Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 170,234 (bp)   Positions: 282
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.123
.977
.011
.0
.002
.496
.079
.151
.001
.003
.014
.0
.089
.001
.01
.004
--
--
.172
.007
.001
.334
.137
.011
.0
.0
.186
.527
.063
.0
.003
.035
.024
.544
.009
.141
.323
.011
.005
.001
.001
.0
.0
.0
.011
--
.001
.36
.018
.004
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.343
.871
.02
.467
.004
.001
.05
.005
.148
.139
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.116
.015
.002
.0
.023
.105
.083
.0
.013
.001
.055
.009
.003
.008
.004
.0
.003
.027
.269
.456
.113
.146
.161
.001
.297
.012
.24
.093
.075
.096
.19
--
.339
.017
.008
.015
.078
.0
.978
.874
.86
.244
.003
--
--
--
.042
.007
.636
--
--
.006
.001
.003
.075
.015
.006
.093
.129
.104
.069
.004
.063
.02
.031
.159
.006
--
.159
.917
.0
.0
.072
.001
.026
.004
.001
--
.055
.035
.842
.005
.366
.002
.0
.05
.041
.017
.04
.053
.045
.016
.11
.011
.055
.037
.584
.589
.017
.065
--
.84
.059
.056
.022
--
.001
.134
.861
.001
.004
.002
--
--
.061
.004
--
.109
.003
.068
.264
.022
--
.025
.125
--
.011
.062
.01
.0
.987
--
.019
.047
.063
.09
.007
.023
.001
.003
.001
.0
.003
.004
.002
.001
.0
.004
.004
.029
.61
.32
--
.089
--
--
--
.067
--
.02
.023
--
.331
.251
.207
.013
.264
.355
.501
--
.997
.003
.003
.398
.009
.196
.004
.004
--
--
--
.006
.028
.611
.058
--
.653
.657
.067
.112
--
.132
--
.0
.002
.001
.668
.017
--
.131
.63
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
A
G
T
T
T
A
T
T
T
A
T
T
C
G
C
A
T
T
G
C
A
T
C
A
C
T
T
C
C
T
T
T
A
G
C
4
G
C
C
C
T
G
A
T
G
G
A
C
C
T
A
T
G
G
G
2
A
A
T
T
T
T
T
T
G
A
A
T
T
G
C
C
32
28
4
A
G
C
6
T
G
A
15
C
G
T
A
C
C
T
C
T
G
C
G
T
C
A
C
A
A
4
2
54
2
T
T
A
38
G
G
G
4
T
T
A
A
A
T
T
A
T
T
A
G
G
A
T
T
A
A
A
C
G
T
G
A
T
G
C
A
C
C
A
T
C
G
T
A
16
A
C
T
19
T
C
A
T
A
22
A
A
C
C
2
A
C
T
A
A
T
8
A
G
A
G
T
2
T
C
G
C
4
G
G
T
T
A
C
C
C
G
A
C
T
T
C
A
G
C
G
12
T
C
C
T
2
C
A
A
G
C
T
C
T
A
C
T
A
C
C
C
C
C
T
T
T
C
C
C
G
C
T
40
C
T
A
T
A
G
A
A
T
T
A
A
A
T
T
2
A
A
C
C
T
G
G
C
T
A
A
A
A
A
G
C
A
C
G
4
2
2
2
136
T
2
A
3
109
10
C
A
  122,217,884
  122,218,080
  122,218,476
  122,218,487
  122,219,095
  122,219,465
  122,219,667
  122,220,362
  122,223,847
  122,224,210
  122,224,657
  122,225,120
  122,225,204
  122,225,330
  122,227,071
  122,229,633
  122,233,151
  122,233,172
  122,234,452
  122,234,529
  122,234,557
  122,234,888
  122,235,318
  122,235,345
  122,235,651
  122,236,425
  122,237,086
  122,237,256
  122,237,440
  122,238,606
  122,239,919
  122,240,965
  122,241,255
  122,241,322
  122,241,546
  122,241,654
  122,243,385
  122,245,283
  122,246,625
  122,246,933
  122,247,321
  122,247,544
  122,248,051
  122,248,207
  122,249,188
  122,250,051
  122,250,791
  122,251,348
  122,251,519
  122,251,724
  122,254,344
  122,254,433
  122,254,998
  122,255,012
  122,255,236
  122,255,512
  122,256,005
  122,256,015
  122,256,464
  122,256,630
  122,257,127
  122,257,368
  122,257,771
  122,258,526
  122,258,691
  122,259,012
  122,261,066
  122,261,211
  122,261,478
  122,261,973
  122,262,530
  122,263,588
  122,264,733
  122,264,737
  122,264,839
  122,265,060
  122,265,061
  122,265,102
  122,265,125
  122,265,139
  122,265,415
  122,266,053
  122,266,373
  122,266,447
  122,267,232
  122,267,597
  122,268,002
  122,268,022
  122,268,399
  122,268,733
