Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 83,356 (bp)   Positions: 243
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.025
1.0
.999
.02
.992
.004
.0
.0
.0
.648
.999
.001
1.0
.006
.01
.0
.052
.007
.003
.004
.047
--
--
.088
.001
--
--
--
--
1.0
.024
.01
.0
.0
.301
.013
.251
--
--
.006
.03
.0
.006
.001
.012
.001
.003
.155
.043
.351
.357
.11
--
--
.039
.017
.883
.533
.762
.015
.003
.001
.003
.129
.0
.009
.0
.513
.453
.035
.315
.023
.002
.989
.56
.419
.002
.058
.684
.086
.295
.317
.017
.525
.113
.104
.007
.015
.111
.278
--
--
.035
.016
.104
.176
.058
.88
.121
.009
.0
.035
.666
.112
.105
.372
.009
.003
.274
--
.002
.023
.007
.537
.512
.0
.001
.003
.011
--
--
.007
.566
.269
.012
.001
.112
.12
.022
.0
.025
.0
.005
.021
.048
.002
.024
.0
.108
.001
.044
.058
--
.076
.088
.175
.07
.02
.043
.556
.389
.049
--
--
.002
.096
.008
.004
.009
.448
--
--
--
--
--
.109
.938
.985
.958
.021
.237
.344
.2
.207
.388
.706
.195
.184
.314
.552
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.03
.013
.005
.008
.584
.018
.043
.024
.03
.057
.046
.129
.405
.469
.037
.058
.142
.028
.036
.009
.147
.046
.027
.017
.136
.43
.016
.003
.005
.013
.003
.151
.156
.065
.026
.015
.016
.008
.001
.051
.001
.0
.006
.009
.002
.002
.0
.839
.004
.01
.005
.058
.0
.058
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
Mapk8
G
G
G
A
A
G
T
T
A
4
G
C
T
C
T
A
31
T
G
A
T
5
31
G
T
C
T
G
G
G
G
G
T
C
G
A
C
T
C
A
T
G
T
C
2
G
G
T
C
3
2
C
G
A
A
G
A
G
A
C
A
T
G
T
G
A
C
A
C
T
C
2
C
A
T
T
G
3
3
G
T
C
6
A
2
T
C
T
T
A
C
G
A
T
G
A
A
A
T
A
G
A
C
G
G
T
A
G
C
C
C
C
T
A
C
A
C
G
G
G
A
G
A
G
G
G
A
C
G
C
T
A
T
G
C
A
5
G
T
2
T
C
G
A
T
C
2
T
C
G
C
T
2
C
T
G
2
G
A
A
T
C
T
C
T
53
A
5
C
C
C
T
T
A
C
G
G
T
T
T
G
A
C
A
G
A
A
G
C
G
T
A
A
2
G
G
C
C
A
C
2
T
A
A
A
G
T
C
A
T
A
A
G
G
G
T
A
2
A
C
2
10
G
C
T
T
G
G
A
T
A
A
11
C
C
G
A
G
3
T
A
T
G
  11,579,733
  11,580,162
  11,580,216
  11,580,525
  11,580,543
  11,581,099
  11,581,361
  11,581,549
  11,582,202
  11,582,366
  11,582,982
  11,583,151
  11,583,679
  11,584,503
  11,584,679
  11,584,720
  11,585,281
  11,585,530
  11,585,724
  11,586,006
  11,586,675
  11,586,938
  11,586,945
  11,587,086
  11,589,040
  11,589,308
  11,589,409
  11,589,459
  11,589,460
  11,590,197
  11,590,386
  11,590,585
  11,590,675
  11,590,899
  11,591,096
  11,595,322
  11,595,476
  11,595,501
  11,595,553
  11,595,633
  11,595,771
  11,596,198
  11,596,539
  11,597,203
  11,597,643
  11,597,985
  11,597,987
  11,598,071
  11,598,077
  11,601,254
  11,601,255
  11,601,656
  11,601,916
  11,601,951
  11,603,538
  11,603,873
  11,603,981
  11,604,142
  11,604,147
  11,604,912
  11,604,924
  11,604,963
  11,605,043
  11,605,498
  11,606,547
  11,606,646
  11,606,736
  11,608,496
  11,609,085
  11,609,214
  11,609,259
