Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 149,147 (bp)   Positions: 410
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.124
1.0
.952
.087
.729
.979
.0
.13
.227
1.0
1.0
.001
.068
.028
--
--
.068
.001
.002
.015
.179
.351
.001
.001
.566
.022
.744
.001
.002
.464
--
.175
.058
.862
.656
.605
.0
.001
.105
.001
.0
.017
.024
.006
.002
--
--
--
.871
.002
.002
.0
.366
.351
.336
.0
.371
.0
.178
.473
.006
.0
.005
.0
.005
.003
.407
.001
.002
--
.001
.1
.124
.0
1.0
.017
.071
.102
.04
.013
.0
.001
.034
.033
.001
.092
.001
.001
.003
.234
.009
.075
.004
.025
.001
.03
.001
.001
.002
.0
.035
.001
.001
.0
.005
.004
.044
.033
.549
.004
.005
.012
.034
.026
--
1.0
1.0
.162
.031
.108
.0
.002
.117
.002
.055
.037
.103
.013
.004
.003
.002
.026
.026
.007
.0
.001
.001
.047
.017
.015
.003
.046
.046
.005
.814
.005
.0
--
--
--
--
.089
.096
.211
.023
.003
.034
.239
.005
.002
.069
.742
--
--
.001
.466
.02
.169
.079
.0
.001
.339
.2
.0
.474
.0
.004
.048
.012
.007
.089
.002
.019
.014
.364
.0
.002
.002
.0
.0
.001
.461
.141
.024
.001
.032
.289
.117
.014
.396
.003
.007
.193
.241
.024
.057
.028
.028
--
--
.091
.036
.063
.006
.001
.005
.231
.249
.073
.032
.012
.311
.063
.051
.001
.125
.015
.755
.451
.163
.07
.006
.008
.001
.003
.005
.001
.024
.0
.016
.021
.012
.442
.855
.859
.91
.034
.03
.001
.006
.493
.004
.005
.511
.001
.001
.012
.016
--
.092
.009
.124
.01
.11
.643
.245
.121
.003
.079
.057
.0
.008
.18
.042
.066
.001
--
--
.024
.408
.48
.0
.009
.132
--
.007
.133
.002
.181
.014
.062
.139
--
.066
--
--
.715
.255
.124
.145
.139
.14
.001
.002
.012
.007
.0
--
.022
.052
.254
.125
.165
.025
.121
--
--
.345
.991
.031
.267
.007
--
.1
.191
.182
.163
.475
.004
.029
.001
.965
.144
.002
--
.095
.898
.045
.366
.354
.005
.504
.012
.082
.013
.311
.009
.106
--
--
--
.061
.031
.025
.014
.013
.093
.013
.8
.007
.012
.005
.142
.01
.025
.0
.523
.1
.114
.022
.002
.157
.109
.031
.458
.037
.96
.02
.411
--
.042
.016
.0
.057
.042
.104
.001
.001
.001
--
.279
.045
.03
.03
.002
.003
.001
.002
.036
.0
.252
.285
.0
.96
.196
.116
.936
.01
.012
.984
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
Ppp2r5e
5
C
G
A
C
C
T
9
3
C
G
C
T
T
A
T
A
T
T
C
G
G
C
G
4
G
2
2
G
C
C
G
A
G
T
G
C
C
A
9
T
A
A
2
T
A
T
C
A
A
C
T
G
T
T
C
A
C
T
T
C
A
T
A
C
C
A
G
A
4
T
A
A
A
G
C
2
C
T
G
T
T
C
G
C
8
C
A
A
A
6
A
G
T
T
T
G
G
C
G
C
T
A
C
C
T
A
C
13
G
G
T
T
A
T
G
T
G
G
C
T
C
A
A
G
A
A
T
C
T
A
A
C
G
C
G
G
T
T
C
T
T
G
G
G
T
T
3
9
G
A
5
4
G
T
2
G
A
G
C
T
C
7
T
A
A
C
A
A
T
T
C
G
G
A
C
G
2
T
A
G
G
10
8
A
G
C
A
T
T
A
T
A
A
T
A
T
A
C
C
T
G
A
A
G
G
T
G
C
C
G
T
T
A
A
C
3
5
A
G
G
G
C
C
C
T
C
A
T
G
A
G
A
T
A
T
C
A
T
C
G
G
A
2
22
20
T
C
T
9
A
T
8
C
T
A
G
T
G
A
C
C
C
C
T
G
A
T
G
A
T
A
A
G
C
C
A
A
A
A
C
A
A
T
G
G
T
C
T
4
G
A
A
G
G
A
A
G
2
A
A
G
A
A
C
A
G
T
A
C
A
C
C
G
A
A
A
A
T
A
C
C
C
T
G
3
2
C
C
G
A
G
G
A
A
G
4
A
A
G
T
T
C
T
C
G
T
G
A
T
A
G
C
G
T
G
T
C
C
C
C
A
C
T
A
4
G
T
G
G
C
C
T
A
T
T
T
T
T
A
T
4
2
3
A
C
T
C
T
C
A
G
C
C
T
A
T
C
C
10
3
2
G
G
A
A
C
4
3
A
  107,836,329
  107,836,543
  107,836,609
  107,837,267
  107,837,403
  107,837,722
  107,838,225
  107,839,160
  107,839,166
  107,839,423
  107,840,477
  107,840,868
  107,841,314
  107,841,496
  107,841,735
  107,841,873
  107,842,191
  107,842,895
  107,842,927
