Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 175,093 (bp)   Positions: 498
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.096
.023
.0
.001
.187
.06
.018
.099
.001
.001
.0
.004
.991
1.0
.996
.007
.01
.008
.003
.012
.034
.362
.097
.003
.004
.023
.001
.001
.005
.0
.02
.008
--
--
--
--
--
.002
.003
.002
.011
.0
.003
.029
.028
.011
.156
.001
.018
.004
.011
.002
.043
.192
.0
.002
.001
.0
.001
.192
.0
.001
.013
.013
.001
.011
.001
.005
.001
.004
.001
.002
.0
.008
.023
.002
.058
.268
.296
.002
.0
.959
.013
.001
.522
.002
.0
.0
.0
.0
.004
.009
.006
.0
.021
.034
.003
.0
.81
.003
.113
.002
.215
.025
.172
.018
.002
.002
.0
.0
.0
--
--
.001
.001
.015
.002
.004
.018
.001
.039
.007
.007
.083
.021
.002
.416
--
.004
.0
--
--
.082
.192
.653
--
--
--
--
.002
.003
.008
.008
.014
.158
.149
.064
--
.003
.112
.001
.101
.008
.004
.013
.003
.002
.001
.0
.098
.481
.321
.024
.075
.034
.772
.024
.002
.007
.021
.308
.01
.024
.005
.013
.579
.804
.01
.005
.082
.0
.102
.002
.001
.441
.023
.013
.731
.004
.001
.067
.708
.002
.193
.47
.13
.101
.025
.0
.001
.008
--
--
.004
.002
.001
.0
.002
.006
.008
.001
.006
.015
.0
.03
.0
.945
.846
.011
.008
.04
.002
.002
.802
.1
.546
.015
.017
.151
.042
.0
.003
--
--
.047
.01
.002
.0
.066
.008
--
.001
.005
.05
.0
.008
.417
.148
.058
.026
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
.337
.002
.021
.02
.006
.008
.002
--
--
.038
.001
.092
.03
.0
.024
.015
.623
.387
.213
.162
.004
.006
.008
.012
.214
.203
.022
.014
.854
.002
.0
.001
.015
.002
.0
.002
.07
.334
.056
.004
.038
.053
.065
.003
.001
.001
.0
.007
.058
.001
.474
.0
.029
.033
.955
.569
.006
.01
.131
.004
.214
.001
.005
.01
.005
.014
.014
.013
.0
.002
.026
.002
.092
.04
.002
.006
.202
.023
.023
.001
.0
.001
.001
.001
.009
.132
.244
.736
.05
.052
.022
.003
.004
.001
.008
.008
.1
.103
.002
.88
.0
.007
.001
--
.022
.12
.003
.0
.001
.0
.001
.838
.181
.002
.0
.007
.002
.067
.003
.098
.0
.002
.001
.122
.036
.037
.005
.006
.051
.003
.118
.746
.09
.005
.084
.071
.008
.007
.065
.082
.031
.001
.001
.017
.008
.003
.001
.003
.003
.025
.009
.024
--
--
--
--
--
--
--
--
.22
.002
.001
.01
.003
.009
.057
.019
.002
.041
.29
.066
.0
.027
.0
.008
.301
.001
.271
.022
.342
.001
.003
.997
.01
.0
.475
.043
.059
.023
.015
--
.539
.44
.356
.071
.051
.039
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.0
.026
.005
.002
.0
.001
.011
.002
.137
.008
.023
.004
--
.022
.106
.013
.002
.373
.348
.001
.001
.029
.071
.0
.006
.001
.001
.005
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
G
A
T
G
C
G
A
A
19
T
C
G
6
3
C
A
C
C
A
G
T
A
G
G
C
C
G
T
C
A
A
C
C
G
2
G
4
C
C
T
T
T
A
C
8
7
A
G
A
A
A
C
T
T
T
C
T
C
T
C
G
G
3
A
C
G
T
12
8
C
T
T
C
T
A
3
C
C
A
G
T
T
G
A
T
C
G
A
G
G
G
G
G
A
C
A
C
C
7
T
A
G
C
C
C
A
C
G
C
C
T
A
A
3
A
T
2
G
T
G
C
T
G
A
10
4
2
C
G
T
C
G
C
A
A
A
3
C
C
C
T
G
T
C
A
C
C
A
G
T
T
A
A
C
G
G
G
C
T
G
A
G
A
G
G
G
C
C
4
C
A
G
T
A
C
G
G
A
A
T
C
T
T
G
C
C
6
3
T
G
C
T
A
A
A
C
A
8
2
C
G
C
