Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 331,941 (bp)   Positions: 528
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.928
.984
1.0
1.0
1.0
.003
.008
.01
.065
.331
.007
.055
.364
.082
.764
.501
.029
.314
.089
.868
.237
--
.002
.0
.021
.234
.004
.946
.146
.216
.003
.003
.046
.002
.002
.0
.0
.046
--
.001
.187
--
--
--
.002
.066
.225
.007
.397
.001
.26
.236
.0
.006
.872
.028
.031
.011
--
.004
.995
.074
.012
.003
.006
.015
.0
.012
.006
--
.019
.005
.011
.324
.015
.017
.032
.011
--
--
.0
.131
.119
.019
--
.085
.002
.102
.333
--
.621
.005
.028
.002
1.0
.081
.048
--
--
--
--
--
--
.195
.02
.771
.0
.001
.007
.002
.486
.01
.021
--
--
.033
--
--
.043
.027
--
--
--
--
--
--
.005
.002
.002
.125
.043
.007
.001
.184
.006
.028
.003
.312
.013
.143
.103
.017
.001
.14
.377
.075
.109
.02
.001
.002
.0
.004
.0
.015
.86
.004
--
.002
.176
.03
.001
.0
.208
.003
.954
.773
.066
.202
.033
.024
.07
.022
.002
.062
.176
.019
--
.286
--
--
.127
.019
.385
.018
.053
.006
.011
.0
.001
.079
.055
.011
.641
.002
.082
.026
.003
.006
.003
.072
.002
.03
.529
.0
.967
.004
--
.005
.193
.007
.035
.044
.002
.011
.033
.025
.329
.04
.004
.061
.015
.206
.015
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
--
.0
.032
.038
.004
.005
.003
.001
.0
.004
.039
.009
.003
--
--
.004
.012
.002
.019
.011
.007
--
.029
.002
.189
.008
.014
.001
.0
.002
.038
.551
.704
.234
.006
.001
--
--
--
.123
.003
.0
.628
.03
.0
.007
.021
.717
.0
.001
.0
.004
.949
.484
.009
.0
.009
.001
.305
.045
.067
.447
--
.905
.018
.05
--
.021
.023
.024
.007
.015
.029
.067
.007
.002
.043
.013
.189
.006
.003
.113
.022
--
--
--
.025
.006
.012
--
.001
.132
.011
.001
.006
.001
.001
.255
.006
.0
.0
.0
.018
.002
.001
.34
.0
.022
.087
.06
.007
.007
.003
.0
.001
.01
.009
.01
.029
.008
.018
.002
.144
.062
.236
.031
.003
.001
.0
1.0
.002
.001
.013
.071
.008
.004
.018
.004
.047
.019
.011
.051
.006
.502
.088
.088
.001
.012
.019
.002
--
--
.015
.02
.001
.078
.035
.048
.06
--
--
--
--
--
.011
.133
--
.999
1.0
.997
.166
.111
--
--
.017
.001
.001
.003
.008
.199
.046
--
--
.994
.051
.062
--
--
.012
.006
--
--
.093
.02
--
.019
.005
--
--
--
--
--
.015
--
.028
--
--
.027
.007
.015
.195
.117
--
.001
.104
.073
.071
.034
--
.1
.361
.002
.102
.005
.003
.037
.045
.007
.37
.002
.002
1.0
.014
.022
.945
.164
.338
.967
.011
.029
--
--
.004
.095
--
.015
.008
.002
.03
.012
.049
.015
.064
.001
.005
.003
.002
.025
.0
.001
.003
.001
.002
.012
.031
.01
.0
.955
.005
--
--
.089
.029
--
.131
.228
--
.047
.009
.006
.001
1.0
.004
--
1.0
.004
.993
.009
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.995
.0
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
Rere
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
T
4
C
G
T
T
C
A
C
A
A
G
G
C
G
A
T
A
G
A
T
A
3
C
C
A
G
A
T
A
T
C
T
A
C
T
T
T
C
A
A
G
A
G
A
C
A
C
C
A
G
A
T
C
G
C
G
G
A
A
G
C
A
T
C
C
C
C
C
C
A
G
C
T
A
A
G
T
A
G
8
C
T
G
A
C
T
C
G
C
G
A
A
C
A
A
22
A
C
C
C
C
T
G
A
A
C
A
A
T
T
C
C
3
2
T
T
C
C
G
A
6
T
C
C
G
G
T
T
C
G
T
T
C
C
A
G
G
C
G
T
C
A
G
C
C
G
G
A
A
C
C
G
A
C
G
6
T
A
T
T
G
G
G
C
T
T
G
9
T
C
T
C
T
G
A
A
3
G
G
A
C
4
G
T
G
4
5
T
C
A
C
A
C
G
G
C
G
T
T
A
T
T
C
A
C
G
C
C
C
T
