Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 231,684 (bp)   Positions: 540
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.007
--
--
--
.041
.0
.009
.005
.022
.089
.01
.02
.012
.001
.004
.023
.005
.019
.014
.0
.005
.947
.003
.001
.0
.0
.002
.063
--
.003
--
--
.026
.045
.001
.011
.482
.72
--
--
.001
.005
.001
.808
.044
.007
.001
.101
.129
.002
.004
.011
.011
.117
.13
.174
.002
.001
.062
.045
.003
--
.177
.023
.049
.744
.985
--
.001
.001
.144
.001
.142
--
--
.0
.042
.055
.004
.019
--
.0
.035
.045
.0
--
.0
.068
.001
.003
.015
.013
.038
.002
.006
.001
.237
.001
.003
--
.006
.004
.096
.194
.065
.0
.0
.001
.0
.004
.007
.229
.01
.004
.003
.005
.008
.002
.0
.009
.003
.008
.007
--
--
--
.003
.036
.005
.01
.01
.005
.083
.001
.002
.004
.001
.002
.001
.974
.0
.059
.0
.545
.003
.007
.0
.0
.041
.047
.023
--
--
--
.971
1.0
.164
.001
.001
.002
.06
.0
.033
.002
.001
.028
.092
.147
.002
.004
.051
.063
.047
--
.35
.0
.002
.005
.009
.001
.067
.262
.054
.085
.032
.001
.002
.083
.002
.013
.03
--
--
.005
.001
.089
.075
.0
.0
.015
.053
.001
--
.05
.078
.226
.991
.0
.402
.004
.005
.014
.015
.002
.016
.006
.001
.402
--
.004
.001
--
.002
.628
.001
.004
.013
.006
.002
.008
--
--
--
--
.008
.002
.049
.007
.029
.03
.002
.04
--
--
.042
.009
.002
.002
.003
.006
.143
.026
.001
.003
.05
.002
.002
.0
.008
.002
.002
.088
.006
.164
.103
--
.018
.014
.239
.578
--
.208
.004
.002
.001
.002
.019
.033
.014
.002
.002
.037
.011
.021
.142
.006
.003
.031
.623
.001
--
.012
.001
.007
.236
.008
.001
.013
.013
.006
.008
.008
.003
.001
.025
.039
.327
.002
.008
.001
.007
.001
.001
.008
--
.0
.002
.101
.045
.05
.073
.045
.0
.001
.015
.046
.067
.035
.132
.633
.303
.051
.004
.007
.073
.025
.13
.037
.013
.065
.002
.008
.244
.387
.007
.004
.28
.438
.031
.015
.003
--
.015
.001
.001
.013
.766
.004
.001
.783
.953
.002
.007
.117
.137
.234
.008
.008
.001
.45
.0
.001
.001
.013
.001
.002
.016
.0
.04
.002
--
--
.006
.007
.667
.074
--
.112
.006
.009
.024
--
--
--
--
.033
.049
--
--
--
.999
.001
.03
.023
.0
.058
.002
.002
.003
--
--
--
--
--
.015
.56
.001
--
.004
.136
1.0
.0
.158
.98
.001
.002
.0
.0
.166
.0
--
--
--
--
.034
.004
.005
.0
.776
.001
.002
.003
.0
.972
.094
.059
.081
.06
.028
.428
.007
.147
.565
.03
.006
.001
.009
.005
.741
.003
.035
.018
.117
.03
.011
.036
.015
.033
.0
.018
.009
.006
.0
.351
.087
.244
.001
.001
.005
.095
.209
.532
.996
.008
.128
.001
.001
.004
.134
.091
.02
.01
--
--
.03
.009
.003
.0
.0
.009
.002
.002
.0
1.0
.998
.0
.107
.006
.241
.004
.001
.0
.0
.057
.001
--
.0
.002
.036
--
--
.008
.0
.003
.003
.098
.004
.033
.395
.992
.053
.068
.069
.068
.066
.063
.059
.047
.039
.027
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
Ncoa2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
2
T
C
A
G
T
T
G
G
C
C
G
G
G
A
T
A
C
T
T
C
G
16
A
A
T
G
T
C
G
3
G
A
C
T
T
A
T
A
6
T
T
A
5
G
A
T
T
G
C
A
A
G
T
G
A
T
G
C
C
G
4
C
A
G
T
G
T
T
C
T
A
G
T
G
G
T
C
G
A
G
T
T
11
A
T
A
G
C
G
8
C
A
8
G
C
T
T
T
G
2
T
C
G
A
G
A
C
T
2
A
6
G
T
T
C
C
T
G
C
G
C
T
C
7
C
A
A
T
A
C
A
G
A
G
C
T
T
G
A
G
T
C