C
C
2
C
A
A
T
A
T
G
G
T
A
G
A
G
T
T
A
T
C
A
G
C
C
T
A
T
A
G
A
C
G
2
15
C
A
G
A
T
A
7
T
A
C
G
T
T
A
C
A
C
G
C
G
G
C
A
C
A
C
A
T
2
T
A
T
C
G
A
A
A
G
A
T
C
C
G
G
G
G
C
C
G
A
T
G
G
6
6
A
A
G
2
T
C
A
C
G
T
C
C
A
A
C
A
C
A
G
A
C
A
A
A
A
T
A
C
G
T
C
C
2
3
2
C
C
C
C
G
T
A
T
G
C
G
A
C
G
C
A
C
G
C
A
T
G
C
C
G
A
4
A
A
A
G
T
T
T
G
T
T
C
G
A
A
A
A
C
T
T
C
T
A
A
T
G
T
T
G
G
A
T
A
C
C
C
T
C
A
G
T
C
T
G
A
C
G
G
A
A
A
G
C
T
C
G
G
C
A
G
C
G
G
A
G
T
T
4
G
C
T
A
G
C
A
C
G
T
T
G
G
C
G
T
C
2
A
4
2
G
C
A
5
T
T
A
T
T
A
2
9
4
3
9
T
A
G
G
T
G
T
C
T
T
T
2
C
C
C
C
T
C
C
8
A
C
C
10
A
T
C
G
G
11
10
G
G
7
A
T
G
A
C
T
C
  144,696,563
  144,697,367
  144,697,794
  144,697,911
  144,698,722
  144,698,746
  144,698,870
  144,698,965
  144,698,985
  144,699,644
  144,699,771
  144,699,949
  144,699,952
  144,700,199
  144,700,301
  144,700,545
  144,700,811
  144,700,815
  144,700,818
  144,701,162
  144,701,383
  144,701,630
  144,701,980
  144,702,380
  144,702,575
  144,702,640
  144,702,672
  144,702,728
  144,702,912
  144,702,986
  144,703,003
  144,703,056
  144,703,058
  144,703,074
  144,703,094
  144,703,114
  144,703,130
  144,703,167
  144,703,286
  144,703,511
  144,703,654
  144,703,676
  144,703,830
  144,703,884
  144,703,924
  144,703,925
  144,703,950
  144,703,991
  144,704,331
  144,704,554
  144,704,574
  144,704,587
  144,704,607
  144,704,878
  144,704,926
  144,705,432
  144,705,849
  144,705,953
  144,705,992
  144,706,073
  144,706,104
  144,706,135
  144,706,150
  144,706,320
  144,706,574
  144,706,618
  144,707,754
  144,707,824
  144,707,828
  144,707,972
  144,708,125
  144,708,400
  144,708,671
  144,709,198
  144,710,066
  144,710,193
  144,710,503
  144,710,540
  144,710,563
  144,710,573
  144,712,475
  144,712,581
  144,712,835
  144,712,921
  144,713,129
  144,713,148
  144,713,308
  144,713,490
  144,713,529
  144,713,539
  144,713,560
  144,713,585
  144,713,594
  144,713,660
  144,713,726
  144,713,748
  144,713,880
  144,713,976
  144,714,048
  144,714,118
  144,714,222
  144,714,238
  144,714,291
  144,715,294
  144,715,563
  144,715,591
  144,715,642
  144,715,993
  144,716,019
  144,716,200
  144,716,332
  144,716,368
  144,716,955
  144,716,973
  144,717,679
  144,717,857
  144,717,889
  144,717,918
  144,718,440
  144,718,685
  144,724,024
  144,724,049
  144,724,056
  144,724,098
  144,725,116
  144,727,739
  144,731,671
  144,732,258
  144,734,138
  144,737,492
  144,739,912
  144,740,738
  144,754,748
  144,755,040
  144,755,045
  144,761,488
  144,764,183
  144,764,215
  144,764,221
  144,764,227
  144,767,364
  144,767,644
  144,767,787
  144,768,234
  144,768,479
  144,769,388
  144,769,630
  144,769,728
  144,770,375
  144,770,868
  144,772,344
  144,772,412
  144,772,632
  144,773,085
  144,773,341
  144,773,359
  144,773,376
  144,773,468
  144,773,494
  144,773,495
  144,773,604
  144,773,833
  144,773,864
  144,773,977
