Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 81,203 (bp)   Positions: 347
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.079
.012
.003
.009
.019
.003
.004
.0
.102
.0
.0
.001
.001
.0
.004
.001
.0
.016
.002
.002
.002
.043
.23
.974
.667
.001
.363
.0
.0
.065
.0
.004
.0
.296
.001
.002
.055
.001
.003
.002
.044
.599
.002
.005
.0
.001
.015
.0
.015
.0
.521
.016
.002
.089
.005
--
--
--
.057
.181
.007
.126
.0
.014
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.404
.432
.033
.131
.001
.725
.018
.134
.14
.207
.023
.0
.019
.494
.037
.348
.158
.009
.193
.007
.26
.067
.003
.019
.008
.021
.038
.017
.007
.987
.0
.0
.002
--
--
.018
.034
.001
.003
.104
.001
.019
.0
.032
.0
.002
.355
.0
.008
.021
.01
.014
.045
.002
.003
1.0
1.0
.763
.869
.0
.007
.0
.006
.0
.002
.107
.049
.005
.002
.035
.0
.058
.092
.675
.376
.001
.778
.211
.001
.053
.058
.01
.131
.107
.001
.136
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.716
.004
.576
.448
.148
.101
.161
.007
.006
.003
.012
1.0
1.0
.998
.999
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
.142
.641
.104
.045
.046
.015
--
.082
.065
.057
.164
.308
.113
.07
.019
.025
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.377
.042
.329
.146
.178
.023
.001
.0
.895
.828
.39
.049
.223
.5
.208
.057
.282
.027
.285
.151
.294
.603
.332
.022
.452
.516
.505
.959
.647
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.067
--
--
.078
.024
.001
.031
.065
.009
.045
.016
.001
.001
.0
.001
.003
.168
.109
.289
.216
.108
.048
.016
.014
.005
.05
.089
.043
.043
.03
.031
.08
.066
.0
.003
.09
.041
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
Rasa1
G
T
T
T
C
C
A
G
C
G
G
G
G
A
G
A
A
A
A
T
A
C
2
G
G
4
A
G
C
C
A
G
T
C
C
C
G
A
G
C
T
A
C
C
A
G
T
G
C
C
2
T
G
A
G
T
T
10
A
T
G
2
T
G
16
A
C
G
G
A
A
T
A
A
G
A
C
T
G
A
G
C
T
G
A
C
9
T
A
A
T
A
C
A
C
5
C
C
T
A
C
A
G
G
T
G
C
G
A
G
6
T
C
3
C
C
A
G
C
G
A
C
G
A
G
2
A
C
A
C
A
C
G
T
T
G
2
A
T
T
4
A
A
T
C
G
A
T
A
G
G
T
T
A
C
A
G
T
A
G
A
C
A
3
T
G
C
T
T
C
A
T
T
A
A
T
T
G
C
G
A
A
C
T
C
C
G
G
G
T
G
T
C
4
T
C
A
C
G
T
T
A
T
T
G
G
2
A
G
C
C
T
G
G
G
A
C
A
G
C
A
G
A
T
C
A
C
C
C
T
C
T
A
C
A
C
C
G
T
2
G
G
A
C
G
3
A
T
C
C
C
A
3
2
C
T
G
T
C
T
T
G
A
G
C
G
A
C
A
G
G
G
G
T
A
A
T
C
A
G
C
T
G
G
A
C
C
A
A
A
T
4
2
T
5
A
A
4
2
G
G
C
G
C
C
A
A
A
G
A
A
A
A
T
G
A
A
2
T
G
5
3
T
G
T
A
G
A
A
G
G
3
C
A
C
A
11
12
T
A
A
A
G
T
T
A
T
  13,470,690
  13,470,944
  13,471,374
  13,471,500
  13,472,007
  13,472,031
  13,472,111
  13,472,287
  13,472,622
  13,473,242
  13,473,243
  13,473,337
  13,473,440
  13,473,562
  13,473,672
  13,473,691
  13,473,903
