Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,092 (bp)   Positions: 378
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.714
.002
.0
.224
.004
.001
.621
.922
.046
.001
.016
.004
.02
--
.103
.063
.288
.078
.0
.027
.224
.014
.257
.0
--
.006
--
.036
.033
.002
.331
.059
1.0
.049
.125
.045
.168
.0
.31
.793
.389
.435
.016
.079
.01
.646
--
--
.149
.12
.03
--
--
.315
--
.429
--
.001
.0
.088
.332
.59
.722
.73
--
.445
--
--
--
.036
.006
.004
.013
.057
.32
.003
.411
.001
.049
--
.083
.023
--
.154
.0
.006
.063
.143
.019
.048
.242
.002
.002
.0
.0
.059
.001
.866
.056
.02
.029
.001
--
--
--
.028
.712
.02
--
--
--
--
--
--
.044
.442
.001
.008
.007
.215
--
--
.127
--
--
--
.541
.993
.001
--
--
--
.112
.0
.012
--
.011
.117
.142
.419
.148
.009
.031
.001
.18
.967
.301
.042
.012
.083
.23
.008
.014
.741
.0
.001
.002
.034
.001
.001
.018
.015
.012
.01
--
.98
.058
.034
.001
.015
.002
.003
.013
.034
.004
.005
.0
.112
.16
.007
.035
.012
.15
.319
.023
.006
.227
.046
.019
.022
.009
.01
.173
.021
.0
.021
.003
.017
.032
.466
.531
1.0
.558
.99
.0
.007
.123
.152
.007
--
.002
.002
.01
.009
.002
.104
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.053
.06
.004
.046
.252
--
--
.247
.039
.046
.213
.018
.019
.148
.045
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.984
.966
.987
.0
.0
.0
.345
--
--
.109
.021
.499
.238
--
.037
.056
.108
--
--
--
.402
.389
.047
.02
--
.001
.01
.1
--
--
.004
.137
.001
.003
.015
.439
.001
.213
.228
.097
.032
.014
--
--
.711
.144
--
--
--
--
--
--
--
.178
.041
.562
.251
.119
--
--
--
--
--
--
--
--
.055
.003
.83
.423
.044
.045
.004
.249
.241
.067
.05
.034
--
.03
.007
.113
.058
.001
.13
.33
.002
.13
--
--
.712
.196
.01
--
--
.001
.088
.91
.739
.601
.339
.073
.013
.024
.127
.037
.582
.579
.002
--
.0
.022
.055
.071
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
G
G
T
G
A
3
T
G
C
C
G
A
A
A
T
C
A
G
C
C
A
A
C
T
A
C
T
C
C
C
G
G
G
G
8
C
G
C
T
A
T
3
C
G
T
C
G
C
2
T
G
C
C
60
G
G
T
A
2
A
T
G
C
2
A
A
G
G
28
27
C
G
C
G
G
C
A
A
T
C
C
G
5
T
C
10
T
T
A
C
C
A
A
T
8
6
T
T
T
T
C
T
A
A
9
A
T
T
C
C
T
A
T
G
A
G
G
C
A
C
A
C
A
C
G
A
A
A
G
T
G
G
C
C
C
G
G
T
T
T
G
A
G
C
T
T
G
G
A
C
T
G
C
G
C
G
2
A
C
G
C
C
T
T
A
24
T
T
G
C
G
T
A
G
A
C
T
A
A
T
139
G
4
C
T
C
T
G
G
A
A
G
C
G
A
G
G
A
T
G
11
10
C
G
T
T
C
A
9
2
8
C
C
G
2
A
A
T
G
T
A
T
G
T
A
T
A
A
G
G
C
A
G
A
G
T
A
A
T
C
C
G
C
G
A
G
A
A
C
C
C
A
T
T
T
G
C
A
T
G
A
C
A
A
G
T
G
A
G
G
G
C
G
G
T
A
A
2
7
A
4
2
T
G
T
C
T
T
A
5
C
2
8
T
T
C
T
T
T
G
G
C
A
A
A
A
9
G
C
T
C
C
T
13
G
A
T
A
G
A
A
C
A
G
C
T
C
C
T
T
C
T
T
C
2
G
C
C
C
T
G
G
T
G
T
G
G
G
C
A
G
C
C
T
T
C
A
T
A
T
G
A
T
C
4
A
3
A
T
2
A
A
G
C
C
T
A
A
  108,898,848
  108,899,119
  108,899,588
  108,899,730
  108,899,803
  108,900,013
  108,900,199
  108,900,368
  108,900,979
  108,902,268
  108,903,111
  108,903,954
  108,904,472
  108,904,645
  108,904,953
  108,905,765
  108,905,903
  108,906,135
  108,906,170
  108,906,517
  108,906,829
  108,907,096
  108,907,467