  144,774,047
  144,774,764
  144,775,889
  144,776,193
  144,776,497
  144,776,802
  144,776,944
  144,777,080
  144,777,177
  144,777,184
  144,777,457
  144,777,625
  144,777,665
  144,777,927
  144,778,005
  144,778,067
  144,778,086
  144,778,297
  144,778,337
  144,778,357
  144,778,388
  144,778,582
  144,779,249
  144,779,252
  144,779,755
  144,779,816
  144,779,832
  144,780,304
  144,780,426
  144,780,596
  144,780,686
  144,780,818
  144,781,122
  144,781,424
  144,781,432
  144,781,867
  144,782,976
  144,782,985
  144,784,198
  144,784,200
  144,785,868
  144,786,736
  144,786,944
  144,787,022
  144,787,415
  144,787,635
  144,788,213
  144,788,639
  144,788,743
  144,789,344
  144,789,573
  144,789,644
  144,789,857
  144,790,118
  144,790,137
  144,790,283
  144,790,333
  144,790,361
  144,790,487
  144,790,550
  144,791,084
  144,791,582
  144,791,776
  144,792,106
  144,792,232
  144,792,879
  144,792,976
  144,793,145
  144,794,188
  144,794,638
  144,795,159
  144,795,266
  144,795,358
  144,795,913
  144,796,057
  144,797,173
  144,797,224
  144,797,229
  144,797,498
  144,797,702
  144,798,094
  144,798,112
  144,798,785
  144,799,166
  144,799,206
  144,799,391
  144,799,563
  144,799,651
  144,800,024
  144,800,192
  144,800,350
  144,800,640
  144,800,652
  144,800,660
  144,800,663
  144,800,676
  144,801,383
  144,801,590
  144,801,690
  144,801,692
  144,801,801
  144,802,482
  144,802,484
  144,802,514
  144,802,539
  144,802,884
  144,803,012
  144,803,093
  144,803,182
  144,803,189
  144,803,254
  144,803,257
  144,803,413
  144,803,428
  144,803,441
  144,803,445
  144,803,667
  144,803,668
  144,803,687
  144,803,940
  144,804,102
  144,804,104
  144,804,171
  144,804,366
  144,804,555
  144,804,687
  144,805,302
  144,805,303
  144,805,380
  144,805,395
  144,805,427
  144,805,474
  144,805,936
  144,806,043
  144,806,391
  144,806,423
  144,806,949
  144,806,954
  144,806,962
  144,807,009
  144,807,119
  144,807,394
  144,807,573
  144,807,677
  144,807,748
  144,807,830
  144,807,849
  144,807,975
  144,808,220
  144,808,306
  144,809,033
  144,809,046
  144,809,065
  144,809,173
  144,809,195
  144,809,454
  144,809,599
  144,809,608
  144,809,621
  144,809,701
  144,809,755
  144,810,098
  144,810,099
  144,810,100
  144,810,234
  144,810,388
  144,810,601
  144,810,605
  144,811,049
  144,811,378
  144,811,482
  144,812,147
  144,812,463
  144,812,771
  144,812,779
  144,812,782
  144,812,890
  144,813,041
  144,813,151
  144,813,206
  144,813,366
  144,813,433
  144,813,489
  144,813,867
  144,814,020
  144,814,023
  144,814,375
  144,814,381
  144,814,382
  144,814,566
  144,814,588
  144,814,592
  144,814,795
  144,814,809
  144,814,998
  144,815,193
  144,815,259
  144,815,291
  144,815,647
  144,816,335
  144,816,473
  144,817,232
  144,817,299
  144,817,659
  144,817,672
  144,817,940
  144,818,141
