Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 310,551 (bp)   Positions: 527
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.002
.0
.001
.0
.006
.005
.008
.001
.003
.763
.001
.004
.879
.986
.555
.034
.009
.111
--
--
.001
.004
.003
.001
.001
.722
.076
.001
.001
.975
.001
.225
.037
.003
.003
.921
.089
.058
.001
.171
.425
.156
.025
.0
.005
.0
.0
.0
.003
.071
--
--
--
--
--
--
--
.0
.003
.002
.008
.01
.0
.0
.004
.146
--
.009
.02
.036
.032
.217
.206
.02
.125
.005
.012
.011
.137
.374
.005
.103
.028
.002
--
.005
.019
.001
.003
.002
.002
.344
.121
.014
.053
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.216
.053
.003
.005
.231
.269
.877
.011
.002
.007
.014
.024
.017
.017
.141
.236
.477
.013
.084
.0
.005
.004
.074
.004
.0
.313
.0
.003
.001
.355
.374
.0
.988
.998
.011
.21
.018
.001
.002
.022
.848
.195
.01
.019
.093
.082
.069
.246
.007
.031
.002
.024
.003
.001
.002
.012
.018
.001
.003
.007
.125
.001
.001
.003
.014
.0
.059
.076
.004
.001
.003
.001
.001
.053
.001
.001
.01
.009
.026
.009
.002
.002
.018
.04
.985
.001
.069
.018
.015
.003
.872
.137
.947
.001
.0
.007
.493
.001
.005
.281
.471
.005
.003
.005
.011
.0
.004
.006
.004
.002
.0
.0
.003
.002
.05
.011
.005
.004
.02
.001
.008
.015
.008
.003
.019
.0
.03
.356
.0
.001
.0
.0
.99
.011
.055
.001
.0
.002
.089
.036
.024
.074
.035
.037
.019
.069
.003
--
--
.0
.0
.0
.001
.002
.044
.006
.009
.996
.043
.218
.0
--
--
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.387
.177
.001
.001
.0
.005
.001
.01
.001
.0
.011
.001
.027
.023
.002
.02
.044
.008
.002
.004
.0
.0
.0
.045
.001
.0
.788
.01
.032
.075
.033
.028
.003
.0
.0
.014
.0
.114
.004
.349
.001
--
.001
--
--
--
.001
--
.001
.002
.0
.0
.006
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.695
--
--
.132
--
--
--
.001
--
--
.353
.012
.033
.022
.0
--
--
--
.109
.21
.003
.04
.002
.002
.001
.001
.004
.0
.003
.013
.004
.007
.001
.0
.003
.021
.016
.866
--
.036
.347
.065
.0
.0
.198
.091
.053
.04
.029
.031
.187
.168
.056
.134
.02
.005
.025
.003
.011
.673
.001
.202
--
.015
.003
.307
.009
.001
.491
.016
.016
.002
.008
.014
.014
.0
.001
.0
--
--
--
.075
.0
.0
--
.082
.0
.999
.003
.003
.001
.001
.035
.002
--
--
.007
.022
.008
.0
--
.055
.027
.302
.026
.027
.711
.004
.044
.001
.051
.034
.191
.189
.001
.0
.003
.999
.051
--
.0
.009
.016
.006
.009
.55
--
.096
--
--
--
--
--
--
--
.005
.004
.43
.177
.117
.1
.492
.488
.43
.05
.009
.017
.007
.108
.07
.005
.0
.018
.221
.172
.008
.007
.641
.675
.008
.001
.005
.002
.001
.001
.22
.226
.0
.001
.0
.473
.023
.51
.324
.362
.006
.022
.009
.002
.003
--
.0
.9
.899
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
Nalcn
C
C
C
T
G
G
G
A
G
G
A
T
C
T
G
A
T
A
T
C
G
C
A
T
A
A
A
A
C
A
C
T
G
T
G
A
A
T
G
T
A
T
T
T
A
G
A
A
4
A
C
T
C
C
A
G
A
G
A
A
2
C
G
T
G
G
C
3
G
T
C
C
C
G
G
A
C
C
G
T
C
G
G
T
T
A
G
A
C
G
A
C
C
T
T
A
A
A
C
G
G
G
C
T
G
G
C
A
T
G
4
C
T
T
A
A
2
T
A
C
T
A
C
T
T
A
A
A
T
A
A
T
C
T
G
G
T
T
C
A
G
A
T
T
4
T
T
C
A
C
C
G
A
T
A
T
G
T
C
A
A
A
A
A
T
A
C
G
T
C
T
T
A
T
C
T
C
T
A
A
G
T
A
A
A
A
G
T
T
C
G
T
4
C
G
2
A
T
T
6
T
A
T
A
G
T
T
C
G
G
C
C
T
C
A
C
T
G
5
A
C
T
A
A
G
G
T
A
G
C
C
T
C
G
A