  13,473,941
  13,474,061
  13,474,356
  13,474,427
  13,474,511
  13,474,958
  13,475,232
  13,475,873
  13,476,017
  13,476,550
  13,476,692
  13,478,021
  13,478,047
  13,478,289
  13,478,598
  13,479,962
  13,480,495
  13,480,544
  13,480,756
  13,480,786
  13,480,916
  13,481,224
  13,481,263
  13,481,367
  13,481,603
  13,482,460
  13,482,528
  13,482,922
  13,483,237
  13,484,308
  13,484,659
  13,484,695
  13,484,789
  13,485,068
  13,485,491
  13,486,881
  13,487,617
  13,487,906
  13,488,055
  13,488,059
  13,488,074
  13,488,433
  13,488,743
  13,489,359
  13,490,033
  13,490,444
  13,490,593
  13,490,918
  13,491,592
  13,491,649
  13,491,717
  13,491,729
  13,492,117
  13,492,197
  13,492,596
  13,493,021
  13,493,148
  13,493,176
  13,493,430
  13,493,486
  13,493,495
  13,493,547
  13,493,549
  13,493,618
  13,494,015
  13,494,021
  13,494,070
  13,494,447
  13,494,461
  13,494,464
  13,494,493
  13,494,958
  13,495,043
  13,495,402
  13,495,687
  13,495,971
  13,496,264
  13,496,632
  13,496,833
  13,497,018
  13,497,249
  13,497,448
  13,497,513
  13,497,536
  13,498,265
  13,498,397
  13,498,853
  13,498,952
  13,499,234
  13,499,748
  13,499,946
  13,499,973
  13,500,023
  13,500,086
  13,500,201
  13,500,453
  13,500,640
  13,500,681
  13,501,021
  13,501,215
  13,501,258
  13,501,268
  13,501,296
  13,501,820
  13,501,828
  13,501,957
  13,502,086
  13,502,105
  13,502,243
  13,502,245
  13,502,590
  13,502,592
  13,502,615
  13,503,126
  13,503,431
  13,503,529
  13,503,956
  13,504,422
  13,505,084
  13,505,537
  13,506,097
  13,506,285
  13,506,414
  13,506,576
  13,506,731
  13,507,020
  13,507,487
  13,507,488
  13,507,907
  13,507,945
  13,508,403
  13,508,436
  13,508,539
  13,508,770
  13,508,814
  13,509,213
  13,509,365
  13,509,424
  13,509,753
  13,509,986
  13,510,078
  13,510,754
  13,511,547
  13,511,928
  13,511,969
  13,512,328
  13,512,590
  13,512,601
  13,512,872
  13,512,953
  13,513,000
  13,513,078
  13,513,319
  13,513,845
  13,514,148
  13,514,291
  13,514,372
  13,514,664
  13,514,923
  13,515,187
  13,515,261
  13,515,291
  13,515,636
  13,515,779
  13,516,160
  13,516,175
  13,516,192
  13,516,286
  13,516,292
  13,516,323
  13,516,337
  13,516,403
  13,516,554
  13,517,062
  13,517,175
  13,517,552
  13,517,871
  13,518,398
  13,518,526
  13,518,612
  13,518,951
  13,519,243
  13,519,358
  13,519,368
  13,519,610
  13,519,774
  13,520,015
  13,520,018
  13,520,075
  13,520,185
  13,520,381
  13,520,604
  13,520,800
  13,520,827
