Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 688,901 (bp)   Positions: 348
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
.924
--
.012
.025
--
.076
.006
--
.0
.0
.0
.511
--
.005
--
--
--
--
.004
--
.0
.1
.066
.102
--
.082
.001
.051
.047
.002
.005
.006
.627
.25
.213
.008
.0
.938
.996
.022
.009
.036
.02
--
--
--
--
.011
.028
.007
.002
.27
--
--
--
--
--
--
--
.182
.036
.082
.0
.004
.0
.17
.938
.001
.235
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.038
.007
.166
--
--
.173
.003
.126
.974
.0
--
--
--
--
--
.065
.001
.997
.808
.306
.301
.312
.041
.0
.008
.014
.007
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
1.0
.874
.334
.006
.001
--
.238
.028
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.083
.016
.3
.35
.005
.003
.131
.115
.662
.006
--
--
.0
.001
.0
.007
.347
.128
.213
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.0
.033
.017
.814
1.0
--
--
--
--
--
.016
.001
.0
.0
.321
.955
.993
.001
.999
.83
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.083
.072
.041
.007
.027
.036
.031
.013
.004
.018
.96
.652
.917
.82
.018
.024
.0
.252
.06
--
--
--
--
--
--
--
.093
.008
.865
.316
.168
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.02
.01
.001
.139
.151
.0
.16
.014
.045
.008
.015
--
.024
.037
.002
.021
.0
.0
.002
.01
.037
--
--
--
--
--
.022
.013
.003
--
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.029
.014
.032
.008
--
.002
--
--
--
--
.012
.012
.003
.004
.304
.294
.289
.279
.999
.0
.013
.063
--
--
--
--
.086
--
--
--
.008
.014
.002
.009
.003
.004
.123
.002
.006
.001
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
2
G
G
G
2
6
2
A
A
T
2
T
T
2
G
C
G
6
A
A
2
2
G
2
T
2
A
4
2
4
2
3
A
2
70
A
G
C
C
A
T
A
G
T
A
T
C
T
A
T
T
T
T
T
G
G
G
T
C
28
C
A
A
A
C
7
G
C
G
T
T
3
G
T
8
A
T
T
G
A
G
A
A
G
A
C
C
2
A
A
C
A
2
16
G
T
A
A
T
T
A
C
A
C
A
A
G
G
C
T
C
T
A
T
T
A
T
A
A
G
T
C
C
C
T
G
A
A
C
C
2
T
2
C
29
C
C
G
C
A
G
A
A
A
G
T
G
4
C
G
G
G
C
G
G
A
C
T
G
T
T
G
A
G
A
G
T
T
2
C
G
16
G
12
G
8
3
G
2
T
G
T
G
T
C
A
C
C
G
T
A
C
C
G
A
C
C
G
T
G
A
T
C
A
A
A
T
A
A
A
C
C
T
T
T
C
A
A
G
G
A
A
6
4
2
G
C
G
C
T
T
G
C
G
G
A
C
G
C
T
G
6
4
24
T
C
A
C
C
C
G
T
G
2
G
A
G
A
2
A
12
8
G
A
T
C
T
C
6
G
G
G
T
G
6
2
4
A
T
C
C
C
T
C
2
A
T
G
C
A
2
A
G
G
C
A
G
T
G
A
G
G
T
A
C
C
C
G
T
20
2
T
T
C
14
G
G
C
T
C
G
A
A
5
3
14
A
T
C
G
G
C
8
G
A
G
2
T
T
12
2
C
T
T
A
C
A
  3,484,223
  3,499,242
  3,545,110
  3,548,464
  3,557,712
  3,561,427
  3,579,087
  3,581,627
  3,594,836
  3,604,262
  3,604,362
