Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 134,712 (bp)   Positions: 507
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.345
.002
.002
.241
.015
.0
.002
.0
.005
.033
.0
.001
.006
.001
.0
.002
.037
.341
.023
.24
.0
.594
.001
.064
.001
.072
.161
.004
.002
.088
.015
.003
.008
.022
.001
.041
.062
.211
.092
--
.433
.012
.002
.136
.113
.04
.08
.001
.009
.001
.004
.001
.004
.001
.001
.004
.0
.001
.001
.079
.174
.002
.001
.016
.284
.008
.058
.005
.012
.037
.0
.002
.003
.72
.003
.041
.331
.016
--
--
.003
.991
.99
.994
.639
.086
.026
--
--
--
.001
.007
--
--
.048
.079
.162
.002
.002
.022
.01
.017
.126
.013
.05
.771
--
.099
--
--
.006
.0
.003
.002
.003
.147
.004
.381
.004
.419
.426
.627
.015
.017
.114
.128
.135
.014
--
.04
.548
.07
.009
.092
.387
.001
.009
.001
.005
.005
.0
.007
.012
.001
.001
.01
.019
.001
.003
.053
.001
.001
.001
.006
.0
.001
.001
.155
.004
.024
.421
.018
.056
.372
.004
.041
.057
.021
--
--
.002
.0
.011
.093
.004
.024
.047
.055
.002
.038
.029
.031
.001
.0
.003
.903
.04
.016
.001
.0
.006
.067
.064
.014
.001
.003
.006
.001
.059
.087
--
--
--
--
.098
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.303
.003
--
--
--
.034
.011
.007
.002
.044
.088
.005
.004
.016
.002
.014
.088
.026
.073
.008
.002
.086
.092
.023
.028
.016
.003
.003
.004
.008
.02
.021
--
--
--
--
--
--
.051
.07
.474
.215
.046
.015
.033
.002
.001
.062
.007
--
.144
.015
.115
.039
.075
--
--
--
--
.043
.152
.015
.006
.05
.284
.391
.358
.008
.04
.057
.024
.163
.057
.055
.001
.019
.078
.003
.557
.003
.016
.022
.141
.004
.007
.006
.008
.004
.01
--
--
--
--
.2
.241
.148
.061
.045
.065
.002
.083
.01
.008
.202
--
--
--
--
--
--
--
.034
.012
.008
.105
.171
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.734
.003
--
--
.097
.087
.146
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
--
--
--
.043
--
.122
.002
.001
.14
.016
.113
--
.024
.003
--
--
--
--
--
--
.009
.079
.048
.866
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.024
.004
.016
--
--
--
.009
.035
.071
.034
.061
.061
.116
.174
.001
.061
.082
.133
.954
.004
.05
--
--
--
--
.044
.001
.0
.0
.334
.021
.002
.004
.0
.001
.051
.207
.061
.003
.004
.0
.001
.001
--
--
--
--
.003
.667
.241
.0
.032
.088
.004
.009
.0
.008
.253
.004
.002
.013
--
--
.179
--
--
--
--
--
.109
.124
--
--
.029
.003
.07
.001
.035
.006
.027
.013
.013
.113
.108
--
--
--
.003
--
.05
--
--
.08
.002
.004
--
--
.076
.004
.054
--
.602
.05
.005
.025
.003
.009
.215
.245
.074
.067
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
T
C
A
A
A
A
A
C
A
C
A
T
C
A
T
A
C
T
G
T
G
A
T
A
12
A
A
G
T
3
G
C
G
C
C
C
A
T
C
G
G
T
T
A
G
A
A
G
G
G
C
C
G
C
T
A
T
A
C
G
2
G
A
C
G
A
A
C
G
G
T
A
G
16
A
C
3
C
A
G
C
T
G
G
G
12
A
A
A
G
A
C
A
A
8
6
A
A
C
T
G
C
C
C
C
A
G
G
A
4
G
T
G
T
A
T
A
A
A
C
A
T
C
A
C
C
C
A
A
G
A
107
C
A
A
A
G
G
G
C
G
G
G
C
C
A
A
A
T
T
A
T
C
C
T
T
G
8
A
G
C
C
G
A
A
3
T
8
C
4
A
C
G
A
T
G
C
23
C
G
T
T
G
T
T
A
G
A
T
C
T
G
A
A
T
A
T
T
T
C
A
G
C
G
G
G
2
G
A
G
G
A
C
T
T
A
