Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 209,347 (bp)   Positions: 599
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.02
.0
.049
.05
.011
.001
.12
.022
.273
.027
.001
.002
.0
.307
--
--
.705
.533
.001
.006
.002
.0
.0
.0
.097
.005
.001
.118
.01
.965
.996
.002
.0
.011
.022
.021
.002
.018
.012
.053
.088
.037
.062
.001
.001
.001
.002
.0
.0
.0
.041
.017
.0
.002
--
.023
.002
.304
.027
.041
.024
.004
.0
.095
.007
.005
.244
.026
.007
.048
.059
.002
.004
.001
.0
.001
.003
.001
.001
.149
.033
.008
.078
.317
.036
.0
.001
.001
.001
.0
.095
.013
.006
.0
.0
.004
--
--
--
.037
.0
--
--
.003
.001
.004
.037
.029
.575
.008
.038
.023
.672
.058
.317
.021
.052
.022
.086
.119
.01
.017
.032
.614
--
.552
.021
.003
.12
.243
.001
.137
--
--
--
.04
.0
.002
.002
.007
.01
.001
.016
.057
.043
.072
.008
.002
.004
.001
.001
.001
.001
.002
.778
.001
--
.004
.382
.023
.067
.006
.012
--
--
--
--
--
--
.081
.018
.057
.0
.064
.002
.004
.052
.02
.146
.012
.001
.081
.075
.034
.002
.001
.009
.07
.09
.028
.0
.002
.175
.029
.007
--
.17
.01
.023
.124
.356
.004
.084
.001
.137
.088
.059
.002
.003
.001
.147
.013
.01
.501
.21
.044
.315
.006
.082
.962
.804
.0
.005
.047
.008
.004
.227
.014
.0
.001
--
--
.003
.0
.001
.002
.0
.009
.066
.062
.03
.001
.077
.369
.017
.001
.881
.37
.997
.016
.001
.004
.012
.081
--
--
.08
.006
.0
.032
.039
.045
.009
.002
.156
--
--
--
--
--
.093
.005
.121
.479
.705
.87
.007
.006
.006
.008
.016
.16
.245
.002
.0
.005
.979
.059
1.0
.047
.16
.039
.0
.116
.168
.007
.003
.287
.208
.03
.012
.008
.006
.0
.0
.003
.001
.985
.002
.002
.028
.0
.079
.005
.009
.0
.001
.0
.018
.0
.009
.029
.243
.493
.099
.001
.064
.107
.035
.01
.064
.0
.0
.0
.12
.035
.053
.055
.064
.015
.019
.003
.008
.179
.003
.154
.004
.007
.097
.008
.004
.006
.69
.692
.039
.038
.295
.063
.415
.027
.724
.278
.945
.153
.422
--
--
--
--
--
--
--
.995
--
--
--
.002
.015
.011
.0
.718
.003
.001
.024
.0
.0
.0
.005
.05
--
.001
.018
.012
.062
.001
--
.038
.003
.0
.001
.009
.854
.016
.112
--
--
.0
.022
.008
.105
.024
.0
.0
.908
.911
.01
.0
.0
.005
.344
.936
.122
.049
.051
.004
.002
.004
.051
.091
.001
.001
.016
.008
--
--
--
--
--
.001
.009
.09
.05
.857
.893
.004
.003
.006
.006
.0
.163
.963
.001
.001
--
.035
.788
.486
.005
.019
.016
.02
.021
.042
.004
--
--
--
.173
.243
.202
.0
.002
.019
.0
.0
.019
.001
.0
.011
--
--
--
--
.014
.037
.017
.091
.068
.043
.05
.008
.005
.027
.027
.01
.012
.001
.004
.007
.001
.011
.0
.06
.284
.0
.0
.001
.125
.231
.001
.003
.008
.063
.067
.004
.0
.102
.008
.001
.002
.006
.085
.018
.667
.018
.213
.004
.02
.228
.056
.08
.375
--
--
.089
.16
.015
.047
.124
.026
.129
--
--
--
--
--
--
.001
.024
.023
.01
--
--
.032
.055
.009
.011
.147
.003
.002
.001
.001
.009
.009
.001
.002
.994
.063
.007
.599
.001
.095
.311
.051
.118
.922
.085
--
--
--
--
--
.016
.033
.112
.001
.0
.001
.041
.042
.003
.0
.002
.007
.995
.001
.022
.844
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
G
4
C
G
C
G
G
A
C
C
C
G
A
T
4
3
T
T
C
T
T
T
3
G
T
T
G
T
C
T
G
A
G
T
C
A
C
G
T
G
T
C
C
G
G
A
C
G
A
A
A
A
T
C
C
A
C
10
T
A
G
A
A
8
C
A
G
C
G
T
T
A
G
T
A
G
A
G
A
14
A
C
15
G
T
G
A
T
3
A
A
A
G
A
A
T
G
C
G
C
A
G
4
A
A
G
T
2
C
G
C
G
G
A
G
C
G
A
A
G
C
C
