Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 30,864 (bp)   Positions: 400
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.0
.0
.675
.002
.019
.005
.001
.852
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.005
.001
.0
.038
.0
.0
.009
.0
.003
.12
.0
.725
.005
.005
.006
.0
.0
.009
.017
.0
.001
.002
.011
.003
.0
.002
.0
.017
.004
.005
.0
.003
.011
.001
.01
--
.018
.018
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.001
.001
.0
.001
.0
.01
.0
.0
.0
.0
.007
.001
.001
.078
.174
.026
.022
.0
.001
.0
.007
.04
.013
.01
.024
.074
.004
.153
.002
.001
.003
.001
.0
.0
.001
.001
.002
.002
.0
.006
.189
.114
.005
.223
.009
.031
.039
.012
.01
.048
.013
.128
.062
.007
.002
.502
.396
.083
.069
.03
.001
.128
.131
.039
.021
.052
.197
.0
.005
.001
.036
.002
.0
.008
.023
.001
.0
.001
.0
.002
.0
.003
.0
.0
.333
.038
.227
.028
.001
.006
.056
.044
.0
.003
.027
.052
.313
.273
.014
.132
.008
.003
.096
.284
.012
.005
.102
.066
.237
.203
.01
.01
.001
.087
.0
.005
.06
.0
.016
.0
.001
.0
.001
.0
.018
.02
.0
.0
.003
.048
.083
.148
.226
.033
.017
.017
.077
.039
.171
--
.014
.001
.004
.008
.0
.998
.377
.001
.0
.0
.002
.0
.0
.0
.002
.016
.005
.003
.008
.001
.0
.0
.016
.001
.0
.102
.003
.018
.515
.003
.038
.04
.002
.021
.02
.006
.014
.009
.079
.48
.273
.004
.0
.001
.001
.0
.0
.0
.011
.002
.0
.004
.0
.009
.001
.315
.0
.0
.002
.056
.014
.126
.023
.108
.031
.007
.005
.062
.001
.034
.0
.033
.0
.006
.018
.001
.017
.005
.46
.248
.235
.052
.094
.059
.018
.607
.007
.008
.116
.354
.19
.076
.081
.07
.02
.076
.073
.402
.033
.1
.085
.007
.007
.008
.022
.076
.013
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.059
.187
.117
.078
.1
.11
.105
.243
.022
.009
.035
.003
.02
.0
.005
.004
.003
.022
.024
.004
.001
.001
.002
.035
.016
.009
.002
.001
.019
.016
.037
.005
.736
.029
.032
.039
.268
.075
.072
.084
.001
.001
.0
.002
.001
.005
.0
.0
.001
.001
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
Pdilt
A
T
T
T
A
G
G
A
C
A
T
A
T
T
C
T
T
T
A
C
A
A
T
G
A
G
C
A
C
T
G
G
T
T
G
T
A
C
C
G
G
C
C
G
A
C
G
G
G
T
G
G
C
A
A
G
G
C
C
G
A
T
C
A
C
C
C
G
G
C
T
G
T
C
G
C
T
A
G
G
T
G
T
C
G
T
T
A
A
3
G
G
G
A
G
A
G
T
G
C
A
C
T
T
T
C
G
G
A
A
T
C
G
C
T
C
T
C
C
C
T
A
6
4
T
T
C
T
C
G
A
T
A
T
T
G
T
G
C
T
A
A
C
G
C
G
A
C
6
A
C
G
G
4
4
A
A
A
C
T
C
G
A
C
A
T
T
A
G
T
G
G
C
T
A
T
2
A
G
T
G
G
G
A
A
T
G
T
G
12
T
T
C
C
T
T
T
A
T
T
T
T
G
A
C
G
G
A
C
A
T
C
G
2
4
G
C
G
C
A
G
G
A
G
G
G
T
G
G
G
C
T
C
T
A
G
G
T
T
A
C
T
C
T
C
C
A
C
A
C
G
G
T
T
A
T
C
T
G
A
C
A
G
T
A
C
C
C
G
G
G
C
C
G
G
A
A
7
C
5
T
C
C
C
T
C
C
A
G
C
C
C
G
T
C
C
C
C
A
A
T
A
C
A
G
C
A
C
A
C
A
A
T
T
A
G
A
G
C
T
A
A
G
G
T
T
G
A
A
T
C
G
T
A
T
G
C
G
C
T
C
T
T
A
C
T
A
G
T
T
C
T
C
G
8
G
C
A
C
A
C
G
C
T
C
C
T
T
C
C
C
G
G
C
A
C
C
C
G
G
C
C
C
A
T
T
A
T
C
A
C
A
G
A
G
A
G
T
G
T
  196,149,511
  196,149,645
  196,149,852
  196,149,853
  196,149,901
  196,150,046
  196,150,070
  196,150,194
  196,150,318
  196,150,462
  196,150,569
  196,150,585
  196,150,679
  196,150,786
  196,150,831
  196,150,914
  196,151,089
  196,151,213
  196,151,266
  196,151,299
  196,151,399
  196,151,451
  196,151,673
  196,151,776
