Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 70,759 (bp)   Positions: 147
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
LEW/NCrl (KNAW) 
.011
--
.064
.02
.006
.007
.002
--
--
--
--
--
--
.023
.039
.008
.001
.006
.007
.005
.003
.01
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.003
.006
.001
.007
.002
.002
.006
--
--
--
.01
.002
.002
.042
.102
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.006
.002
.001
.003
.004
--
.017
.052
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
Prp15
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
C
G
A
2
C
G
C
T
C
C
C
A
8
C
12
A
C
T
T
T
G
T
3
T
T
C
A
G
T
G
A
A
A
A
G
C
3
A
T
G
T
C
2
A
A
G
A
G
C
T
A
A
G
A
A
C
T
A
C
T
C
T
G
G
C
T
C
G
C
C
T
G
C
C
G
T
C
G
G
A
T
T
T
A
G
G
C
C
A
T
C
G
A
C
T
G
16
G
G
C
C
C
T
A
A
G
G
G
A
A
T
T
G
C
C
A
C
A
A
A
T
T
A
C
G
3
2
A
100
3
G
A
A
G
T
T
T
C
4
2
T
T
A
T
C
A
  228,750,982
  228,751,048
  228,751,208
  228,751,270
  228,751,619
  228,751,673
  228,751,790
  228,752,581
  228,752,950
  228,752,995
  228,753,149
  228,753,154
  228,753,242
  228,753,521
  228,753,592
  228,753,612
  228,753,857
  228,753,859
  228,753,861
  228,753,868
  228,754,212
  228,754,451
  228,769,348
  228,769,550
  228,769,761
  228,771,705
  228,771,721
  228,773,150
  228,773,454
  228,773,607
  228,773,653
  228,773,720
  228,773,793
  228,773,814
  228,773,821
  228,773,996
  228,774,007
  228,774,026
  228,774,029
  228,774,072
  228,774,152
  228,774,155
  228,774,163
  228,774,265
  228,774,268
  228,774,335
  228,774,354
  228,774,396
  228,774,413
  228,774,484
  228,774,557
  228,774,560
  228,774,587
  228,774,665
  228,774,831
  228,774,962
  228,775,146
  228,775,190
  228,775,349
  228,775,385
  228,775,386
  228,775,401
  228,775,752
  228,775,755
  228,776,026
  228,776,035
  228,776,098
  228,776,386
  228,776,499
  228,776,524
  228,776,611
  228,776,913
  228,777,190
  228,777,235
  228,777,929
  228,777,937
  228,778,350
  228,778,355
  228,778,929
  228,779,071
  228,779,353
  228,779,487
  228,780,894
  228,781,339
  228,781,421
  228,781,442
  228,781,444
  228,781,465
  228,781,479
  228,781,498
  228,781,504
  228,781,520
  228,781,677
  228,781,682
  228,781,860
  228,782,068
  228,782,311
  228,782,678
  228,782,755
  228,782,855
  228,782,937
  228,783,044
  228,783,066
  228,783,189
  228,783,276
  228,783,487
  228,783,569
  228,783,720
  228,783,814
  228,783,994
  228,784,029
  228,784,072
  228,784,365
  228,789,201
  228,789,432
  228,789,436
  228,792,648
  228,794,035
  228,794,425
  228,801,218
  228,801,863
  228,801,872
  228,802,901
  228,802,928
  228,804,036
  228,804,469
  228,804,633
  228,804,634
  228,806,780
  228,807,358
  228,807,447
  228,807,846
  228,808,619
  228,810,279
  228,810,588
  228,810,592
  228,810,671
  228,810,936
  228,813,803
  228,813,804
  228,813,876
  228,814,364
  228,814,366
  228,814,375
  228,819,193
  228,819,277
  228,819,696
-
C/2
G/58
A/58
2/-
3
19
2
T/5
-
T
G
-
8/-
C/2
12/-
G
C/2
T/C
T/C
T/2
G/-
T/-
3/-
T/-
C
2
2
2
C
T
T
G
C
T
2
T
-
C
A
T
C
T
-
T
T
A
G
2
T
2
T
G
A
T
5
T
-
T
A
A
T
A
A
A
A
A
A
A
T
T
C
A
2
T
T
A
2
C
A
T
-
2
A
G
-
A
2
2
C
C
A
2
-
G
A
A
-
T
T
2
A
G
G
G
G
A
T
A
T
3
G
3
G/-
C/2
CA/CT
A/G
C/9
A/C
G
A/C
T/C
T/3
A/15
C/G
G/2
3/-
2/-
A/-
100/-
3/-
G/C
C
A/6
G/3
G
T/3
16
C/3
4/-
2/-
T/C
T/A
A/G
T/13
C/2
T