T
G
G
T
G
A
G
A
A
C
G
C
A
C
T
T
A
12
G
A
T
C
G
G
A
A
C
G
T
T
G
T
G
A
G
A
4
G
G
G
A
5
T
A
T
C
T
A
C
A
C
A
G
A
G
10
3
A
C
A
4
T
G
C
2
A
C
C
G
A
T
G
A
T
C
C
A
C
C
C
A
G
T
T
G
T
T
16
A
G
C
G
C
C
T
T
T
T
G
C
A
A
G
G
C
G
G
G
G
G
2
T
A
G
G
A
T
A
C
G
G
C
A
T
A
T
C
A
A
T
C
T
2
T
28
C
G
C
C
2
T
T
A
G
C
C
T
8
C
A
G
G
T
4
C
G
T
C
G
G
A
A
A
A
A
G
G
C
T
G
G
T
T
C
G
G
G
G
T
T
C
T
A
T
C
C
C
T
C
G
G
G
T
2
A
A
T
3
G
T
A
A
A
53
G
C
A
T
C
A
C
T
G
G
A
C
G
C
T
A
T
G
C
T
G
C
A
G
T
2
C
C
A
A
A
G
3
C
C
A
C
C
G
A
A
A
A
12
2
T
G
A
T
A
A
C
G
T
C
G
T
2
A
A
C
A
A
G
T
T
A
A
T
2
C
C
G
T
C
C
C
C
4
G
A
A
G
8
12
10
A
  112,902,370
  112,902,427
  112,902,647
  112,902,826
  112,903,097
  112,903,293
  112,903,513
  112,903,843
  112,903,864
  112,903,901
  112,904,058
  112,904,176
  112,904,233
  112,904,348
  112,905,475
  112,905,664
  112,907,464
  112,907,712
  112,907,839
  112,907,959
  112,908,309
  112,908,879
  112,909,173
  112,909,972
  112,910,076
  112,910,250
  112,910,252
  112,910,331
  112,910,535
  112,910,681
  112,910,968
  112,911,127
  112,911,662
  112,911,838
  112,912,413
  112,912,435
  112,912,444
  112,912,674
  112,913,022
  112,913,104
  112,913,227
  112,913,920
  112,913,935
  112,914,462
  112,914,889
  112,915,041
  112,915,114
  112,915,182
  112,915,514
  112,915,599
  112,916,048
  112,916,244
  112,916,284
  112,916,301
  112,916,312
  112,916,838
  112,916,851
  112,916,866
  112,916,973
  112,917,007
  112,917,236
  112,917,300
  112,917,482
  112,917,658
  112,917,852
  112,917,974
  112,918,005
  112,918,017
  112,918,030
  112,918,067
  112,918,092
  112,918,096
  112,918,097
  112,918,164
  112,918,671
  112,918,701
  112,918,808
  112,918,986
  112,919,155
  112,919,164
  112,919,255
  112,919,773
  112,919,774
  112,920,045
  112,920,108
  112,920,672
  112,920,907
  112,922,564
  112,922,831
  112,923,346
  112,923,726
  112,923,842
  112,924,332
  112,925,049
  112,925,547
  112,925,549
  112,925,554
  112,926,069
  112,926,148
  112,926,354
  112,926,588
  112,927,428
  112,927,459
  112,927,538
  112,927,634
  112,928,817
  112,928,959
  112,929,043
  112,929,278
  112,929,561
  112,930,980
  112,931,224
  112,931,252
  112,931,419
  112,931,541
  112,931,942
  112,932,660
  112,932,818
  112,933,306
  112,933,596
  112,933,597
  112,933,629
  112,933,770
  112,933,778
  112,934,031
  112,934,080
  112,934,081
  112,934,189
  112,934,454
  112,934,613
  112,934,825
  112,934,853
  112,934,979
  112,935,113
  112,935,181
  112,935,321
  112,935,330
  112,935,336
  112,935,671
  112,935,711
  112,935,726
  112,935,735
  112,935,817
  112,935,863
  112,935,934
  112,936,105
  112,936,163
  112,936,257
  112,936,277
  112,936,423
  112,936,634
  112,936,732
  112,936,733
  112,937,021
  112,937,033
  112,937,505
  112,937,736
  112,938,041
  112,938,432
  112,938,643
  112,939,678
  112,940,445
  112,940,474
  112,941,363
  112,941,471
  112,942,782
  112,942,785
