133,949,873
  133,950,000
  133,950,180
  133,950,227
  133,950,493
  133,950,831
  133,950,875
  133,950,897
  133,951,738
  133,951,748
  133,952,000
  133,952,003
  133,952,008
  133,952,087
  133,952,157
  133,952,161
  133,952,704
  133,952,835
  133,952,938
  133,953,167
  133,953,332
  133,953,358
  133,953,534
  133,953,651
  133,953,652
  133,953,712
  133,954,092
  133,954,247
  133,954,434
  133,954,524
  133,954,579
  133,954,596
  133,954,722
  133,954,928
  133,955,049
  133,955,318
  133,955,991
  133,956,043
  133,956,376
  133,956,678
  133,957,211
  133,957,301
  133,957,437
  133,957,597
  133,957,708
  133,958,677
  133,958,679
  133,959,209
8
T
-
-
A
G
2
A
-
C
C
A
A
T
T
-
2
C
T
A
3/CA
-
-
A
-
C
C
T
-
T
G
A
3
A
A
C
A
T
C
G/2
2
C
A
G
G
C
-
-
G/-
A
G
2
-
T
-
2
-
G
8/-
-
T/C
A
C
A
T
T
T/-
-
G
A
A
A
A
A
C
T
G
T
T
G
-
-
C
A
11
9/7
2
C
A
-
T
T
-
C
-
C/7
7/-
T
A
A
A
A
A
G
A
T
T
A
G
G
G
-
T
A/G
C/T
A
C
C
A
C
2
2
2
C
-
C
C
2
C
C
C
C
C
A
T
2
2
-
-
T
A
C
15
9
T
A
-
T
T
C
T
G
-
2
2
-
-
G
A
A
A
A
C
G
G
4
-
C
A/-
110
G
C
C
12/-
A/-
C
15
2
-
-
G
2
2
2
T
T
4
5
-
-
T
-
3
-
T
3/GT
2
C
T
G
T
A
9/11
-
3/-
-
-
C
G
A
2
A
A
G
C
A
A
G
C
-
-
G
C
T
-
A
C
T
C
C
T
4
G
A
A
C
A
G
A
G
6
C
A
A
C
A
T
26
T
G/-
3
A
T
A
A
C
G
3
T
2
C/2
G
A
-
C
C
C
G/2
A/5
-
C
2
G
T
G
116
C
-
T
114
G
T
11/12
C
A
-
5
A
-
G
-
G
-
C
A
A
G
A
C/2
2/-
C
G
-
A
A
T
T
A
T
T
A
C
A
3/5
A
A
G
T
-
-
16/-
14/-
A