Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 134,712 (bp)   Positions: 425
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.345
.002
.241
.002
.015
.0
.0
.002
.037
.341
.023
.24
.0
.003
.594
.001
.001
.001
.064
.049
.001
.072
.161
.003
.088
.015
.003
.008
.022
.041
.062
.211
.092
.049
.012
.002
.113
.04
.08
.009
.001
.001
.004
.001
.004
.001
.001
.004
.0
.001
.017
.001
.19
.002
.001
.016
.098
.284
.237
.008
.058
.006
.012
.037
.0
.002
.003
.72
.003
.041
.331
.016
--
--
.003
.994
--
--
.062
.026
--
.149
.022
.001
.004
.024
.421
.012
.018
.056
.372
.004
--
.041
.057
.013
--
.002
.0
.003
.011
.093
.004
.024
.047
.055
.004
.004
.049
.038
.002
--
.029
.031
.0
.003
.04
.016
.001
.0
.006
.067
.001
.001
.003
.0
.023
.011
.015
.064
.054
.012
.015
.005
.001
.008
--
--
--
.052
.027
.039
--
--
--
.001
.0
.303
.936
.0
.034
.003
.011
.044
.088
.159
.004
.033
.016
.002
.014
.088
.026
.008
.008
.002
.086
.092
.023
.028
.003
.004
.008
.02
.021
--
--
--
--
--
--
.051
.07
.474
.215
.046
.015
.033
.002
.001
.04
.007
.018
--
--
.144
.17
.312
.015
.115
.039
.075
--
--
--
.043
.152
.367
.015
.006
.05
.284
.391
.358
.008
.04
.057
.024
.163
.057
.055
.001
.019
.078
.003
.557
.003
.016
.022
.141
.004
.007
.006
.008
.004
.001
--
--
--
--
.2
.241
.148
.061
.045
.065
.002
.083
.01
.008
.202
--
--
--
--
--
.034
.012
.008
.105
.171
.001
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.001
.001
.734
.003
--
--
.097
.087
.146
.011
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.013
.023
.013
.039
.493
.001
.011
--
--
--
--
--
.641
.018
.019
.023
--
--
--
--
.406
.107
.076
.063
.001
.073
.08
.016
.1
.003
.055
.192
.005
--
.002
.209
.025
.006
--
--
.021
.079
.001
.04
.005
.012
--
.327
.002
.004
--
--
.003
.102
.012
.032
.002
.015
.028
.029
--
--
--
--
.011
.01
.011
.001
.092
.048
.007
.866
--
.047
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.241
.032
.088
.004
.045
.253
.002
.025
.013
--
.109
.099
.012
--
.003
.07
.006
.027
.113
--
--
--
--
--
.002
.004
.004
--
.068
.479
.076
.004
.054
--
.054
--
.602
.003
.009
.245
.296
.365
.074
.067
.066
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
Rab31
T
A
A
G
A
A
T
A
C
T
G
T
C
G
A
T
G
G
A
C
12
A
A
C
3
G
C
G
C
C
A
T
C
C
T
T
G
A
A
G
G
G
C
C
G
C
T
A
T
A
G
C
4
G
A
C
G
G
G
A
A
A
G
G
T
A
G
16
A
C
3
C
A
G
C
G
G
A
A
A
A
2
T
G
A
G
C
T
C
G
A
A
T
3
T
4
4
A
C
C
G
A
T
G
C
23
C
T
T
G
A
G
T
T
T
T
G
A
T
G
T
G
T
A
A
T
G
A
G
G
T
A
A
C
G
A
2
8
8
4
T
C
4
G
C
16
14
A
G
G
C
T
A
A
C
A
C
G
A
C
T
T
A
G
G
A
T
C
G
G
A
G
T
T
G
T
G
A
G
A
4
G
G
G
A
5
T
A
T
C
12
A
G
C
T
A
24
22
C
A
G
A
G
10
A
C
A
C
4
T
G
C
2
A
C
C
G
A
T
G
A
T
C
C
A
C
C
C
A
G
T
T
G
T
T
8
2
G
3
G
C
C
T
T
T
T
G
C
A
A
G
G
C
A
G
G
2
T
A
G
G
A
T
A
C
G
G
C
A
T
A
T
C
A
A
T
C
T
C
2
T
4
C
G
C
C
2
A
T
T
A
T
G
T
C
T
C
T
C
C
A
T
A
16
T
G
G
T
C
T
C
A
T
10
5
3
T
G
T
C
A
G
A
10
A
G
2
G
A
T
C
C
G
C
G
A
G
A
30
C
T
A
G
C
G
G
C
4
A
A
A
C
A
G
2
A
C
A
T
26
A
C
G
T
10
T
G
T
T
C
G
A
T
G
4
34
T
C
2
T
C
C
A
C
3
C
30
A
T
2
A
C
12
A
A
T
C
2
G
T
G
T
A
T
4
2
C
2
T
G
T
C
A
T
C
C
A
A
8
6
2
12
10
8
A
  112,902,370
  112,902,647
  112,902,826
  112,902,890
  112,903,097
  112,903,293
  112,903,818
  112,905,664
  112,907,464
  112,907,712
  112,907,839
  112,907,959
  112,908,610
  112,908,695
  112,908,879
  112,909,173
  112,909,335
  112,909,359
  112,909,972
  112,910,004
  112,910,076
