Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 175,093 (bp)   Positions: 445
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.006
.0
.0
.072
.001
.001
.0
.019
.659
.001
.039
.187
.094
.102
.0
.001
.99
.185
.056
.003
.033
.063
.012
.004
.001
.102
.015
.017
.002
.001
.01
.003
.002
.046
.067
.221
.009
.002
.052
.005
.993
.008
.0
.026
.01
--
--
--
.001
.001
.005
.0
.129
.021
.008
.004
.237
.003
.001
--
--
--
.0
.0
.001
.002
.0
--
.042
.002
.017
.001
.002
.007
.015
.002
.037
.0
.002
.007
.005
.781
.614
.106
.002
.386
.001
.042
.057
.095
.002
.006
.008
.097
.107
.1
.054
.033
.013
.022
.002
.0
.004
.015
.001
.009
.01
.117
.001
.023
.005
.163
.051
.003
.0
.006
.012
.01
.003
.69
.817
.002
.007
.015
.005
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.217
.222
.2
.339
.162
.002
.001
.0
.004
.0
.0
.04
.001
.008
.011
.06
.037
.008
.012
.256
.18
.021
.413
.35
.088
.01
.22
.0
.348
.653
.979
.975
.004
.012
.008
--
--
.001
.004
.005
.264
.008
.003
.001
.018
--
.064
.003
.16
.004
.013
.0
.321
.075
.136
.011
.024
.021
.731
.002
.708
.002
.193
.452
.025
.0
--
.059
.053
.004
.049
.001
.002
.008
.001
.006
.0
.0
.03
.0
1.0
.945
.846
.011
.008
.04
.323
.096
.015
.017
.151
.066
.001
.004
.024
--
.0
.002
.0
.001
.066
.008
--
.001
.05
.23
.001
.004
.417
.148
.058
.026
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.337
.002
.02
.006
.002
--
--
.003
.038
.001
.092
.0
.024
.642
.623
.387
.213
.162
.004
.006
.008
.231
.022
.014
.001
.001
.002
.0
.001
.015
.0
.007
.07
.364
.334
.056
.004
.038
.053
.065
.003
.001
.001
.0
.007
.058
.001
.0
.033
.0
.955
.569
.006
.01
.131
.004
.214
.001
.01
.005
.013
.0
.002
.026
.002
.092
.123
.002
.105
.004
.021
.052
.013
.022
.003
.103
.88
.0
.007
.002
.067
.098
.0
.001
.122
.004
--
.036
.037
.021
.02
.003
.008
.075
.001
.001
.017
.008
.001
.029
.001
.001
.012
.002
.08
.003
.023
.034
.395
.017
.001
.001
.004
.003
--
--
--
.019
.29
.301
.001
.001
.271
.443
.001
.003
.01
.001
.475
.043
.059
--
--
--
.539
.44
.356
.071
.051
.001
--
--
--
--
--
--
--
.007
.002
.0
.048
.003
.023
.0
.003
.039
.003
.0
.0
.401
--
.221
.344
.016
.017
.002
--
--
--
--
--
--
--
.003
.106
.225
.085
.002
.002
.004
.071
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
Osbpl3
G
5
C
C
A
C
C
3
A
C
T
3
T
C
G
G
G
G
T
A
8
C
C
C
G
C
T
T
A
C
C
T
C
G
G
T
T
2
G
A
G
A
A
T
C
12
6
G
A
T
A
3
G
C
A
T
A
C
2
G
C
T
C
C
C
7
A
G
T
G
C
C
A
C
T
T
C
G
C
G
T
G
C
T
2
C
A
G
T
A
G
T
A
T
G
C
G
A
9
A
T
C
C
G
G
A
G
A
G
T
C
T
A
T
C
C
G
G
T
A
G
C
C
A
T
C
G
2
2
C
C
A
C
T
C
T
C
C
T
C
4
3
23
C
C
G
5
C
T
A
G
C
A
2
C
A
A
2
2
C
C
T
A
A
3
T
5
C
C
A
G
C
C
G
G
3
C
T
G
C
A
C
T
A
T