  112,943,012
  112,943,882
  112,944,035
  112,944,641
  112,945,166
  112,945,889
  112,946,025
  112,946,150
  112,946,287
  112,946,920
  112,946,922
  112,946,971
  112,947,331
  112,948,581
  112,948,587
  112,948,628
  112,948,740
  112,948,745
  112,948,853
  112,949,101
  112,949,102
  112,949,213
  112,949,274
  112,949,369
  112,949,436
  112,949,437
  112,949,454
  112,949,482
  112,949,527
  112,949,946
  112,950,063
  112,950,248
  112,950,290
  112,951,937
  112,951,947
  112,951,969
  112,951,987
  112,952,280
  112,952,741
  112,952,751
  112,952,763
  112,952,772
  112,952,985
  112,953,028
  112,953,173
  112,953,210
  112,953,372
  112,953,474
  112,953,672
  112,953,809
  112,954,062
  112,955,578
  112,955,590
  112,955,826
  112,955,913
  112,955,922
  112,955,934
  112,956,158
  112,956,379
  112,956,494
  112,956,495
  112,956,534
  112,956,583
  112,956,691
  112,956,818
  112,956,936
  112,957,015
  112,957,087
  112,957,136
  112,957,223
  112,957,229
  112,957,248
  112,957,428
  112,957,452
  112,957,502
  112,957,546
  112,957,554
  112,957,562
  112,957,594
  112,957,826
  112,957,959
  112,958,132
  112,958,253
  112,958,647
  112,958,648
  112,958,773
  112,958,869
  112,958,946
  112,958,959
  112,958,998
  112,959,075
  112,959,125
  112,959,265
  112,959,290
  112,959,690
  112,959,819
  112,960,346
  112,960,479
  112,960,612
  112,960,815
  112,960,903
  112,960,990
  112,961,081
  112,961,165
  112,961,206
  112,961,213
  112,961,230
  112,961,459
  112,961,484
  112,961,700
  112,961,945
  112,962,025
  112,962,205
  112,962,271
  112,962,320
  112,962,366
  112,962,598
  112,963,025
  112,963,049
  112,963,276
  112,963,304
  112,963,308
  112,963,324
  112,963,513
  112,963,607
  112,963,746
  112,963,813
  112,964,312
  112,964,432
  112,964,555
  112,964,668
  112,964,789
  112,964,870
  112,964,871
  112,964,872
  112,964,873
  112,964,929
  112,965,097
  112,965,464
  112,965,506
  112,965,546
  112,965,717
  112,965,771
  112,965,824
  112,965,866
  112,966,202
  112,966,297
  112,966,460
  112,966,531
  112,966,613
  112,966,714
  112,966,831
  112,966,929
  112,967,037
  112,967,110
  112,967,146
  112,967,147
  112,967,166
  112,967,170
  112,967,346
  112,967,406
  112,967,531
  112,967,800
  112,967,840
  112,967,990
  112,968,004
  112,968,205
  112,968,323
  112,968,538
  112,968,819
  112,968,833
  112,968,846
  112,968,947
  112,969,116
  112,969,301
  112,969,396
  112,969,454
  112,969,629
  112,969,840
  112,969,860
  112,969,954
  112,970,230
  112,970,374
  112,970,404
  112,970,479
  112,970,488
  112,970,589
  112,970,650
  112,970,777
  112,970,915
  112,971,379
  112,971,383
  112,975,783
  112,980,586
  112,980,945
  112,981,178
  112,981,540
  112,982,926
  112,983,220
  112,983,560
  112,984,191
  112,984,384
  112,985,474
  112,985,546
  112,986,734
  112,987,636
  112,987,933
  112,988,469
  112,991,012