  112,910,250
  112,910,252
  112,910,501
  112,910,681
  112,910,968
  112,911,127
  112,911,662
  112,911,838
  112,912,435
  112,912,444
  112,912,674
  112,913,022
  112,913,379
  112,913,920
  112,913,935
  112,914,889
  112,915,041
  112,915,114
  112,915,514
  112,915,599
  112,915,928
  112,916,048
  112,916,244
  112,916,284
  112,916,301
  112,916,312
  112,916,838
  112,916,851
  112,916,866
  112,916,906
  112,916,973
  112,917,234
  112,917,300
  112,917,482
  112,917,658
  112,917,788
  112,917,852
  112,917,877
  112,917,974
  112,918,005
  112,918,018
  112,918,030
  112,918,067
  112,918,092
  112,918,096
  112,918,097
  112,918,164
  112,918,671
  112,918,701
  112,918,808
  112,918,986
  112,919,155
  112,919,164
  112,919,255
  112,920,045
  112,920,254
  112,920,607
  112,920,731
  112,920,907
  112,923,349
  112,925,553
  112,926,354
  112,937,736
  112,938,432
  112,938,643
  112,939,678
  112,940,111
  112,940,445
  112,940,474
  112,941,363
  112,941,471
  112,941,889
  112,942,782
  112,942,785
  112,943,016
  112,944,035
  112,944,641
  112,945,166
  112,945,230
  112,945,889
  112,946,025
  112,946,150
  112,946,287
  112,946,920
  112,946,922
  112,946,969
  112,947,271
  112,947,302
  112,947,331
  112,947,421
  112,947,917
  112,948,581
  112,948,587
  112,948,666
  112,948,745
  112,949,101
  112,949,102
  112,949,213
  112,949,275
  112,949,369
  112,949,436
  112,949,482
  112,949,485
  112,949,527
  112,949,569
  112,949,796
  112,949,847
  112,950,186
  112,950,610
  112,950,736
  112,950,802
  112,950,922
  112,950,930
  112,951,150
  112,951,160
  112,951,936
  112,951,946
  112,951,974
  112,952,024
  112,952,242
  112,952,249
  112,952,702
  112,952,708
  112,953,391
  112,953,549
  112,953,551
  112,953,672
  112,954,187
  112,954,401
  112,954,569
  112,954,830
  112,955,913
  112,956,158
  112,956,379
  112,956,392
  112,956,495
  112,956,504
  112,956,534
  112,956,583
  112,956,691
  112,956,818
  112,956,936
  112,957,086
  112,957,087
  112,957,136
  112,957,223
  112,957,229
  112,957,248
  112,957,428
  112,957,502
  112,957,554
  112,957,562
  112,957,594
  112,957,826
  112,957,959
  112,958,132
  112,958,253
  112,958,647
  112,958,648
  112,958,773
  112,958,869
  112,958,946
  112,958,959
  112,958,998
  112,959,075
  112,959,125
  112,959,265
  112,959,290
  112,959,690
  112,959,808
  112,960,346
  112,960,376
  112,960,479
  112,960,554
  112,960,612
  112,960,704
  112,960,706
  112,960,815
  112,960,903
  112,960,990
  112,961,081
  112,961,165
  112,961,206
  112,961,230
  112,961,459
  112,961,484
  112,961,540
  112,961,700
  112,961,945
  112,962,025
  112,962,205
  112,962,271
  112,962,320
  112,962,366
  112,962,598
  112,963,025
  112,963,049
  112,963,276
  112,963,304
  112,963,308
  112,963,324
  112,963,513
  112,963,607
  112,963,746
  112,963,813
  112,964,312
  112,964,432
  112,964,555
  112,964,668
  112,964,789
  112,964,870
  112,964,871
  112,964,872
  112,964,873
  112,964,937
  112,965,098
  112,965,464
  112,965,513
  112,965,546
  112,965,717
  112,965,771
  112,965,824
  112,965,866
  112,966,202
  112,966,297
  112,966,460
  112,966,531
  112,966,613
  112,966,714
  112,966,831
  112,966,929
  112,967,037
  112,967,131
  112,967,166
  112,967,170
