Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 102,890 (bp)   Positions: 451
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.356
.42
.038
.165
.81
.0
.012
.041
.062
.001
.006
.0
.001
.0
.083
.06
--
.001
.001
.004
.026
.602
.002
.0
.003
.013
.0
.001
.034
.05
.086
--
.002
.0
.004
.005
.163
.001
.006
.085
.086
.016
.044
.121
.99
.001
.136
.004
.038
.022
.117
--
.001
.001
.083
.004
.728
.035
.011
.001
.026
.05
.041
--
--
.001
.002
.0
.045
.003
.238
.299
--
.014
.042
.013
.007
.007
.01
.141
.154
.006
.002
.002
.006
.014
--
.4
.02
.007
.004
.0
.846
.052
.067
.072
.171
.027
.001
.001
.001
.002
.003
.061
.026
.007
.004
.001
.134
.112
.014
.001
.014
.007
.004
.009
.029
.032
.007
.014
.041
.001
.616
.002
.0
.009
.015
.0
.0
.013
.015
.003
.009
.007
.004
.0
.0
.0
.009
.003
.003
.036
.036
.029
.115
.016
.009
.052
.042
.239
.003
.0
.001
.001
.001
.003
.596
.74
.084
.054
.998
.014
.421
.001
.007
.162
--
.009
.053
.001
.005
.025
.056
.001
.006
.77
.0
.003
.017
.001
.0
.002
.001
.002
.006
.003
.0
.0
.012
.006
.001
.041
.167
.022
.006
.075
.061
.001
.007
.002
.001
.092
.095
.123
.108
.002
.09
.0
.132
.001
.013
.005
.412
.002
.167
.018
.265
.093
.005
.033
.3
.019
.001
.03
.0
.0
.0
.0
.014
.001
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.072
--
--
--
--
--
.001
.249
--
.964
.693
.226
--
--
.045
.061
.001
.001
.301
.004
.227
.001
.081
.056
.042
.009
--
--
--
--
--
.0
.004
.001
.002
.687
.061
.022
.016
.022
.002
.001
.397
.005
.002
.66
.017
.005
.032
.037
.022
.017
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
--
--
--
--
--
--
.037
.046
.151
.294
.396
.012
.004
.009
.004
.003
.081
.019
--
--
.005
.079
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.002
.001
.001
.027
.001
.001
.002
.005
.004
.003
.003
.004
.001
.087
.121
.08
.041
.049
.372
.214
.011
.039
.026
.032
.704
.705
.021
.022
.019
.0
.008
.002
.055
.004
.011
.063
.044
.004
.005
.006
.722
.019
.019
.0
.649
.65
.662
.599
.01
.005
.001
.055
.059
.012
.006
.019
.337
.101
.041
.015
.002
.004
.218
.172
.096
.273
--
--
--
--
.034
.013
.014
.028
.853
.002
.002
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
Med12l
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
C
T
C
C
T
G
T
C
C
C
T
C
23
2
G
3
C
G
C
C
T
G
G
T
2
A
G
C
C
G
C
C
G
G
C
9
T
T
T
C
C
G
T
C
G
A
C
C
T
T
T
A
T
G
C
C
A
C
G
G
G
T
12
G
A
T
T
T
4
T
C
3
G
G
G
G
C
A
C
C
G
C
A
G
T
A
G
C
T
G
8
7
A
T
G
G
T
A
T
G
C
2
C
G
T
T
C
T
T
T
T
C
A
C
A
A
T
G
2
C
T
T
C
G
C
A
2
T
T
C
T
C
C
A
T
G
A
T
A
T
T
T
G
G
G
C
T
A
A
A
T
G
4
G
A
C
G
C
C
G
G
G
T
C
T
C
A
5
T
A
A
C
A
C
G
G
2
G
G
T
C
C
A
T
G
C
C
T
G
A
A
T
C
8
A
T
C
G
A
A
A
C
C
T
G
C
T
C
T
A
T
C
A
A
3
C
C
C
G
A
G
T
G
T
A
T
T
T
A
A
G
A
C
C
A
A
T
T
G
A
T
A
A
A
4
C
A
C
G
T
T
T
11
C
A
A
G
G
C
A
C
G
C
G
A
G
C
C
T
3
T
T
T
T
C
C
T
T
T
A
T
C
C
G
A
C
T
T
T
T
T
T
T
C
A
T
T
A
G
T
2
T
T
T
4
C
T
A
T
G
T
A
C
A
2
T
13
G
G
3
G
A
C
T
T
A
A
T
C
C
G
C
G
G
A
T
T
C
C
G
A
G
T
T
T
G
T
C
T
T
A
G
T
A
G
T
T
T
C
A
T
C
2
G
A
A
C
A
4
G
A
A
C
T
G
T
G
G
C
G
G
G
G
T
C
T
A
C
A
7
111
T
A
A
G
C
C
T
A
C
T
G
T
T
T
G
C
C
G
G
T
C
T
C
A
T
T
G
G
T
T
C
A
T
A
T
C
C
G
C
C
G
C
C
A
C
T
T
T
G
T
G
G
18
2
A
C
C
  168,632,592
  168,632,605
  168,632,668
  168,633,183
  168,634,442
  168,635,051
  168,635,569
  168,635,900
  168,636,816
  168,637,099
  168,637,530
  168,637,905
  168,639,260
  168,639,678
  168,640,554
  168,640,687
  168,641,045
  168,641,940
  168,642,427
  168,642,946
  168,643,229
  168,643,477
  168,643,948
  168,644,797
  168,645,079
  168,645,128
