Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,092 (bp)   Positions: 387
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.922
.995
.046
.077
.002
--
.012
.257
.001
.0
--
.883
.006
--
.003
.003
.25
.014
.006
.598
--
--
--
--
.036
.059
.384
.155
.049
.045
.008
.033
.158
.168
.004
.284
.35
.073
.31
.146
.265
--
.007
.131
.435
.016
.394
.259
.079
.005
.003
.01
.0
.0
--
.511
.149
.0
--
.071
--
.146
.23
.239
.001
.08
.0
.088
.11
.332
.079
.001
.002
.59
.73
.562
.023
.163
.174
--
--
--
.033
.677
.193
--
--
--
--
--
.036
.011
.006
.011
.041
.737
.002
.001
.029
.003
.0
.283
.051
.016
.049
--
.017
.007
.076
.218
.193
.067
--
--
.056
.185
.043
.107
.01
.071
.034
.158
.876
.877
.099
.006
.063
.019
.29
.142
.242
.009
.002
.025
.0
.0
.747
.088
.056
.916
.393
.008
.001
.214
--
--
--
--
--
--
--
.896
.965
.028
.712
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.044
.17
.399
.002
.007
.081
.222
.215
.199
.043
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.591
.993
.656
.001
.001
.001
.082
--
--
--
--
--
--
.015
.006
.0
.199
.601
.015
.055
.032
.015
.112
.131
.016
.118
.023
.006
.035
.004
.0
.0
.001
.014
.012
.018
.007
--
.107
.011
.005
.117
.148
.272
.002
.022
.091
.003
.009
.007
.037
.001
.0
.022
.18
.967
--
.042
.083
.016
.23
.008
.014
.016
.741
.001
.002
.026
.001
.01
.018
.015
.012
--
.01
.003
.004
.011
.582
.98
.992
.058
.034
.002
.003
.018
.013
.034
.004
.0
.002
.112
.16
--
.012
.117
.016
.001
.021
.003
.017
.116
.123
.004
.006
.007
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.093
--
--
.0
.547
.191
--
--
.892
--
.005
.021
--
--
--
.137
--
--
.119
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.055
.003
.83
.423
.044
.044
.003
.327
.249
.241
.067
.05
.023
--
.03
.007
.113
.001
.13
.33
.002
.13
--
.712
.196
.01
.004
--
--
.001
.392
.383
.088
.739
.244
.037
.002
--
.0
.055
.146
.053
.049
.004
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
Ppp2r3a
G
C
G
C
A
T
T
A
T
T
A
T
G
T
C
A
A
G
T
T
C
T
C
C
C
C
G
5
A
8
G
T
T
A
C
T
T
T
C
A
A
T
A
A
A
C
G
C
G
T
13
A
C
T
T
2
G
T
A
G
A
A
2
T
T
4
A
A
T
G
G
G
G
C
C
A
C
A
G
G
C
T
A
A
T
C
G
C
A
2
C
C
A
G
A
C
A
T
G
G
A
C
A
T
A
C
G
G
3
G
T
2
10
A
C
C
C
A
T
G
T
T
G
C
C
T
T
T
C
A
A
A
G
A
G
6
2
T
C
T
A
G
C
A
G
A
A
T
A
G
G
T
T
G
T
T
C
T
C
T
C
A
T
T
C
A
15
T
A
A
T
G
T
C
T
C
A
G
A
C
G
G
C
T
T
G
A
A
G
G
C
A
G
T
C
T
C
C
G
A
G
G
G
T
T
G
C
T
G
T
T
T
G
C
G
C
C
A
T
T
C
C
C
C
A
G
G
C
G
A
T
C
T
A
C
C
A
G
G
G
C
2
T
T
A
T
G
T
A
T
T
G
C
G
A
C
2
A
A
C
3
C
T
T
T
A
A
G
G
G
T
G
T
G
T
A
T
G
A
C
A
T
A
T
T
T
C
2
C
A
A
T
G
A
C
C
C
A
T
G
T
C
G
A
C
A
G
G
A
A
C
C
A
T
A
A
2
T
T
10
2
C
T
A
9
T
2
C
T
T
C
T
T
T
G
A
C
C
C
T
T
G
T
C
T
T
C
A
C
G
C
C
C
T
A
G
T
G
T
G
G
C
A
G
C
T
T
C
C
A
T
A
C
A
T
A
C
T
A
G
C
T
A
A
A
C
A
  108,899,730
  108,900,979
  108,901,372
  108,902,268
  108,903,271
  108,903,618
  108,904,953
  108,905,931
  108,907,805
  108,907,911
  108,907,964
  108,908,279
  108,908,876
  108,909,221
  108,909,402
  108,910,581
  108,911,034
  108,911,457
  108,911,526
  108,911,834
  108,912,224
  108,912,844
