Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 170,234 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.123
.011
.0
.002
.58
.011
.0
.003
.915
.003
.014
.0
.089
.021
--
--
.172
.326
.312
.311
.069
.059
.011
.527
.009
.024
.071
--
.007
.248
.462
.0
.0
.0
.018
--
--
.16
.118
--
--
--
--
--
.116
.062
.001
.003
.017
.873
--
.084
--
--
.078
.978
--
.595
.007
.015
.001
.125
.063
--
.282
.917
.0
.081
.072
.001
.004
.001
--
.004
.004
.004
.035
.842
.005
.366
.001
.0
.05
.172
.138
.113
.078
.041
.017
.04
.053
.045
.11
.011
.055
.037
.584
.017
.065
--
.094
.018
--
.022
.034
--
.001
.134
.959
.861
.945
.001
.004
.049
.002
--
--
--
.061
.004
.109
.003
.068
--
.264
.022
--
.025
.125
--
.062
.01
.0
--
--
--
--
.048
.047
.063
.09
.023
.035
.04
.996
.003
.001
.0
.003
.004
.0
.004
.016
.002
.0
.002
.95
.003
.001
.01
.532
.548
.61
--
.01
.041
.32
.309
.901
.258
.119
.123
.094
--
--
.067
.044
.044
.066
.385
.288
--
--
--
.01
.067
.024
.102
.021
.009
.013
.658
.07
.02
.002
.219
--
--
.331
.0
.004
.002
.009
.143
.253
.268
.209
.207
.001
.111
.305
.013
.039
.003
.869
.997
.994
.0
.002
.122
.001
.046
.04
--
.015
.0
.0
.012
.011
.997
.003
.81
.71
.59
.604
.273
.092
.068
.398
.247
.194
.009
.196
.429
--
--
.001
.001
.004
.005
.118
.002
.021
.435
.011
.007
.254
.001
.105
.006
.052
.772
.607
.351
.562
.0
.006
.105
.021
.058
.138
.568
.615
.164
.003
.014
--
--
.101
.004
.224
.005
.007
.005
.04
.487
.223
.065
--
--
.012
.04
.023
--
--
.104
.002
.028
--
.216
.006
--
--
.005
.02
.27
.068
.017
.302
.161
.649
.0
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
Mrtfa
A
T
T
T
A
G
T
C
C
A
T
T
C
G
T
T
G
T
G
C
C
A
A
C
T
A
G
T
A
G
C
A
T
G
C
C
A
A
5
T
4
6
T
8
A
T
G
G
G
A
C
G
4
2
A
T
A
T
T
A
C
T
A
A
A
A
T
C
19
T
10
T
A
C
C
C
A
A
C
C
C
A
C
2
2
T
C
T
A
A
T
8
G
A
G
T
2
C
G
C
A
2
C
T
G
T
A
C
T
C
T
C
G
A
A
T
T
T
T
C
G
C
G
C
12
T
C
C
T
T
A
A
G
A
A
A
A
T
T
A
C
A
T
G
C
C
C
C
C
T
C
C
A
3
A
T
T
G
G
A
T
G
C
G
A
C
T
A
C
G
G
G
A
G
G
T
G
G
2
C
G
G
T
A
T
A
A
G
G
A
5
C
T
C
C
C
G
G
T
G
T
G
G
G
2
A
C
A
G
A
A
A
2
A
T
A
C
C
T
A
G
2
C
A
T
C
A
A
A
T
C
A
A
A
A
G
A
T
T
C
A
G
G
C
A
C
T
G
G
T
C
C
C
G
C
6
G
G
C
G
A
C
T
A
C
T
A
A
T
C
A
A
T
T
A
C
T
A
G
T
A
G
G
T
C
T
G
G
A
2
A
C
T
G
A
C
2
3
T
T
T
C
T
T
G
G
T
12
G
T
A
G
T
  122,217,884
  122,218,476
  122,218,487
  122,219,095
  122,220,006
  122,220,075
  122,220,750
  122,223,166
  122,223,313
  122,224,210
  122,224,657
  122,225,120
  122,225,204
  122,226,704
  122,233,151
  122,233,172
  122,234,452
  122,234,887
  122,234,914
  122,234,916
  122,235,336
  122,235,337
  122,235,345
  122,237,256
  122,238,236
  122,241,255
  122,241,653
  122,242,037
  122,243,304
  122,244,815
  122,244,839
  122,248,051
  122,248,207
  122,248,466
  122,251,519
  122,255,712
  122,257,656
  122,259,589
  122,264,710
  122,264,726
  122,264,839
  122,265,125
  122,265,139
  122,265,458
  122,266,053
  122,268,541
  122,269,270
  122,270,229
  122,272,398
  122,273,457
  122,274,721
  122,275,498
  122,276,280
  122,276,282
  122,277,286
  122,278,334
  122,280,273
  122,280,835
  122,280,951
  122,283,067
  122,283,566
  122,284,015
  122,284,705
  122,286,443
  122,287,186
  122,287,806
  122,288,680
  122,288,763
  122,289,849
  122,289,934
  122,291,866
  122,291,967
  122,293,351
  122,293,473
  122,293,477
  122,293,481
  122,293,814
  122,294,605
  122,296,107
  122,296,428
  122,296,922
  122,297,043
  122,297,092
  122,297,180
  122,297,186
  122,297,199
  122,297,204
  122,297,307
  122,297,897
  122,300,303
  122,300,954
  122,301,155
  122,302,522
  122,302,662
  122,302,894
  122,303,348
  122,303,700
  122,305,033
  122,305,152
  122,305,304
  122,305,522
  122,305,566
  122,306,945