  168,645,232
  168,645,420
  168,645,517
  168,646,316
  168,646,440
  168,646,604
  168,646,873
  168,646,944
  168,646,955
  168,647,504
  168,647,695
  168,647,770
  168,650,523
  168,650,573
  168,650,607
  168,651,050
  168,652,227
  168,653,270
  168,653,344
  168,654,635
  168,654,665
  168,655,107
  168,655,459
  168,655,942
  168,656,096
  168,656,846
  168,656,932
  168,656,938
  168,657,578
  168,658,645
  168,659,635
  168,660,841
  168,661,120
  168,661,595
  168,662,463
  168,662,727
  168,664,052
  168,664,815
  168,664,872
  168,665,522
  168,666,762
  168,668,136
  168,669,757
  168,671,010
  168,672,653
  168,672,654
  168,673,279
  168,674,986
  168,675,560
  168,675,562
  168,675,565
  168,675,567
  168,675,570
  168,675,578
  168,675,601
  168,675,611
  168,675,631
  168,675,634
  168,675,643
  168,675,647
  168,676,320
  168,676,456
  168,676,600
  168,676,637
  168,677,252
  168,677,345
  168,677,445
  168,677,903
  168,677,904
  168,678,070
  168,678,079
  168,678,459
  168,678,584
  168,678,712
  168,678,841
  168,679,008
  168,679,132
  168,679,381
  168,679,861
  168,680,470
  168,680,847
  168,681,374
  168,681,631
  168,682,957
  168,682,978
  168,683,046
  168,683,076
  168,684,062
  168,684,548
  168,685,144
  168,685,821
  168,685,840
  168,686,035
  168,686,047
  168,686,053
  168,686,161
  168,686,343
  168,686,557
  168,686,594
  168,686,663
  168,686,732
  168,686,750
  168,686,753
  168,686,904
  168,686,905
  168,686,932
  168,687,414
  168,688,351
  168,688,667
  168,688,868
  168,688,869
  168,688,873
  168,688,947
  168,688,998
  168,689,027
  168,689,380
  168,689,398
  168,689,497
  168,689,668
  168,689,680
  168,689,837
  168,689,908
  168,689,944
  168,690,000
  168,690,247
  168,690,749
  168,690,799
  168,690,800
  168,690,999
  168,691,016
  168,691,060
  168,691,065
  168,691,082
  168,691,090
  168,691,129
  168,691,477
  168,691,673
  168,692,019
  168,692,544
  168,692,553
  168,693,480
  168,694,663
  168,694,772
  168,694,881
  168,694,977
  168,694,990
  168,695,023
  168,695,165
  168,695,387
  168,695,419
  168,695,641
  168,695,656
  168,695,867
  168,696,010
  168,696,095
  168,696,383
  168,696,386
  168,696,393
  168,696,397
  168,696,448
  168,696,509
  168,696,510
  168,697,058
  168,697,266
  168,697,684
  168,697,838
  168,697,910
  168,697,932
  168,698,540
  168,698,597
  168,698,637
  168,698,716
  168,698,766
  168,698,827
  168,699,002
  168,699,144
  168,699,608
  168,699,759
  168,700,102
  168,700,713
  168,701,275
  168,701,306
  168,701,386
  168,701,665
  168,701,801
  168,701,821
  168,701,980
  168,702,366
  168,702,748
  168,702,911
  168,702,938
  168,703,368
  168,703,484
  168,703,569
  168,703,793
  168,703,903
  168,704,109
  168,704,195
  168,704,274
  168,704,375
  168,704,390
  168,704,446
  168,704,587
  168,705,163
  168,705,508
  168,706,689
  168,706,986
  168,707,041
  168,707,169
  168,707,496
  168,707,621
  168,707,751
  168,707,765
  168,708,092
  168,708,151
  168,708,229
  168,708,253
  168,708,324
  168,708,476
  168,708,517
  168,708,610
  168,708,654
  168,708,782
  168,709,259
  168,709,315
  168,709,347
  168,709,373
  168,709,374
  168,709,519
  168,709,542
  168,709,607
  168,709,619
  168,709,651
  168,709,693
  168,709,723
  168,709,820
  168,709,961
  168,709,999
  168,710,007
  168,710,102
  168,710,153
  168,710,321
  168,710,330
  168,710,363
  168,710,371
  168,710,494