  144,818,161
  144,818,173
  144,818,403
  144,818,918
  144,818,956
  144,819,443
  144,819,591
  144,819,600
  144,819,811
  144,819,854
  144,819,880
  144,820,124
  144,820,514
  144,820,890
  144,820,893
  144,820,977
  144,821,097
  144,821,421
  144,821,625
  144,821,920
  144,822,093
  144,822,181
  144,822,214
  144,822,283
  144,822,302
  144,822,371
  144,822,455
  144,822,508
  144,822,566
  144,822,579
  144,822,591
  144,822,592
  144,822,621
  144,822,625
  144,822,840
  144,822,855
  144,824,028
  144,824,115
  144,825,184
  144,825,206
  144,826,601
  144,830,103
  144,830,174
  144,830,901
  144,831,488
  144,831,892
  144,831,940
  144,831,978
  144,832,038
  144,832,224
  144,832,336
  144,832,836
  144,832,841
  144,833,015
  144,833,037
  144,833,437
  144,834,656
  144,835,170
  144,835,259
  144,835,405
  144,836,205
  144,836,419
  144,837,990
  144,841,033
  144,841,710
  144,841,963
  144,843,216
  144,843,274
  144,844,463
  144,845,248
  144,845,484
  144,845,485
  144,845,720
  144,845,828
  144,845,857
  144,845,980
  144,846,358
  144,847,043
  144,849,803
  144,850,480
  144,851,251
  144,851,360
  144,851,369
  144,851,378
  144,851,409
  144,851,413
  144,851,421
  144,851,755
  144,852,462
  144,852,469
  144,852,519
  144,852,722
  144,852,724
  144,852,730
  144,852,746
  144,853,098
  144,855,105
  144,857,772
  144,857,996
  144,858,492
  144,859,124
  144,859,426
  144,860,017
  144,862,920
  144,863,760
  144,865,203
  144,865,999
  144,866,065
  144,866,098
  144,866,450
  144,867,159
  144,867,403
  144,867,462
  144,867,967
  144,867,981
  144,869,632
  144,869,633
  144,869,878
  144,869,882
  144,870,114
  144,870,743
  144,870,834
  144,870,885
  144,871,081
  144,871,085
  144,871,090
  144,871,127
A
3
C
A
G
6
T
G
-
G
T
-
-
-
T
G
C/T
C/T
A/G
2
C
G
A
A
-
A
A
C
T
G
G
T
T
C
-
G/C
-
9
A
C
C
C
G
G
-
-
2
A
G
T
G
T
C
G
G
A
C
T
C
T
A
A
-
T
T
A
C
12/-
-
T
C
T/C
T
A
G
-
T
T
G
A
2
2
A
T
C
A
A
G
A
A
A
A
A
G
T
G
T
A
-
G
5
A
T
T
A
T
T
A
T
G
C
G
3
-
G
C
-
A
C
T
C/G
T/A
G/-
G
10/-
-
2/-
-
G/C
T/3
A
2
3
A/C
A/C
4
-
C/T
C/T
C/T
C
A
A
T
G
T
T
A/-
A
3/4
-
G
T
T
A
A
T
T
C
A
G
-
T
A
A
A
G
A
-
T
G
A
G
C
A
-
A
G
G
C
T
A
A
A
G
A
-
-
G
A
T
C
-
G
G
T
T
-
-
C/-
A
-
A
A
-
T
C
T
C
G
C
C
A
C
G
3
G
-
C
2
T
C
T
G
A
T
T
C
G
C
G
A
8
T
A
-
-
G
T
T
4
2
C
-
C
T
2
A
C
G
2
A
A/C
T
T
T
G/A
G/A
C/T
A/C
T
G
T
2
C
-
-
G
C
T
C
G
C
G
A
11
-
4
-
C
3
3
A
T
6
G/A
17
C
A
A
-
6/-
2
A/C
A
-
C
T
G
-
A
C
T
T
C
G
T
G
5
G
A
T
A
G
G
G
G
A
7
T
C
C
T
T
-
3/-
2/-
C/-
A
T
T
A
C
G
G
T
T
15/6
2
-
A
A
G
T
A
T
T
C
-
A
C/-
G/C
A/4
-
A/2
A/T
G
A
C
5
C
A
C
G
T
A
T
G
G
G
T
C
C
T
C
G
G
C
A
G
G
A
A
G
C
T
T
T
T
A
T
G
A
C
T
-
C
T
A
A
2
2
A/C
G
T
T
A
T
2
T
T
A/C
A
T
A
A
A/2
C
A
T/G
-
A
A
C
G
A
T
-
T
-
T/2
C
G/C
A
T
T
-
-
-
G
-
2/-
G/2
T
G
-
-
-
5
3
C
2
2/-
9/-
-
3/-
9/-
C
G
G/C
G/A
T/A
G/-
T/3
C/G
T/G
C
C
-
T
C/-
A
A
C
2
T
-
T
T
A
-
T
C
A
A
C
-
-
2
2
-
G
A
A
9
C/G
A
G