  122,268,838
  122,269,187
  122,269,548
  122,270,084
  122,270,311
  122,270,357
  122,270,451
  122,270,698
  122,271,097
  122,271,729
  122,272,534
  122,272,587
  122,272,672
  122,272,675
  122,272,785
  122,273,254
  122,273,604
  122,273,944
  122,274,694
  122,274,832
  122,275,322
  122,276,034
  122,276,280
  122,276,479
  122,276,943
  122,277,079
  122,277,161
  122,277,286
  122,278,164
  122,278,334
  122,278,438
  122,278,439
  122,279,376
  122,279,429
  122,280,250
  122,280,265
  122,280,273
  122,280,429
  122,280,951
  122,281,091
  122,281,599
  122,281,727
  122,282,153
  122,282,419
  122,282,620
  122,282,908
  122,283,067
  122,283,141
  122,283,874
  122,283,902
  122,284,016
  122,284,331
  122,284,493
  122,284,705
  122,285,590
  122,285,931
  122,286,110
  122,286,428
  122,286,443
  122,287,377
  122,287,806
  122,288,679
  122,288,680
  122,289,849
  122,289,934
  122,291,780
  122,291,834
  122,291,967
  122,293,351
  122,293,595
  122,293,814
  122,294,605
  122,296,107
  122,296,428
  122,296,921
  122,297,043
  122,297,092
  122,297,307
  122,297,897
  122,300,303
  122,300,954
  122,301,155
  122,302,441
  122,302,522
  122,302,662
  122,302,894
  122,303,348
  122,303,700
  122,303,701
  122,305,033
  122,305,152
  122,305,284
  122,305,487
  122,305,563
  122,305,589
  122,307,115
  122,308,049
  122,308,768
  122,311,128
  122,312,205
  122,314,472
  122,316,504
  122,318,306
  122,319,081
  122,319,082
  122,319,580
  122,320,286
  122,321,007
  122,322,661
  122,322,924
  122,323,295
  122,324,175
  122,324,494
  122,325,057
  122,325,829
  122,325,982
  122,327,048
  122,327,357
  122,327,886
  122,330,695
  122,330,912
  122,331,043
  122,331,588
  122,331,659
  122,331,811
  122,331,837
  122,331,923
  122,332,587
  122,333,136
  122,333,718
  122,334,024
  122,334,037
  122,334,083
  122,334,086
  122,334,088
  122,334,090
  122,334,092
  122,334,099
  122,334,151
  122,334,851
  122,337,083
  122,337,764
  122,338,584
  122,339,077
  122,340,172
  122,340,287
  122,340,620
  122,341,535
  122,342,369
  122,343,478
  122,344,201
  122,344,968
  122,346,428
  122,346,871
  122,348,291
  122,348,722
  122,349,198
  122,349,516
  122,349,522
  122,349,531
  122,349,746
  122,350,633
  122,355,014
  122,357,342
  122,357,939
  122,359,254
  122,359,329
  122,359,420
  122,359,421
  122,362,668
  122,362,669
  122,362,670
  122,367,112
  122,368,824
  122,369,125
  122,369,807
  122,373,131
  122,373,701
  122,373,709
  122,375,120
  122,375,122
  122,376,185
  122,377,568
  122,377,910
  122,378,880
  122,378,881
  122,378,882
  122,382,780
  122,385,081
  122,385,268
  122,385,850
  122,385,910
G
A
G
C
C
4
C
C
C
G
C
C
T
A
T
G
C
C
11
T
C
T/-
T
G
T
A
T/7
2
T
C
G
G
G
-
-
-
G/3
T
C/18
T
C
A
G
C
A
A
T
T
T
C
G
C
2
A
C
-
C
G
C
C
G
C
C
G
A
G
G
C
C
A
A
2
32/-
-
-
T
A
T
-
2
A
G
-
G
T
C
G
G
T
C
A
C
A
T
T
C
T
G
T
C
G
-
-
-
-
C
C
-
-
A
A
2
-
C
C
G
G
G
C
C
C
G
A
G
A
A
2
C
6
3
C
G
2
A
C
A
G
C
A
T
-
-
T
-
C
T
A
2
G
-
2
C/2
T/2
-
C
13
17
C
G
22/-
-
G
T
C/2
-
2
A
A
G
G
-
-
2
A
T
5
C
2/-
T/-
T
A
4
-
7
A
C
C
G
T
T
T
A
-
3
7
C
T
A/3
G/11
T
4
-
C
A
T
C
-
T
G
G
A
G
A
2
C
G
A
C
G
T
-
-
A
G
-
A
A
-
5
C/2
A
C/2
C
-
2
T/11
A/-
T/2
C
11
-
G
2
G
9
G
2
-
-
-
-
-
A
T
-
-
-
T
A
G
T
C
T
C
A
A
G
T
T
4/-
2/-
-
-
-
T/2
2/-
A/-
3/-
-
-
11/13
C