G
A
A
C
C
2
A
G
A
A
A
G
4
G
A
A
G
A
T
G
C
G
T
G
A
G
T
G
T
G
T
A
G
C
G
A
T
G
G
C
A
G
A
A
T
A
G
A
T
A
T
A
G
T
T
G
G
C
T
2
6
C
G
3
A
C
G
T
A
A
G
A
T
A
C
A
C
T
3
G
C
3
G
C
T
T
G
T
4
G
A
T
C
T
T
A
T
A
C
G
C
A
2
C
A
A
T
12
4
A
C
A
G
A
T
T
G
G
T
C
A
G
4
A
2
2
G
T
6
3
G
G
G
C
G
A
T
12
10
T
T
T
T
G
C
T
G
T
2
G
T
T
G
18
C
T
C
G
A
T
43
G
T
T
G
T
4
C
T
C
C
A
C
T
C
C
3
T
2
T
T
A
A
A
C
A
G
A
A
T
G
G
C
T
A
G
C
A
T
T
C
4
A
T
16
C
3
G
T
T
C
T
C
T
T
T
A
G
T
C
C
A
A
C
T
G
T
C
C
5
G
C
C
C
G
C
C
A
T
G
A
G
A
T
10
A
2
C
C
T
A
A
C
T
16
3
A
G
A
C
T
A
A
A
C
3
G
A
T
G
G
T
T
A
T
T
G
T
C
G
A
G
T
A
G
T
A
G
A
A
G
16
14
C
G
T
G
G
A
G
C
G
2
A
C
C
T
G
C
G
T
2
4
2
2
2
C
A
A
A
8
4
G
A
T
T
G
T
T
A
4
A
T
A
C
T
A
G
A
A
A
A
2
G
C
5
C
G
G
G
2
G
A
C
G
A
T
G
T
C
C
T
A
G
A
A
T
T
G
A
C
T
G
C
A
A
T
2
T
G
G
C
C
G
G
A
C
T
C
A
C
T
A
A
G
G
C
T
A
C
G
C
7
A
C
C
A
T
T
C
T
G
G
C
C
G
C
G
A
T
G
G
T
C
T
A
A
A
G
A
A
C
T
G
G
C
G
A
C
C
C
A
C
C
T
T
G
A
G
C
C
C
2
A
T
G
A
2
T
G
12
126
6
A
G
G
2
T
T
C
G
2
T
T
A
6
A
  173,641,474
  173,641,478
  173,641,486
  173,641,487
  173,642,843
  173,643,929
  173,644,003
  173,644,183
  173,644,192
  173,644,624
  173,644,767
  173,644,798
  173,645,285
  173,645,740
  173,650,493
  173,650,494
  173,651,543
  173,652,266
  173,652,558
  173,652,716
  173,653,144
  173,653,296
  173,653,472
  173,653,483
  173,653,814
  173,654,307
  173,654,589
  173,654,853
  173,655,124
  173,655,217
  173,655,278
  173,655,423
  173,655,882
  173,655,991
  173,656,367
  173,656,368
  173,656,448
  173,656,623
  173,656,676
  173,656,783
  173,656,922
  173,657,079
  173,657,303
  173,657,933
  173,658,025
  173,658,089
  173,658,546
  173,658,550
  173,659,189
  173,659,688
  173,659,835
  173,660,165
  173,660,287
  173,660,367
  173,660,713
  173,661,197
  173,661,456
  173,661,693
  173,661,951
  173,662,921
  173,662,983
  173,663,172
  173,663,378
  173,663,783
  173,663,872
  173,664,384
  173,664,548
  173,664,664
  173,664,897
  173,665,315
  173,665,320
  173,665,846
  173,665,928
  173,666,172
  173,666,223
  173,666,281
  173,666,434
  173,666,595
  173,666,703
  173,667,508
  173,667,859
  173,671,850
  173,671,905
  173,672,335
  173,672,476
  173,672,729
  173,672,913
  173,673,143
  173,673,238
  173,673,652
  173,673,785
  173,674,060
  173,674,270
  173,674,322
  173,674,890
  173,675,385
  173,675,720
  173,675,721
  173,675,800
  173,676,352
  173,676,534
  173,676,600
  173,676,639
  173,677,037
  173,677,107
  173,677,342
  173,677,381
  173,677,616
  173,677,669
  173,677,981
  173,677,997
  173,678,556
  173,678,909
  173,679,061
  173,679,076
  173,679,128
  173,679,215
  173,679,944
  173,680,147
  173,680,164
  173,680,217
  173,680,362
  173,680,993
  173,682,021
  173,683,012
  173,684,277
  173,684,362
  173,684,369
  173,684,753
  173,684,787
  173,685,360
  173,685,378
  173,685,870
  173,685,888
  173,685,891
  173,686,550
  173,686,872
  173,687,097
  173,687,359
  173,687,399
  173,687,403
  173,687,446
  173,687,586
  173,687,596
  173,687,607
  173,687,751
  173,687,917
  173,688,046
  173,688,514
  173,688,575
  173,688,942
  173,689,289
  173,689,331
  173,689,636
  173,690,102
