Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 151,613 (bp)   Positions: 257
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.05
.002
.008
.002
.012
.002
.0
.001
.013
.02
.028
.013
.08
.031
.009
.079
.012
--
--
--
--
--
--
--
.075
.0
.006
.4
.064
.156
.002
.004
.146
.848
.028
.028
.335
.015
--
.016
.018
.01
.001
.001
.028
.004
.056
.024
.003
.35
.167
.026
.005
.082
.005
.331
.029
.03
.017
.036
.026
.001
.094
.101
.025
.043
.649
.008
.002
.001
.002
.004
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.371
.368
.365
.359
.306
.284
.251
.218
.24
.073
.04
.001
.327
.36
.022
.001
--
--
--
--
--
.04
.465
.004
.008
.049
.085
.0
.007
.018
.0
.002
.002
.006
.131
.003
.01
.071
.212
.024
--
.025
--
--
--
--
.004
.001
.027
.011
--
.009
.004
--
--
--
.076
--
--
--
--
.146
.026
.012
--
.007
.01
.103
.014
.0
.0
.258
.126
.123
.855
.179
.007
.003
.015
.01
.151
--
--
--
--
--
.198
.03
.031
.094
.016
.054
--
--
--
--
--
.035
.101
.525
--
.007
.007
.013
.766
.004
.001
.085
.009
.001
.022
.0
.0
.0
.024
.001
--
--
.007
.005
.092
.008
.005
.005
.58
.003
.345
.341
1.0
1.0
1.0
1.0
1.0
.975
.998
.999
1.0
1.0
1.0
1.0
.25
.034
.015
.005
.009
.001
.002
.001
.002
.01
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.097
.386
.378
--
.01
.004
.002
.161
.334
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
Osbpl8
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
C
C
G
C
T
4
A
T
A
T
G
C
T
A
A
A
C
C
C
C
2
C
8
A
G
G
G
A
A
A
2
G
T
G
G
T
T
A
2
A
A
G
4
C
A
A
2
G
T
C
14
G
A
5
T
T
G
T
T
G
C
C
A
A
4
13
A
A
A
A
T
12
T
G
T
2
A
4
4
T
T
6
T
G
4
3
T
5
T
G
T
T
C
A
G
G
G
T
T
T
C
3
G
G
A
T
A
A
T
G
T
T
G
T
G
G
3
A
A
C
A
G
G
T
C
A
G
C
T
T
G
T
T
A
T
13
C
4
G
A
4
T
A
G
A
A
A
A
C
A
T
C
T
C
C
C
T
A
T
A
G
G
A
2
C
A
C
C
A
G
A
A
C
A
G
A
2
G
G
A
A
A
G
3
A
A
A
C
G
A
T
G
G
2
G
10
C
G
C
T
C
T
A
C
T
G
C
20
C
G
G
A
T
T
G
C
C
C
G
C
T
C
G
G
10
G
C
G
C
T
A
A
C
T
C
C
G
A
C
G
T
A
C
A
A
G
C
2
C
C
4
C
10
A
  53,888,267
  53,888,276
  53,889,020
  53,890,037
  53,890,359
  53,890,465
  53,890,578
  53,890,579
  53,891,064
  53,892,975
  53,893,122
  53,893,368
  53,893,475
  53,894,283
  53,894,958
  53,895,343
  53,895,352
  53,895,356
  53,895,357
  53,895,477
  53,895,491
  53,895,492
  53,895,567
  53,895,869
  53,896,298
  53,896,849
  53,896,875
  53,897,774
  53,899,131
  53,899,268
  53,899,798
  53,899,846
  53,900,521
  53,901,806
  53,901,926
  53,902,140
  53,902,307
  53,903,525
  53,905,724
  53,906,029
  53,906,352
  53,906,418
  53,906,514
  53,906,723
  53,907,379
  53,907,473
  53,908,332
  53,909,820
  53,909,973
  53,910,278
  53,910,329
  53,910,452
  53,911,960
  53,913,037
  53,913,053
  53,913,166
  53,913,421
  53,915,163
  53,915,165
  53,916,250
  53,916,592
  53,916,812
  53,926,163
  53,927,357
  53,927,480
  53,927,809
  53,928,787
  53,929,068
  53,929,387
  53,929,390
  53,929,393
  53,929,396
  53,929,399
  53,930,206
  53,930,207
  53,930,388
  53,930,525
  53,930,599
  53,930,722
  53,930,736
  53,930,745