  108,912,973
  108,913,622
  108,913,880
  108,915,618
  108,916,619
  108,916,775
  108,918,293
  108,920,202
  108,921,449
  108,921,845
  108,922,292
  108,922,600
  108,922,653
  108,922,760
  108,922,941
  108,923,334
  108,923,395
  108,923,517
  108,923,898
  108,924,590
  108,924,879
  108,924,950
  108,924,986
  108,925,960
  108,926,346
  108,926,840
  108,928,016
  108,928,086
  108,928,388
  108,928,412
  108,928,530
  108,928,610
  108,928,617
  108,929,530
  108,929,576
  108,929,674
  108,931,408
  108,931,754
  108,931,881
  108,932,080
  108,932,302
  108,932,727
  108,932,878
  108,933,322
  108,933,572
  108,933,669
  108,934,260
  108,934,452
  108,934,589
  108,935,274
  108,935,699
  108,935,841
  108,935,929
  108,936,147
  108,936,870
  108,936,930
  108,937,036
  108,937,037
  108,937,289
  108,937,362
  108,937,383
  108,937,835
  108,938,038
  108,938,245
  108,938,344
  108,938,378
  108,938,390
  108,938,397
  108,938,399
  108,938,646
  108,938,804
  108,938,897
  108,938,906
  108,939,154
  108,940,881
  108,941,081
  108,941,084
  108,941,411
  108,941,480
  108,942,713
  108,942,832
  108,943,194
  108,943,286
  108,943,422
  108,943,531
  108,943,572
  108,943,608
  108,943,991
  108,944,680
  108,945,031
  108,945,385
  108,945,609
  108,945,654
  108,945,803
  108,945,902
  108,945,998
  108,946,353
  108,946,682
  108,946,717
  108,946,826
  108,946,872
  108,946,931
  108,946,960
  108,947,732
  108,947,780
  108,947,885
  108,948,014
  108,948,369
  108,948,381
  108,948,903
  108,949,056
  108,949,161
  108,949,401
  108,949,445
  108,949,449
  108,950,264
  108,950,408
  108,950,746
  108,950,924
  108,951,135
  108,951,388
  108,951,808
  108,952,031
  108,952,269
  108,952,312
  108,952,548
  108,953,011
  108,953,081
  108,953,158
  108,953,337
  108,954,007
  108,954,047
  108,954,168
  108,954,274
  108,954,418
  108,955,032
  108,955,217
  108,955,324
  108,955,328
  108,955,364
  108,955,430
  108,955,498
  108,955,499
  108,955,769
  108,955,890
  108,955,902
  108,955,904
  108,955,982
  108,956,148
  108,956,556
  108,956,695
  108,957,074
  108,957,244
  108,957,487
  108,957,493
  108,957,534
  108,957,538
  108,957,545
  108,957,724
  108,957,769
  108,957,825
  108,957,879
  108,957,883
  108,957,922
  108,957,975
  108,958,330
  108,958,354
  108,958,360
  108,958,365
  108,958,881
  108,959,009
  108,959,019
  108,959,169
  108,959,189
  108,959,203
  108,959,441
  108,959,536
  108,959,552
  108,959,566
  108,959,569
  108,959,709
  108,959,721
  108,959,909
  108,960,107
  108,960,185
  108,960,264
  108,960,293
  108,960,401
  108,960,730
  108,960,776
  108,960,793
  108,960,965
  108,961,050
  108,961,110
  108,961,234
  108,961,271
  108,961,498
  108,961,781
  108,962,156
  108,962,642
  108,962,769
  108,962,796
  108,963,737
  108,963,795
  108,963,803
  108,963,807
  108,964,027
  108,964,141
  108,964,375
  108,964,505
  108,964,678
  108,964,810
  108,964,876
  108,965,571
