Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,756 (bp)   Positions: 232
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.029
.612
.725
.066
.118
.846
--
--
.196
.001
.015
.106
.003
.054
--
.107
--
--
--
--
--
--
.018
.0
.0
.618
.101
.545
.0
.0
.0
.003
.163
.002
.061
.725
.712
.005
.017
.032
--
.028
.312
--
.093
.019
--
--
.035
.163
.435
.593
.086
.181
--
--
.048
.104
.446
.43
.434
.336
--
--
.812
--
--
.45
.062
.009
--
--
--
.002
.023
.014
.005
.009
.028
.0
.021
.121
.24
.035
.08
.013
--
--
.033
--
.08
.064
--
.031
.037
.006
.008
.011
.751
.71
.002
.495
--
--
--
--
.035
.0
.03
.055
.002
.479
.0
.145
.039
.074
.002
.134
.019
.913
.029
.011
.614
.662
.773
.554
.001
.011
.071
.057
.003
.038
.239
.117
.012
.016
.002
.002
--
--
--
.002
.315
.001
.056
.036
.012
--
.051
.932
.245
.001
.174
.012
.063
.001
.049
.052
.052
.051
.06
.011
.004
.017
.026
.135
--
--
.011
.303
.0
.021
--
--
--
--
--
--
.927
.003
.02
.006
--
--
.0
.003
.0
.014
.053
.011
.023
.001
.003
.003
.006
.016
.026
.085
.202
.095
.918
.869
.003
.002
.005
.001
1.0
.0
.003
.54
.022
.032
1.0
.996
.0
.991
.021
.002
--
--
--
--
--
.02
.809
.004
.058
.075
.004
.039
.001
.004
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
Ptpra
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
G
T
T
C
C
2
4
T
C
T
C
2
C
T
G
A
A
3
T
T
T
C
T
A
G
C
T
C
T
A
6
G
G
2
A
T
C
C
T
G
T
A
3
A
G
7
A
G
A
16
A
T
C
C
C
G
A
A
G
G
C
G
2
7
A
C
A
C
G
G
A
C
T
G
2
A
C
T
C
G
C
A
C
A
T
2
2
2
G
A
A
T
G
T
G
C
4
T
A
A
T
G
C
C
A
A
T
T
4
T
G
T
G
A
A
T
A
4
A
A
A
T
T
T
A
T
A
T
C
A
6
A
C
C
A
G
G
C
T
A
G
T
A
T
C
C
C
C
G
C
A
T
A
G
A
A
A
C
G
T
2
C
A
T
A
C
T
2
T
4
C
G
G
G
G
2
G
G
G
T
G
A
A
A
A
T
C
A
C
G
2
A
T
C
C
T
C
G
A
T
C
G
G
A
T
C
A
T
T
T
A
C
G
T
A
G
9
G
G
5
G
G
A
A
A
C
T
T
A
T
  129,479,961
  129,480,178
  129,480,219
  129,480,942
  129,481,386
  129,483,106
  129,483,377
  129,483,406
  129,483,664
  129,484,230
  129,486,874
  129,486,917
  129,487,542
  129,487,894
  129,488,885
  129,490,649
  129,491,126
  129,491,370
  129,491,497
  129,491,883
  129,491,903
  129,491,983
  129,492,874
  129,493,050
  129,493,061
  129,493,546
  129,494,032
  129,494,108
  129,495,146
  129,495,159
  129,495,171
  129,495,578
  129,495,736
  129,497,492
  129,498,411
  129,498,798
  129,498,799
  129,499,337
  129,499,345
  129,499,349
  129,500,322
  129,501,538
  129,503,559
  129,504,031
  129,504,536
  129,506,513
  129,506,630
  129,506,639
  129,506,896
  129,507,061
  129,507,495
  129,508,063
  129,508,629
  129,508,788
  129,509,524
  129,509,528
  129,509,742
  129,510,058
  129,510,397
  129,510,841
  129,510,848
  129,510,869
  129,511,441
  129,511,876
  129,512,815
  129,513,257
  129,513,298
  129,514,116
  129,514,138
  129,514,252
  129,515,392
  129,515,501
  129,515,502
  129,515,976