G
A
T
T
T
T
T
A
C
T
C
A
C
G
T
T
G
A
C
C
A
A
A
G
G
T
G
G
A
C
C
T
T
A
C
A
A
G
T
G
A
T
T
A
C
A
C
C
C
A
A
G
G
T
T
T
T
G
C
G
A
G
T
T
G
C
T
G
G
A
A
G
A
T
C
C
C
C
A
T
A
A
T
T
T
G
T
T
T
T
A
T
A
A
A
T
G
A
T
A
A
G
T
A
C
C
C
C
G
C
A
24
G
G
T
G
2
6
2
G
G
G
G
G
A
C
G
G
A
A
G
T
G
A
C
T
T
C
T
C
G
G
T
G
T
A
T
C
C
T
C
T
C
A
C
28
T
C
T
6
T
4
G
T
A
A
T
G
C
C
A
G
C
A
T
T
G
A
A
A
G
C
C
C
C
A
G
A
G
T
T
A
C
A
T
G
G
A
A
G
T
G
A
T
C
A
T
T
2
C
T
A
A
A
G
T
C
C
T
C
2
36
A
G
T
A
2
C
T
C
C
T
A
C
T
C
C
T
G
T
5
T
C
A
A
G
T
T
T
C
A
T
T
A
T
G
T
A
G
T
A
C
3
C
A
T
A
G
G
C
3
C
A
T
C
T
A
A
G
A
C
G
G
C
G
A
T
A
T
C
G
G
  113,115,992
  113,117,020
  113,122,125
  113,125,341
  113,125,713
  113,126,277
  113,126,349
  113,128,554
  113,133,497
  113,134,157
  113,134,372
  113,137,089
  113,137,112
  113,137,117
  113,137,407
  113,137,589
  113,146,016
  113,154,253
  113,157,103
  113,157,348
  113,157,585
  113,157,707
  113,158,460
  113,158,586
  113,158,587
  113,158,734
  113,159,552
  113,160,347
  113,160,916
  113,161,779
  113,162,204
  113,162,913
  113,164,006
  113,164,630
  113,164,950
  113,165,425
  113,167,206
  113,167,459
  113,167,691
  113,169,071
  113,169,538
  113,169,587
  113,169,700
  113,169,959
  113,170,073
  113,170,274
  113,170,947
  113,171,016
  113,171,081
  113,171,443
  113,171,569
  113,171,574
  113,172,010
  113,172,046
  113,172,091
  113,172,152
  113,172,306
  113,172,356
  113,172,467
  113,172,535
  113,172,581
  113,173,278
  113,174,827
  113,175,057
  113,175,148
  113,175,180
  113,175,403
  113,175,481
  113,175,739
  113,175,815
  113,176,574
  113,176,765
  113,176,825
  113,176,908
  113,177,355
  113,177,431
  113,177,441
  113,178,244
  113,178,315
  113,179,105
  113,179,447
  113,179,755
  113,179,814
  113,180,330
  113,181,106
  113,182,643
  113,185,211
  113,185,340
  113,185,376
  113,185,715
  113,185,716
  113,186,193
  113,186,447
  113,188,285
  113,188,293
  113,188,497
  113,188,783
  113,189,479
  113,190,007
  113,190,039
  113,190,047
  113,190,098
  113,190,648
  113,190,717
  113,190,986
  113,191,049
  113,191,299
  113,191,826
  113,192,186
  113,192,483
  113,192,675
  113,192,908
  113,193,246
  113,194,275
  113,194,517
  113,194,808
  113,195,160
  113,196,157
  113,196,222
  113,196,307
  113,196,695
  113,197,041
  113,197,868
  113,198,118
  113,198,161
  113,198,208
  113,198,260
  113,198,655
  113,199,161
  113,199,450
  113,200,385
  113,200,605
  113,200,867
  113,201,677
  113,201,872
  113,201,918
  113,202,737
  113,203,613
  113,203,939
  113,206,256
  113,207,266
  113,207,423
  113,207,601
  113,207,946
  113,208,143
  113,208,266
  113,209,157
  113,209,438
  113,209,490
  113,209,613
  113,209,690
  113,210,218
  113,210,894
  113,210,989
  113,212,479
  113,212,910
  113,214,154
  113,215,220
  113,216,126
  113,216,875
  113,217,420
  113,217,569
  113,217,978
  113,218,135
  113,218,416
  113,218,480
  113,218,565
  113,218,578
  113,218,640
  113,219,090
  113,219,294
  113,219,388
  113,219,555
  113,219,617
  113,219,711
  113,220,238
  113,220,342