  122,307,115
  122,307,156
  122,308,049
  122,308,768
  122,311,128
  122,311,906
  122,312,205
  122,313,622
  122,314,472
  122,316,504
  122,317,073
  122,318,306
  122,319,074
  122,319,078
  122,319,082
  122,319,580
  122,320,286
  122,322,661
  122,322,924
  122,323,295
  122,323,499
  122,324,175
  122,324,494
  122,325,057
  122,325,829
  122,325,982
  122,327,048
  122,327,886
  122,330,695
  122,330,912
  122,331,435
  122,331,478
  122,331,490
  122,331,594
  122,331,728
  122,331,811
  122,331,837
  122,331,923
  122,333,136
  122,333,179
  122,333,445
  122,333,796
  122,334,024
  122,334,037
  122,334,083
  122,334,086
  122,334,088
  122,334,099
  122,334,151
  122,334,756
  122,334,867
  122,335,689
  122,335,738
  122,336,085
  122,336,186
  122,337,171
  122,337,606
  122,337,740
  122,337,750
  122,337,764
  122,338,441
  122,338,531
  122,338,538
  122,338,584
  122,338,590
  122,339,019
  122,339,474
  122,339,711
  122,340,153
  122,340,183
  122,340,567
  122,340,619
  122,340,680
  122,340,823
  122,340,831
  122,340,854
  122,341,133
  122,341,173
  122,341,346
  122,341,512
  122,341,536
  122,341,796
  122,342,369
  122,342,479
  122,343,187
  122,343,564
  122,343,875
  122,344,197
  122,344,253
  122,344,897
  122,345,279
  122,345,507
  122,345,808
  122,346,427
  122,346,517
  122,346,871
  122,347,835
  122,347,865
  122,347,891
  122,347,968
  122,348,197
  122,348,292
  122,348,306
  122,348,721
  122,348,722
  122,348,815
  122,348,881
  122,349,139
  122,349,198
  122,349,501
  122,350,530
  122,350,597
  122,350,633
  122,350,646
  122,351,143
  122,351,224
  122,351,398
  122,351,894
  122,351,949
  122,352,105
  122,352,136
  122,353,308
  122,353,573
  122,353,904
  122,354,078
  122,354,280
  122,354,543
  122,355,014
  122,356,177
  122,356,184
  122,356,191
  122,356,198
  122,357,077
  122,357,129
  122,357,224
  122,357,939
  122,358,224
  122,358,717
  122,359,254
  122,359,329
  122,359,480
  122,360,184
  122,360,185
  122,361,181
  122,362,008
  122,362,838
  122,362,848
  122,363,173
  122,363,434
  122,363,891
  122,364,150
  122,364,584
  122,364,941
  122,365,413
  122,365,821
  122,366,143
  122,366,352
  122,366,476
  122,366,555
  122,367,061
  122,367,181
  122,369,124
  122,369,274
  122,369,557
  122,369,570
  122,369,583
  122,369,807
  122,369,982
  122,370,290
  122,370,709
  122,371,162
  122,372,070
  122,372,584
  122,372,895
  122,373,131
  122,373,185
  122,373,621
  122,374,128
  122,374,417
  122,374,418
  122,375,085
  122,375,119
  122,375,159
  122,375,578
  122,375,680
  122,375,855
  122,376,185
  122,377,464
  122,377,629
  122,377,708
  122,378,095
  122,378,178
  122,378,787
  122,378,881
  122,378,910
  122,379,294
  122,381,901
  122,383,306
  122,383,488
  122,383,509
  122,383,632
  122,383,952
  122,384,100
  122,384,185
  122,384,245
  122,385,591
  122,385,888
  122,385,904
  122,386,461
  122,387,012
G
G
C
C
G
T
C
T
T
G
C
C
T
A
C
C
5
T/-
G/T
C/T
C/T
A/G
G
2
C
G
3
-
T
G/C
C/G
G
C
A
T
T
G
2
-
T/C
-
-
2
-
G
3
G/3
A
A
-
2
A
4/-
2/-
G
C
2
2
6
G
3
T/2
-
G
C
2
4
2
-
C
-
C
G
C/G
C/G
C/G
-
G
T
2
C/-
2
A
2/-
2/-
T/C
C/A
A
G
G
-
-
A
T
5
C
-
T
A
C/T
A/G
-
3
C
A
C
G
T
T/G
T
T/C
T
A
5
-
T/C
T/C
T/C
C
T
3
T
3
2
-
C
A
G
C
T/-
G
G
A
T
T
C
T
A
C
G
A
G
C
4
T
-
-
A
G
-
-
5
G
-
G
C
C
2
A
G
C
G/A
C/2
A
G
2
C
G
2
A
A
A
5
G/A
G/2
C
A
A
-
G
G/A
A
G
-
G
C
G
A
A
C
-
T
C
T
A
G
G/T
G/2
G
A
C
A
A
A
2/-
A/T
G
G
A
G
A/-
2
2/-
G
C
-
T
T
C
-
T
-
T
22
C
G
C
G
G
C
A
A/-
A/-
A/-
A/-
A
G
C
-
T
G
-
-
T
2
T/4
G
T
A
G
T
T
2
2
3
-
G/A
T
T
C
G
5
6
T
T
G
T
C
C
A
G
5
C
C
G
G
C
G
2
C
G
C
A
C
C/5
9
A
A
G
-
G
T
3
A
2
T
-
-
C
C
G
T
C
C
C
A
C
-
A
2
-
C
A