  112,992,110
  112,992,134
  112,992,991
  112,993,038
  112,993,049
  112,995,186
  112,995,814
  112,996,232
  112,996,910
  112,997,193
  112,998,200
  112,998,214
  112,998,219
  112,998,224
  112,998,243
  112,998,692
  112,998,811
  112,998,950
  112,999,043
  112,999,052
  112,999,151
  112,999,168
  112,999,216
  112,999,288
  112,999,303
  112,999,315
  112,999,319
  112,999,379
  112,999,532
  112,999,625
  112,999,720
  112,999,849
  112,999,892
  113,000,064
  113,000,396
  113,000,413
  113,000,435
  113,000,468
  113,000,574
  113,000,735
  113,000,875
  113,001,033
  113,001,190
  113,001,294
  113,001,513
  113,001,604
  113,001,689
  113,001,796
  113,001,830
  113,001,955
  113,002,056
  113,002,058
  113,002,152
  113,002,214
  113,002,474
  113,002,580
  113,002,608
  113,002,649
  113,002,652
  113,002,821
  113,002,865
  113,002,896
  113,003,975
  113,004,153
  113,006,228
  113,006,317
  113,006,342
  113,007,061
  113,007,204
  113,007,582
  113,007,980
  113,008,172
  113,008,708
  113,009,908
  113,009,936
  113,010,228
  113,010,837
  113,010,843
  113,011,321
  113,011,683
  113,011,890
  113,011,916
  113,012,907
  113,013,153
  113,013,157
  113,013,161
  113,013,166
  113,013,171
  113,013,276
  113,013,717
  113,014,402
  113,014,403
  113,014,551
  113,014,622
  113,014,663
  113,015,097
  113,015,766
  113,015,871
  113,016,175
  113,016,645
  113,016,817
  113,016,914
  113,016,915
  113,017,155
  113,017,198
  113,017,517
  113,018,492
  113,018,702
  113,019,742
  113,020,683
  113,020,934
  113,022,242
  113,022,367
  113,024,750
  113,025,206
  113,025,326
  113,026,349
  113,026,533
  113,027,958
  113,029,502
  113,029,759
  113,030,772
  113,031,654
  113,032,469
  113,033,038
  113,034,098
  113,034,981
  113,034,982
  113,035,154
  113,035,156
  113,035,739
G
T
C
-
G
G
G
T
-
T
G
3
T
G
C
G
3
C
A
C
A
-
C
G
-
T
6
A
C
-
A
T
A
T
T
T
C
C
A
A
A
-
C
C
A
G
C
A
A
A
-
T
A
T
G
G
C
G
T
A
2/-
A
G
T
A
G
G
3
2
A
A
C
A
-
C
T
-
T
C
G/19
T
A
T
A
A
-
G
T
G
5/4
G
G
-
G
8/-
6/-
A/G
G
T
3/5
A
T
4
G
7
2
A
13
3
-
A
C
A
C
G
A
G
T
G
T
G
C
T
G
16
T
A
G
G
A
G
-
2
G
G
G
A
C
A
T
A
A
A
T
G
G
C
G
8
2
G
C
T
-
C
C
T
-
T
A
?
G
A
11
G
-
C
-
5
-
C
5
2
G
G
A
2
-
C/11
24
C
2
A
C
C
G
13
C
C
T
C
G/28
A/-
G
C
G
4
C
C
G
G
15
3
3
A
A
-
2
G
A
A
G
A
C
G
G
C
A
A
-
A
G
A
G
G
T
A
A
T
T
C
C
G
-
A
G
C
A
A
A
G
G
T
A
C
C
A
C
A
G
C
C
-
15
C
A
G
-
C
C
C
A
C
-
T
C
5
T
A
2
A
10/-
3/-
A/G
T
G
-
C
A
21
-
G
A
T
A
G
A
A
T
C
T
T
G
T
G
T
T
A
C
A
A
8
A
-
5
G/A
8
A
T
T
C
C
C
C
A
G
G
G
C
A
T
4
2
4
27
A
-
C
4
T
A
G
C
T
T
T
A
A
G
C
G
C
T
T
G
C
A
C
-
A
-
T
A
T
A
-
C
41
G
-
3
T
C
-
C/2
G
4
A
-
-
T
A
2
A
2
A
4
5
G
T
T
8
A
A
42
6
A
C
C
T
A
A
2
A
C
C
G
C
G
A
G
2
2
-
T
C
A
A
C
-
-
G
C
-
A
G
C
C
T
-
A
T
G
C
A
G
T
2
C
3
G
T
C
-
C
C
C
A
T
C
C
T
T
A
C
-
G
5
G
-
C
A
-
T
G
G
T
T
A
G
G
G
G
-
-
2
-
10
C
G
G
G
A
C
T
T
2
2/-
A/-
G
2
-
G
G/3
C
2
G
A/-
C
2/-
2
C/3
C
C
2
-
G
C/2
-
-
G
G
G/3
8/-
12/-
10/-
G