C
40
A
2
T
C
A
A
6
4
T
A
G
T
A
G
G
C
C
A
T
C
C
T
T
G
G
C
C
A
T
T
A
T
A
C
G
A
8
A
A
G
T
C
G
C
C
C
C
T
G
2
C
G
G
C
A
A
A
G
G
16
G
T
A
G
C
C
G
C
G
T
T
A
A
2
A
T
G
T
17
G
C
T
C
T
G
A
C
A
G
T
C
C
C
C
T
C
G
A
T
G
C
C
C
C
C
G
G
C
5
T
A
G
C
C
G
A
5
A
T
11
T
A
A
T
T
A
T
A
C
C
C
8
A
C
T
C
A
A
C
T
G
C
A
C
T
T
A
A
G
G
T
A
3
G
G
T
T
T
C
G
A
T
T
9
T
G
A
A
G
22
C
T
T
4
2
G
3
7
C
C
A
A
T
G
A
C
C
A
G
T
A
T
C
T
A
C
C
T
C
T
C
A
5
G
G
C
28
G
C
G
C
C
C
A
T
A
A
C
4
2
C
T
G
G
A
C
T
6
T
G
G
T
G
C
C
C
A
C
G
A
T
C
4
G
G
G
G
G
G
A
G
C
T
C
9
2
A
T
3
G
G
G
A
G
T
2
54
A
4
T
G
G
A
G
C
G
G
T
2
G
A
T
G
A
C
G
C
A
C
G
A
A
T
A
T
A
T
T
C
C
T
G
A
A
G
T
6
C
C
T
4
A
A
T
A
T
T
12
G
A
C
G
A
T
G
G
C
T
T
A
2
G
T
A
T
4
T
T
C
C
G
3
2
G
C
G
C
12
T
G
A
A
C
A
G
G
T
T
A
G
G
G
G
C
T
A
C
A
A
T
2
C
G
A
T
A
A
A
T
A
G
A
G
T
C
A
G
G
G
G
G
G
G
G
G
  10,310,118
  10,310,777
  10,310,795
  10,310,967
  10,311,230
  10,311,723
  10,311,930
  10,311,935
  10,311,970
  10,312,496
  10,312,506
  10,313,722
  10,313,736
  10,313,840
  10,314,156
  10,314,705
  10,315,169
  10,315,942
  10,316,006
  10,317,036
  10,317,481
  10,317,865
  10,318,306
  10,318,383
  10,318,393
  10,318,394
  10,318,400
  10,319,098
  10,319,255
  10,319,569
  10,319,990
  10,320,521
  10,320,711
  10,320,723
  10,321,253
  10,321,518
  10,321,701
  10,322,020
  10,323,181
  10,323,409
  10,324,536
  10,324,541
  10,324,543
  10,325,306
  10,326,010
  10,326,203
  10,326,707
  10,326,729
  10,326,732
  10,327,192
  10,327,597
  10,327,935
  10,328,145
  10,328,203
  10,328,204
  10,328,210
  10,328,960
  10,329,320
  10,329,658
  10,329,865
  10,330,863
  10,332,145
  10,336,045
  10,337,211
  10,337,428
  10,338,237
  10,338,340
  10,338,565
  10,339,777
  10,339,778
  10,340,050
  10,340,436
  10,340,694
  10,340,821
  10,340,902
  10,341,395
  10,341,428
  10,341,587
  10,342,220
  10,342,282
  10,342,399
  10,342,985
  10,344,017
  10,344,846
  10,345,272
  10,345,490
  10,345,697
  10,346,604
  10,346,944
  10,347,068
  10,347,111
  10,347,561
  10,348,251
  10,348,497
  10,348,726
  10,348,902
  10,349,125
  10,349,762
  10,350,281
  10,350,997
  10,352,003
  10,352,005
  10,352,099
  10,352,507
  10,352,512
  10,352,660
  10,352,696
  10,352,890
  10,353,256
  10,353,839
  10,353,870
  10,353,951
  10,354,289
  10,354,965
  10,355,067
  10,355,208
  10,355,355
  10,355,627
  10,356,443
  10,356,489
  10,356,565
  10,356,630
  10,356,640
  10,356,665
  10,356,843
  10,356,894
  10,356,920
  10,357,054
  10,358,218
  10,358,227
  10,358,228
  10,358,267
  10,358,283
  10,358,313
  10,359,054
  10,359,354
  10,359,616
  10,359,649
  10,360,095
  10,360,501
  10,361,447
  10,361,719
  10,361,937
  10,362,579
  10,362,925
  10,363,491
  10,364,195
  10,364,196
  10,364,232
  10,364,422
  10,364,660
  10,366,420
  10,366,422
  10,366,695
  10,367,016
  10,367,193
  10,367,300
  10,367,620
  10,368,040
  10,368,142
  10,368,714
  10,368,842
  10,368,954
  10,370,296
  10,370,478
  10,370,609
  10,370,623
  10,370,783
  10,370,894
