Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 47,169 (bp)   Positions: 424
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.071
.0
.0
.257
.002
.001
--
--
--
.471
.017
.002
.033
.0
.001
.028
.003
.001
.134
.007
.007
.12
.008
.778
.021
.0
.001
.078
.002
.014
.169
.015
.002
.0
.004
.002
.0
.002
.001
.053
.003
.002
.0
.045
.0
.0
.001
.001
.008
.003
.0
.056
.001
.002
.002
.003
.695
.0
.007
.0
.016
.007
.004
.404
.543
.958
1.0
.663
.08
.748
--
--
--
--
--
.016
.002
.025
.026
.002
.0
.635
.914
.012
.018
.444
--
--
--
.006
.007
.016
.021
.007
.002
.051
.0
.969
.004
.0
.004
.028
.002
.004
.056
.008
.146
.095
.003
.0
.003
.002
.004
.002
.011
.006
.102
.127
.1
.001
.002
.001
.005
.129
.118
.024
.064
.021
.0
.024
.002
.11
.091
.001
.0
.005
.001
.719
.019
.008
.005
.916
.003
.028
.002
--
--
--
--
--
.397
.046
.624
.003
.046
.002
.625
.001
.009
.005
.003
.001
.001
.001
.294
.016
.0
.001
.003
.001
.002
.002
.005
.003
.058
.0
.005
.661
.345
.0
.021
.994
.0
.0
.002
.006
.0
.0
.026
.001
.0
.082
.009
.046
.136
.091
.048
.471
.13
.029
.306
.159
.182
.004
.001
.054
.0
.018
.246
.016
.001
.006
.008
1.0
.096
.004
.007
.014
.007
.001
.017
.016
.002
.002
.001
.005
.43
.021
.002
.06
.009
.146
.003
--
--
--
.077
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.068
.013
.008
.009
.016
.029
.006
.001
.013
.012
.033
.018
.141
.818
.098
.004
.004
.205
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.027
.02
.223
.053
.004
.375
.003
.036
.021
.0
.001
.001
.009
.014
.001
.001
.0
.087
.11
.004
.985
.001
.015
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
Mmrn1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
C
C
A
T
G
C
G
G
A
A
G
T
G
C
A
G
T
G
T
A
G
T
G
C
G
C
T
A
T
T
T
T
A
C
C
G
A
T
G
G
2
C
C
G
T
G
C
G
4
C
A
G
C
2
G
T
T
T
C
G
G
A
T
C
A
C
C
T
C
A
G
C
T
G
A
C
9
A
T
G
T
A
C
A
T
T
A
A
C
C
T
A
T
C
A
G
A
A
T
G
A
A
C
A
A
G
T
G
C
G
C
T
T
C
G
T
C
A
A
6
T
G
C
A
A
C
C
G
G
A
G
T
G
C
G
T
A
A
G
3
A
T
A
C
G
A
T
G
G
T
G
T
C
G
T
A
G
T
A
T
C
G
A
T
T
G
C
T
6
C
G
A
C
T
C
C
G
C
C
T
A
2
T
5
G
T
G
G
G
G
A
T
G
A
G
G
G
T
C
T
T
T
A
G
A
G
G
A
A
G
G
A
G
T
A
A
A
A
A
C
G
T
T
T
C
G
A
G
G
G
G
G
G
T
T
T
T
C
C
G
C
T
A
2
A
2
G
T
G
T
T
A
A
T
A
G
G
C
A
T
C
C
G
A
C
10
T
G
G
C
A
T
C
T
A
T
A
C
C
G
T
T
G
A
T
T
T
A
G
A
T
3
A
13
T
C
G
G
T
T
A
T
A
C
A
G
C
T
C
C
G
G
T
G
G
T
C
T
A
A
A
T
T
T
T
G
A
C
G
A
A
G
T
G
T
C
C
A
C
C
G
T
A
3
17
T
G
G
T
T
T
A
G
C
A
T
A
G
A
C
A
C
A
A
G
T
T
T
T
G
T
G
C
A
G
G
T
T
G
A
A
T
A
C
A
A
A
16
T
T
A
G
A
G
G
G
C
C
A
G
C
G
A
C
G
A
G
C
A
T
G
A
A
T
A
G
34
16
C
C
C
A
  155,798,513
  155,798,880
  155,799,310
  155,799,474
  155,799,697
  155,799,964
  155,800,574
  155,800,663
  155,800,665
  155,800,719
  155,800,767
  155,800,869
  155,801,352
  155,801,536
  155,802,094
  155,802,280
  155,802,763
  155,803,204
  155,803,227
  155,803,327
  155,803,870
  155,803,872
  155,803,882
  155,804,149
  155,804,380
  155,804,523
  155,804,641
  155,805,055
  155,805,315
  155,805,335
  155,805,400
  155,805,737
  155,805,856
  155,805,997
  155,806,013
  155,806,025
  155,806,242
  155,806,496
  155,806,648
  155,806,872
  155,807,046
  155,807,066
  155,807,076
  155,807,236
