Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 106,099 (bp)   Positions: 403
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
--
.018
.001
.003
.02
.998
.042
.411
.414
.33
.007
.0
.002
.012
.009
.046
.075
.004
.008
.356
.299
.235
.278
.288
.002
.033
.006
.056
.036
.001
.001
.021
.001
.004
.071
.1
.003
.004
.005
.001
.0
.002
.005
.002
.01
.001
.001
.051
.13
.005
.016
--
.013
.003
.007
.001
.108
.1
--
.007
.015
.052
.004
.441
--
.034
.022
.024
.02
.0
.007
.008
.019
.004
.0
.046
.008
.006
.0
.012
.001
.0
.661
.534
.008
.001
.001
.117
.012
.0
.0
.594
.002
.191
.829
.005
.011
.007
.0
.001
.018
.019
.0
.076
.003
.0
.004
.0
.019
.179
.0
.001
.032
.006
.862
.001
.001
.013
.0
.001
.05
.05
.002
.001
.0
.007
.0
.001
.063
.177
.0
.004
.003
.002
.001
.063
.055
.323
.0
.0
.042
.001
.002
.001
.0
.001
.036
--
.184
.003
.071
.003
.0
.016
.034
.308
.248
.015
.021
.026
.04
.001
.005
.833
.047
.026
.003
.017
.005
.001
.064
.0
.01
.006
.846
.012
.009
.003
.016
.0
.017
.0
.0
.001
.004
.009
.006
.0
.0
.016
.0
.0
.0
.065
.045
.009
.001
.0
.0
.001
.003
.006
.001
.007
.004
.206
.0
.0
.005
.048
.002
.004
.006
.039
.013
.014
.224
.677
.001
.0
.0
.0
.342
.023
.008
--
--
.026
.345
.046
.382
.548
.357
.317
.8
.905
.946
.92
.536
.519
.526
.583
.003
.002
.004
.026
.011
.003
.014
.039
.0
.001
.259
.111
.011
.0
.005
.018
--
--
.005
.008
.002
.251
.003
.01
--
.104
.003
.01
.494
.213
.012
.02
.008
.059
.007
.548
.124
.02
.107
.221
.001
.001
.19
.058
.057
--
--
--
.606
.013
.0
.186
.002
.002
.037
.003
.001
.003
.008
.0
.0
.001
.021
.0
.005
.019
.044
.04
.014
.001
.002
.0
.0
.001
.027
.068
.002
.002
.013
.155
.01
--
--
--
--
.006
.015
.669
.006
.011
.0
.022
.001
--
--
--
--
.083
.003
.104
.029
.009
--
--
.036
--
--
--
.0
.006
.003
.001
.006
.0
.026
.002
.079
.002
.001
.0
.0
.003
.002
.362
.001
.003
.03
.099
.003
.025
.021
.016
.05
.122
.004
.106
.031
.002
.003
.087
.002
.0
.03
.0
.0
.988
.001
.698
.857
.881
.877
.287
.151
.222
.019
.003
.002
.028
--
.085
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
Ptprq
3
2
C
A
A
T
T
C
G
C
A
C
G
2
T
G
C
T
A
G
G
T
T
T
A
A
G
G
A
A
G
C
T
G
C
G
T
T
A
C
G
T
2
A
C
T
G
C
T
G
G
C
6
G
A
3
A
G
C
27
C
C
T
T
T
G
A
A
T
G
T
C
A
C
T
T
A
T
A
G
C
G
A
C
A
G
T
A
T
A
C
4
2
A
T
C
G
T
T
C
G
T
T
C
A
G
A
C
A
T
T
T
A
4
T
2
G
A
C
T
G
C
A
C
A
A
3
G
A
14
C
G
T
A
G
T
C
C
G
A
G
A
A
T
T
A
C
C
10
T
C
10
C
C
A
T
2
A
C
4
2
G
G
T
A
T
T
G
C
A
G
A
T
C
A
T
T
C
A
T
A
T
C
A
G
C
A
T
A
C
A
4
C
G
T
G
G
C
G
T
C
C
T
C
T
T
18
2
A
T
C
G
A
G
G
2
T
T
A
C
A
C
C
A
T
G
9
8
A
C
T
G
T
G
T
T
G
T
C
T
C
G
T
G
A
G
G
T
C
T
A
C
C
T
T
A
C
C
C
T
T
18
T
G
4
G
T
C
2
T
C
T
A
G
A
A
C
T
T
C
C
C
G
T
C
C
A
T
A
A
A
10
C
A
T
C
T
T
G
G
C
G
T
A
C
A
G
G
C
G
G
C
T
G
C
G
C
A
G
T
C
2
T
C
C
C
C
A
A
T
C
T
T
C
A
C
T
3
2
A
G
G
C
8
C
A
2
G
22
A
16
A
8
C
T
T
A
G
G
G
A
C
C
C
G
A
G
2
T
A
G
C
A
C
12
G
23
T
G
G
T
T
T
2
6
G
A
C
A
A
A
A
T
3
T
A
A
G
T
T
T
2
C
  49,774,100
  49,774,101
  49,775,113
  49,775,215
  49,775,244
  49,775,386
  49,775,947
  49,776,436
  49,777,571
  49,777,606
  49,777,610