  173,690,196
  173,690,469
  173,690,640
  173,690,974
  173,691,274
  173,692,012
  173,692,036
  173,692,829
  173,694,029
  173,694,152
  173,694,757
  173,695,224
  173,695,297
  173,695,318
  173,695,442
  173,695,707
  173,696,082
  173,696,788
  173,696,798
  173,697,071
  173,697,085
  173,697,403
  173,697,496
  173,697,523
  173,697,638
  173,697,644
  173,697,672
  173,697,678
  173,697,840
  173,698,354
  173,698,922
  173,699,039
  173,699,363
  173,699,369
  173,699,568
  173,699,882
  173,699,922
  173,700,123
  173,700,204
  173,700,329
  173,700,849
  173,701,047
  173,702,443
  173,703,054
  173,703,161
  173,703,321
  173,703,953
  173,704,110
  173,704,117
  173,704,505
  173,704,849
  173,704,859
  173,704,994
  173,705,239
  173,705,421
  173,706,121
  173,706,404
  173,707,145
  173,707,213
  173,707,397
  173,707,414
  173,708,122
  173,708,385
  173,712,930
  173,713,002
  173,713,246
  173,713,919
  173,713,984
  173,714,832
  173,714,889
  173,715,469
  173,716,008
  173,716,247
  173,718,398
  173,719,324
  173,719,882
  173,719,913
  173,719,957
  173,720,171
  173,720,503
  173,721,550
  173,722,307
  173,723,032
  173,724,210
  173,724,211
  173,724,239
  173,724,694
  173,726,923
  173,727,899
  173,728,163
  173,728,475
  173,729,515
  173,729,732
  173,729,768
  173,733,233
  173,733,406
  173,733,625
  173,734,089
  173,734,493
  173,734,694
  173,734,709
  173,736,021
  173,736,908
  173,737,146
  173,737,288
  173,737,290
  173,738,574
  173,739,135
  173,739,489
  173,740,496
  173,740,905
  173,740,918
  173,741,537
  173,741,673
  173,741,752
  173,742,649
  173,744,867
  173,745,261
  173,747,314
  173,748,007
  173,748,727
  173,748,949
  173,748,969
  173,750,220
  173,751,249
  173,751,565
  173,752,155
  173,752,261
  173,752,453
  173,752,755
  173,753,002
  173,753,795
  173,754,240
  173,754,414
  173,755,410
  173,755,501
  173,755,523
  173,755,680
  173,756,216
  173,756,683
  173,756,863
  173,756,881
  173,757,193
  173,757,502
  173,758,109
  173,758,124
  173,758,129
  173,758,429
  173,758,740
  173,759,800
  173,759,894
  173,760,493
  173,760,683
  173,760,808
  173,760,854
  173,761,084
  173,761,326
  173,761,410
  173,761,571
  173,761,575
  173,761,668
  173,761,703
  173,762,164
  173,762,521
  173,762,616
  173,762,758
  173,762,924
  173,763,016
  173,763,049
  173,763,120
  173,763,384
  173,763,682
  173,763,747
  173,764,300
  173,765,048
  173,765,074
  173,765,173
  173,765,314
  173,765,324
  173,765,416
  173,765,954
  173,766,381
  173,766,383
  173,766,384
  173,766,605
  173,766,626
  173,767,651
  173,767,825
  173,768,175
  173,768,945
  173,768,998
  173,769,040
  173,769,220
  173,769,360
  173,769,580
  173,769,650
  173,769,685
  173,769,851
  173,769,852
  173,769,945
  173,769,946
  173,770,044
  173,770,114
  173,770,238
  173,770,295
  173,770,492
  173,770,515
  173,770,708
  173,770,756
  173,770,868
  173,771,024
  173,772,493
  173,773,757
  173,773,760
  173,774,197
  173,776,356
  173,777,195
  173,777,278
  173,777,521
  173,777,728
  173,777,852
  173,777,995
  173,778,008
  173,778,012