  168,710,576
  168,710,584
  168,710,630
  168,710,741
  168,710,751
  168,710,874
  168,711,014
  168,711,053
  168,711,072
  168,711,076
  168,711,097
  168,711,169
  168,711,176
  168,711,239
  168,711,275
  168,711,291
  168,711,307
  168,711,309
  168,711,330
  168,711,359
  168,711,779
  168,711,814
  168,711,858
  168,711,868
  168,711,984
  168,711,990
  168,711,995
  168,711,998
  168,712,000
  168,712,003
  168,712,010
  168,712,036
  168,712,059
  168,712,061
  168,712,103
  168,712,171
  168,712,256
  168,712,274
  168,712,321
  168,719,332
  168,719,350
  168,719,399
  168,719,402
  168,719,427
  168,719,436
  168,719,486
  168,719,534
  168,719,593
  168,719,605
  168,719,616
  168,719,623
  168,719,643
  168,719,681
  168,719,765
  168,719,905
  168,719,917
  168,719,935
  168,719,949
  168,719,950
  168,719,968
  168,719,979
  168,720,040
  168,720,115
  168,720,128
  168,720,132
  168,720,215
  168,720,227
  168,720,231
  168,720,257
  168,720,259
  168,720,296
  168,720,328
  168,720,418
  168,720,430
  168,720,485
  168,720,509
  168,720,618
  168,720,645
  168,720,716
  168,720,742
  168,720,766
  168,720,790
  168,720,816
  168,720,830
  168,720,832
  168,720,841
  168,720,859
  168,720,930
  168,720,955
  168,720,957
  168,721,070
  168,721,074
  168,721,082
  168,721,129
  168,721,165
  168,721,181
  168,721,182
  168,722,149
  168,722,158
  168,722,424
  168,722,475
  168,723,539
  168,723,658
  168,723,659
  168,724,353
  168,724,406
  168,724,411
  168,724,640
  168,724,826
  168,725,079
  168,725,143
  168,725,196
  168,725,253
  168,725,271
  168,725,295
  168,725,613
  168,725,638
  168,725,650
  168,725,818
  168,725,827
  168,726,058
  168,726,066
  168,726,197
  168,726,216
  168,726,285
  168,726,293
  168,726,588
  168,726,621
  168,726,675
  168,726,695
  168,726,803
  168,726,908
  168,726,919
  168,727,103
  168,727,262
  168,727,364
  168,727,430
  168,727,569
  168,727,607
  168,727,642
  168,727,693
  168,727,782
  168,727,833
  168,728,000
  168,728,027
  168,728,389
  168,728,447
  168,728,460
  168,728,463
  168,728,473
  168,728,481
  168,728,538
  168,728,687
  168,728,744
  168,728,778
  168,728,883
  168,728,887
  168,728,895
  168,728,921
  168,729,030
  168,729,037
  168,729,066
  168,729,262
  168,729,302
  168,729,432
  168,729,437
  168,729,445
  168,729,509
  168,730,095
  168,730,112
  168,730,194
  168,730,441
  168,731,063
  168,731,284
  168,731,700
  168,731,748
  168,731,958
  168,732,268
  168,732,315
C
C
-
T
C
T
T
15/17
G/9
C
T
A
-
A
G
-
-
A
-
-
A
T
T
C
A
2
A
-
G
C
G
5
A
T
T
A
A
10
-
T/5
C
C
-
T
A
G
T
A
G
G
T
4
-
C
-
C
A
T
2
C
-
T
A
11
5
-
G/2
G
C
G
9
4/-
-
T
-
3
T
C
T
2
-
2
-
2
G
G
19/11
G
G
T
2
C
5
8/-
7/-
C
C
C
A
C
T
C
A
2
-
G
2
C
G
A
-
A
C
C
A
G
T
G
G
C
C
-
T
C
G
T
A
-
G
2/-
T/-
C
G
C
T
T
G
G
A
G
G
2
C
C
C
A
C
A
T
T/2
C
T
A/2
T/-
A
-
2
2
2
2
T
A
15
2
T
-
T
9/11
T
G
-
G
T
G
T
G
T
-
2
-
T
A
C
T
T
-
C
A
G
A
G
A
C
-
4
T
-
G
A
A
A
G
-
C
T
T
11
A
A
C
T
C
G
C
T
G
5
-
T
3
T
A
T
A
C
C
-
G
C
C
C
3
20
A
G
T
T
G
G
C
A
A
G
C
T
G
G
-
G
-
T
C
2
A
A
-
T
C
G
A
A
T
G
T
A
T
5
G
A
2
T
-
-
G
C
C
-
A
T
C
C
C
G
C
T
2
T
5
T
G
C
C
C
C
C
C
T
G
4
4
C
T
G
-
A
A
C
-
T
G
T
G
A
C
G
T
T
-
G
-
53
A
-
A
T
T
2
C
G
G
A
T
T
A
-
A
C
G
G
C
A
T
A
T
A
C
C
C
A
G
T
C
A
G
C
C
T
A
C
C
C
T
G
G
A
-
A
2
T
T
G
-
2
2
2
T
C
4
C
3
A
T
A
A
T
A
-
T
G
G
T
G
-
-
C
C
T
A
T
T
5
T
T
C
A
-
C
-
A
A
4
T
T
A
G
C
G
C
G
G
T
T
C
3
G
G
C
C
C
T
A
T
T
5
2
8
T
C
-
G
A
C
2
A
T
-
-
-
G
G
G