  155,807,473
  155,807,608
  155,807,755
  155,807,763
  155,807,781
  155,808,303
  155,808,919
  155,809,056
  155,809,224
  155,809,250
  155,809,957
  155,809,958
  155,810,902
  155,811,263
  155,811,614
  155,811,622
  155,812,078
  155,812,152
  155,812,155
  155,812,798
  155,812,891
  155,813,962
  155,814,484
  155,814,592
  155,814,687
  155,814,737
  155,814,788
  155,814,895
  155,814,937
  155,814,950
  155,815,016
  155,815,017
  155,815,332
  155,815,918
  155,815,987
  155,815,997
  155,816,257
  155,816,267
  155,816,384
  155,816,399
  155,816,514
  155,816,515
  155,816,594
  155,816,706
  155,816,751
  155,816,872
  155,816,913
  155,817,056
  155,817,058
  155,817,069
  155,817,303
  155,817,340
  155,817,387
  155,817,466
  155,817,554
  155,817,594
  155,817,867
  155,817,885
  155,818,134
  155,818,242
  155,818,258
  155,818,271
  155,818,302
  155,818,503
  155,818,523
  155,818,623
  155,818,756
  155,818,878
  155,818,917
  155,818,928
  155,818,947
  155,818,954
  155,819,025
  155,819,080
  155,819,095
  155,819,109
  155,819,281
  155,819,284
  155,819,298
  155,819,419
  155,819,479
  155,819,480
  155,819,525
  155,819,533
  155,819,559
  155,819,569
  155,819,586
  155,819,606
  155,819,671
  155,819,680
  155,819,750
  155,819,831
  155,819,838
  155,819,855
  155,819,900
  155,819,929
  155,820,022
  155,820,048
  155,820,255
  155,820,351
  155,820,373
  155,820,395
  155,820,473
  155,820,486
  155,820,490
  155,820,491
  155,820,501
  155,820,579
  155,820,861
  155,820,929
  155,821,089
  155,821,116
  155,821,171
  155,821,324
  155,821,352
  155,821,430
  155,821,459
  155,821,644
  155,821,696
  155,821,705
  155,821,792
  155,821,980
  155,822,069
  155,822,166
  155,822,198
  155,822,214
  155,822,218
  155,822,235
  155,822,259
  155,822,713
  155,822,724
  155,822,817
  155,822,838
  155,823,237
  155,824,361
  155,824,432
  155,824,494
  155,824,667
  155,824,745
  155,825,055
  155,825,057
  155,825,060
  155,825,074
  155,825,233
  155,825,310
  155,825,323
  155,825,405
  155,825,683
  155,825,771
  155,825,795
  155,826,053
  155,826,071
  155,826,217
  155,826,492
  155,826,658
  155,826,674
  155,826,684
  155,826,740
  155,826,784
  155,826,797
  155,826,836
  155,826,850
  155,827,067
  155,827,075
  155,827,095
  155,827,102
  155,827,412
  155,827,518
  155,827,542
  155,827,636
  155,827,773
  155,827,821
  155,827,900
  155,827,905
  155,827,910
  155,827,987
  155,828,001
  155,828,021
  155,828,033
  155,828,060
  155,828,064
  155,828,067
  155,828,070
  155,828,124
  155,828,158
  155,828,190
  155,828,216
  155,828,270
  155,828,361
  155,828,379
  155,828,430
  155,828,571
  155,828,579
  155,828,779
  155,828,934
  155,828,956
  155,828,986
  155,829,027
  155,829,028
  155,829,034
  155,829,101
  155,829,292
  155,829,304
  155,829,344
  155,829,477
  155,829,569
  155,829,587
  155,829,687
  155,829,751
  155,829,839
  155,830,039
  155,830,042
  155,830,155
  155,830,186
  155,830,239
  155,830,247
  155,830,269
  155,830,308
  155,830,327
  155,830,330
  155,830,385
