Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 688,901 (bp)   Positions: 238
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.333
--
--
.023
.025
--
.141
--
--
--
.04
.0
.0
.0
.15
.142
--
--
--
--
--
--
.066
--
.0
.627
.086
.008
.0
.938
.036
.02
--
--
--
--
.011
.028
.007
.002
.27
--
--
--
--
--
--
--
.036
.082
.0
.004
.0
.938
.001
.029
.038
.007
.166
--
.173
.003
.126
.974
.0
.001
.997
.808
.306
.301
.312
.041
.0
.008
.014
.007
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
1.0
.874
.334
.006
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.083
.016
.3
.35
.005
.003
.131
.115
.662
.006
--
--
.0
.007
.128
.213
.012
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
1.0
.0
.017
.814
1.0
--
--
--
--
--
.001
.0
.0
.321
.955
.993
.001
.999
.83
--
--
--
--
--
--
--
.007
.027
.036
.031
.013
.004
.018
.96
.652
.917
.82
.024
.0
.252
.06
--
--
.093
.008
.865
.316
.168
.0
.02
.01
.001
.0
.16
.014
.045
.002
.021
.0
.0
.002
.01
.037
--
--
--
--
.022
.013
.003
.002
.0
--
--
--
--
--
--
--
.029
.014
.032
.008
.002
--
--
--
--
.012
.012
.003
.004
.013
.063
.086
--
.014
.003
.123
.006
.001
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
Mctp1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
T
T
G
C
G
A
C
T
T
A
T
C
G
T
C
A
G
T
6
A
G
C
T
A
T
A
G
C
A
G
T
A
T
C
T
A
T
T
T
T
T
G
G
G
T
C
C
A
A
A
C
G
C
T
G
A
G
A
G
A
C
C
2
G
T
A
A
T
T
A
C
A
C
A
A
C
T
A
T
T
A
A
G
C
T
G
C
G
C
A
G
A
A
A
G
T
G
G
G
G
C
G
G
A
C
T
G
T
T
G
A
G
A
G
T
T
2
C
G
12
G
3
G
2
T
G
T
C
A
C
C
G
T
A
C
C
G
C
C
G
T
G
A
T
C
A
A
T
A
A
A
C
C
T
T
T
C
G
G
A
A
G
C
G
C
T
T
G
C
G
G
A
G
C
T
G
C
C
C
C
G
T
G
T
C
T
C
G
G
T
G
C
C
C
T
C
2
A
T
C
A
2
A
G
G
A
G
T
A
G
T
A
C
C
G
T
20
2
T
C
14
G
G
C
T
C
G
T
C
G
A
T
C
T
C
A
  3,481,861
  3,490,804
  3,525,087
  3,532,881
  3,557,712
  3,560,662
  3,569,029
  3,594,836
  3,601,413
  3,601,415
  3,603,392
  3,604,262
  3,604,362
  3,638,797
  3,646,180
  3,646,181
  3,668,122
  3,692,119
  3,707,631
  3,728,977
  3,737,800
  3,759,251
  3,773,965
  3,812,233
  3,840,675
  3,855,293
  3,859,489
  3,884,158
  3,884,449
  3,885,540
  3,886,761
  3,886,922
  3,888,843
  3,889,036
  3,889,510
  3,889,939
  3,890,316
  3,890,384
  3,890,395
  3,890,396
  3,890,853
  3,891,126
  3,891,649
  3,892,288
  3,893,306
  3,893,638
  3,894,497
  3,895,245
  3,896,191
  3,896,270
  3,896,676
  3,896,801
  3,898,549
  3,899,740
  3,900,195
  3,907,361
  3,907,647
  3,907,761
  3,907,884
  3,908,434
  3,910,082
  3,910,132
  3,910,331
  3,910,549
  3,912,196
  3,914,776
  3,915,664
  3,916,326
  3,916,526
  3,916,527
  3,916,557
  3,916,950
