Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 155,320 (bp)   Positions: 455
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.006
.034
.381
.012
.052
.001
--
--
.038
.007
.001
.0
.124
.017
.011
.01
.241
.035
.356
.005
.862
.132
.119
.064
--
.046
.0
.002
.001
.001
.199
.019
.001
.0
.0
.001
.016
.418
.438
.025
.112
.379
.007
.0
.19
.001
.0
.427
.554
.593
.399
.395
.048
.452
.241
.0
.013
--
.006
.102
.105
.074
.179
--
.02
.04
.0
.001
.005
.162
.072
.086
.27
.015
.014
.144
.051
.008
.077
.099
.077
.001
.288
.225
.629
.069
.061
.02
.003
.004
--
--
.001
.14
--
--
.088
.001
.0
.0
.011
.44
.329
.024
.0
.001
.219
.214
.212
.209
.034
.019
.006
.0
.001
.001
.0
.002
.0
.021
.04
--
--
.322
.0
.01
.004
.011
--
--
--
--
--
.004
.005
.341
.319
.287
.271
.266
.26
.011
.08
.005
--
.021
.017
.003
.014
.076
.027
.003
.0
.002
.062
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.055
.065
.068
.001
.06
.711
.048
.071
.12
--
--
--
--
.013
.383
.63
.585
.644
.202
.001
.002
.036
.0
.087
.041
.003
.036
.051
.002
.003
.002
.0
.078
.006
.604
.513
.0
.003
.225
.021
.026
.0
.085
.187
.123
.013
.078
.022
.001
.002
.0
--
.082
--
.013
--
--
--
--
--
--
.012
.67
.594
--
--
--
--
--
.004
.003
.001
.202
.07
.008
.003
.229
.006
.002
.36
.74
.241
.045
--
--
.18
.142
.005
.007
.298
.006
.118
.003
.071
.489
.056
--
--
--
--
--
.0
.065
.022
.0
.011
--
.005
.005
.076
.029
.001
.097
.0
.074
.078
.093
.042
.008
.0
.299
.02
.195
.0
.001
.0
.047
.0
.06
.44
.003
.065
.106
.008
.032
.002
.016
.062
.009
--
--
--
.049
.007
.001
.038
.026
.113
.023
.046
.005
.089
.022
.263
.009
.038
.015
.0
.001
--
--
--
--
--
--
--
.03
.006
.003
.003
.009
1.0
.152
.143
.121
.01
--
.208
.498
.021
.06
.247
--
--
--
--
.202
.093
.017
.001
.001
.077
.259
.746
.001
.002
.024
.052
.159
.07
.109
.135
.0
.044
.0
.084
.091
.115
.116
.247
.014
.0
.009
.049
--
.005
.06
.028
.333
.152
.026
.111
.098
.065
.026
.001
.002
.003
.001
.0
.0
.005
.0
.002
.0
.041
.638
.0
.001
.316
.006
.005
--
.001
.032
.547
.595
.604
.023
.0
.033
.04
.012
.081
.441
.066
.003
.001
.001
.099
.007
.0
.937
.011
.0
.016
.0
.024
.0
.0
.001
.028
.004
.0
.007
.005
.336
.151
.0
.025
.002
.0
.004
.005
.007
.0
.0
.043
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
Parva
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
T
C
T
C
T
8
G
2
A
T
T
G
C
C
G
T
G
T
G
G
A
C
T
A
C
T
T
T
A
G
G
A
A
T
C
G
G
A
A
A
C
C
G
A
A
C
A
C
C
A
G
T
A
C
C
G
G
T
C
G
T
T
C
G
T
A
G
T
G
G
2
A
A
T
T
G
T
G
C
C
G
A
G
T
C
A
G
C
T
8
C
G
T
G
A
G
C
A
A
T
2
A
G
15
T
C
C
C
15
C
3
C
T
C
G
T
C
A
T
A
G
2
T
C
2
A
G
C
G
G
3
3
G
A
C
A
C
A
A
A
G
4
2
G
T
16
A
C
G
C
G
C
T
G
C
C
2
A
4
6
4
G
G
7
3
T
C
G
13
A
A
T
A
A
T
G
G
G
G
T
A
T
A
T
C
A
T
C
T