A
T
4
C
T
T
C
A
C
A
C
A
A
4
T
T
T
5
G
A
G
A
C
C
C
T
2
T
T
T
G
C
C
G
G
C
C
T
G
G
A
G
G
A
G
C
G
C
T
G
A
C
G
C
G
T
A
G
T
C
G
4
C
C
A
T
T
C
T
C
G
C
G
C
G
C
A
G
A
T
T
G
A
C
G
G
G
A
4
C
C
T
4
T
A
A
A
G
T
G
G
T
G
A
3
9
G
T
G
G
G
T
G
C
G
G
C
C
T
C
A
A
C
T
C
G
G
G
G
C
C
C
G
G
T
T
C
5
G
A
T
G
T
G
C
A
T
G
C
C
G
A
C
A
C
A
A
T
G
C
2
C
A
G
T
G
T
2
4
T
T
T
G
T
T
T
T
T
A
T
2
G
A
G
G
3
A
G
C
C
G
C
G
C
C
C
T
A
A
G
A
A
A
A
6
G
C
A
C
C
G
G
G
T
G
G
2
25
3
C
C
G
C
C
T
T
G
T
A
C
A
G
A
T
A
C
A
C
A
A
G
G
C
G
A
T
C
G
C
A
C
A
T
G
G
A
A
C
13
C
T
C
T
C
G
A
T
G
G
5
C
T
C
C
G
C
A
4
C
G
G
C
G
G
T
A
G
G
A
A
G
A
T
G
A
G
T
T
G
A
C
A
C
G
C
A
C
2
A
G
T
T
C
C
A
  170,961,268
  170,961,674
  170,962,266
  170,962,299
  170,962,315
  170,963,752
  170,964,521
  170,964,522
  170,965,763
  170,966,160
  170,966,292
  170,966,660
  170,967,020
  170,968,062
  170,968,776
  170,969,417
  170,969,758
  170,971,003
  170,972,684
  170,972,760
  170,973,172
  170,973,260
  170,973,357
  170,973,402
  170,974,535
  170,974,855
  170,975,102
  170,975,608
  170,975,928
  170,975,967
  170,976,115
  170,976,248
  170,976,533
  170,979,290
  170,981,435
  170,981,438
  170,981,439
  170,982,045
  170,983,048
  170,984,483
  170,984,849
  170,985,797
  170,986,052
  170,986,114
  170,986,662
  170,987,238
  170,987,301
  170,987,738
  170,987,821
  170,988,016
  170,988,107
  170,988,410
  170,988,574
  170,989,135
  170,989,578
  170,989,628
  170,990,717
  170,991,889
  170,993,113
  170,993,754
  170,994,492
  170,994,865
  170,995,066
  170,995,183
  170,995,856
  170,996,477
  170,996,966
  170,996,983
  170,997,800
  170,998,385
  170,998,539
  171,000,039
  171,001,062
  171,001,130
  171,001,870
  171,002,575
  171,002,896
  171,003,173
  171,004,067
  171,004,647
  171,007,011
  171,007,550
  171,007,552
  171,007,565
  171,007,860
  171,008,279
  171,010,202
  171,010,786
  171,010,853
  171,012,292
  171,012,559
  171,013,119
  171,013,194
  171,013,199
  171,014,260
  171,014,551
  171,014,646
  171,018,917
  171,019,072
  171,019,980
  171,020,328
  171,020,565
  171,021,071
  171,021,600
  171,021,809
  171,022,045
  171,022,163
  171,022,232
  171,022,758
  171,023,112
  171,023,516
  171,023,596
  171,023,778
  171,024,994
  171,025,232
  171,026,179
  171,026,338
  171,026,341
  171,028,491
  171,028,803
  171,029,186
  171,029,826
  171,030,010
  171,030,114
  171,030,671
  171,031,038
  171,031,682
  171,032,473
  171,032,938
  171,033,307
  171,033,763
  171,033,775
  171,034,045
  171,034,674
  171,035,437
  171,035,884
  171,035,898
  171,036,678
  171,037,201
  171,037,941
  171,038,048
  171,040,005
  171,040,870
  171,040,909
  171,041,010
  171,041,278
  171,042,048
  171,042,490
  171,042,665
  171,042,825
  171,042,838
  171,044,059
  171,045,197
  171,046,605
  171,046,888
  171,047,220
  171,047,898
  171,048,109
  171,049,458
  171,049,778
  171,049,993
  171,050,091
  171,050,484
  171,051,277
  171,051,730
  171,051,744
  171,052,669
  171,053,954
  171,054,142
  171,054,875
  171,055,564
  171,055,574
  171,055,892
  171,056,647
  171,057,229
  171,057,323