  108,907,805
  108,907,964
  108,909,402
  108,911,834
  108,913,622
  108,915,618
  108,916,488
  108,916,514
  108,916,615
  108,916,619
  108,919,400
  108,920,202
  108,920,548
  108,921,449
  108,922,653
  108,922,748
  108,923,517
  108,924,141
  108,925,827
  108,925,960
  108,926,346
  108,928,086
  108,928,530
  108,928,812
  108,929,470
  108,929,517
  108,929,674
  108,929,724
  108,930,061
  108,930,438
  108,930,477
  108,931,190
  108,931,754
  108,931,947
  108,932,080
  108,933,324
  108,933,669
  108,934,260
  108,934,589
  108,935,929
  108,936,146
  108,936,147
  108,937,383
  108,938,008
  108,938,344
  108,938,372
  108,938,373
  108,938,646
  108,938,897
  108,939,741
  108,940,241
  108,940,300
  108,940,599
  108,941,480
  108,942,869
  108,943,273
  108,943,422
  108,943,548
  108,944,563
  108,945,390
  108,945,754
  108,946,018
  108,946,243
  108,947,780
  108,947,885
  108,947,928
  108,948,014
  108,948,062
  108,948,903
  108,949,161
  108,949,214
  108,949,443
  108,949,445
  108,949,464
  108,950,103
  108,950,272
  108,950,746
  108,951,310
  108,951,449
  108,951,808
  108,952,312
  108,952,886
  108,953,011
  108,954,168
  108,954,274
  108,954,343
  108,954,822
  108,955,324
  108,955,364
  108,955,430
  108,955,444
  108,955,982
  108,956,556
  108,957,200
  108,957,303
  108,957,317
  108,957,487
  108,957,538
  108,957,825
  108,957,975
  108,958,232
  108,958,267
  108,958,287
  108,958,341
  108,958,739
  108,959,009
  108,959,189
  108,959,558
  108,959,569
  108,959,589
  108,960,965
  108,962,769
  108,963,795
  108,964,006
  108,964,375
  108,964,678
  108,964,714
  108,964,750
  108,964,810
  108,965,930
  108,966,195
  108,966,434
  108,966,732
  108,966,913
  108,967,608
  108,967,804
  108,968,099
  108,968,211
  108,968,372
  108,968,491
  108,969,390
  108,969,853
  108,970,121
  108,970,122
  108,970,123
  108,970,379
  108,970,414
  108,970,747
  108,970,965
  108,971,323
  108,971,538
  108,972,571
  108,973,041
  108,973,938
  108,974,500
  108,975,192
  108,976,954
  108,977,074
  108,979,079
  108,979,151
  108,979,711
  108,980,177
  108,980,589
  108,980,722
  108,981,219
  108,981,509
  108,982,085
  108,983,758
  108,984,071
  108,984,209
  108,984,790
  108,984,859
  108,985,018
  108,985,102
  108,986,400
  108,986,498
  108,987,323
  108,988,919
  108,989,318
  108,989,342
  108,989,450
  108,989,848
  108,990,093
  108,990,359
  108,990,387
  108,990,572
  108,990,929
  108,991,037
  108,991,038
  108,991,561
  108,993,829
  108,993,866
  108,993,941
  108,994,058
  108,994,247
  108,994,285
  108,994,574
  108,994,616
  108,994,655
  108,994,657
  108,994,965
  108,995,004
  108,995,104
  108,995,460
  108,996,167
  108,996,359
  108,996,457
  108,997,032
  108,997,068
  108,997,126
  108,997,208
  108,997,562
  108,997,640
  108,997,731
  108,997,925
  108,997,930
  108,998,052