  196,151,885
  196,152,032
  196,152,118
  196,152,308
  196,152,380
  196,152,463
  196,153,255
  196,153,330
  196,153,795
  196,153,807
  196,153,918
  196,154,644
  196,154,680
  196,154,682
  196,154,702
  196,154,704
  196,154,742
  196,154,865
  196,154,882
  196,154,925
  196,155,158
  196,155,549
  196,155,654
  196,155,677
  196,155,679
  196,155,830
  196,155,898
  196,155,985
  196,156,014
  196,156,015
  196,156,117
  196,156,400
  196,156,430
  196,156,615
  196,156,702
  196,156,838
  196,156,855
  196,156,893
  196,156,894
  196,156,896
  196,156,898
  196,156,950
  196,156,957
  196,156,967
  196,157,058
  196,157,155
  196,157,255
  196,157,630
  196,157,683
  196,157,794
  196,157,815
  196,157,863
  196,158,015
  196,158,049
  196,158,146
  196,158,164
  196,158,204
  196,158,368
  196,159,017
  196,159,021
  196,159,022
  196,159,033
  196,159,092
  196,159,142
  196,159,248
  196,159,284
  196,159,556
  196,159,571
  196,159,575
  196,159,645
  196,159,695
  196,159,884
  196,159,923
  196,160,107
  196,160,108
  196,160,334
  196,160,480
  196,160,546
  196,160,568
  196,160,607
  196,160,618
  196,160,661
  196,160,810
  196,160,830
  196,160,832
  196,160,834
  196,160,853
  196,160,882
  196,160,886
  196,160,891
  196,160,910
  196,160,913
  196,161,001
  196,161,008
  196,161,013
  196,161,017
  196,161,143
  196,161,161
  196,161,318
  196,161,320
  196,161,364
  196,161,651
  196,161,690
  196,162,304
  196,162,487
  196,162,705
  196,162,774
  196,162,836
  196,162,921
  196,162,937
  196,163,054
  196,163,108
  196,163,296
  196,163,362
  196,163,370
  196,163,371
  196,163,523
  196,163,565
  196,163,596
  196,163,713
  196,163,762
  196,163,799
  196,163,825
  196,164,013
  196,164,114
  196,164,135
  196,164,306
  196,164,365
  196,164,443
  196,164,453
  196,164,546
  196,164,554
  196,164,562
  196,164,670
  196,164,684
  196,164,911
  196,165,133
  196,165,168
  196,165,186
  196,165,241
  196,165,323
  196,165,362
  196,165,422
  196,165,462
  196,165,475
  196,165,504
  196,165,506
  196,165,718
  196,166,023
  196,166,364
  196,166,387
  196,166,405
  196,166,458
  196,166,467
  196,166,521
  196,167,016
  196,167,132
  196,167,212
  196,167,279
  196,167,286
  196,167,339
  196,167,756
  196,167,758
  196,167,881
  196,167,977
  196,168,036
  196,168,541
  196,168,543
  196,168,552
  196,168,601
  196,168,635
  196,168,717
  196,168,721
  196,168,954
  196,169,044
  196,169,180
  196,169,607
  196,169,720
  196,169,783
  196,169,854
  196,169,864
  196,170,090
  196,170,263
  196,170,305
  196,170,422
  196,170,428
  196,170,528
  196,170,661
  196,170,672
  196,170,675
  196,170,678
  196,170,715
  196,170,818
  196,170,835
  196,170,951
  196,171,137
  196,171,140
  196,171,686
  196,171,755
  196,171,769
  196,171,851
  196,171,870
  196,171,890
  196,172,049
  196,172,085
  196,172,172
  196,172,273
  196,172,385
  196,172,386
  196,172,464
  196,172,607
  196,172,876
  196,172,943
  196,172,985
  196,173,002
  196,173,010
  196,173,056
  196,173,274
