Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 73,993 (bp)   Positions: 204
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.646
.993
.069
.163
.003
.998
.982
.992
.033
.003
.0
.0
.007
.99
.001
.002
.0
.0
.03
.311
.822
.998
.025
.026
.002
.047
.011
.144
.228
.001
.001
.001
.035
.116
.0
.015
.019
.0
.003
.137
.0
.001
.054
--
.0
.001
.0
.001
.272
.268
.275
.0
.235
.001
.0
.003
.027
.556
.875
.037
.001
.001
.013
.008
.001
.002
.896
.109
.031
.005
.02
.0
.007
.049
.0
.001
.001
.005
.001
.009
.0
.015
.016
.019
.029
.002
.038
.265
.011
.0
.111
.292
.795
.967
.082
.093
.0
.002
.996
.002
.0
.103
.681
.007
.019
.124
.156
.157
.034
.016
.002
.007
.026
.095
.0
.018
.001
.0
.0
.926
.006
.032
.05
.089
.097
.107
.109
.038
.057
.583
.446
.0
.002
.001
.001
.0
.011
.999
.013
.004
.031
.0
.001
.006
.098
.66
.001
.006
.0
.001
.0
.0
.691
.004
.001
.0
.002
.016
.002
.0
.076
.001
.041
.005
.021
.076
.001
.003
.403
.075
.077
.092
.001
.001
.0
.0
.001
.0
.002
.001
.477
.038
.01
.0
.001
.0
.0
.005
.587
.009
.005
.001
.001
.004
.01
.011
.021
.001
.054
.018
.005
.898
.001
.124
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
Pik3r1
C
T
A
A
C
A
A
C
G
G
T
T
G
G
G
C
G
A
C
T
A
A
3
A
4
A
T
T
A
T
C
T
A
C
C
2
A
G
G
C
C
C
C
C
T
A
T
T
G
A
4
C
G
A
T
T
A
T
A
A
T
C
T
A
G
G
A
G
T
G
A
C
A
T
T
C
2
A
C
C
T
A
G
G
A
G
A
G
A
T
G
G
A
T
A
A
T
4
G
A
A
2
T
T
T
5
12
6
C
A
G
A
C
T
G
A
G
T
T
T
T
G
G
3
8
2
5
3
T
A
A
G
3
G
3
G
A
G
G
G
2
2
T
A
C
C
T
G
T
C
G
C
G
T
A
G
C
A
A
C
A
T
C
A
C
A
T
A
G
A
C
A
A
C
2
A
T
C
C
C
T
A
8
A
C
G
C
G
A
A
G
G
3
3
A
A
G
G
G
G
A
G
G
A
  50,891,516
  50,892,066
  50,892,138
  50,893,828
  50,893,838
  50,894,188
  50,894,330
  50,894,457
  50,895,027
  50,895,048
  50,895,565
  50,897,271
  50,898,417
  50,899,656
  50,899,813
  50,899,817
  50,899,945
  50,900,178
  50,900,206
  50,901,832
  50,902,260
  50,902,874
  50,903,050
  50,903,051
  50,903,260
  50,903,515
  50,904,041
  50,904,359
  50,905,944
  50,906,394
  50,906,784
  50,906,869
  50,907,082
  50,907,101
  50,907,225
  50,908,173
  50,908,174
  50,910,375
  50,910,381
  50,911,642
  50,911,821
  50,911,865
  50,914,401
  50,914,843
  50,916,166
  50,916,260
  50,916,455
  50,917,435
  50,917,571
  50,917,572
  50,917,734
  50,918,365
  50,918,416
  50,918,519
  50,918,610
  50,920,645
  50,921,322
  50,921,611
  50,921,889
  50,922,067
  50,922,732
  50,922,896
  50,922,969
  50,923,018
  50,923,073
  50,923,144
  50,923,471
  50,923,775
  50,923,844
  50,924,076
  50,924,370
  50,924,537
  50,925,238
  50,925,480
  50,926,361
  50,926,592
  50,926,794
  50,927,100
  50,927,257
  50,928,507
  50,928,573
  50,932,813
  50,932,814
  50,932,816
  50,932,818
  50,933,192
  50,933,263
  50,933,443
  50,933,591
  50,934,331
  50,935,709
  50,935,718
  50,936,505
  50,937,888
  50,938,477
  50,938,479
  50,938,641
  50,938,886
  50,939,140
  50,939,514
  50,939,552
  50,939,868
  50,940,604
  50,941,074
  50,941,190
  50,941,366
  50,941,551
  50,941,563
  50,941,807
  50,941,918
  50,944,181
  50,944,426
  50,944,437
  50,944,525
  50,944,858
  50,945,078
  50,945,394
  50,946,454
  50,946,769
  50,947,127
  50,947,334
  50,947,411
  50,947,414
  50,947,423
  50,947,426
  50,947,432
  50,947,435
  50,948,713
  50,948,733
  50,948,974
  50,948,981
  50,948,993
  50,949,006
  50,949,007
  50,949,012
  50,949,027
  50,949,043
  50,949,145
  50,949,800
  50,949,810
  50,949,820
  50,949,836
  50,950,590
  50,951,373
  50,952,423
  50,952,627
  50,954,250
  50,954,357
  50,954,517
  50,954,740
  50,954,858
  50,955,134
  50,955,176
  50,955,624
  50,956,912
  50,957,007
  50,957,026
  50,957,200
  50,957,377
  50,957,786
  50,957,809
  50,958,682
  50,958,784
  50,958,991
  50,959,365
  50,960,211
  50,960,325
  50,960,467
  50,960,655
  50,960,767
  50,960,768
  50,960,785
  50,961,216
  50,961,220
  50,961,257
  50,961,259
  50,961,295
  50,961,382
  50,961,395
  50,961,462
  50,961,566
  50,961,721
  50,961,730
  50,962,441
  50,962,461
  50,962,645
  50,962,707
  50,962,783
  50,963,141
  50,963,275
  50,963,277
  50,963,288
  50,963,289
  50,963,299
  50,963,363
  50,963,364
  50,963,394
  50,963,493
  50,963,598
  50,963,858
  50,964,218
  50,964,279
  50,964,721
  50,964,821
2
C
A/G
G
3
-
5
T
G/-
G/A
C
G
A
A
G/C
C/G
T
-
2
A
A/-
-
-
-
-
2
2
C
-
C
A
2
5
A
T
2/-
A/-
A
A
G
T
T
G
2
G
T
A
-
G/2
A/-
-
A
T
G
C
C
C
A
6
-
C
T
C
G
T
C
A/2
8/10
A
A
G
T
G
A
C
T
-
G
T
T
2
C
C
2
T
A
G
2
C
2
A
A
G
-
-
2
T/-
4/-
A
G
C
-
C
C
C
-
12/-
6/-
T
G
A
G
3
C
A
2
A
-
C
C
G
-
GT/5
3/-
8/-
2/-
5/-
-
A
-
4
4
3/-
G/2
3/-
G/A
A/-
A
G/T
T/GT
2/-
2/-
A
T
T
C/12
G
2
C
A
A
T
A
2
G
A
T
T
T
G
G
A
G
2
T
G
2
G
C
G
T
-
G
T
-
-
25
G
2
G
C
G
-
G
G
A
T
A
2
-
G/-
G/A
3/-
3/-
A/3
A/4
G/A
4
A
T
G
A
T
-