  3,917,294
  3,918,128
  3,918,363
  3,918,648
  3,918,912
  3,920,148
  3,920,236
  3,920,387
  3,920,410
  3,921,370
  3,921,448
  3,921,514
  3,921,725
  3,922,635
  3,923,353
  3,923,354
  3,926,221
  3,926,234
  3,926,396
  3,926,754
  3,927,759
  3,927,848
  3,927,989
  3,928,389
  3,928,509
  3,928,527
  3,928,949
  3,929,949
  3,930,881
  3,931,093
  3,931,142
  3,931,145
  3,931,146
  3,931,801
  3,931,990
  3,932,018
  3,932,306
  3,932,456
  3,932,760
  3,932,964
  3,933,147
  3,933,393
  3,933,567
  3,933,799
  3,934,017
  3,934,073
  3,934,659
  3,936,112
  3,941,430
  3,946,737
  3,949,035
  3,952,616
  3,952,657
  3,952,721
  3,953,455
  3,954,180
  3,954,332
  3,955,088
  3,955,477
  3,955,709
  3,956,533
  3,957,823
  3,958,223
  3,959,730
  3,959,891
  3,960,407
  3,961,287
  3,962,822
  3,962,845
  3,963,640
  3,964,965
  3,965,456
  3,965,988
  3,966,129
  3,967,326
  3,968,685
  3,969,735
  3,970,551
  3,971,286
  3,972,293
  3,972,419
  3,972,568
  3,972,642
  3,972,648
  3,973,288
  3,973,379
  3,973,959
  3,976,356
  3,976,781
  3,978,482
  3,979,711
  3,980,940
  3,980,984
  3,980,991
  3,981,015
  3,981,240
  3,981,436
  3,982,574
  3,982,799
  3,982,819
  3,982,867
  3,982,981
  3,984,850
  3,986,878
  3,988,099
  3,988,846
  3,993,577
  3,996,247
  3,997,533
  3,997,952
  4,000,170
  4,002,025
  4,002,665
  4,009,723
  4,010,225
  4,011,839
  4,012,018
  4,013,670
  4,014,016
  4,014,203
  4,015,934
  4,021,530
  4,022,552
  4,023,230
  4,024,412
  4,025,815
  4,025,973
  4,026,520
  4,028,099
  4,032,307
  4,033,181
  4,033,942
  4,034,631
  4,038,920
  4,039,499
  4,039,902
  4,040,071
  4,041,406
  4,042,011
  4,043,762
  4,045,719
  4,046,048
  4,047,159
  4,047,402
  4,047,487
  4,047,948
  4,048,354
  4,050,093
  4,052,914
  4,053,327
  4,054,167
  4,054,186
  4,058,155
  4,059,066
  4,059,206
  4,059,705
  4,060,371
  4,062,776
  4,062,956
  4,069,421
  4,070,506
  4,072,172
  4,074,316
  4,078,658
  4,079,837
  4,080,937
A/-
C/2
T/2
T/C
A
C/2
G/2
2
C/2
T/4
T/A
-
T/6
C/T
G/2
T/-
C/2
A/-
2
T/-
-
A/G
G/A
C/G
T/-
-
T/A
-
T
T
A/2
A
C
G
111
T
C
C
G
A
A
C
C
A
G/A
3
G
T
T
-
G
-
-
A
T
G
C
G
A
C
T
T
T
2
-
A
C
G
T
C
-
T
T
C
G
A/C
G
T
C
C
C
T/A
G
C
T
2
A
A
A
T
-
G
G/T
T
T
-
A
A
A
T
A
A
T
2
A
G
C/T
C
T
3
2
T
T
4
G
2
C
C
-
G
A
12/-
T
-
A
-
C
A
T/C
C/T
T
T
G
A
A
3
T
A
C
T
T
A
-
A
G
C
T
-
C
C
9
G
A/C
A
A
C
C
C
2
A
A
A/2
T
C
T
T
A
T/C
G
T
T
A
A
G
T
G
T/2
T
A
G
A
A
A
C
A
C
G
G
A
3
G/A
-
A
3
T
T
C
T
-
G
C
T
T
2/-
G
2
A
A/G
A
-
G
2
2
G
C/G
C/T
G/A
C
-
-
-
T
-
G/A
C
A
C
T
G/A
G
T
G/2
G
C
C/2
T/C
T
G