G
G
G
G
T
G
T
T
A
C
A
T
A
G
T
A
C
G
C
A
10
T
A
A
A
T
G
5
T
2
T
C
G
C
C
C
G
C
2
2
A
T
G
2
T
T
G
G
G
4
A
C
G
A
T
G
T
G
A
C
G
C
A
C
T
T
G
C
T
2
G
T
T
C
G
C
G
T
A
C
A
A
T
A
T
C
C
G
A
G
4
3
2
2
A
G
G
G
T
T
C
G
T
C
C
A
C
T
A
T
T
G
A
T
T
A
14
C
A
T
A
A
T
C
C
T
T
T
C
G
G
T
C
A
2
C
C
T
A
T
A
C
G
A
T
A
G
C
C
A
A
G
T
G
G
A
G
A
T
G
2
G
G
T
G
A
A
T
T
T
C
C
A
T
G
T
G
A
T
A
A
A
T
G
C
4
6
A
T
G
A
T
T
C
A
T
A
G
21
G
13
2
C
T
2
3
A
T
A
G
C
A
C
A
G
T
T
G
G
T
C
A
2
C
T
C
G
T
G
2
G
C
C
G
C
6
A
8
A
C
C
T
G
A
G
A
C
G
T
T
3
G
A
G
C
A
C
T
G
G
G
G
A
C
  184,228,548
  184,228,586
  184,228,750
  184,230,668
  184,230,911
  184,231,034
  184,233,493
  184,233,976
  184,233,991
  184,234,807
  184,235,037
  184,235,150
  184,235,155
  184,235,180
  184,235,631
  184,236,289
  184,236,562
  184,236,748
  184,237,230
  184,237,316
  184,237,936
  184,238,202
  184,238,475
  184,238,489
  184,238,496
  184,238,562
  184,238,657
  184,239,312
  184,239,322
  184,239,362
  184,239,406
  184,239,747
  184,239,838
  184,240,173
  184,240,367
  184,240,401
  184,240,422
  184,240,441
  184,240,761
  184,240,778
  184,240,857
  184,241,009
  184,241,060
  184,241,207
  184,241,279
  184,241,343
  184,241,548
  184,242,319
  184,242,794
  184,242,833
  184,242,912
  184,243,137
  184,243,799
  184,243,870
  184,243,924
  184,244,369
  184,244,409
  184,244,643
  184,245,207
  184,245,295
  184,245,463
  184,245,783
  184,246,057
  184,246,093
  184,246,214
  184,246,477
  184,246,605
  184,246,641
  184,246,917
  184,247,567
  184,247,722
  184,248,318
  184,248,343
  184,248,558
  184,248,674
  184,248,952
  184,249,033
  184,249,213
  184,249,391
  184,249,407
  184,249,435
  184,251,011
  184,251,074
  184,251,421
  184,251,428
  184,251,648
  184,251,899
  184,251,904
  184,252,714
  184,253,373
  184,253,480
  184,253,974
  184,253,993
  184,254,672
  184,255,208
  184,255,585
  184,256,234
  184,256,993
  184,257,874
  184,258,213
  184,259,664
  184,260,985
  184,261,266
  184,261,446
  184,262,249
  184,262,866
  184,263,310
  184,263,914
  184,263,918
  184,263,919
  184,263,921
  184,263,946
  184,263,948
  184,263,950
  184,263,973
  184,264,848
  184,264,849
  184,264,927
  184,265,019
  184,265,196
  184,265,864
  184,266,056
  184,266,432
  184,266,492
  184,267,024
  184,268,619
  184,268,830
  184,269,700
  184,270,226
  184,270,250
  184,270,264
  184,270,269
  184,270,601
  184,270,659
  184,270,839
  184,270,914
  184,272,484
  184,272,495
  184,272,510
  184,272,516
  184,272,518
  184,272,520
  184,274,122
  184,274,415
  184,274,813
  184,274,893
  184,274,976
  184,274,979
  184,274,994
  184,275,440
  184,275,966
  184,275,975