  13,520,860
  13,520,868
  13,520,898
  13,520,899
  13,520,914
  13,520,978
  13,521,009
  13,521,028
  13,521,050
  13,521,065
  13,521,099
  13,521,106
  13,521,165
  13,521,193
  13,521,228
  13,521,248
  13,521,309
  13,521,339
  13,524,860
  13,528,662
  13,529,309
  13,529,904
  13,530,321
  13,530,517
  13,530,974
  13,531,235
  13,531,333
  13,531,662
  13,531,674
  13,531,941
  13,532,137
  13,532,148
  13,532,679
  13,533,315
  13,533,330
  13,533,332
  13,533,592
  13,533,667
  13,533,671
  13,533,676
  13,533,866
  13,533,904
  13,533,911
  13,534,053
  13,534,195
  13,534,339
  13,534,344
  13,534,352
  13,534,353
  13,534,365
  13,534,366
  13,534,375
  13,534,390
  13,534,433
  13,534,464
  13,534,891
  13,535,428
  13,535,562
  13,535,581
  13,535,883
  13,535,900
  13,535,904
  13,535,906
  13,535,974
  13,535,996
  13,536,121
  13,536,428
  13,536,687
  13,536,703
  13,536,816
  13,537,309
  13,537,341
  13,537,563
  13,537,656
  13,537,806
  13,538,158
  13,538,326
  13,538,549
  13,538,575
  13,538,766
  13,539,181
  13,539,698
  13,539,913
  13,540,017
  13,540,724
  13,540,919
  13,541,323
  13,541,325
  13,541,790
  13,542,093
  13,542,110
  13,542,686
  13,542,859
  13,542,862
  13,543,040
  13,543,041
  13,543,052
  13,544,470
  13,544,631
  13,544,642
  13,544,746
  13,544,778
  13,544,825
  13,544,926
  13,545,326
  13,546,266
  13,546,346
  13,546,730
  13,546,905
  13,547,020
  13,547,022
  13,547,262
  13,547,800
  13,547,954
  13,548,007
  13,548,095
  13,548,394
  13,549,005
  13,549,108
  13,549,110
  13,549,114
  13,549,254
  13,549,353
  13,549,367
  13,549,437
  13,549,439
  13,549,443
  13,549,444
  13,549,461
  13,549,471
  13,549,944
  13,550,497
  13,550,762
  13,551,234
  13,551,460
  13,551,695
A
-
-
C
T
G
T
2
T
A
A
T
A
G
A
G
G
T
T
A
G
T
-
T
A
-
G
C
G
A
G
A
6
T
A
G
A
G
A
T
C
G
2
T
G
A
C
A
T
T
-
A
A
-
A
C
C
10/-
G
A
5
-
C
A
-
C
T
2
A
4
-
C
G
G
A
G
G
C
C
T
A
T
C
A
C
T
-
2
C
T
2
G
T
2
T
-
A
11
-
G
2
T
A
A
C
A
G
C
2
A
-
C
T
-
C/T
T
G
A
T
A
-
A
G/T
A/2
G/-
-
A/-
T
G
T
-
T
C
2
C
A
-
T
G
A
-
G
T
C
A
A
G
C
G
A
C
2
5
T
A
4
A
C
G
A
T
T
G
-
C
T
T
C
G
T
G
G
C
4
G
C
G
A
T
C
5
-
T
A
T
T
A
T
C
C
A
A
A
-
A
T
G
T
A
A
G
G
C
C
C
A
-
T
C
C/G
C/A
C
A
C
A
C
A
T
C
T
G
A
C
G
T
C
G
G
T
T/A
A
A
G
T
G
G
T
GT/3
C
-
C
T
-
T
GA/4
3/-
A/-
G
2
C/2
2
G
-
2/-
T
C
-
2
A
A
T/C
G/A
A/G
G/A
C/T
G/A
G
T
C
C
?
G/A
G/A
T/A
G
G
C
T
G
T
A
A
2
A
G
T
T
-
C
G
7
-
-
TA/3
5/-
C
-
4/-
2/-
C
A
T
A
T
C/2
12
A/2
2
A
-
A/5
G
C
3
A
G
G
-
C
A
-
-
C
C
C
C
A
-
G
A
A
-
T
G
A
-
-
-
-
A/G
G
G
A
C
C
G
G