  112,967,346
  112,967,406
  112,967,531
  112,967,800
  112,967,840
  112,967,990
  112,968,004
  112,968,205
  112,968,323
  112,968,538
  112,968,819
  112,968,833
  112,968,846
  112,968,947
  112,969,116
  112,969,301
  112,969,396
  112,969,454
  112,969,629
  112,969,840
  112,969,860
  112,969,954
  112,970,202
  112,970,230
  112,970,374
  112,970,428
  112,970,479
  112,970,488
  112,970,589
  112,970,650
  112,970,777
  112,970,778
  112,970,915
  112,971,379
  112,971,383
  112,977,860
  112,977,932
  112,978,140
  112,978,179
  112,978,614
  112,978,679
  112,980,020
  112,980,585
  112,980,945
  112,981,132
  112,981,178
  112,981,238
  112,981,532
  112,981,711
  112,982,186
  112,982,726
  112,982,927
  112,983,131
  112,983,143
  112,983,175
  112,983,220
  112,983,371
  112,983,553
  112,984,142
  112,984,144
  112,984,384
  112,984,773
  112,985,453
  112,985,546
  112,986,327
  112,986,476
  112,986,939
  112,987,110
  112,987,175
  112,987,614
  112,987,637
  112,987,876
  112,988,241
  112,988,471
  112,988,513
  112,988,522
  112,989,710
  112,989,725
  112,989,866
  112,990,306
  112,990,681
  112,990,801
  112,990,991
  112,991,337
  112,991,342
  112,991,615
  112,991,941
  112,992,001
  112,992,141
  112,992,184
  112,992,480
  112,992,541
  112,992,876
  112,992,917
  112,992,931
  112,992,938
  112,992,991
  112,993,051
  112,993,056
  112,993,057
  112,993,174
  112,993,175
  112,993,519
  112,995,612
  112,995,809
  112,996,232
  112,996,463
  112,996,910
  112,997,194
  112,997,600
  112,998,200
  112,998,214
  112,998,219
  112,998,224
  112,998,243
  112,998,447
  112,998,547
  112,998,692
  113,000,838
  113,001,301
  113,004,153
  113,004,420
  113,006,341
  113,007,204
  113,007,980
  113,008,172
  113,008,708
  113,008,766
  113,010,837
  113,011,321
  113,011,478
  113,011,683
  113,012,219
  113,013,276
  113,013,277
  113,013,912
  113,014,363
  113,014,622
  113,014,663
  113,015,871
  113,016,175
  113,016,914
  113,017,153
  113,017,504
  113,018,658
  113,020,683
  113,020,934
  113,022,367
  113,024,748
  113,024,750
  113,025,206
  113,025,329
  113,025,558
  113,026,349
  113,026,533
  113,027,958
  113,028,543
  113,028,652
  113,029,502
  113,029,759
  113,033,038
  113,034,098
  113,034,982
  113,034,984
  113,034,988
  113,035,154
  113,035,156
  113,035,158
  113,035,739
G
C
-
C
G
G
C
G
3
C
A
C
T
C
-
C
A
T
G
2
-
T
6/4
T
-
A
T
A
T
T
C
C
A
T
-
C
A
G
C
A
A
A
-
T
A
T
G
G
C
G
A
T
-
A
G
T
A
A
A
G
G
G
2
A
A
C
A
-
C
T
-
T
C
19
T
A
A
15
G
G
2
2/-
3
T
T
A
C/3
2
G
A
11
G
2
-
C
-
-
C
5
T
2
G
G
A
2
-
C/15
2
2
24
G
7
C
2
C
C
13
C
C
A
C
28
C
T
G
A
2
G
C
A
C
G
G
T
A
G
-
-
-
-
A
T
-
T
T
16/-
-
G
-
C
T
C
G
G
T
G
A
A
T
T
C
C
G
T
T
G
C
A
A
A
G
A
C
C
A
C
A
G
C
C
-
15
C
A
G
-
C
C
C
A
-
-
A
T
2
C
24/-
22/-
5
T
A
2
A
-
G
T
G
G
-
C
A
21/23
-
G
A
T
A
G
A
A
T
C
T
T
G
T
G
T
T
A
C
A
A
8
A
-
2/-
A
-
A
T
T
C
C
C
C
A
G
G
G
C
A
T
G
27
A
-
C
4
T
A
G
C
T
T
T
A
A
G
C
G
C
T
T
G
C
A
C
T
-
A
-
T
A
T
A
2/-
A/-
C
41
G
C
A
G
T
C
A
C
-
T
2
C
C
-
A
A
A
T/-
3
24
12
G
A
-
5/-
3/-
-
A
A
T
T
A
G
-
G
A
-
A
T
2
2
108
A
A
A
G
A
G
-
T
C
T
A
T
2
A
T
-
G
G
T
A
G
-
2/-
A/-
T
G
T/10
-
G
A
T
42
-
2
A
C
C
T
A
G
A
A
-
-
C
T
-
C
G
C/3
G
T
-
G
-
G
4
2/-
-
A
-
G
G
C
T
-
A
-
A
T/2
G
C
4/-
-
3
-
7
C
C
2
9
C
-
G
G
G
8/-
-
2/-
12/-
10/-
8/-
G