  113,220,365
  113,220,380
  113,220,415
  113,220,486
  113,220,580
  113,220,668
  113,220,780
  113,220,821
  113,220,822
  113,220,953
  113,221,255
  113,221,337
  113,221,435
  113,221,825
  113,222,108
  113,222,269
  113,222,347
  113,222,429
  113,222,601
  113,222,889
  113,223,150
  113,223,394
  113,223,560
  113,224,040
  113,224,127
  113,224,238
  113,224,393
  113,224,469
  113,224,599
  113,224,841
  113,225,002
  113,225,280
  113,226,273
  113,226,339
  113,226,421
  113,226,479
  113,226,534
  113,226,881
  113,226,959
  113,226,984
  113,227,220
  113,227,258
  113,227,262
  113,227,629
  113,227,649
  113,227,756
  113,227,942
  113,228,100
  113,228,380
  113,228,415
  113,228,428
  113,228,484
  113,228,517
  113,228,587
  113,228,636
  113,228,735
  113,228,787
  113,228,943
  113,229,174
  113,229,303
  113,229,339
  113,229,378
  113,230,203
  113,230,630
  113,230,737
  113,230,855
  113,230,951
  113,231,145
  113,231,383
  113,231,552
  113,231,555
  113,231,593
  113,232,030
  113,232,090
  113,232,320
  113,232,520
  113,232,612
  113,232,718
  113,232,761
  113,232,830
  113,233,110
  113,233,169
  113,233,171
  113,233,256
  113,233,276
  113,233,440
  113,233,915
  113,233,965
  113,234,124
  113,234,308
  113,234,511
  113,234,565
  113,235,051
  113,235,271
  113,235,416
  113,236,002
  113,236,264
  113,236,995
  113,237,189
  113,237,265
  113,237,345
  113,237,372
  113,237,502
  113,237,701
  113,237,707
  113,237,776
  113,237,783
  113,237,784
  113,237,821
  113,237,848
  113,237,855
  113,237,940
  113,237,990
  113,238,014
  113,238,116
  113,238,208
  113,238,423
  113,238,589
  113,238,613
  113,238,777
  113,239,109
  113,239,198
  113,239,274
  113,239,493
  113,239,496
  113,239,498
  113,239,637
  113,239,834
  113,240,018
  113,241,297
  113,242,104
  113,242,930
  113,243,647
  113,243,650
  113,243,706
  113,244,179
  113,244,305
  113,245,875
  113,245,887
  113,246,075
  113,246,259
  113,246,283
  113,246,562
  113,246,715
  113,246,979
  113,249,723
  113,252,839
  113,253,480
  113,253,512
  113,254,667
  113,255,791
  113,257,654
  113,257,668
  113,258,239
  113,258,441
  113,259,007
  113,259,189
  113,260,971
  113,261,418
  113,262,068
  113,262,688
  113,264,838
  113,265,181
  113,266,118
  113,266,135
  113,266,496
  113,267,278
  113,267,462
  113,268,820
  113,270,422
  113,271,792
  113,271,968
  113,272,035
  113,272,498
  113,272,553
  113,272,572
  113,273,249
  113,273,683
  113,274,368
  113,274,533
  113,275,296
  113,277,958
  113,278,137
  113,279,116
  113,280,534
  113,280,787
  113,281,397
  113,282,561
  113,284,306
  113,285,114
  113,285,281
  113,285,534
  113,285,954
  113,286,290
  113,286,552
  113,286,562
  113,286,703
  113,287,111
  113,287,176
  113,287,645
  113,287,659
  113,287,781
  113,287,980
  113,288,184
  113,288,284
  113,288,410
  113,288,516
  113,288,823
  113,289,081
  113,289,727
  113,289,767
  113,289,926
  113,290,399
  113,290,421
  113,290,533
  113,290,757
  113,290,831
  113,290,943
  113,291,078