G
A
T
T
G
G
C
A
G
C
G
C
A
T
T
A
A
A
G
2
C
C
T
3
2
9
A
T
T
G
G
C
A
G
A
G
G
T
T
A
T
C
7
T
A
T
G
G
G
C
G
C
C
A
A
G
A
T
A
T
T
C
C
G
T
T
A
C
A
C
C
G
C
G
G
C
A
C
A
A
T
T
A
T
C
C
G
A
A
G
C
T
C
C
G
G
G
G
G
A
T
C
C
G
6
6
A
G
C
T
T
C
A
C
G
T
C
C
A
A
C
A
C
A
A
A
G
A
A
A
T
A
C
G
T
C
2
C
C
C
C
G
T
C
T
A
G
15
A
C
C
G
G
T
A
A
A
T
T
T
T
A
G
T
T
A
C
A
T
G
G
A
A
A
G
T
G
G
G
A
A
A
A
G
T
A
A
A
A
A
A
C
A
2
A
T
T
2
C
2
2
2
G
A
A
T
T
A
12
A
C
2
9
4
3
9
A
G
G
T
G
T
C
T
C
C
T
G
T
G
A
T
C
G
G
C
C
C
A
A
A
A
15
T
A
T
A
A
T
A
C
C
C
A
G
G
G
A
C
G
  144,703,479
  144,706,019
  144,707,875
  144,712,316
  144,720,949
  144,723,000
  144,723,081
  144,723,122
  144,723,655
  144,724,024
  144,724,049
  144,724,752
  144,725,120
  144,725,125
  144,726,153
  144,726,157
  144,726,360
  144,726,850
  144,727,447
  144,727,526
  144,727,735
  144,728,112
  144,728,211
  144,728,948
  144,729,977
  144,730,027
  144,730,144
  144,730,145
  144,730,300
  144,730,311
  144,730,443
  144,730,724
  144,730,757
  144,730,840
  144,731,195
  144,731,567
  144,731,599
  144,731,671
  144,732,032
  144,732,227
  144,732,617
  144,732,985
  144,733,393
  144,733,791
  144,733,854
  144,734,098
  144,734,104
  144,734,138
  144,735,664
  144,735,702
  144,736,016
  144,736,383
  144,736,488
  144,736,915
  144,737,443
  144,737,492
  144,737,646
  144,738,149
  144,738,165
  144,738,170
  144,738,318
  144,738,549
  144,739,712
  144,739,742
  144,739,814
  144,740,280
  144,740,290
  144,740,738
  144,740,917
  144,740,977
  144,741,282
  144,741,663
  144,742,072
  144,743,493
  144,743,507
  144,743,717
  144,743,981
  144,744,023
  144,744,031
  144,744,131
  144,744,169
  144,744,236
  144,744,287
  144,744,443
  144,744,473
  144,744,545
  144,744,557
  144,744,858
  144,744,928
  144,744,951
  144,745,108
  144,745,298
  144,745,299
  144,745,433
  144,745,434
  144,745,473
  144,745,735
  144,745,768
  144,745,948
  144,746,064
  144,746,367
  144,746,386
  144,746,402
  144,746,542
  144,746,617
  144,746,717
  144,747,174
  144,747,281
  144,747,678
  144,750,740
  144,750,748
  144,751,476
  144,751,532
  144,751,647
  144,751,683
  144,751,797
  144,751,849
  144,751,970
  144,752,088
  144,752,382
  144,752,679
  144,752,885
  144,752,979
  144,753,038
  144,753,114
  144,753,267
  144,753,575
  144,753,642
  144,753,692
  144,753,725
  144,754,173
  144,754,250
  144,754,346
  144,754,395
  144,754,491
  144,754,618
  144,754,635
  144,754,748
  144,754,892
  144,754,905
  144,755,047
  144,755,048
  144,755,057
  144,755,068
  144,755,074
  144,755,343
  144,755,380
  144,755,737