  108,965,663
  108,965,728
  108,965,754
  108,965,930
  108,965,931
  108,966,069
  108,966,434
  108,966,489
  108,966,690
  108,966,732
  108,966,913
  108,967,293
  108,967,804
  108,968,211
  108,968,278
  108,968,372
  108,968,491
  108,969,390
  108,969,439
  108,969,853
  108,970,122
  108,970,123
  108,970,397
  108,970,747
  108,970,899
  108,970,965
  108,971,323
  108,971,538
  108,971,704
  108,972,571
  108,973,048
  108,973,051
  108,973,056
  108,973,223
  108,973,938
  108,973,966
  108,974,500
  108,975,192
  108,979,079
  108,979,151
  108,979,301
  108,979,711
  108,980,177
  108,980,589
  108,981,219
  108,981,263
  108,981,509
  108,982,085
  108,983,830
  108,985,019
  108,985,504
  108,987,324
  108,987,491
  108,989,848
  108,990,387
  108,990,572
  108,990,915
  108,994,247
  108,994,653
  108,994,661
  108,995,003
  108,995,005
  108,996,167
  108,996,359
  108,997,009
  108,997,253
  108,997,529
  108,997,547
  108,997,857
  108,997,925
  108,998,860
  109,000,614
  109,000,993
  109,003,427
  109,004,131
  109,004,892
  109,005,117
  109,005,155
  109,005,659
  109,005,904
  109,006,644
  109,007,790
  109,007,978
  109,009,056
  109,009,064
  109,009,079
  109,009,541
  109,012,935
  109,012,992
  109,013,310
  109,013,668
  109,013,696
  109,016,597
  109,018,682
  109,018,727
  109,018,754
  109,018,826
  109,018,851
  109,023,943
  109,024,425
  109,024,531
  109,024,560
  109,024,565
  109,024,635
  109,024,758
  109,024,967
  109,025,198
  109,025,484
  109,025,702
  109,025,722
  109,025,865
  109,026,004
  109,026,227
  109,026,311
  109,026,619
  109,026,623
  109,026,715
  109,026,746
  109,026,895
  109,027,594
  109,027,699
  109,028,511
  109,028,842
  109,029,098
  109,029,160
  109,029,330
  109,029,788
  109,030,091
  109,031,042
  109,031,682
  109,032,184
  109,032,261
  109,032,267
  109,032,399
  109,032,403
  109,033,063
  109,033,280
  109,033,286
  109,034,072
  109,034,279
  109,034,349
  109,035,206
  109,035,434
  109,036,123
  109,037,039
  109,037,394
  109,038,606
  109,038,611
  109,038,627
  109,038,661
  109,038,678
3
T
A
T
T
A
T/5
T
C
G
C
T/A
-
C
5/T
11
-
2
-
C
T
C
T
T
G
G
A
-
C
-
G/2
C
C
C
G
5
-
T/2
T
AT/3
G
C
G
T
G
9
A
T
A
C
-
G
T
C
C
2/-
G/T
C
-
8
G
G
-
3
T/9
-
G
T
C
A
T
G/A
A
T
T
-
T
C
A
A
T
13
-
G
C
T
C
-/3
A/3
2/-
3
T
T
C
-
A
C
C
A
A
G
T
G
3
T
7/5
A
A
-
A
A
-
-
T
A
T
G
C
C
A
C
C
A
T
T
A
C
A
G
-
G
G
A
G
G/A
6/-
-
C
T
A
-
A
T
G
A
G
C
C
G
A
A
C
G
A
C
C
T
C
T
C
3
G
C
A
G
G
-
C
G
G
C
T
A
T
C
T
C
G/C
5
C/T
A
A
A
G
C
G/A
G
A/C
G/A
G/A
A
G
2
C
-
C
T
-
2
G
G/A
G/C
A
C
C
C
A
C
C
C
C
A
A
T
2
2
T
G
C
C
T
T
3
T
G
T
C
G
A
T
C
T
C
G
T
T
G
A
A
G/-
-
-
C
G
G
2
C
C
G
T/C
C
5
7
A
C
T
-
A/-
C
T
3/-
A
C
C
T/C
G
A/G
G/A
G/A
A
5
2
C
A
A
T
C
A
G
T
5
T/C
C
C
C
-
A
2/-
C/A
G
G
C
A
G
C/3
C/T
-
-
C
G/A
C
T
A
2
T
A/G
A
A
-
G
G
T
G
A
G
-
-
-
C
10/-
2/-
3
C
G
9/-
A
-
C/3
T/A
T/C
C/T
T/C
G
T/C
G/A
T
T
T
G
G
C
A
C
7
C
C
A
-
T
A
A
A
T
C
T
C
C
T
C
A
A
A
G
A
3
C
C
T
T
G
A
G
2
2
C
G
T
T/A
G
G/2
T
G
C
G
C
G
C