  10,371,418
  10,371,672
  10,371,726
  10,371,727
  10,371,985
  10,372,624
  10,372,697
  10,372,699
  10,372,700
  10,372,703
  10,372,839
  10,372,901
  10,373,015
  10,373,108
  10,373,355
  10,373,693
  10,374,214
  10,374,717
  10,374,926
  10,375,073
  10,375,147
  10,375,302
  10,375,646
  10,375,647
  10,375,808
  10,375,864
  10,376,214
  10,376,569
  10,376,577
  10,376,987
  10,377,069
  10,377,481
  10,377,614
  10,377,776
  10,377,949
  10,378,686
  10,378,732
  10,379,367
  10,379,556
  10,379,591
  10,379,896
  10,380,053
  10,380,269
  10,380,964
  10,381,708
  10,381,786
  10,381,983
  10,383,199
  10,383,673
  10,383,893
  10,384,457
  10,384,460
  10,384,545
  10,384,568
  10,385,226
  10,385,393
  10,385,736
  10,385,933
  10,386,087
  10,386,357
  10,386,362
  10,386,459
  10,386,571
  10,386,577
  10,386,585
  10,386,622
  10,387,322
  10,387,380
  10,387,504
  10,387,584
  10,387,585
  10,387,729
  10,387,804
  10,391,088
  10,391,472
  10,391,651
  10,392,187
  10,392,203
  10,392,316
  10,392,325
  10,392,401
  10,392,445
  10,392,484
  10,392,494
  10,392,504
  10,392,536
  10,392,592
  10,392,593
  10,392,823
  10,392,914
  10,392,985
  10,393,070
  10,394,425
  10,394,540
  10,394,884
  10,395,347
  10,396,347
  10,396,558
  10,396,625
  10,396,813
  10,396,824
  10,396,898
  10,397,414
  10,397,720
  10,398,490
  10,398,496
  10,398,525
  10,399,835
  10,400,411
  10,400,589
  10,401,440
  10,401,886
  10,402,237
  10,402,677
  10,403,259
  10,403,713
  10,403,811
  10,403,930
  10,404,261
  10,405,007
  10,405,395
  10,405,561
  10,405,753
  10,406,377
  10,406,477
  10,406,485
  10,406,669
  10,406,679
  10,406,726
  10,406,730
  10,406,732
  10,406,733
  10,407,035
  10,407,045
  10,407,273
  10,407,564
  10,411,640
  10,412,045
  10,412,421
  10,412,525
  10,412,533
  10,412,672
  10,412,770
  10,413,308
  10,413,379
  10,413,594
  10,413,780
  10,413,988
  10,414,316
  10,414,722
  10,414,724
  10,414,949
  10,415,048
  10,415,606
  10,415,953
  10,416,343
  10,416,934
  10,417,674
  10,419,706
  10,419,845
  10,419,853
  10,419,965
  10,420,054
  10,420,175
  10,420,813
  10,421,159
  10,421,226
  10,421,358
  10,422,077
  10,422,090
  10,422,375
  10,422,429
  10,422,902
  10,422,930
  10,422,964
  10,423,464
  10,424,436
  10,424,530
  10,424,555
  10,424,612
  10,425,837
  10,425,953
  10,426,095
  10,426,184
  10,427,535
  10,428,364
  10,428,452
  10,429,330
  10,429,686
  10,429,898
  10,430,404
  10,430,441
  10,430,669
  10,430,985
  10,431,004
  10,431,044
  10,431,697
  10,431,728
  10,432,107
  10,432,304
  10,432,583
  10,433,102
  10,433,207
  10,433,383
  10,433,667
  10,433,779
  10,434,573
  10,435,087
  10,435,883
  10,436,702
  10,436,764
  10,437,277
  10,437,935
  10,438,303
  10,438,412
  10,439,288
  10,439,406
  10,439,734
  10,440,314
  10,441,410
  10,441,458
  10,442,531
  10,444,402
  10,444,462
  10,444,633
  10,444,976
  10,445,577
  10,445,642
  10,446,276
  10,446,452