  144,755,972
  144,756,160
  144,756,404
  144,756,581
  144,756,858
  144,756,886
  144,757,193
  144,757,381
  144,757,384
  144,757,582
  144,757,882
  144,758,101
  144,758,111
  144,758,349
  144,758,364
  144,758,381
  144,758,429
  144,758,759
  144,759,029
  144,759,053
  144,761,371
  144,761,488
  144,761,497
  144,761,510
  144,763,618
  144,763,874
  144,764,118
  144,764,183
  144,764,191
  144,764,553
  144,765,201
  144,765,206
  144,765,922
  144,766,201
  144,766,521
  144,766,780
  144,767,249
  144,769,699
  144,769,728
  144,770,868
  144,772,356
  144,773,341
  144,773,359
  144,773,435
  144,773,864
  144,774,047
  144,774,169
  144,775,510
  144,776,193
  144,776,944
  144,779,755
  144,779,781
  144,780,426
  144,780,596
  144,780,686
  144,780,854
  144,781,432
  144,781,867
  144,784,193
  144,785,204
  144,785,853
  144,785,868
  144,786,120
  144,786,944
  144,787,415
  144,788,213
  144,788,639
  144,788,743
  144,789,123
  144,789,573
  144,789,644
  144,789,857
  144,790,032
  144,790,118
  144,790,137
  144,790,283
  144,790,333
  144,790,361
  144,791,328
  144,791,894
  144,792,106
  144,792,232
  144,792,879
  144,793,454
  144,793,555
  144,794,719
  144,794,908
  144,795,159
  144,795,878
  144,795,913
  144,796,057
  144,796,107
  144,797,173
  144,797,224
  144,797,229
  144,797,498
  144,798,094
  144,798,514
  144,798,626
  144,799,057
  144,799,166
  144,799,206
  144,799,391
  144,799,563
  144,799,651
  144,800,024
  144,800,176
  144,800,192
  144,800,350
  144,800,640
  144,800,652
  144,800,660
  144,800,663
  144,800,676
  144,801,383
  144,801,590
  144,801,692
  144,801,801
  144,802,484
  144,802,514
  144,802,539
  144,802,879
  144,802,884
  144,803,012
  144,803,093
  144,803,189
  144,803,254
  144,803,412
  144,803,413
  144,803,428
  144,803,441
  144,803,445
  144,803,667
  144,803,668
  144,803,687
  144,804,073
  144,804,171
  144,804,366
  144,804,523
  144,804,532
  144,804,687
  144,805,302
  144,805,303
  144,805,380
  144,805,427
  144,805,471
  144,805,936
  144,805,963
  144,806,043
  144,806,391
  144,806,423
  144,806,949
  144,806,954
  144,806,962
  144,807,009
  144,807,119
  144,807,394
  144,807,573
  144,807,677
  144,807,748
  144,807,830
  144,807,975
  144,808,306
  144,808,368
  144,809,033
  144,809,046
  144,809,065
  144,809,173
  144,809,195
  144,809,454
  144,809,599
  144,809,608
  144,809,701
  144,809,755
  144,810,100
  144,810,234
  144,810,388
  144,810,601
  144,810,605
  144,811,049
  144,811,231
  144,811,482
  144,812,485
  144,812,562