  171,058,324
  171,059,191
  171,059,992
  171,060,364
  171,061,556
  171,062,477
  171,062,801
  171,063,549
  171,064,341
  171,064,432
  171,064,607
  171,064,653
  171,064,710
  171,065,204
  171,065,400
  171,065,403
  171,065,542
  171,065,970
  171,066,063
  171,066,071
  171,066,653
  171,067,111
  171,067,814
  171,067,963
  171,068,254
  171,069,249
  171,069,352
  171,069,681
  171,069,804
  171,070,205
  171,071,064
  171,072,314
  171,073,516
  171,074,271
  171,074,786
  171,074,952
  171,075,176
  171,075,502
  171,075,539
  171,075,541
  171,075,626
  171,075,958
  171,076,405
  171,077,194
  171,077,314
  171,077,497
  171,077,615
  171,078,064
  171,078,106
  171,078,231
  171,078,242
  171,078,409
  171,078,430
  171,079,083
  171,079,309
  171,080,234
  171,081,862
  171,082,444
  171,082,757
  171,083,406
  171,083,455
  171,083,488
  171,083,837
  171,084,337
  171,084,921
  171,085,442
  171,085,812
  171,086,243
  171,086,528
  171,086,567
  171,086,692
  171,086,797
  171,087,955
  171,088,251
  171,088,385
  171,088,406
  171,088,424
  171,089,636
  171,090,198
  171,090,731
  171,091,343
  171,092,492
  171,092,734
  171,093,127
  171,094,265
  171,094,900
  171,095,172
  171,095,862
  171,095,985
  171,096,180
  171,097,010
  171,098,632
  171,099,076
  171,099,081
  171,100,854
  171,101,471
  171,101,807
  171,104,855
  171,106,969
  171,107,194
  171,108,430
  171,110,146
  171,112,952
  171,113,608
  171,113,935
  171,114,576
  171,115,786
  171,116,638
  171,117,441
  171,122,157
  171,124,985
  171,125,862
  171,125,992
  171,126,524
  171,128,279
  171,129,030
  171,130,129
  171,130,169
  171,131,530
  171,133,255
  171,134,620
  171,135,467
  171,136,033
  171,138,795
  171,139,939
  171,140,027
  171,141,505
  171,141,595
  171,142,957
  171,143,177
  171,143,408
  171,143,790
  171,148,713
  171,149,046
  171,149,352
  171,149,713
  171,150,918
  171,155,000
  171,157,480
  171,157,594
  171,158,701
  171,158,861
  171,158,939
  171,160,727
  171,160,843
  171,161,117
  171,162,050
  171,163,153
  171,163,810
  171,166,337
  171,166,472
  171,166,862
  171,167,154
  171,167,443
  171,167,521
  171,167,664
  171,167,989
  171,168,122
  171,168,284
  171,168,410
  171,169,052
  171,169,402
  171,170,208
  171,170,344
  171,170,350
  171,170,354
  171,170,437
  171,170,438
  171,170,649
  171,170,782
  171,170,784
  171,170,812
  171,170,934
  171,171,012
  171,171,129
  171,171,540
  171,171,553
  171,171,937
  171,171,967
  171,171,986
  171,172,183
  171,172,240
  171,172,416
  171,172,525
  171,172,650
  171,172,816
  171,173,125
  171,173,141
  171,173,323
  171,173,346
  171,173,464
  171,173,466
  171,173,472
  171,173,825
  171,174,024
  171,174,370
  171,175,149
  171,175,334
  171,175,595
  171,176,422
  171,176,457
  171,176,458
  171,176,616
  171,178,092
  171,178,465
  171,178,695
  171,179,728
  171,179,731
  171,180,099
  171,180,179
  171,180,189
  171,180,301
  171,180,623
  171,181,068
  171,181,304
  171,181,344
  171,181,922
  171,181,931
  171,182,018
  171,182,055
  171,182,611