  11,609,552
  11,609,654
  11,611,424
  11,611,433
  11,611,444
  11,611,479
  11,611,650
  11,611,665
  11,611,800
  11,611,838
  11,612,722
  11,613,501
  11,614,163
  11,614,441
  11,614,442
  11,614,992
  11,615,059
  11,615,096
  11,615,406
  11,622,361
  11,622,418
  11,622,529
  11,623,554
  11,623,803
  11,624,495
  11,624,840
  11,624,875
  11,625,595
  11,625,624
  11,625,761
  11,625,769
  11,627,318
  11,627,670
  11,627,762
  11,628,416
  11,628,515
  11,628,563
  11,629,143
  11,629,380
  11,629,636
  11,630,250
  11,630,283
  11,630,435
  11,630,439
  11,630,568
  11,630,570
  11,630,768
  11,630,811
  11,630,845
  11,630,848
  11,631,160
  11,631,688
  11,631,832
  11,632,014
  11,632,068
  11,632,211
  11,632,215
  11,632,273
  11,632,455
  11,632,487
  11,632,534
  11,632,593
  11,632,957
  11,632,963
  11,633,029
  11,633,043
  11,633,193
  11,633,466
  11,633,780
  11,633,836
  11,633,958
  11,634,209
  11,634,299
  11,634,302
  11,634,475
  11,634,997
  11,635,001
  11,635,326
  11,635,370
  11,635,757
  11,635,966
  11,637,506
  11,637,510
  11,637,599
  11,638,252
  11,638,370
  11,638,371
  11,638,415
  11,638,509
  11,639,437
  11,639,814
  11,640,086
  11,640,088
  11,640,298
  11,640,652
  11,640,890
  11,641,011
  11,641,784
  11,643,175
  11,643,185
  11,643,370
  11,643,791
  11,643,792
  11,643,805
  11,644,044
  11,644,341
  11,644,478
  11,644,832
  11,644,936
  11,645,650
  11,645,748
  11,645,890
  11,646,035
  11,646,086
  11,646,147
  11,647,267
  11,647,417
  11,647,978
  11,648,207
  11,648,827
  11,649,616
  11,649,804
  11,649,927
  11,650,328
  11,651,371
  11,651,432
  11,651,472
  11,651,878
  11,651,941
  11,652,257
  11,652,816
  11,653,064
  11,653,327
  11,653,513
  11,653,599
  11,653,790
  11,654,159
  11,654,405
  11,655,392
  11,655,470
  11,655,730
  11,655,874
  11,656,378
  11,656,465
  11,656,517
  11,656,533
  11,656,539
  11,656,698
  11,656,816
  11,656,841
  11,656,844
  11,656,886
  11,656,891
  11,656,901
  11,657,116
  11,657,378
  11,658,415
  11,658,543
  11,658,742
  11,658,769
  11,659,001
  11,659,263
  11,660,076
  11,660,367
  11,661,437
  11,661,638
  11,661,709
  11,661,792
  11,662,008
  11,662,056
  11,662,380
  11,662,459
2
C
A
G
C
A
C
7
-
-
T
G
2
A
C
21
-
C
A
T
A
-
-
A
C
T
C
G/2
?
A
A
A
C
T
C
G
A
G
G
5
A
A
A
T
-
A
A
G
T
3/-
2/-
G
G/-
7
C
4
C
A
T
T
G
G
A
8
T
T
T
T
T
A
A
-
2
G
C
C
A
-
-
A
C
T
-
G
2/-
T/-
T
C
C
G
C/-
2
T
C
A
G
G
-
C
G
A
G
T
A
A
C
G
A
T
T
T
T
C
-
2
-
2
A
A
-
2
A
C
C
2
T
G
3
C
G
A
T
C
2
T
6
-
A
2
-
G
T
4
-
2
T
-
2
A
A
T
2
2/-
C/-
C
A
-
G/-
T
G
A
9
A
T
A
-
2
-
A
A
T
C
-
C
T
C
A
C
A
C
-
G
2
G
C
G
G
C
T
T
2
G
9
-
A
A
A
T
T
2
-
C
G
G
C
T
C
2
3/4
5
-
T
A
A
A
A
G
-
G
T
-
-
2
G
7
G
A
A
-
C
C
2
-
T
T
A
G
A
-
G
5
C
C