  184,275,986
  184,276,009
  184,276,466
  184,278,070
  184,278,209
  184,278,217
  184,278,585
  184,278,640
  184,278,641
  184,278,664
  184,278,666
  184,278,706
  184,278,717
  184,278,736
  184,278,799
  184,278,849
  184,278,854
  184,278,867
  184,278,927
  184,279,090
  184,279,905
  184,280,395
  184,280,730
  184,281,498
  184,282,605
  184,282,770
  184,282,868
  184,282,873
  184,283,462
  184,283,752
  184,283,933
  184,284,113
  184,284,129
  184,284,185
  184,284,308
  184,284,332
  184,284,377
  184,284,570
  184,284,825
  184,284,956
  184,285,202
  184,285,469
  184,285,623
  184,286,951
  184,286,996
  184,287,065
  184,287,086
  184,287,195
  184,287,235
  184,288,281
  184,288,291
  184,289,080
  184,289,183
  184,289,196
  184,289,302
  184,289,728
  184,290,231
  184,291,830
  184,291,850
  184,291,973
  184,292,737
  184,292,937
  184,293,311
  184,293,556
  184,294,734
  184,295,164
  184,295,885
  184,296,090
  184,296,630
  184,296,880
  184,299,493
  184,299,551
  184,299,557
  184,299,581
  184,299,613
  184,299,619
  184,299,681
  184,299,773
  184,299,774
  184,300,395
  184,300,413
  184,300,496
  184,300,603
  184,300,663
  184,301,726
  184,302,165
  184,302,189
  184,302,196
  184,302,362
  184,302,779
  184,303,015
  184,303,056
  184,303,183
  184,303,831
  184,304,106
  184,304,324
  184,304,433
  184,304,471
  184,304,629
  184,304,646
  184,305,371
  184,305,372
  184,307,667
  184,309,616
  184,309,867
  184,310,174
  184,310,906
  184,311,211
  184,311,331
  184,311,436
  184,311,535
  184,311,613
  184,311,614
  184,311,622
  184,311,625
  184,311,835
  184,311,983
  184,312,493
  184,312,498
  184,313,882
  184,315,575
  184,317,372
  184,317,549
  184,318,056
  184,318,147
  184,318,196
  184,318,457
  184,318,485
  184,318,815
  184,318,872
  184,318,873
  184,318,883
  184,318,890
  184,318,982
  184,319,102
  184,319,265
  184,319,340
  184,319,547
  184,319,693
  184,319,853
  184,319,921
  184,320,050
  184,320,159
  184,320,424
  184,320,563
  184,320,977
  184,321,005
  184,321,204
  184,321,232
  184,322,279
  184,323,526
  184,323,950
  184,324,129
  184,324,140
  184,324,361
  184,324,379
  184,324,398
  184,324,619
  184,325,334
  184,325,837
  184,326,157
  184,326,537
  184,326,705
  184,327,394
  184,327,802
  184,327,885
  184,328,278
  184,328,375
  184,329,003
  184,329,198
  184,329,326
  184,329,850
  184,330,219
  184,330,896
  184,330,928
  184,330,984
  184,331,228
  184,331,246
  184,331,267
  184,331,432
  184,331,438
  184,331,913
  184,332,016
  184,332,024
  184,332,039
  184,332,151
  184,332,436
  184,333,680
  184,333,691