  129,515,987
  129,516,681
  129,516,757
  129,516,758
  129,516,771
  129,516,793
  129,517,145
  129,517,181
  129,517,182
  129,517,921
  129,518,475
  129,519,142
  129,519,165
  129,519,171
  129,519,361
  129,519,564
  129,519,859
  129,519,923
  129,520,753
  129,521,426
  129,522,640
  129,522,693
  129,523,455
  129,523,647
  129,526,765
  129,526,809
  129,527,167
  129,527,328
  129,527,576
  129,527,606
  129,527,619
  129,527,637
  129,527,802
  129,529,772
  129,529,842
  129,531,780
  129,532,351
  129,532,617
  129,532,659
  129,534,686
  129,534,811
  129,535,103
  129,535,781
  129,536,350
  129,536,370
  129,536,773
  129,537,488
  129,537,763
  129,538,251
  129,538,318
  129,538,401
  129,539,253
  129,539,797
  129,539,991
  129,540,403
  129,540,598
  129,540,642
  129,540,656
  129,540,908
  129,540,988
  129,542,196
  129,542,412
  129,543,319
  129,543,915
  129,544,432
  129,544,445
  129,544,459
  129,544,680
  129,545,913
  129,546,074
  129,546,659
  129,547,284
  129,547,390
  129,547,623
  129,548,313
  129,548,744
  129,549,624
  129,549,870
  129,550,153
  129,550,382
  129,550,850
  129,550,984
  129,551,924
  129,551,988
  129,552,103
  129,552,106
  129,552,138
  129,552,392
  129,552,781
  129,553,426
  129,553,748
  129,554,028
  129,555,244
  129,555,423
  129,556,170
  129,556,205
  129,557,582
  129,557,773
  129,558,517
  129,559,253
  129,559,256
  129,559,268
  129,559,280
  129,559,410
  129,559,814
  129,560,683
  129,560,911
  129,560,934
  129,562,457
  129,563,025
  129,564,588
  129,564,665
  129,564,667
  129,567,987
  129,568,028
  129,568,591
  129,569,872
  129,570,227
  129,570,231
  129,570,232
  129,570,235
  129,570,247
  129,570,265
  129,570,285
  129,570,289
  129,570,355
  129,570,378
  129,570,388
  129,570,515
  129,570,628
  129,570,945
  129,570,993
  129,571,241
  129,571,401
  129,571,877
  129,572,517
  129,573,234
  129,574,896
  129,575,108
  129,575,289
  129,575,780
  129,576,184
  129,576,557
  129,576,668
  129,577,099
  129,577,116
  129,577,119
  129,577,129
  129,577,133
  129,577,638
  129,579,961
  129,580,051
  129,580,059
  129,580,060
  129,580,961
  129,581,015
  129,581,843
  129,582,158
C
3
A
C
G
6
C/G
2/-
-
2
T
C
T
-
T
-
A
A/G
G
-
-
C
A
T
G
G
C
T
C
T
T/C
G
-
A
A
-
A/-
T/C
C/T
C/T
C
A
C
3
-
G
2
7/-
A/T
C
G
16/-
G
C
A
A
G
A
5
T
A
-
2
A
-
7/-
G
T
T
-
2
G/T
A/T
-
G
A
-
A/2
T
C
T
A
A
T
T
G
T/G
-
-
-
A
G
G
-/TC
A
C
2
T
-
-
C
G
C
G/A
C/T
C/T
T
T
G
C
-
C
A
A/9
2
G
G
C
5
-
G
G
C
-
C
T/C
G
C
G
C
T
-
-
G
G
T
G
A
3
3
T/3
G
A
T/2
G
3
T
T
A
T
A
T
G
C
G
A
C
C
G
T
C
C
-
G
G
C
G
2
-
-
A
-
-
4
A
G/A
A
2/-
A
A
A
8
A
C
G
G
G
C
A
G
G
G/-
-
-
T/C
C/G
C/G
T/C
C/T
G/C
A/-
T/A
G
A
A
G
C
-
-
G
C
G
G
3
A
C
-
-
-
-
-
-
3
A
A/G
A/G
A/G
C/T
A
C
G
-