Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 111,420 (bp)   Positions: 238
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.054
.0
.067
.0
.951
.0
.015
1.0
.0
--
--
--
--
.001
--
.767
.02
.033
.001
.01
.273
.024
.005
.035
--
.024
.721
.004
.018
.013
.009
.13
--
--
.3
.018
.056
.175
.131
.014
.0
.0
--
--
--
.008
.0
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.0
.006
.012
.011
.002
.292
.32
.007
.005
--
.077
.042
.676
.038
.07
.006
.027
.001
.006
--
--
.863
.036
.042
.04
.136
.207
.216
.004
.0
.0
.4
--
--
.001
.001
.054
.001
.002
--
.069
.065
.012
.012
.011
.047
.064
.907
.001
.041
.03
.08
.003
.0
--
--
--
--
.307
.147
.111
.0
--
.135
.0
.015
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.097
.014
.041
.05
.005
.025
.09
.001
.001
.151
.027
.323
.325
.178
.27
.192
.024
.046
--
.105
--
.09
.712
--
--
.014
.03
.018
.034
--
.096
.009
--
--
--
.0
.004
.027
.011
.009
.027
.048
.517
.027
.17
.017
--
.128
--
.37
.043
.001
.264
.001
.001
.002
.0
.0
.013
.037
.065
.03
.35
--
--
--
--
--
.067
.259
.082
.059
--
--
--
--
.005
.001
.0
--
--
.002
.002
.0
.0
.001
.0
.007
.008
.0
.002
.001
.0
.001
.003
.0
.028
.0
.037
.091
.115
.004
.003
.013
.026
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
Prkcz
C
T
G
T
T
A
A
C
G
A
G
G
6
2
G
3
C
T
T
C
C
T
G
C
G
C
G
A
A
G
C
C
T
A
C
T
G
C
12
G
A
G
T
T
17
G
A
A
G
C
T
2
T
G
A
20
C
T
T
T
A
G
3
G
T
C
G
G
T
C
T
T
T
A
C
T
A
T
2
G
A
G
T
115
C
T
A
T
C
A
T
T
C
A
A
T
C
C
C
G
T
C
C
T
C
C
C
C
G
A
C
T
C
A
A
C
A
T
G
G
T
C
A
G
A
T
C
C
2
14
T
2
16
T
G
G
C
C
4
136
C
G
C
G
A
C
A
G
C
C
A
G
C
A
A
C
C
T
G
A
G
A
A
C
12
G
G
G
C
T
T
4
C
T
3
A
G
T
C
T
T
C
A
T
T
C
A
A
T
A
T
C
T
T
C
10
T
C
T
A
G
A
C
C
G
G
G
2
A
T
C
G
6
G
A
G
A
T
C
G
A
A
A
C
2
C
A
C
C
G
A
C
T
C
A
T
T
T
  176,117,278
  176,117,436
  176,117,786
  176,118,094
  176,118,277
  176,118,376
  176,118,938
  176,118,969
  176,119,590
  176,119,634
  176,119,894
  176,119,896
  176,119,934
  176,120,037
  176,120,297
  176,120,308
  176,120,433
  176,120,898
  176,120,901
  176,120,994
  176,121,012
  176,121,058
  176,121,087
  176,121,158
  176,121,166
  176,121,614
  176,121,989
  176,122,980
  176,123,106
  176,123,216
  176,123,482
  176,123,484
  176,123,690
  176,123,909
  176,123,970
  176,124,331
  176,124,403
  176,124,411
  176,124,476
  176,124,824
  176,124,967
  176,126,082
  176,126,087
  176,128,180
  176,129,117
  176,129,137
  176,130,114
  176,130,231
  176,130,993
  176,131,311
  176,131,327
  176,131,697
  176,131,708
  176,131,838
  176,131,990
  176,132,862
  176,133,565
  176,133,570
  176,134,373
  176,135,033
  176,135,326
  176,135,503
  176,135,592
  176,135,912
  176,135,913
  176,136,697
  176,138,157
  176,138,169
  176,138,806
  176,138,876
  176,139,368
  176,139,896
  176,140,031
  176,140,217
  176,140,227
  176,140,535