  184,333,857
  184,334,255
  184,334,871
  184,335,331
  184,335,394
  184,336,313
  184,337,320
  184,340,020
  184,340,287
  184,340,906
  184,340,996
  184,340,997
  184,341,661
  184,341,673
  184,343,257
  184,348,091
  184,348,480
  184,348,722
  184,349,995
  184,350,268
  184,350,511
  184,350,625
  184,351,336
  184,352,502
  184,353,236
  184,353,319
  184,353,482
  184,353,589
  184,353,779
  184,354,265
  184,355,648
  184,356,282
  184,357,213
  184,357,218
  184,357,267
  184,357,291
  184,357,636
  184,358,001
  184,358,267
  184,358,610
  184,359,140
  184,359,178
  184,359,245
  184,359,362
  184,359,759
  184,360,424
  184,360,918
  184,360,973
  184,360,976
  184,360,981
  184,360,984
  184,360,995
  184,361,383
  184,361,588
  184,361,646
  184,361,652
  184,362,162
  184,362,208
  184,362,219
  184,362,490
  184,363,440
  184,363,744
  184,364,016
  184,364,385
  184,364,430
  184,364,986
  184,365,049
  184,365,696
  184,366,655
  184,367,404
  184,367,502
  184,367,848
  184,367,849
  184,367,850
  184,368,007
  184,368,150
  184,368,244
  184,369,294
  184,370,009
  184,370,115
  184,370,170
  184,370,237
  184,370,251
  184,370,325
  184,370,331
  184,370,392
  184,370,408
  184,370,433
  184,371,165
  184,371,843
  184,371,863
  184,372,350
  184,372,776
  184,372,866
  184,373,520
  184,375,928
  184,376,982
  184,378,063
  184,378,455
  184,378,760
  184,380,130
  184,380,233
  184,381,229
  184,381,548
  184,381,763
  184,381,840
  184,382,370
  184,382,431
  184,382,524
  184,382,560
  184,382,649
  184,382,838
  184,382,839
  184,382,853
A
A
C
A
C
T
C
-
G/C
-
G
-/14
TG/-
T
T
T
2
C
A
T/2
-
A
G
4
6
G
T
C
-
C
C
T
A
C
G
G
T
A
A
G
G
G
T
T
A
G
G
T
G
14
T
A/G
A
5
G
T
T
A
A
C
T
A
C
C
C/T
A
C
G
A
C
G/3
T
-
2
G
C
C
4
T/C
G/C
C/G
T
C
A/C
A
2
T
G
A
T
-
-
T
A
C
A
G
G/T
T
G
G
6
-
G
2
-
C
C/T
C/-
C/T
15/-
C/-
3/-
2
-
2
2
C
T
G
C
C
A
2/-
C
T
-
C
G/9
C/3
G/C
G/A
3/-
-
A
G
6
8
C/G
A/T
A/T
T/5
A
-
-
A
T/A
-
3
T
G/T
C/A
G/T
C/T
T/G
3
4
A
-
A/3
4/-
6/-
4/-
G/C
G/3
7/-
3/-
-
5
3
-
2
-
T/C
G
C
G
A
A
A
A
T/G
G
-
G
C
T
-
-
T
G
A
A
T
A
C
A
A
C
G
A
2
3
G
A
C
A/-
T
A
T
G
-
C
G
G
G
G
G/T
-
T/C
-
C
C/G
G/C
C/G
C/G
C/T
G/T
C/G
2/-
-
3
3
3
-
5/3
C
A
A
C
-
G
T
3
G
C
A
14
A
T
-
G/3
T
G
T
G
7/5
A
G
C
-
A
C
G
G
A
T
A
C
G
2
G
T
-
G
C
T
G
A
-
A
-
-
-
2/-
G
A
A
A
A
C
G
A
C
T
2
G
CG/10
-
T
C
G
2
G
G
A
G
-
C/T
A/3
G
G
G
C
T
T
C
C
2
T
A
A
C
T
C
-
2
A
C
T
C
G
5
A
17
C
G
T
G
T
-
G
C
2
A
A
C
A
A/G
C
T
2/-
3
2
C
5/3
G
G
3/5
C
C
A
6/5
G
C
A
C
C
-
C
T
G
C
C
5/3
T
-
-
G
C
T
G
C
C
T
T
-
3
-
-
G/-
-
-
T
8
-
-
T
C
G
A
T
G
T
G
A
C
C
A
-
C
G
A/-
2/-
C/-
C
T
A
C
C
-
T
C/-
C/T
3
9
-
A/3
-
G
T
T
A
A
G
A
3
T
C
G
C
-
A
G
C
G
G
T
C
T
A
A
T
C
T