  49,778,319
  49,778,968
  49,779,305
  49,779,309
  49,779,352
  49,779,371
  49,780,168
  49,780,835
  49,780,842
  49,781,498
  49,781,515
  49,782,186
  49,782,189
  49,782,190
  49,782,284
  49,783,105
  49,783,380
  49,783,426
  49,783,638
  49,783,799
  49,783,908
  49,783,984
  49,784,035
  49,784,036
  49,784,209
  49,784,336
  49,784,432
  49,784,600
  49,784,627
  49,784,641
  49,784,718
  49,784,979
  49,785,475
  49,785,485
  49,785,497
  49,785,619
  49,785,620
  49,785,919
  49,785,926
  49,786,158
  49,786,215
  49,786,258
  49,786,588
  49,786,601
  49,786,603
  49,786,669
  49,786,913
  49,786,917
  49,787,185
  49,787,691
  49,787,829
  49,787,992
  49,788,079
  49,788,238
  49,788,345
  49,788,561
  49,788,719
  49,788,970
  49,789,062
  49,789,156
  49,789,331
  49,789,407
  49,789,483
  49,789,501
  49,789,609
  49,789,759
  49,790,367
  49,790,581
  49,790,867
  49,791,022
  49,791,269
  49,791,362
  49,791,749
  49,791,769
  49,792,188
  49,792,973
  49,793,122
  49,794,999
  49,795,029
  49,795,311
  49,796,313
  49,796,724
  49,797,236
  49,797,890
  49,797,920
  49,799,946
  49,801,886
  49,802,125
  49,802,910
  49,803,041
  49,804,307
  49,804,913
  49,805,279
  49,805,621
  49,806,117
  49,806,478
  49,806,615
  49,806,730
  49,806,784
  49,806,960
  49,807,511
  49,807,739
  49,808,113
  49,808,603
  49,808,700
  49,809,119
  49,809,283
  49,809,753
  49,809,875
  49,810,536
  49,810,568
  49,810,917
  49,811,492
  49,811,709
  49,811,710
  49,811,777
  49,812,064
  49,812,333
  49,812,576
  49,812,647
  49,814,180
  49,814,391
  49,814,392
  49,814,454
  49,814,615
  49,815,414
  49,815,455
  49,815,575
  49,815,744
  49,815,905
  49,816,252
  49,816,340
  49,816,436
  49,816,476
  49,816,516
  49,817,136
  49,817,960
  49,818,256
  49,818,652
  49,818,725
  49,818,791
  49,818,901
  49,818,922
  49,818,980
  49,819,185
  49,819,263
  49,819,271
  49,819,383
  49,819,393
  49,819,446
  49,819,586
  49,819,807
  49,819,879
  49,819,950
  49,819,993
  49,820,116
  49,820,419
  49,820,501
  49,820,712
  49,820,825
  49,821,019
  49,821,451
  49,821,540
  49,821,823
  49,821,976
  49,822,222
  49,822,276
  49,822,411
  49,822,420
  49,822,484
  49,822,562
  49,822,573
  49,822,624
  49,822,781
  49,823,187
  49,823,226
  49,824,911
  49,827,987
  49,828,340
  49,828,782
  49,829,510
  49,829,514
  49,829,516
  49,829,548
  49,829,552
  49,829,556
  49,829,558
  49,829,563
  49,829,566
  49,829,573
  49,829,575
  49,830,249
  49,830,625
  49,831,227
  49,832,878
  49,834,424
  49,834,731
  49,834,732
  49,835,159
  49,835,410
  49,836,040
  49,837,723
  49,837,820
  49,838,149
  49,838,938
  49,838,939
  49,839,625
  49,841,429
  49,841,544
  49,841,681
  49,842,191
  49,842,932
  49,843,371
  49,844,455
  49,844,516
  49,844,576
  49,844,577
  49,844,892
  49,845,029
  49,845,045
  49,845,051
  49,845,088
  49,845,092
  49,845,094
  49,845,163
  49,845,167
  49,845,177
  49,845,178
  49,845,183
