Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 219,010 (bp)   Positions: 195
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.15
.09
.011
--
.044
--
.155
.112
.004
.01
--
.141
.0
.188
.703
.091
--
--
.923
.016
.009
.037
.009
--
--
--
.013
.002
--
--
--
.41
.611
--
.049
.021
.637
.015
.031
.001
.007
.001
.003
.0
.003
.006
1.0
.02
.957
.1
--
--
--
.001
--
.102
.084
.056
.002
.196
.231
.006
.004
.021
--
--
--
.67
.017
.002
.074
.161
.14
.001
.0
.001
.0
.018
.072
--
.302
--
.021
.099
.019
.022
.015
.021
.014
.015
.005
.468
.053
.006
.173
.153
.08
.046
.166
.144
.036
.012
.081
.022
.495
.481
.057
.231
.011
.003
.002
.03
.011
.031
.033
.001
--
.013
--
--
.012
--
--
.017
--
--
--
--
.608
--
.005
.047
.001
.616
.106
.682
.202
.167
.59
.122
.151
--
--
1.0
.198
.066
.003
.036
.011
.113
.047
.466
.349
--
--
--
.014
.254
.258
.011
--
--
.316
--
--
--
.026
.039
.001
--
.009
.387
.01
.15
--
--
--
.109
.055
.031
.777
--
--
--
--
.001
.019
.004
.019
--
.069
.014
.536
.061
.009
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
Rngtt
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC103692329
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
A
A
T
G
T
T
A
A
2
A
A
A
A
C
G
A
A
5
C
T
A
C
A
A
C
3
A
G
C
G
G
A
A
A
T
T
G
T
T
C
G
G
A
A
C
T
T
T
C
C
A
C
C
T
T
T
T
G
C
G
T
A
C
C
A
C
C
A
C
C
C
A
A
C
C
G
20
T
G
2
T
C
A
A
C
A
C
C
3
T
T
T
A
T
2
C
G
T
A
T
A
8
A
T
C
G
T
A
A
A
G
T
C
C
C
A
5
C
A
T
G
T
T
C
A
C
G
G
T
G
A
A
A
C
A
A
A
G
G
G
T
G
G
C
T
G
A
A
G
G
C
G
G
G
2
A
A
A
A
G
G
A
G
A
A
C
T
T
C
T
T
A
C
G
3
C
G
T
T
A
A
A
4
T
C
G
C
C
A
G
T
T
T
  53,143,674
  53,143,701
  53,145,169
  53,146,806
  53,150,834
  53,153,038
  53,155,462
  53,156,029
  53,157,990
  53,158,997
  53,162,117
  53,164,687
  53,166,888
  53,168,774
  53,169,520
  53,170,158
  53,170,536
  53,170,554
  53,170,830
  53,171,835
  53,172,092
  53,172,093
  53,172,692
  53,172,742
  53,174,010
  53,174,497
  53,175,803
  53,176,390
  53,177,875
  53,177,888
  53,177,889
  53,177,996
  53,178,107
  53,179,133
  53,179,872
  53,179,942
  53,180,272
  53,180,531
  53,181,163
  53,181,571
  53,182,419
  53,183,379
  53,184,384
  53,185,535
  53,187,508
  53,188,513
  53,188,858
  53,190,185
  53,191,268
  53,191,374
  53,192,436
  53,193,060
  53,193,123
  53,193,751
  53,193,927
  53,194,221
  53,194,259
  53,194,540
  53,194,887
  53,195,265
  53,195,311
  53,195,879
  53,196,495
  53,196,680
  53,196,933
  53,196,939
  53,197,800
  53,198,412
  53,199,917
  53,200,057
  53,200,377
  53,200,472
  53,200,541
  53,200,994
  53,201,729
  53,202,891
  53,203,781
  53,203,996
  53,204,392
  53,204,834
  53,205,516
  53,205,872
  53,207,683
  53,209,623
  53,213,821
  53,215,319
  53,215,358
  53,215,854
  53,216,313
  53,216,703
  53,218,014
  53,218,565
  53,220,480
  53,220,997
  53,221,145
  53,221,208
  53,221,705
  53,222,899
  53,223,220
  53,223,457
  53,223,690
  53,225,098
  53,225,171
  53,225,347
  53,226,696
  53,226,703
  53,227,388
  53,227,717
  53,228,588
  53,229,332
  53,229,384
  53,229,937
  53,230,265
  53,232,799
  53,233,376
  53,234,204
  53,234,453
  53,238,104
  53,241,933
  53,241,961
  53,242,552
  53,242,639
  53,243,493
  53,245,652
  53,246,485
  53,246,860
  53,248,062
  53,248,468
  53,249,133
  53,249,583
  53,253,123
  53,253,655
  53,254,720
  53,256,049
  53,257,326
  53,257,494
  53,257,590
  53,257,682
  53,258,157
  53,258,502
  53,258,886
  53,259,726
  53,260,377
  53,262,831
  53,264,009
  53,265,218
  53,265,246
  53,267,263
  53,267,754
  53,268,430
  53,270,343
  53,272,198
  53,272,967
  53,274,261
  53,274,356
  53,274,422
  53,281,882
  53,282,377
  53,283,635
  53,285,174
  53,289,867
  53,290,433
  53,293,418
  53,297,380
  53,298,175
  53,298,614
  53,300,247
  53,300,318
  53,300,920
  53,306,804
  53,308,824
  53,310,419
  53,310,740
  53,311,432
  53,316,361
  53,316,680
  53,317,949
  53,319,753
  53,321,353
  53,321,379
  53,322,237
  53,325,611
  53,327,274
  53,328,988
  53,329,641
  53,330,759
  53,353,150
  53,353,942
  53,355,364
  53,355,759
  53,356,600
  53,360,787
  53,360,808
  53,361,087
  53,361,161
T/C
C
G
A/G
C
A
C
G
C
G
2/-
T
G
G
G
G
G/A
A/T
G
-
-
A
G
T
G
-
G
3/-
G
-
A
T
A
G
T
C
2
T/C
A
G
3
T
G/A
A
C
-
T
C
-
T/A
C/G
A
G
T
2
C
C
C
G
A
T
A
C
G
C/G
T
G
A
A
G
T
2
T
C
G
T
C/T
2
-
A
-
-
C
A
5
G
G
G
C/T
T
-
A
C
G
-
-
-
T
-
A
C
T/C
A/G
8/-
T
-
T
C
C
G
G
T
C
G
A
2
A
G
-
T
T
C
3
C
G
C/2
5
T
A
G/33
G
A
G
C
G
C/T
G
A/G
C
G/T
C
C
T/-
A
A
A
-
A
A/G
G
A
A
T
A
A
A
-
G
A/-
G
2
T
A
-
A
C
A/T
G
C
T/C
G
2
C
G
-
A
-
T
7
3
C
A/G
A/G
G
-
C
G
A
T
G
A/2
G/C
-
C
C