Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 58,885 (bp)   Positions: 253
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.901
.0
.0
.018
.019
.492
.001
.231
.082
.0
.006
.013
.013
.001
.004
.105
.016
.005
.0
.0
.055
.001
.001
.286
.058
.003
.002
.01
.109
.145
.29
.063
.06
.001
.0
.028
1.0
.614
.003
.001
.076
.004
.38
.085
.082
.053
.001
.0
.0
.0
.039
.991
.0
.0
.002
.093
.263
.306
.037
--
--
--
--
--
.012
.009
.095
--
--
.005
.099
.012
.088
--
--
.006
.011
.005
.0
.08
.001
.887
.507
.029
--
--
--
--
.066
.017
--
.074
.248
.482
.131
.726
.79
.604
.639
.008
.077
.033
.293
.899
.066
.067
.071
.079
.077
.074
.033
--
--
.016
.021
--
--
.001
.936
.0
.0
.004
.001
.053
.068
.299
--
--
--
.122
.102
.066
.07
.772
--
--
--
.002
.129
.562
.142
--
--
--
--
--
--
.018
.003
.027
.11
.018
.007
.0
.001
.003
.045
.152
.001
.002
.008
.0
.0
.003
--
--
--
--
.021
.063
.057
.084
.037
.0
.002
.009
.007
.001
.008
--
--
--
--
.006
.003
--
--
--
--
--
--
--
.16
.004
.015
.875
.001
.005
.01
.007
.016
.003
.32
.024
.025
.002
.001
.104
.345
.0
.003
.013
.008
.998
.021
.0
.0
.001
.001
.806
.013
.012
.049
.003
.061
.102
.052
.11
.066
.001
.002
.003
.01
.0
.0
.026
.001
.0
.002
.0
.014
.003
.02
.0
.0
.0
.0
.029
.0
.005
.949
.196
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
Mdga1
G
C
A
A
A
5
G
A
A
G
C
G
A
A
G
G
A
C
C
G
G
C
A
4
3
A
G
T
7
2
2
4
T
G
A
G
G
A
C
G
G
T
C
A
T
T
A
T
T
A
C
A
T
A
C
C
T
C
T
C
12
4
A
5
T
G
A
A
C
G
A
T
T
3
C
G
A
T
C
A
C
T
C
T
8
4
4
A
A
T
A
C
T
A
G
A
C
C
C
A
T
C
4
T
C
A
A
A
4
2
G
T
T
T
T
T
C
T
C
A
T
2
G
A
A
A
G
A
T
C
G
A
G
T
T
T
A
G
T
G
A
A
G
G
C
A
A
G
A
4
A
A
G
T
T
T
2
A
C
T
A
C
G
A
G
A
A
C
T
G
C
A
A
T
T
C
2
8
T
G
G
T
A
C
5
A
A
T
C
G
A
T
C
A
G
C
T
C
G
T
C
T
T
G
G
A
7
T
A
G
T
4
2
G
C
G
A
C
A
C
A
A
T
G
T
C
G
C
C
2
G
C
T
C
T
C
G
G
C
7
C
C
T
T
A
A
C
G
C
G
G
A
C
  10,708,178
  10,709,344
  10,709,632
  10,711,844
  10,712,038
  10,712,363
  10,713,134
  10,713,757
  10,713,845
  10,714,466
  10,714,657
  10,714,668
  10,714,670
  10,714,684
  10,714,696
  10,714,708
  10,714,721
  10,715,220
  10,715,913
  10,716,474
  10,716,516
  10,716,894
  10,716,931
  10,717,042
  10,717,043
  10,717,244
  10,717,250
  10,717,333
  10,718,357
  10,718,362
  10,718,388
  10,718,858
  10,718,917
  10,718,930
  10,718,931
  10,719,254
  10,719,346
  10,720,536
  10,720,661
  10,720,900
  10,721,344
  10,721,913
  10,722,740
  10,723,868
  10,723,920
  10,723,972
  10,724,078
  10,724,356
  10,724,441
  10,725,186
  10,725,273
  10,726,648
  10,726,884
  10,727,078
  10,727,610
  10,727,831
  10,727,889
  10,727,900
  10,727,923
  10,728,099
  10,728,656
  10,728,682
  10,728,696
  10,728,700
  10,728,931
  10,729,253
  10,729,938
  10,730,761
  10,730,781
  10,730,909
  10,731,223
  10,731,299
  10,731,378
  10,731,607
  10,731,660
  10,732,033
  10,732,669
  10,732,729
  10,732,867