  108,998,092
  108,998,377
  108,998,860
  108,999,250
  108,999,609
  109,000,017
  109,000,088
  109,000,342
  109,000,425
  109,000,730
  109,000,844
  109,000,897
  109,000,977
  109,001,033
  109,001,303
  109,001,314
  109,001,493
  109,001,680
  109,001,681
  109,002,120
  109,002,240
  109,002,673
  109,002,758
  109,002,841
  109,002,984
  109,003,080
  109,003,099
  109,003,315
  109,003,356
  109,003,384
  109,003,427
  109,003,434
  109,003,475
  109,003,498
  109,003,530
  109,003,746
  109,004,127
  109,004,135
  109,004,171
  109,004,360
  109,004,677
  109,004,690
  109,004,776
  109,004,827
  109,004,842
  109,004,904
  109,005,433
  109,006,004
  109,006,007
  109,006,314
  109,006,642
  109,006,644
  109,007,077
  109,007,527
  109,007,724
  109,007,880
  109,007,883
  109,007,906
  109,008,165
  109,008,384
  109,008,442
  109,009,064
  109,009,071
  109,009,119
  109,009,541
  109,010,487
  109,010,488
  109,010,746
  109,010,872
  109,011,689
  109,011,985
  109,012,255
  109,012,323
  109,012,463
  109,012,870
  109,012,935
  109,012,992
  109,013,329
  109,013,529
  109,013,643
  109,013,644
  109,013,667
  109,013,668
  109,016,471
  109,018,193
  109,018,803
  109,021,926
  109,022,522
  109,022,569
  109,022,773
  109,022,863
  109,023,477
  109,024,425
  109,024,522
  109,024,531
  109,024,555
  109,024,560
  109,024,565
  109,024,758
  109,025,198
  109,025,484
  109,025,702
  109,025,722
  109,025,865
  109,026,003
  109,026,271
  109,026,619
  109,026,623
  109,026,715
  109,026,746
  109,027,191
  109,027,594
  109,027,699
  109,028,511
  109,028,842
  109,028,847
  109,029,098
  109,029,160
  109,029,330
  109,029,788
  109,030,091
  109,031,042
  109,031,505
  109,031,682
  109,032,184
  109,032,261
  109,032,399
  109,032,403
  109,033,063
  109,034,072
  109,034,251
  109,034,279
  109,034,293
  109,034,309
  109,034,514
  109,034,721
  109,034,738
  109,034,752
  109,035,206
  109,035,342
  109,035,343
  109,035,434
  109,036,123
  109,037,039
  109,037,381
  109,037,394
  109,037,595
  109,038,678
T
A
C
?
G
3/-
C
G/2
T
T
A
C
G
G
T/7
G
9
C
T
A
G
G
2
C
C
5
C
T
G
T
G/A
A
A
A
-
T
2
G
3
?
G
-
9
A
C
T
A
17
-
C
T
A
T
-
7
8
C
G
-
T
C
T
T
2/-
-
-
A
C
28/-
27/-
T
C
T
8
A
T
G
G
C
5/7
T
A
-
2
T
-
C
A
C
G
T
G
G
C
8/-
6/-
G
C
A
A
T
C
G
C
-
G
C
C
T
C/2
C
G
C
A
G
T
C
T
G
T
5
A
G
G
A
G
24
G
2
C
5
C
C/3
T
3
T
A
C
C
20
A
G
-
T
C
2
C
4/3
G
T
C
?
7
A
T
G/3
2/-
A/-
7
A
T
A
C
C
G
-
5
C
A
-
A
A
T
A
G
T
C
9
C
C
-
A
-
T
C
4/3
2
C
A
21
2
C
A
T
G
C
-
G
C
A
11/-
10/-
T
T
-
G
T
G
-
-
-
-
-
A
-
G
C
C
A
C
G
C
A
2
G
C
G
G
A
A
T
C
A
G
A
G
G
G
C
T
T
-
G
T
G
A
G
C
T
G
A
G
C
C
C
A
G
G
C
-
G
2
4
G
A
A
3
G
A
A
2
4/CA
A
A
-
G
10
-
-
G
-
2/-
A
C
C
T
A
C
G
-
CT/3
-
-
C
C
A
A
C
2
A
A
T
G
G
T
G
-
A
T
C
T
-
G
-
G/5
5
C
G
A
2
7
C/60
T
C
T
C
T
G
C
C
7
C
C
A
-
A
A
A
T
C
3
C
C
T
C
2
A
A
A
G
A
4
T
C
C
T
G
A
G
C
A
G
C
T
-
G
-
C
A
2/-
A/-
G
G/2
T
2
G
C
C