  173,778,119
  173,778,452
  173,778,752
  173,778,783
  173,778,877
  173,778,954
  173,778,955
  173,778,990
  173,779,065
  173,779,144
  173,779,212
  173,779,794
  173,779,945
  173,779,947
  173,779,959
  173,780,736
  173,781,087
  173,782,487
  173,782,789
  173,783,052
  173,783,354
  173,784,218
  173,784,357
  173,786,645
  173,788,286
  173,789,516
  173,789,530
  173,790,613
  173,791,580
  173,791,918
  173,792,011
  173,792,284
  173,792,339
  173,792,340
  173,792,918
  173,792,920
  173,793,258
  173,794,653
  173,794,711
  173,794,968
  173,795,492
  173,795,604
  173,795,747
  173,797,288
  173,797,289
  173,797,577
  173,798,554
  173,798,693
  173,798,770
  173,799,916
  173,800,073
  173,800,153
  173,801,036
  173,802,868
  173,803,438
  173,803,458
  173,803,475
  173,803,619
  173,803,710
  173,804,173
  173,804,559
  173,804,645
  173,806,209
  173,806,607
  173,806,611
  173,807,255
  173,807,360
  173,807,414
  173,807,648
  173,807,733
  173,808,196
  173,809,027
  173,809,813
  173,809,838
  173,809,911
  173,810,118
  173,810,183
  173,810,426
  173,810,798
  173,810,863
  173,810,864
  173,811,626
  173,811,764
  173,811,826
  173,812,488
  173,812,651
  173,812,670
  173,812,679
  173,812,808
  173,813,806
  173,813,832
  173,814,584
  173,814,761
  173,815,612
  173,815,744
  173,815,759
  173,816,729
  173,816,818
  173,816,844
  173,817,424
  173,817,714
  173,817,920
  173,818,248
  173,818,606
  173,819,217
  173,819,230
  173,819,233
  173,819,309
  173,819,356
  173,819,366
  173,819,384
  173,819,476
  173,819,495
  173,819,579
  173,819,581
  173,819,833
  173,819,862
  173,819,989
  173,820,106
  173,820,116
  173,820,245
  173,820,273
  173,820,304
  173,820,317
  173,820,368
  173,820,458
  173,820,525
  173,820,529
  173,820,549
  173,820,588
  173,820,673
  173,820,916
  173,820,956
  173,820,985
  173,821,034
  173,821,086
  173,821,091
  173,821,341
  173,821,441
  173,822,026
  173,822,037
  173,822,116
  173,822,943
  173,823,261
  173,824,088
  173,824,145
  173,824,492
  173,824,639
  173,824,707
  173,824,756
  173,825,139
  173,825,177
  173,825,711
  173,825,966
  173,825,977
  173,826,709
  173,826,719
  173,826,889
  173,827,028
  173,827,216
  173,827,355
  173,827,519
  173,827,772
  173,827,791
  173,828,085
  173,828,195
  173,828,544
  173,828,561
  173,829,109
  173,829,367
  173,829,370
  173,829,540
  173,830,196
  173,830,433
  173,830,767
  173,830,940
  173,830,956
  173,830,981
  173,831,059
  173,831,082
  173,831,086
  173,831,090
  173,831,092
  173,831,155
  173,831,160
  173,831,837
  173,832,316
  173,832,918
  173,833,079
  173,834,178
  173,835,032
  173,835,926
  173,836,022
  173,836,073
  173,836,099
  173,836,729
  173,837,477
  173,837,617
  173,840,456
  173,840,594
  173,840,763
  173,840,820
  173,841,327
  173,841,677
  173,842,032
  173,842,892
  173,842,945
  173,842,952
  173,842,954
  173,843,619
  173,843,620
  173,844,519
  173,844,827
  173,845,193
  173,845,583
  173,846,384
  173,846,681
  173,846,960
  173,847,459
  173,848,697
5
-
2
12
A
A
A
T
A
T
T
A
G
C
4/-
-
-
C
T
C
C
G
-
A
?