  10,733,494
  10,733,734
  10,733,989
  10,733,999
  10,734,287
  10,734,431
  10,734,484
  10,734,498
  10,734,527
  10,734,569
  10,734,627
  10,734,750
  10,735,459
  10,735,564
  10,735,732
  10,735,776
  10,735,791
  10,735,792
  10,735,842
  10,735,874
  10,735,912
  10,736,210
  10,736,409
  10,736,677
  10,736,708
  10,736,801
  10,736,822
  10,736,823
  10,736,925
  10,736,926
  10,736,928
  10,736,964
  10,737,087
  10,737,190
  10,737,336
  10,737,337
  10,737,629
  10,738,232
  10,738,408
  10,738,721
  10,738,904
  10,738,986
  10,739,012
  10,739,091
  10,739,309
  10,739,397
  10,739,435
  10,739,663
  10,739,742
  10,740,262
  10,740,485
  10,740,813
  10,740,823
  10,740,858
  10,741,116
  10,741,289
  10,741,304
  10,741,327
  10,741,424
  10,741,461
  10,741,528
  10,741,738
  10,741,796
  10,741,835
  10,741,853
  10,741,941
  10,741,944
  10,742,052
  10,742,095
  10,742,158
  10,742,165
  10,742,186
  10,742,304
  10,742,380
  10,742,488
  10,742,490
  10,742,671
  10,742,699
  10,742,773
  10,742,807
  10,742,812
  10,742,816
  10,742,844
  10,742,883
  10,742,988
  10,743,149
  10,743,243
  10,743,260
  10,743,276
  10,743,303
  10,743,371
  10,743,372
  10,743,400
  10,743,716
  10,743,966
  10,744,108
  10,744,379
  10,744,422
  10,744,425
  10,744,858
  10,744,993
  10,745,018
  10,745,044
  10,745,063
  10,745,219
  10,745,361
  10,745,427
  10,745,540
  10,745,655
  10,745,730
  10,745,883
  10,745,885
  10,745,984
  10,746,022
  10,746,265
  10,747,331
  10,748,101
  10,748,677
  10,748,705
  10,749,303
  10,749,325
  10,749,328
  10,749,473
  10,749,719
  10,749,810
  10,749,820
  10,749,835
  10,750,191
  10,750,345
  10,750,418
  10,750,736
  10,751,463
  10,751,698
  10,751,960
  10,752,069
  10,752,151
  10,752,785
  10,752,875
  10,752,891
  10,752,969
  10,753,253
  10,753,457
  10,753,557
  10,753,747
  10,753,803
  10,753,809
  10,753,833
  10,754,482
  10,754,946
  10,755,253
  10,755,610
  10,755,611
  10,756,329
  10,757,321
  10,758,050
  10,758,152
  10,758,162
  10,758,478
  10,758,502
  10,758,551
  10,758,575
  10,758,629
  10,758,693
  10,758,901
  10,759,120
  10,759,522
  10,760,474
  10,760,477
  10,761,177
  10,761,639
  10,761,819
  10,762,728
  10,762,924
  10,764,170
A
T
-
6
G
-
A
G
2
T
G
T
T
C
C
C
T
T
T
A
A
G
C
4/-
3/-
6
G/C
A
-
-
-
-
C
2
2
A
A
G
T
A
-
C
T
3/AT
C
C
G
TC/3
G
T
2
G
G
G
T
A
C
T
-
T
-
4/-
A/C
-
C
4
G
2
3
6
2
C
C
-
18
C
G
G
-
G
T
C
T
C
-
-
-
2
G
-
G
T
C
C
G/T
A/G
C/G
T
T
G
2
T
-
T/C
-
G
T
A/3
4/-
2/-
A
A
C
C
C
6
T
C
T
G
C
-
C
2
4
G
A
T
C
A
C
5
T
C
C
C
-
A
C
A
-
G
A
A
C/-
2
5
14
G
-
G
G
A
16
C
A
-
T
T
C
2
A
-
C
T
2
-
-
-
T
2
G
G
A
C
G
2/-
8/-
C
G/A
G/A
3
-
T
-
C
C
A
T
4
A/4
C
T
G
A
T
C
T
T
C
T
A
C
3
G/C
AC/-
-
2
G
A
C
-
-
A
-
C
G
T
G
3
G
T
7
A
A
-
A
T
T
2/-
G/-
A
C
T
C
G
A
A
T
-
T
T
C
A
G
A/2
C/-
A
G
3
A
G
T