  144,812,916
  144,813,886
  144,814,357
  144,814,375
  144,814,381
  144,814,809
  144,815,193
  144,817,659
  144,818,956
  144,819,443
  144,819,591
  144,819,811
  144,819,854
  144,820,143
  144,820,514
  144,820,728
  144,820,821
  144,820,890
  144,820,893
  144,820,913
  144,820,914
  144,821,625
  144,822,371
  144,822,561
  144,822,591
  144,822,592
  144,822,621
  144,822,625
  144,822,855
  144,823,004
  144,824,105
  144,824,887
  144,825,619
  144,826,003
  144,826,680
  144,827,128
  144,827,137
  144,827,183
  144,827,205
  144,827,340
  144,829,114
  144,829,187
  144,829,408
  144,829,874
  144,830,174
  144,831,892
  144,831,893
  144,834,656
  144,835,405
  144,841,963
  144,843,215
  144,843,216
  144,843,274
  144,845,250
  144,845,484
  144,845,485
  144,845,828
  144,845,856
  144,845,980
  144,846,358
  144,847,043
  144,851,248
  144,851,250
  144,851,259
  144,851,360
  144,851,369
  144,851,378
  144,851,409
  144,851,413
  144,851,755
  144,852,462
  144,852,469
  144,852,519
  144,852,722
  144,852,724
  144,852,730
  144,855,105
  144,856,916
  144,858,088
  144,860,017
  144,861,075
  144,861,247
  144,862,109
  144,862,118
  144,862,353
  144,862,671
  144,862,997
  144,863,048
  144,863,461
  144,864,395
  144,864,856
  144,865,581
  144,865,698
  144,866,108
  144,866,109
  144,866,445
  144,867,005
  144,867,010
  144,867,016
  144,867,018
  144,867,020
  144,867,154
  144,867,159
  144,867,415
  144,867,462
  144,867,471
  144,867,768
  144,867,981
  144,869,872
  144,870,405
  144,870,743
  144,871,127
  144,871,531
C
5/-
C/G
T
G
T
T
-
15
G
A
-
T/C
C/T
A
G/A
3
A
2
C
8/-
T
T
T
A
T
A
C
G
G
T
C
T
A
A
C
3
2/-
A
T
A
G
G
C
T
12/-
6/-
G/C
G
C
G
-
A
T
G
T/3
G
9
2/-
G/T
2
-
2
T
T
-
G
2
3
A
T
T
T
T
A
C
T
A
T
A
C
A
T
3
-
T
G
A
C
G
A
C
G
C
A
T
A
G
-
G
C
T
T
A
C
G
A
C
C
2
T
C
C
C
A
T
A
A
C
G
A
G
T
20
C
T
11
2/-
-
G
T
T
T
C
T
C
T
3
C
T
-
-
23/-
C/-
-
A
-
T
C
G
2
T
2
-
T
T
G
-
-
G
A
3
2
A/G
-
C
-
G
-
4
G/A
C/G
T
A
A
-
C/T
C
A
T
T
T
C
G
A
G/A
A/-
T/2
2
A
A
T
T
A
T
A
A
G
G
A
-
G
G
5
-
-
-
C
-
2/-
-
C
C
C
C
A
T
G
3/6
G
A
-
C
3/TA
C
C
T
-
C
G
C
2
A
A
T
A
T
G
C
G
T
4
2
C
C
C
T
T
A
C
G
2
A
A/C
T
T
T
T
G/A
G/A
C/T
A/C
T
G
2
C
-
G
C
A
T
C
G
G
A
C/2
-
4
-
A
3
3
A
A
17
C
T
T
A
-
-
A/2
A
C/2
C
G
T
G
-
A
C
T
T
C
G
T
G
5
G
T
G
-
G
G
G
A
7
T
C
C
T
-
-
A
T
T
A
C
T
G
T
T
-
T
C/-
C/-
G/C
A
5
G
G
G
C
G
G
G
G
A
C
C
T
C/2
-
C
C
C
2
A/C
G
T
A
T
C
C
G
T
G
G
C
C
G
T
G
G
G
G
T
A/2
2/-
-
T/2
T/-
2/-
-
-
-
2/-
G/2
G
6
-
-
5
-
6/5
-
2/-
9/-
-
3/-
9/-
G
G/C
G/A
T/A
G/-
T/3
C/G
C
T
T
C
A
5
2
5
C
2
A
A
C/-
2
T
C
G
T
G
-
C
-
A
T
4
C
T
T
A
T
G
C
-
A
G
G
T