10
T
C
T
C
2
G
A
C
T
G
T
A
C
A
C
T
T
C
A
3
T
A
G
G
G
G
G
T
A
C
T
-
C
-
A
G
G
-
T
-
A
G
A
-
G
G
A
C
G
A
G
T
G
-
2
T
-
T
C
A
-
C
-
G
3
G
A
C
T
C
A
T
A
T
G
A
-
A/44
C
A
G
-
T
A
T
A
A
T
A
T
A
G
G
A
A
T
A
3/5
-
T
C/11
2/-
2
2
2
G
G
5
-
A
G
G
T
C
G
C
T
3
G
A
T
A
G
2
C
A
A
G
A
A
A
G
C
T
A
T
G
C
T
G
3
T
A
G
C
2
C
C
A
C
9
A
3
T
3
-
-
T
T
-
G
2
T
-
G
C
A
G
C
G
2
G
T
C
-
9
T
-
T
2
10
C
T
-
-
C
C
-
T
G
2
T
C
17
T
A
T
G
-
A
5
G
G
-
-
C
9
-
A
G
4
G
A
A
C
T
G
A
-
T
-
-
A
7/5
-
-
5
A
3
CA/4
A
G
G
12/-
10/-
2
C
C
C
2
3/CT
3
A
T/3
-
17
G
C
5
-
T
C
T
A
T
G
43/-
A
G
C
A
C
-
T
C
T
A
T
G
7
13
T
-
C
-
G
C
G
G
G
T
G
C
G
G
C
A
C
T
G
T
A
G
C
C
C
T
-
-
C
-
T
-
C
A
C
T
A
T
C
3
G
G
A
4
T
-
G
T
3
A
A
C
G
A
-
T
G
A
A
A
T
G
T
G
A
C
A
C
C
-
A/3
2/-
2
C/-
A
G
G
T
4
16/-
-
A/-
A
C
T
G
G
2
2
T
-
A
G
C
G/11
G/-
T/-
C
G
-
G
T
C
T
A
C
2
2
6
T
C
G
C
C
C
T
16/-
14/-
-
C
C
A
C
G
13
15
T
-
2
A
T
C
3
A
2
A
-
-
-
-
-
A
G
T
G
8/-
4/-
A
G
C
G
A
C
G
C
4/-
58
3
5
T
A
3
14
G
G
A/14
G
-
2
A
5/-
A
A
A
3
-
A
G
T
A
G
C
C
G
T
T
A
2
-
C
C
G
C
A
G
2
5
A
T
T
T
C
-
2
A
A
T
T
C
C
T
T
C
T
G
T
A
T
G
A
C
T
C
G
T
A
T
-
G
T
T
G
G
4/3
4
A
A
3
T
A
C
A
A
C
13
A
13
C
T
C
G
G
-
T
G
G
T
C
4
7
T
T
T
T
T
T
C
T
4
A
A
A
G
C
T
T
C/23
-
G
C
A
G
-
C
5
-
-
-
G
2
3
2/-
-
C
-
A
2/-
A
-
-
-
T