  107,842,977
  107,843,386
  107,843,448
  107,843,626
  107,843,631
  107,843,954
  107,844,168
  107,844,394
  107,844,931
  107,845,155
  107,845,366
  107,845,686
  107,846,394
  107,846,836
  107,847,016
  107,847,039
  107,847,072
  107,847,689
  107,847,738
  107,847,984
  107,848,072
  107,848,107
  107,848,163
  107,848,204
  107,848,584
  107,849,474
  107,849,762
  107,849,770
  107,849,917
  107,850,021
  107,850,155
  107,851,003
  107,851,754
  107,851,829
  107,851,840
  107,851,853
  107,852,192
  107,852,239
  107,852,269
  107,852,406
  107,852,541
  107,852,670
  107,852,766
  107,852,813
  107,853,346
  107,853,423
  107,853,600
  107,853,867
  107,854,477
  107,855,447
  107,855,573
  107,855,942
  107,856,614
  107,856,622
  107,856,703
  107,857,107
  107,857,747
  107,857,982
  107,858,013
  107,858,517
  107,859,062
  107,859,127
  107,859,221
  107,859,266
  107,859,284
  107,859,401
  107,859,529
  107,859,640
  107,859,641
  107,859,705
  107,859,981
  107,859,998
  107,860,013
  107,860,285
  107,860,519
  107,860,607
  107,860,698
  107,860,780
  107,860,782
  107,861,150
  107,861,282
  107,861,596
  107,861,684
  107,861,689
  107,861,793
  107,862,539
  107,862,956
  107,866,724
  107,867,632
  107,867,998
  107,868,365
  107,868,800
  107,869,588
  107,869,622
  107,869,683
  107,869,902
  107,870,361
  107,870,426
  107,870,610
  107,870,643
  107,872,364
  107,873,276
  107,873,807
  107,874,107
  107,874,406
  107,874,805
  107,875,722
  107,876,196
  107,877,482
  107,878,539
  107,878,818
  107,878,825
  107,879,086
  107,879,108
  107,879,468
  107,879,492
  107,879,663
  107,879,998
  107,880,041
  107,880,195
  107,880,312
  107,880,358
  107,880,883
  107,882,078
  107,882,467
  107,883,708
  107,885,268
  107,885,324
  107,886,906
  107,886,954
  107,886,977
  107,886,995
  107,888,333
  107,888,334
  107,888,343
  107,889,041
  107,889,438
  107,889,457
  107,890,265
  107,891,292
  107,892,858
  107,893,971
  107,894,049
  107,894,242
  107,894,307
  107,894,541
  107,895,213
  107,895,362
  107,895,571
  107,896,232
  107,896,782
  107,896,783
  107,897,400
  107,897,404
  107,898,514
  107,899,055
  107,899,740
  107,900,621
  107,901,452
  107,901,478
  107,902,511
  107,904,717
  107,904,749
  107,904,959
  107,904,961
  107,906,730
  107,907,071
  107,907,248
  107,907,588
  107,909,028
  107,910,563
  107,911,268
  107,911,969
  107,912,183
  107,912,447
  107,913,070
  107,913,408
  107,913,581
  107,913,879
  107,914,379
  107,914,544
  107,915,165
  107,915,308
  107,916,474
  107,917,526
  107,917,570
  107,917,572
  107,918,009
  107,918,596
  107,918,886
  107,918,887
  107,919,282
  107,919,876
  107,920,526
  107,920,605
  107,920,737
  107,920,942
  107,921,710
  107,921,739
  107,921,846
  107,922,235
  107,922,312
  107,922,631
  107,924,021
  107,924,022
  107,924,042
  107,924,100
  107,924,272
  107,924,591
  107,924,628
  107,925,524
  107,925,532
  107,926,074
  107,926,075
  107,926,227
  107,926,677
  107,926,679
  107,926,933
  107,926,987
  107,927,272
  107,928,295
  107,928,464
  107,928,576
  107,929,140
  107,929,280
  107,929,306
  107,929,308
  107,929,356