  155,830,386
  155,830,390
  155,830,394
  155,830,406
  155,830,466
  155,830,578
  155,830,658
  155,830,767
  155,830,784
  155,830,812
  155,830,836
  155,830,840
  155,830,895
  155,830,911
  155,830,937
  155,830,967
  155,831,031
  155,831,069
  155,831,070
  155,831,142
  155,831,188
  155,831,311
  155,831,320
  155,831,340
  155,831,406
  155,831,499
  155,831,511
  155,831,591
  155,831,633
  155,831,719
  155,831,969
  155,831,988
  155,832,006
  155,832,125
  155,832,136
  155,832,153
  155,832,159
  155,832,244
  155,832,266
  155,832,407
  155,832,441
  155,832,447
  155,832,483
  155,832,571
  155,832,589
  155,832,644
  155,832,679
  155,832,729
  155,832,738
  155,832,742
  155,832,991
  155,833,006
  155,833,009
  155,833,037
  155,833,094
  155,833,127
  155,833,153
  155,833,157
  155,833,206
  155,833,283
  155,833,308
  155,833,624
  155,833,716
  155,833,829
  155,834,046
  155,834,086
  155,834,391
  155,834,394
  155,834,461
  155,834,464
  155,834,567
  155,834,570
  155,834,592
  155,834,690
  155,834,740
  155,834,803
  155,834,850
  155,834,876
  155,834,937
  155,835,067
  155,835,078
  155,835,084
  155,835,156
  155,835,181
  155,835,187
  155,835,264
  155,835,277
  155,835,284
  155,835,310
  155,835,349
  155,835,351
  155,835,485
  155,835,495
  155,835,505
  155,835,510
  155,835,526
  155,835,549
  155,835,793
  155,835,837
  155,836,000
  155,836,037
  155,836,192
  155,836,288
  155,836,309
  155,836,319
  155,836,378
  155,836,464
  155,836,465
  155,836,505
  155,836,524
  155,836,565
  155,836,628
  155,836,762
  155,836,838
  155,836,856
  155,836,919
  155,836,969
  155,837,047
  155,837,141
  155,837,210
  155,837,233
  155,837,277
  155,837,363
  155,837,371
  155,837,519
  155,837,586
  155,837,604
  155,837,628
  155,837,634
  155,837,654
  155,837,716
  155,837,792
  155,837,825
  155,837,830
  155,837,882
  155,837,905
  155,838,188
  155,838,202
  155,838,376
  155,838,401
  155,838,415
  155,838,465
  155,838,602
  155,838,706
  155,838,787
  155,838,891
  155,838,943
  155,838,949
  155,839,201
  155,839,273
  155,839,385
  155,840,276
  155,840,655
  155,841,224
  155,841,605
  155,841,989
  155,842,900
  155,844,791
  155,845,260
C
G
T
T
-
C
A
9
55
46
5
G
13
C
A
T
G
A
G
A
A
G
A
C
G/4
T
A
T
C
T
-
A
C
C
G
G
T
A
2
G
2
A
-
T
A
A
A
A
A
A
-
T
G
A
7/3
2/-
A
C
C
-
T
2
2
G
2
T
G
A
T
C
2
G
A
G
C
A
G
T
-
-
C
A
A
G
2
T
C
G
G
G
G
G
-
C
C
T
G
A
G
C
C
A
G
2
T
C
2
A
C
A
T
17
T
C
C
G
T
-
T
G
15
-
4
A
T
G
T
A
A
A
A
G
A
C
A
A
A
C
G
G
A
-
G
C
T
A
C
G
C
A
A
C
2
C
A
A
-
T
A
C
T
A
T
T
T
G
5
C
T
C
-
T
T
G
A
-
G
T
A
T
T
C
G
-
A
-
A
G
A
A
A
A
C
G
A
G
A
A
A
C
2
C
27
G
G
A
G
T
A
T
G
C
A
G
A
A
G
C
G
G
G
T
A
2
10
3
22
2
T
A
A
C
A
A
C
G
G
G
2
T
T
T
T
C
4
-
3
-
T
C
T
C
G
G
G
C
G
A
-
T
T
A
T
T
T
G
T
-
G
A
C
T
G
C
T
C
G
C
C
2
T
A
G
A
T
C
C
G
G
T/C
T
3
A
-
T
13/-
C
T
T
T
C
G
T
G
G
T
T
A
T
-
T
T
A
-
C
A
C
C
T
A
G
2
-
5
G
A
2
G/A
2
2
A
G
G
G/A
A
A
C
T
T
G
G
T
A
C
G
-
-
A
A
T
G
C
G
C
A
T
G
C
G
A
G
T
G
T
G
C
C
A
G
C
C
A
C
A
T
G
A
A
C
G
2
G
G
A
G
T
T
7
C
-
C
A
2
A
C
A
T
A
T
T
T
A
T
A
G
T
A
C
2
A
G
A
A
G
G
C
T
C
-
-
G
T
T
2