  196,173,345
  196,173,459
  196,173,488
  196,173,489
  196,173,750
  196,173,761
  196,173,932
  196,174,076
  196,174,093
  196,174,102
  196,174,132
  196,174,138
  196,174,285
  196,174,394
  196,174,415
  196,174,429
  196,174,466
  196,174,467
  196,174,585
  196,174,683
  196,174,697
  196,174,770
  196,174,779
  196,174,834
  196,174,852
  196,174,860
  196,174,999
  196,175,095
  196,175,123
  196,175,178
  196,175,203
  196,175,204
  196,175,259
  196,175,273
  196,175,376
  196,175,546
  196,175,554
  196,175,668
  196,175,728
  196,175,735
  196,175,970
  196,175,996
  196,176,023
  196,176,069
  196,176,138
  196,176,224
  196,176,226
  196,176,233
  196,176,259
  196,176,276
  196,176,306
  196,176,315
  196,176,317
  196,176,344
  196,176,357
  196,176,516
  196,176,553
  196,176,607
  196,176,628
  196,176,630
  196,176,717
  196,176,719
  196,176,726
  196,176,734
  196,176,768
  196,176,817
  196,176,845
  196,176,870
  196,176,878
  196,176,913
  196,176,919
  196,176,945
  196,177,004
  196,177,033
  196,177,058
  196,177,116
  196,177,117
  196,177,126
  196,177,131
  196,177,142
  196,177,143
  196,177,147
  196,177,154
  196,177,156
  196,177,185
  196,177,188
  196,177,195
  196,177,259
  196,177,285
  196,177,288
  196,177,289
  196,177,294
  196,177,304
  196,177,316
  196,177,327
  196,177,363
  196,177,401
  196,177,619
  196,177,663
  196,177,680
  196,177,697
  196,177,736
  196,177,777
  196,177,792
  196,177,854
  196,177,877
  196,177,884
  196,177,898
  196,177,946
  196,177,989
  196,178,006
  196,178,009
  196,178,012
  196,178,030
  196,178,062
  196,178,088
  196,178,095
  196,178,165
  196,178,180
  196,178,252
  196,178,262
  196,178,271
  196,178,290
  196,178,298
  196,178,306
  196,178,307
  196,178,311
  196,178,320
  196,178,338
  196,178,353
  196,178,369
  196,178,381
  196,178,387
  196,178,480
  196,178,487
  196,178,561
  196,178,576
  196,178,637
  196,178,676
  196,178,858
  196,178,945
  196,179,017
  196,179,085
  196,179,105
  196,179,269
  196,179,300
  196,179,302
  196,179,412
  196,179,424
  196,179,595
  196,179,598
  196,179,599
  196,179,688
  196,179,790
  196,179,796
  196,179,809
  196,179,830
  196,179,848
C
C
C
C
G
C
C
G
T
G
G
-
G
C
T
C
C
C
G
T
G
T
C
A
G
A
T
4
T
C
C
C
C
C
A
C
C
A
T
A
T
T
G
A
G
T
A
A
A
C
11
19
C/3
A/G
-
A
A
T
A
T
C
A
A
6
T
T
T
A
A
T
C
A
C
T
2
T
C
G
A
T
C
A
C
G
A
-
C
G
G
-
A
6
T
G
C
G
A
A
A
-
G
T
-
A
C
T
A
4
4
T
2
T
A
G
A
G
-
T
T
T
16
C
6/-
4/-
A
C
A
C
G
A
C
G
C
-
G
A
C
T
C/2
T/-
G
G
-
A
T
A
T
T
-
4
2
C
A
-
-
G
G
G
G
C
G
A
G
2
C
C
C
G
A
C
C
A
T
C
G
2
-
G
A
TA/3
A
A
A
G
T
-
A
C
A
-
G
C
G
T
C
G
C
5/7
-
-
-
C
T
G
G
T
T
G
T
G
C
T
A
-
-
A
T
A
T
G
C
A
G
A
A
C
C
A
A
T
G
2
2
C
G
A
A
C
4
45
T
A
T
C
A
A
G
17
C
G
A
A
C
C
G
C
G
4
T
T
T
T
A
C
G
T
T
T
T
A
A
2
2
2
A
G
C
-
-
-
C
T
T
T
C
9
G
2
C
A
T
G
A
C
G
T
G
G
T
G
G
G
T
T
A
T
T
G
C
T
G
G
G
C
C
A
4
A
T
C
C
A/2
G/-
G/T
T/4
T/4
2
G
C
C
A
A
C
G
C
T
T
A
T
13
-
C
C
C
G
2
G
A
G
C
A
C
4
-
-
A
T
G
T
-
T
A
A
C
A
T
C
6
T
A
T
C
A
T
G
T
G
6
A
C
T
T
T
3
G
C
G
C
T
T
T
G
A
G
A
G
A
C
T
C