  171,182,975
  171,183,161
  171,184,166
  171,184,439
  171,184,472
  171,184,536
  171,184,547
  171,184,644
  171,184,713
  171,185,352
  171,186,319
  171,186,598
  171,186,606
  171,187,461
  171,187,549
  171,188,073
  171,188,846
  171,190,197
  171,190,624
  171,191,054
  171,193,499
  171,194,445
  171,194,461
  171,194,568
  171,195,013
  171,196,193
  171,196,848
  171,197,109
  171,197,511
  171,198,179
  171,198,350
  171,198,751
  171,200,091
  171,200,094
  171,200,287
  171,200,361
  171,200,376
  171,201,050
  171,202,655
  171,202,716
  171,204,550
  171,204,672
  171,204,855
  171,205,310
  171,206,490
  171,207,348
  171,207,405
  171,207,464
  171,207,911
  171,208,584
  171,209,031
  171,209,032
  171,209,043
  171,209,411
  171,209,867
  171,209,887
  171,209,931
  171,210,730
  171,211,900
  171,212,206
  171,212,583
  171,213,625
  171,214,883
  171,215,198
  171,215,358
  171,215,359
  171,215,482
  171,215,918
  171,216,161
  171,217,731
  171,217,772
  171,218,472
  171,218,632
  171,219,116
  171,219,550
  171,222,661
  171,222,884
  171,224,348
  171,224,492
  171,224,753
  171,225,445
  171,227,978
  171,229,992
  171,230,295
  171,230,930
  171,231,952
  171,232,038
  171,232,930
  171,236,147
  171,237,107
  171,240,079
  171,242,385
  171,242,407
  171,242,433
  171,244,455
  171,248,185
  171,249,804
  171,249,816
  171,250,196
  171,251,046
  171,253,684
  171,255,079
  171,255,163
  171,255,968
  171,257,029
  171,257,759
  171,259,237
  171,259,584
  171,262,131
  171,263,483
  171,267,849
  171,268,533
  171,268,647
  171,269,525
  171,270,228
  171,270,841
  171,272,268
  171,273,386
  171,275,590
  171,278,033
  171,281,628
  171,281,724
  171,283,530
  171,284,999
  171,287,059
  171,287,138
  171,287,171
  171,287,179
  171,287,361
  171,289,731
  171,291,916
A
-
3
-
2
A
G
A
C/T
C
G
G
G
C
A
2
C
G
3
G
A
T
C
G
-
T
T
A/2
A
-
C
A/2
T/C
C/T
G
G
G
T/C
T/G
4
20
G
G
T
G
T
2
T
G
T
T
A/G
A
G
C
T
A
C/T
C
A
A/-
A/G
A
A
G
3
T
T
T
A
T
T
T
T
T
T/C
2
G
A
T/C
C
G/T
-
A
T/C
A
G
T
T/C
T
A
T
A
G
-
T
G
G
-
A/T
G
A
G
T
C
A
C
16
G
G
A/G
C
G
T
T
-
-
A
C
G
T
A
-
6/-
C
C/T
T
A
A
5
G
T
-
4
G
T
T
A/G
A
G/T
T
A
T/C
T
G
A
T
T
G/A
A
G
G
T
T
A
A/T
T
2
-
T/C
G
2
C
T
A
A
C/2
12
C
A
9/-
G
T
5
CT/3
T/G
A
A/G
G
-
A
A
T
T
-
T
-
2
-
-
C
T
G
C/A
G
G
A
A
T
2
T/G
C
A/G
C
C
9
T
G
T
C/G
A
2
C
5
T/-
4/-
T
C
9
A
G
T
G
-
A/G
G
4/-
C
C
C
5/-
33
A/2
A
G
8
A
2
4
-
C
C
C
A
2
T
C
A
T
T
G
A
A
G
A
A
A/-
A
T
G/A
T
T/G
T
C
T
A
C/2
T
2
T
G/T
T/C
T
-
-
T
T
G
A
3
C/G
-
C/T
A
C/T
T
T
C
T
G
A
G
T/5
-
5
G
G
A
G/2
6
T
-
T
G
G
4/-
G
G
G
G
-
C
A
T
C
G/A
-
3/-
-
A
G
-
A
G/A
C
A
C/2
T
C
T
T
C
T
T
C
4
G
C/A
G/A
A
A
A
C/T
C/T
T
T
A
C
C
2
-
A
G
C
A
C
A
T
3
C
T
T
T
A
A/11
C/T
G
G
C
C
C
G/A
G
-
T
A/G
C
C
2
C
-
4/-
G
G
T/-
T
C
C
C
C
C
T
G
2/-
A
T
A
C
-
G
A
G
A
A
T
G/T
T
T
A
T/2
G
G
A
C
G
G
G
-
T
C/T
T
C/T
T
A
A
A
G
3
G/A
-
-
3/-
16
G
A
G
T
T/C
C
A
2
A/C
T
T
G/T
G
C
2
G
A/2
C/T
3
A/T
T
A
T
A
A/G
T/4
T
A
C/A
A/G
T
2
C
2
A
G
G
T
-
3
T/C
A
C
2
C
A/G
C
A
C
5/-
C/2
G
T
T
T
G
G
-
T
A
G/A
C/A
A
A
C
G
G/2
A
G
T
C
T
G
G/T
G
12
C
C
G/A
C
C/T
G
T
A
T
G
T
-
G
-
C
C
G
C/T
A/C