  107,929,392
  107,929,471
  107,929,508
  107,929,728
  107,930,310
  107,930,315
  107,930,517
  107,932,005
  107,932,095
  107,932,194
  107,932,238
  107,932,301
  107,932,654
  107,932,846
  107,933,315
  107,933,408
  107,933,584
  107,933,853
  107,934,102
  107,934,290
  107,934,499
  107,935,024
  107,935,280
  107,935,494
  107,935,685
  107,936,319
  107,937,207
  107,937,269
  107,937,479
  107,937,779
  107,937,791
  107,937,939
  107,938,158
  107,938,506
  107,938,767
  107,938,805
  107,938,907
  107,938,992
  107,939,447
  107,940,531
  107,940,867
  107,941,696
  107,942,190
  107,942,652
  107,943,379
  107,943,666
  107,943,745
  107,944,042
  107,944,206
  107,944,330
  107,944,553
  107,944,673
  107,944,674
  107,944,697
  107,944,799
  107,945,163
  107,945,374
  107,945,638
  107,947,280
  107,947,506
  107,947,703
  107,948,492
  107,948,617
  107,948,680
  107,948,844
  107,948,943
  107,949,409
  107,949,946
  107,950,724
  107,950,909
  107,952,689
  107,953,462
  107,953,685
  107,953,742
  107,953,850
  107,953,889
  107,954,099
  107,954,457
  107,954,459
  107,954,463
  107,955,864
  107,956,449
  107,957,054
  107,957,435
  107,958,818
  107,959,146
  107,959,641
  107,959,827
  107,961,525
  107,962,217
  107,962,333
  107,962,494
  107,964,060
  107,964,253
  107,964,373
  107,964,534
  107,964,552
  107,964,689
  107,964,842
  107,965,008
  107,965,177
  107,966,068
  107,966,232
  107,966,374
  107,967,270
  107,967,280
  107,967,415
  107,967,476
  107,967,478
  107,967,490
  107,967,937
  107,968,321
  107,968,629
  107,968,713
  107,968,845
  107,970,510
  107,970,779
  107,971,349
  107,971,839
  107,972,150
  107,972,363
  107,972,392
  107,972,467
  107,972,600
  107,972,615
  107,972,684
  107,972,763
  107,972,813
  107,972,954
  107,974,306
  107,974,445
  107,974,519
  107,974,575
  107,975,219
  107,975,249
  107,975,291
  107,977,047
  107,977,253
  107,977,304
  107,977,400
  107,977,507
  107,977,512
  107,978,307
  107,978,329
  107,978,943
  107,979,342
  107,979,344
  107,980,441
  107,980,695
  107,981,403
  107,981,404
  107,982,422
  107,982,605
  107,982,661
  107,982,662
  107,982,792
  107,982,821
  107,983,607
  107,983,899
  107,984,207
  107,984,437
  107,984,438
  107,985,095
-
T
A
7
T
T
C
9/-
3/-
T
A
T
-
C
G
2
G
A
C
T
C
7
T
A
-
3
-
-
A
T
A
A
G
9/7
C
T
T
T
5
-
A
T
2
-
C
-
A
T
G
G
A
C
A
T/3
T/-
T
G
T
2
C
T
G
7
G
T
A
-
A
5
-
C
-
15
G
A
T
-
15
2
A
A
5
G
C
7
-
T
C
G
G
-
7
T
G
C
-
-
C
T
C
C/4
-
G
T
T
A
T
T
-
A
T
C
C
G
2
A
A
51
T
A
G
T
G
G
5
G
T
C
T
C
G
-
T
A
T
C
A
C
A
-
G
3/TA
15/17
C
A
C
C
-
-
A
G
5/-
4/-
A
C
-
A
C
A
T
C
2
-
C
G
5
A
A/7
-
2
A
T
A
11/13
2
T
A
-
2
G
A
T
10/-
8/-
C
A
G
G
C
4
G
A
G
G
G
-
C
-
T
T
10
A
G
T
A
A
A
A
T
T
A
C
G
G
G
T
-
-
G
C
A
A
2
18
A
A
2
2
C
C
T
G/2
A/-
G
G
C
T
C
-
T
A
A
2
-
22/-
20/-
A
T
117
-
G
A
-
T
G
G
T
T/2
T
G
T
T
T
T
5
A
T
C
A
2
C
G
G
A
5
T
G
C
G
G
T
G
-
A
C
A
C
3
C
-
A
G
G
A
C
-
2
A
2/-
A/-
-
2
G
25/23
A
G
A
2
G
T
G
T
A
2
G
3
T
G
C
G
T
3
T
C
A
-
-
T
T
C
T
T
A
G
G
C
-
A/26
-
A
A
A
10
5/7
T
A
C
A
C
C
G
A
A
-
A
T
C
A
T
T
G
G
T
2
G
-
T
-
-
2
3
19/17
C
G
C
C
C
C
C
T
C
-
2/-
-
-
T
G
T
C
T
-
3
3
15
C
G
2
T
T
-
3/-
2/-
14
A
-
G
4
4/-
3/-
C