  10,466,832
  10,474,229
  10,474,557
  10,474,676
  10,474,678
  10,475,106
  10,475,735
  10,475,861
  10,476,666
  10,476,913
  10,477,646
  10,477,715
  10,477,721
  10,478,193
  10,478,246
  10,478,265
  10,478,355
  10,478,974
  10,480,610
  10,481,664
  10,481,844
  10,483,683
  10,484,014
  10,484,255
  10,484,432
  10,484,685
  10,484,834
  10,486,001
  10,486,006
  10,486,272
  10,486,360
  10,486,597
  10,486,608
  10,486,626
  10,486,635
  10,487,745
  10,487,854
  10,488,604
  10,489,561
  10,489,826
  10,490,167
  10,490,848
  10,490,906
  10,491,142
  10,491,273
  10,491,584
  10,491,585
  10,491,759
  10,491,889
  10,491,947
  10,492,177
  10,492,604
  10,492,746
  10,492,955
  10,494,011
  10,494,259
  10,494,689
  10,494,756
  10,494,886
  10,495,110
  10,495,803
  10,496,440
  10,497,492
  10,497,711
  10,497,723
  10,497,812
  10,498,571
  10,498,762
  10,499,222
  10,499,436
  10,499,798
  10,500,685
  10,501,431
  10,501,865
  10,502,173
  10,502,628
  10,503,031
  10,504,268
  10,504,385
  10,504,474
  10,504,609
  10,504,689
  10,504,788
  10,505,139
  10,506,803
  10,507,009
  10,507,469
  10,508,161
  10,508,162
  10,508,375
  10,510,150
  10,510,572
  10,511,101
  10,511,611
  10,511,663
  10,511,891
  10,512,325
  10,512,542
  10,512,919
  10,514,273
  10,515,134
  10,515,333
  10,515,520
  10,516,405
  10,517,274
  10,517,284
  10,517,420
  10,517,967
  10,518,111
  10,518,141
  10,518,173
  10,519,024
  10,519,031
  10,519,466
  10,519,513
  10,520,102
  10,520,263
  10,522,083
  10,522,474
  10,523,657
  10,524,153
  10,524,343
  10,526,402
  10,526,540
  10,526,712
  10,528,917
  10,529,068
  10,529,729
  10,532,920
  10,535,142
  10,536,323
  10,536,689
  10,537,261
  10,537,263
  10,537,265
  10,537,267
  10,537,269
  10,537,271
  10,537,275
  10,537,277
  10,537,279
-
3
T
G
2
C
42
A
3
T
T
A
A
-
3
C
G
T
A
-
T
T
-
-
G
2
9
G
T
C
-
7
3
2
C
C
G
-
G
6/-
C
23
-
-
A
10
T/2
G
T
14
T
G
T
C
13/9
A/3
C
A
T
T
G/3
-
T
G
A
G
A
5
G
8
G
G
A
C
A
A
C
T
A
G
2
G
C
-
G
-
G
T
T
C
-
T
G
-
A
T
C
C
C
A
-
5
T
T
T
A
C
G
C
-
3
6/-
2
C
9
G
T
A
A
A
A
T
2
T
-
T
G
-
C
C
2
T
A
C
C
7
C
C
A
4
A
C
T
T
-
A/13
2/-
T/-
T
21
G
6/-
4/-
G
T
A
-
G
A
A
T
-
G
C
T
T
C
-
A
C
T
T
G
C
C
6
3
13
8
A
17
-
G
G
A
C
2
A
T
G
T
C/2
T/-
T
-
T
2
2
T
G
2
G
A
T
-
C
C
G
A
T
CT/6
A
A
-
C
C
G
-
-
G
2
C
2
-
A
T
G
T
3
A
G
2
T
A
C
A
G
G
T
G
G
C
24
C
C
A
A
T
T
T
A
C
G
5/-
C
T
A
G
T
C
-
-
T
2
-
C
G
2
2
7/6
3
C
G
T
T
T
-
T
T
A
T
G
T
2
C
T
T
G
T
G
C
G
T
C
A
C
G
-
T
T
G
T/2
G
G
GT/3
G
-
-
9/-
T/5
C
C
T
-
-
T
C
7
4/-
2/-
A
-
-
A
T
G
G
C
A
-
T
2
T
T
C
G
-
T
C
G
T
T
C
T
A
T
G
-
2
A
T
-
A
A
A
CT/4
T
T
G
C
G
G
A
-
2/-
T
C
A
-
C
11
G
6/-
G
A
A
A
A
G
T
T
G
A
A
T
C
T
-
A
A
A
A
A
A
C
A
13
C
A
-
2/-
G
-
-
A
10
A
G
T
2
-
-
G
-
C
A
27
G
C
T
T
A
C
-
45
T
C
C
G
T
C
G
G
A
A
G
G
G
G
G
C
A
G
A
4
G
A
G
-
A
C
-
T
T
C
-
G
G
A
G
C
C
-
2
G
11
A
G
A
A
A
T
C
C
G
-
A
C
G
3
-
13
C
T
T
A
3/-
2/-
A
T
2
T
-
-
A
G
G
T
G
A
A
C
G
G
A
C
A
C
G
C
G
T
G
C
C
-
T
T
C
2
2
G
G
C
G
2
G
C
T/-
3
6/16
A
A
A
A
A
A
A
A
A