  176,140,626
  176,140,951
  176,141,349
  176,141,350
  176,141,751
  176,143,189
  176,143,273
  176,143,331
  176,144,036
  176,145,467
  176,145,494
  176,149,686
  176,150,217
  176,150,256
  176,151,045
  176,151,723
  176,151,770
  176,153,180
  176,153,226
  176,153,768
  176,154,697
  176,154,702
  176,154,754
  176,154,766
  176,154,775
  176,154,792
  176,154,795
  176,154,948
  176,156,244
  176,156,989
  176,157,032
  176,157,900
  176,161,490
  176,162,418
  176,163,535
  176,164,171
  176,165,340
  176,165,406
  176,166,296
  176,166,311
  176,166,312
  176,166,492
  176,166,935
  176,169,241
  176,169,288
  176,169,586
  176,170,603
  176,171,458
  176,173,075
  176,174,178
  176,174,505
  176,174,559
  176,174,716
  176,174,742
  176,174,900
  176,174,976
  176,175,552
  176,176,106
  176,176,214
  176,177,397
  176,179,148
  176,179,320
  176,179,425
  176,180,007
  176,182,559
  176,182,785
  176,182,962
  176,183,266
  176,183,460
  176,183,599
  176,183,895
  176,183,995
  176,184,870
  176,185,258
  176,186,091
  176,186,590
  176,186,763
  176,188,193
  176,188,624
  176,189,176
  176,189,208
  176,189,516
  176,189,899
  176,190,855
  176,191,013
  176,191,757
  176,191,864
  176,192,568
  176,193,137
  176,193,625
  176,193,779
  176,194,313
  176,197,795
  176,198,277
  176,199,653
  176,199,697
  176,199,725
  176,201,001
  176,201,055
  176,201,506
  176,201,931
  176,202,102
  176,202,314
  176,202,712
  176,203,667
  176,205,405
  176,205,696
  176,207,027
  176,207,298
  176,207,455
  176,207,881
  176,208,596
  176,209,449
  176,209,606
  176,212,102
  176,212,119
  176,212,197
  176,212,782
  176,213,475
  176,213,607
  176,214,575
  176,215,461
  176,215,880
  176,217,542
  176,218,021
  176,219,417
  176,219,969
  176,220,043
  176,221,048
  176,221,049
  176,221,052
  176,221,709
  176,222,470
  176,223,073
  176,223,402
  176,223,588
  176,223,747
  176,223,833
  176,224,035
  176,224,481
  176,224,512
  176,224,761
  176,224,956
  176,225,046
  176,225,094
  176,225,225
  176,225,307
  176,225,365
  176,225,596
  176,226,186
  176,226,205
  176,226,254
  176,226,267
  176,226,428
  176,226,491
  176,226,662
  176,227,015
  176,227,358
  176,227,451
  176,227,464
  176,227,616
  176,227,919
T
C
A
C
C
G
G
T
A
G
5
19
-
2/-
C
-
3
-
C
T
2
20
A
T
A
A
A
G
G
A
-
T
C
G
T
C
A
T
-
A
G
A
-
-
-
-
T
G
A
T
G
-
A
A
G
-
2
C
3
C
G
A
-
T
C
C/5
A
-
C
2
C
C
49
25/3
C/T
T/-
G
C
2/-
G/-
A/-
C
C
-
G
C
G
C
?
2
G
C
T
G
G
T/-
G
A
G
T
C
G
A
C
T
T
T
T
A
C
G
28
-
G
A/-
CT/3
T
9
2
-
C
T
C
A
-
C
T
13
-
-
A
-
-
G
A
T
G
-
-
-
G
5
T
T
G
2
G
T
T
T
G
C
T
5
G
C/3
T
-
A
G
C
2
G
T
-
A
A
A
11
-
3
-
T
T/11
3/-
-
A
C
A
C
C
T
-
C
2
T
G
G
A
G
C
T
C
C
2
-
C
2
C
-
A
2
3/5
T
T
T
T
-
-
G
T
5
-
A
G
A
G
G
T
2
T
C
G
T
-
-
G
T
3
A
C
5
14
T
G
6
C
C