  3,624,545
  3,641,386
  3,647,881
  3,660,236
  3,681,696
  3,689,497
  3,707,631
  3,737,800
  3,747,820
  3,759,251
  3,771,982
  3,773,896
  3,773,965
  3,786,628
  3,807,791
  3,813,227
  3,813,228
  3,830,838
  3,830,840
  3,842,121
  3,850,312
  3,852,644
  3,855,293
  3,860,246
  3,864,738
  3,884,158
  3,884,449
  3,885,540
  3,886,168
  3,886,368
  3,886,683
  3,886,761
  3,886,922
  3,888,843
  3,889,036
  3,889,510
  3,889,939
  3,890,316
  3,890,384
  3,890,395
  3,890,396
  3,890,853
  3,891,126
  3,891,649
  3,892,288
  3,893,306
  3,893,638
  3,894,497
  3,895,245
  3,896,077
  3,896,191
  3,896,270
  3,896,676
  3,896,801
  3,898,549
  3,899,086
  3,899,740
  3,900,195
  3,901,031
  3,901,598
  3,901,628
  3,901,803
  3,902,358
  3,902,549
  3,902,636
  3,903,763
  3,904,624
  3,907,361
  3,907,647
  3,907,761
  3,907,884
  3,908,301
  3,908,434
  3,910,082
  3,910,132
  3,910,331
  3,910,549
  3,912,196
  3,913,394
  3,913,398
  3,913,401
  3,913,406
  3,913,408
  3,913,701
  3,914,776
  3,915,664
  3,916,326
  3,916,526
  3,916,527
  3,916,557
  3,916,950
  3,917,294
  3,918,128
  3,918,363
  3,918,648
  3,918,912
  3,919,407
  3,919,413
  3,920,148
  3,920,236
  3,920,244
  3,920,269
  3,920,387
  3,920,410
  3,920,483
  3,921,131
  3,921,370
  3,921,448
  3,921,514
  3,921,725
  3,922,606
  3,922,611
  3,922,635
  3,923,222
  3,923,353
  3,923,354
  3,923,703
  3,923,819
  3,923,823
  3,923,828
  3,924,779
  3,924,780
  3,924,782
  3,924,846
  3,925,395
  3,925,885
  3,926,221
  3,926,234
  3,926,396
  3,926,754
  3,927,759
  3,927,848
  3,927,989
  3,928,389
  3,928,509
  3,928,527
  3,928,949
  3,929,231
  3,929,293
  3,929,949
  3,930,881
  3,931,093
  3,931,142
  3,931,145
  3,931,146
  3,931,801
  3,931,990
  3,932,018
  3,932,306
  3,932,456
  3,932,760
  3,932,964
  3,933,147
  3,933,393
  3,933,567
  3,933,799
  3,934,017
  3,934,073
  3,934,659
  3,936,112
  3,941,430
  3,944,875
  3,944,907
  3,946,737
  3,949,035
  3,951,314
  3,952,616
  3,952,657
  3,952,721
  3,953,455
  3,954,180
  3,954,332
  3,954,338
  3,954,570
  3,955,088
  3,955,477
  3,955,709
  3,956,533
  3,957,823
  3,958,223
  3,959,730
  3,959,891
  3,960,407
  3,961,287
  3,961,821
  3,962,822
  3,962,845
  3,963,640
  3,964,965
  3,965,456
  3,965,988
  3,966,129
  3,967,326
  3,968,244
  3,968,685
  3,969,735
  3,970,551
  3,971,286
  3,972,293
  3,972,419
  3,972,568
  3,972,642
  3,972,648