  53,930,753
  53,932,416
  53,932,943
  53,935,389
  53,935,404
  53,937,544
  53,937,545
  53,937,546
  53,937,548
  53,937,572
  53,937,578
  53,937,581
  53,937,583
  53,937,694
  53,938,796
  53,940,491
  53,941,562
  53,942,168
  53,942,694
  53,943,443
  53,943,798
  53,944,564
  53,944,656
  53,945,227
  53,945,244
  53,945,247
  53,945,877
  53,946,636
  53,947,000
  53,948,139
  53,948,982
  53,949,712
  53,950,424
  53,951,055
  53,951,234
  53,951,410
  53,954,635
  53,954,636
  53,955,737
  53,958,238
  53,958,524
  53,959,472
  53,959,634
  53,959,865
  53,960,083
  53,960,239
  53,960,854
  53,961,725
  53,962,456
  53,962,485
  53,962,542
  53,962,991
  53,964,229
  53,964,332
  53,964,379
  53,964,532
  53,965,026
  53,965,246
  53,966,230
  53,966,266
  53,966,742
  53,966,900
  53,967,421
  53,967,538
  53,968,405
  53,968,759
  53,969,823
  53,970,011
  53,972,777
  53,973,273
  53,973,888
  53,974,183
  53,974,210
  53,975,734
  53,976,004
  53,978,941
  53,979,638
  53,979,836
  53,979,837
  53,980,068
  53,980,951
  53,983,089
  53,983,330
  53,983,654
  53,983,962
  53,984,778
  53,984,848
  53,984,854
  53,984,870
  53,984,878
  53,984,900
  53,986,993
  53,987,050
  53,987,133
  53,987,148
  53,987,716
  53,987,921
  53,988,201
  53,988,203
  53,988,243
  53,988,277
  53,988,291
  53,989,060
  53,989,923
  53,990,561
  53,991,942
  53,993,288
  53,993,289
  53,993,291
  53,993,918
  53,994,045
  53,994,389
  53,995,850
  53,997,380
  53,997,804
  53,998,082
  53,998,117
  53,999,310
  54,001,382
  54,003,232
  54,003,839
  54,005,701
  54,007,849
  54,010,559
  54,010,584
  54,010,836
  54,011,177
  54,011,178
  54,011,180
  54,011,337
  54,011,987
  54,013,225
  54,013,628
  54,013,726
  54,013,728
  54,013,857
  54,013,967
  54,014,318
  54,014,623
  54,015,264
  54,015,268
  54,015,298
  54,015,374
  54,015,396
  54,015,413
  54,016,256
  54,016,371
  54,017,705
  54,017,716
  54,019,420
  54,020,243
  54,020,247
  54,021,074
  54,021,859
  54,022,496
  54,022,561
  54,023,946
  54,023,955
  54,024,629
  54,025,135
  54,025,380
  54,025,381
  54,026,131
  54,027,272
  54,028,621
  54,029,181
  54,033,695
  54,034,604
  54,034,635
  54,034,636
  54,034,704
  54,035,004
  54,035,126
  54,035,231
  54,035,330
  54,036,815
G/A
G/A
T
T
T
T
C/-
-
-
T
C
-
C
-
T
T/C
A/2
A/C
A/C
C/T
C/A
C/A
C/T
-
2
-
A/G
A
T
-
2
G
-
-
2
C
2
A
G
G
G
-
C
C
A
-
A
G
C
2/-
G/A
C
3
-
T
A/G
-
T/2
C/4
C
2
C
T
G
T
G
G
-
13/-
AC/10
A/-
A/-
-
T/4
12/-
T/C
A
C
-
A/G
4/-
-
C
T/C
-
A
-
-
-
T/-
5/-
TG/4
G/3
T/2
2
G
3/AT
A
-
-
C
-
-
T
-
2
G/2
-
G
G
G
2
A
C
A
A
C
T
C
-
A/3
G
?
T
-
T
T/C
T
T
A
-
C
C
A
C
A
G
C
-
C/T
4/-
G/A
2
-
C
G
A
2
G
C
A/2
T
G
C
3/CT
G
2
2
C/2
T/-
G
-
G
T
A
G
-
2
-
T
-
G
A
G
6
C/2
2
A
A/G
2/-
G/A
G/A
A/G
G
2
-
-
2
A/G
2
CT/3
A
T
C
2
C
-
A
10/-
T
A
T
2
2
C
C
T
A
A
3
-
3/CT
G/C
A
A/T
T/C
T/G
A
C/T
C/G
C/A
G/C
C/T
T/C
C/T
G/A
C
-
T
T
A
G
G
3
2
-
C
C/-
4
A
-
15/16
16
T/A
A/G
T
G
G
A
-
-
C/T
3
-
2
-
2