  49,845,184
  49,845,186
  49,845,191
  49,845,360
  49,845,367
  49,845,375
  49,845,388
  49,845,398
  49,845,403
  49,845,406
  49,845,415
  49,845,421
  49,845,464
  49,845,757
  49,846,061
  49,846,128
  49,846,232
  49,847,006
  49,847,250
  49,847,577
  49,848,355
  49,849,150
  49,849,389
  49,850,271
  49,850,642
  49,942,818
  49,943,019
  49,946,240
  49,946,424
  49,946,992
  49,947,060
  49,947,685
  49,948,563
  49,948,701
  49,948,702
  49,948,893
  49,949,020
  49,949,026
  49,949,139
  49,950,452
  49,951,228
  49,951,866
  49,951,978
  49,955,560
  49,957,902
  49,959,898
  49,960,932
  49,960,933
  49,961,178
  49,961,180
  49,961,182
  49,961,302
  49,965,400
  49,965,512
  49,966,388
  49,967,344
  49,968,066
  49,968,444
  49,968,746
  49,971,241
  49,971,265
  49,971,307
  49,971,602
  49,971,608
  49,971,609
  49,972,725
  49,973,579
  49,973,587
  49,973,598
  49,973,607
  49,973,610
  49,973,618
  49,973,626
  49,973,633
  49,973,641
  49,973,646
  49,973,652
  49,973,661
  49,973,668
  49,973,672
  49,973,681
  49,974,037
  49,974,210
  49,975,566
  49,975,656
  49,975,657
  49,975,660
  49,975,668
  49,980,049
  49,980,601
  49,980,810
  49,984,686
  49,985,283
  49,986,209
  49,986,257
  49,989,453
  49,992,379
  49,993,230
  49,993,231
  49,993,232
  49,998,419
  49,998,967
  49,999,802
  50,000,715
  50,002,984
  50,003,452
  50,005,195
  50,005,817
  50,006,293
  50,006,524
  50,006,694
  50,009,365
  50,011,588
  50,022,875
  50,023,648
  50,024,085
  50,024,190
  50,024,951
  50,025,152
  50,025,524
  50,025,649
  50,025,899
  50,026,015
  50,026,038
  50,026,190
  50,026,699
  50,027,516
  50,027,737
  50,027,738
  50,027,975
  50,029,655
  50,029,742
  50,029,772
  50,029,831
  50,029,833
  50,029,856
  50,029,873
  50,030,079
  50,030,235
  50,030,489
  50,030,707
  50,033,014
  50,033,080
  50,033,869
  50,034,172
  50,034,918
  50,035,165
  50,035,277
  50,035,843
  50,035,875
  50,038,744
  50,038,755
  50,038,762
  50,038,766
  50,038,825
  50,038,981
  50,039,276
  50,039,384
  50,039,476
  50,039,516
  50,039,611
  50,041,263
  50,041,439
3/-
2/-
T
T
C
-
G
T
G/5
G
G
A
T
-
-
A
T
C
T
A
A
16
C
C
T
C
A
-
G
C
A
T
C
A
T
A
C
C
G
T
A
C
-
G
T
G
T
T
C
C
T
T
-
A
-
-
G
T
2
-
A
T
-
C
A
A
C
C
C
A
A
T
G
G
-
2
G
C
T
T
A
A
G
T
-
A
C
9
C
G
T
-
-
G
-
T
A
A
A
A
2
A
-
A
T
A
T
A
T
A
C
G
T
-
C
-
A
2
T
C
A
T
G
T
G
G
3/-
A
C
-
T
A
T/2
A/-
A
C
14
-
A
19
C
G
G
A
C
G
T
2
-
C
A
-
G
G
-
C
2/-
A/T
G
-
-
-
-
C
G
C
G
A
T
C
2
-
A
T
T
C
A
T
G
C
C
C
T
G
C
A
-
C
T
T
C
-
5
A
-
T
T
T
2
-
T
T
C
T
113
C
-
2/-
A/-
C
T
2
G
A
A
2/-
T/-
T/5
G
T
C
T
T
C
C
A
-
8/-
G
A
A
A
G
A
A
A
A
-
A
A
A
A
A
2
-
T
-
-
T
-
-
-
2
C
C
G
A
3/5
T
53
G
-
C
T
4/-
A
2
T
-
A
T
-
9/5
T
G
-
A
18
-
4
-
A
A
C
T
A
AC/6
A
9/7
T
T
-
T
2
-
6
A
A
A
A
T
A
2
C
A
C
-
-
T
2
3
2
2
2
A
A
A
2
2
C
2
-
C
-
T
T
A
-
-
C
C/9
-
13
T
G
T
9
3/-
2/-
A/-
T
15
2
-
T
-
-
A
-
G
-
T
-
T
C
C
G
A
2
C
T
G
-
T
-
G
2
2/-
-
G
A
T
G
A
-
C
-
C
C
C
C
A
T/-
-
-
C
G
T
G
-
G
-
A
-
8
G
G
A
C
C
A
-
T