  3,973,288
  3,973,379
  3,973,959
  3,973,990
  3,974,000
  3,976,356
  3,976,781
  3,978,482
  3,979,711
  3,980,461
  3,980,463
  3,980,465
  3,980,940
  3,980,984
  3,980,991
  3,981,015
  3,981,240
  3,981,436
  3,982,574
  3,982,799
  3,982,819
  3,982,867
  3,982,981
  3,984,689
  3,984,850
  3,986,878
  3,988,099
  3,988,846
  3,989,535
  3,989,537
  3,990,446
  3,993,064
  3,993,577
  3,993,906
  3,996,247
  3,997,533
  3,997,952
  4,000,170
  4,002,025
  4,002,665
  4,003,936
  4,004,002
  4,004,016
  4,004,022
  4,004,050
  4,004,149
  4,004,172
  4,004,195
  4,004,247
  4,004,292
  4,004,294
  4,009,723
  4,010,225
  4,011,839
  4,012,018
  4,012,355
  4,012,826
  4,013,670
  4,014,016
  4,014,203
  4,015,934
  4,018,102
  4,018,106
  4,018,625
  4,019,844
  4,019,847
  4,021,530
  4,022,552
  4,023,230
  4,024,412
  4,025,815
  4,025,973
  4,026,520
  4,028,099
  4,028,246
  4,032,307
  4,033,181
  4,033,942
  4,034,631
  4,038,920
  4,039,499
  4,039,523
  4,039,902
  4,040,071
  4,041,406
  4,041,701
  4,042,011
  4,042,247
  4,043,762
  4,045,719
  4,046,048
  4,046,101
  4,047,159
  4,047,402
  4,047,487
  4,047,948
  4,048,354
  4,050,093
  4,051,382
  4,052,914
  4,053,327
  4,054,167
  4,054,186
  4,058,155
  4,059,066
  4,059,206
  4,059,705
  4,060,371
  4,060,776
  4,060,778
  4,060,779
  4,060,781
  4,061,126
  4,061,158
  4,062,776
  4,062,956
  4,064,392
  4,065,235
  4,065,334
  4,065,574
  4,069,421
  4,070,506
  4,070,595
  4,070,663
  4,070,719
  4,072,172
  4,073,910
  4,073,961
  4,074,316
  4,074,317
  4,078,658
  4,079,231
  4,079,837
  4,080,937
T/-
2/-
G/13
G/2
A
2/-
-
2/-
2
-
6
2/-
T/3
T/-
2/-
40
18
2
-
A/-
G
2/-
2/-
A
2/-
T/-
2/-
A/-
4/-
2/-
-
2/-
3/-
-
2/-
70/-
-
T
T
22
A/6
2
2
A
C
G
111
T
C
C
G
A
A
C
C
A
A
3
G
T
-
T
-
G
-
-
-
A
T
15/17
C
2
-
G/3
2
8/-
-
T/-
G
C
G
A
G
C
T
T
T
2
-
4
5
10
3
-
-
A
C
G
T
C
-
T
T
C
G
C
G
9
C
T
C
2
C
C
C
TG/3
G
A
G
C
T
C
A
2
2
A
A
-
2
T
2
2/-
T/-
2/-
C/-
-
T
A
T
-
G
T
T
T
-
A
A
A
4/-
T
T
A
A
T
2
A
G
T
C
T
3
2
T
T
4
G
2
C
C
-
G
A
16/-
G/3
-
T
-
-
A
-
C
A
C
A
-
T
T
T
G
A
A
3
T
A
C
2
T
T
A
-
A
G
C
T
A/3
-
C
C
9
G
C
A
A
C
C
C
2
-
2
A
A
2
T
6/-
4/-
2/-
C
T
T
A
C
G
T
T
A
A
G
2
T
G
2
T
6/-
4/-
24/-
A
A
G
G
A
A
A
C
A
2/-
5
G
7
G
-
G
-
8/-
A
11
C
G
G
A
-
8
3
A
-
A
-
2/-
4/-
A/20
T/37
3
T
T
C
T
-
G
C
G/2
T
T
-
G
2
A
3
G
A
-
C
G
C
2
2
G
T
G
T
A
C
-
-
2
-
T
-
A
C
A
C
T
A
A/-
A/-
5/-
3/-
-
G
G
T
C
G/-
C/2
8/-
2
G
-
-
2
C
-
-
C/2
T/-
C
21
T
G