  113,291,284
  113,291,353
  113,291,558
  113,291,865
  113,292,971
  113,293,170
  113,294,017
  113,294,054
  113,294,069
  113,294,167
  113,296,269
  113,296,716
  113,299,027
  113,299,056
  113,299,549
  113,299,750
  113,299,845
  113,300,070
  113,300,105
  113,300,124
  113,300,215
  113,300,421
  113,300,672
  113,300,875
  113,300,943
  113,315,957
  113,316,177
  113,316,463
  113,317,758
  113,318,274
  113,319,394
  113,320,330
  113,323,384
  113,323,500
  113,326,509
  113,327,345
  113,327,979
  113,328,061
  113,329,049
  113,329,414
  113,330,023
  113,330,488
  113,330,551
  113,330,728
  113,330,963
  113,333,238
  113,333,503
  113,335,052
  113,335,405
  113,335,841
  113,335,875
  113,336,288
  113,336,289
  113,337,195
  113,337,511
  113,338,314
  113,338,597
  113,341,884
  113,345,131
  113,346,303
  113,346,307
  113,351,425
  113,354,348
  113,357,596
  113,363,950
  113,366,226
  113,372,393
  113,380,191
  113,388,563
  113,388,579
  113,395,689
  113,403,414
  113,405,091
  113,405,675
  113,406,614
  113,410,758
  113,410,759
  113,410,767
  113,410,846
  113,410,860
  113,410,894
  113,410,906
  113,410,996
  113,411,017
  113,411,054
  113,411,121
  113,411,151
  113,411,156
  113,411,193
  113,411,202
  113,411,219
  113,411,505
  113,411,510
  113,411,543
  113,411,558
  113,411,591
  113,411,626
  113,411,843
  113,412,188
  113,412,443
  113,412,941
  113,412,944
  113,413,041
  113,413,276
  113,414,773
  113,414,778
  113,414,947
  113,415,055
  113,415,067
  113,415,076
  113,415,326
  113,415,891
  113,415,903
  113,416,029
  113,416,600
  113,416,849
  113,417,108
  113,417,575
  113,418,141
  113,418,258
  113,418,386
  113,419,027
  113,419,769
  113,419,983
  113,420,432
  113,420,750
  113,420,751
  113,421,218
  113,424,753
  113,425,034
  113,425,042
T
T
T
C
A
A
A
2
C
6
-
2
-
2
T
G
C
3/AT
G
T
A
T
G
T/G
A/G
G
G
A/G
G
G
T
C
2
C
A
C
C
2
A
C
G
C
T/A
A
G
T
G
G
-
G
T
T/A
G
C/G
G
G/A
-
A
C
G
-
T
G/A
G
3
A
T
3/-
A
C
T
T
T
T
2
2
A
T
T
2
A
A
A
-
2
G
G/2
G
T
G/C
A/T
3
T
G
G
-
G
G
2
A
A
2
C/T
G
G/A
A
T
4
A
C
-
T
C
G
G
2
-
-
T
T
G
T
T
G
C
C
-
G
T/2
A/-
T
C
C/G
C
C
C
C
T/G
T
G
C
G
-
C
-
C
C
T
G
T
C/T
G/A
G
T/G
T
C
A
C
T
2
C
G
G
4
A
T
A
C
T/C
A
C
2
T
C
T
C
A
A
G
C
A
C
A/G
C
G
G
A
G
A
T
2
C
4/-
T
-
-
G
A
5
6/-
-
A/-
A
A/-
2
C
2
C/2
A
A
T
T
T/G
T
A/G
T
C
C
5/-
A/3
T
C
T
G
A
A
C
G
A
T
2
T/G
C/T
A
A/G
A
C
C
C
C
C
C
A/C
G
C
-
T
T
2
2
G
G/A
2
T
2
T
G
G
C
A
C
C
G/A
C
T
T
A
A
G
C/A
5
-
G/T
T/2
T
C
T/A
G
T
C/T
G
A
T
T
G
G
C
A
C
T/G
C
C
A
T
T
G
A
-
A
G/A
2
2
A
T
T
T
G/2
3
C
T
G
T
G
C
-
G
G
T/G
A
G
C
2
7
T/C
T/2
A/T
T/C
A/G
G
T
4
T
A/2
C
A/G
G
A
G
T
A
C/2
C/A
T
2
T
A/3
-
G/C
A
C
2
2/-
-
-
5
A
A
A
2
G
T
C
A
-
C
2
G
G/A
A/C
T
C
A
T
C
G
A
A
C
G/A
C
G
C
T
T
-
G
C
T
C
G
28/-
A
T
G
-
C
4/-
A
G
T
A/G
G
A
G
A
2
A
T
G
T/2
T/C
C
G
C
T
T
A
3
A
T
G
G/T
-
G/C
C
C
G
T
C
G
A
A
C
A/-
A
A
A
G
T/A
T
G
T/2
A
-
T
T/G
T
2
G
A
C
A
T
C
C/G
2/-
36/-
G
13
G
2
-
G
G
C/G
C/G
C
-
T
A
A
C/3
T/4
G/T
-
-
A
C/T
T
G
A
G
-
C
T
G
C
-
T
A
A
C
G
A
C
G
3
-
2
T
C
G
T
2
T
-
T
G
C
T
C
C
G
A
-
T
A
T
A
2
G
T/3
A/-
C
T
G/A
A