Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 189,902 (bp)   Positions: 312
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.015
.002
.019
.0
.001
.006
.329
.053
.0
.0
.003
.0
.018
--
.04
.017
.003
.146
.127
.0
.003
.011
.012
.014
.017
.021
.011
.362
.002
.021
.009
.001
.001
.013
.0
.0
.011
.001
.0
.0
.0
.001
.003
.028
.251
.003
.705
.012
.533
.011
.815
.004
.001
.033
.091
.027
.033
.319
.006
.109
.001
.145
.009
.001
.007
.0
.016
.796
.975
.38
.244
.039
.001
.001
.001
.003
.002
.012
.006
.061
.022
.019
.028
.003
.011
.007
.054
.02
.937
.048
.002
.158
.013
.017
.002
.184
.022
.004
.006
.005
.015
.0
.008
.299
.003
.036
.003
.007
.024
.014
.013
--
--
--
.028
--
--
.017
.001
.141
.004
.002
.071
.026
.98
.0
.015
.567
.0
.112
.33
.068
.001
.019
.0
.001
.042
.001
.12
.001
.98
.058
.865
.111
.0
.0
.004
.001
.001
.006
.002
.0
.005
.069
.0
.092
.112
.01
.164
.218
--
--
--
--
.002
.001
.032
.995
--
--
--
--
.007
.002
.341
.0
.092
.001
.011
.006
.056
.058
.009
.013
.184
.053
.002
.005
.33
.012
.002
.156
.024
.202
.003
.012
.017
.008
.089
.007
.048
--
--
--
.124
.002
.001
.0
.309
.014
.08
.035
.017
.002
.078
.001
--
--
.05
.767
.001
.0
.001
.006
.0
.003
.157
.0
.011
.051
--
--
.011
.896
.004
.02
.373
.072
.179
.008
.001
.0
.002
.018
.021
.008
.006
.001
.001
.0
.001
.003
.002
.001
.059
.081
.012
.011
.003
.001
.022
.287
.008
.001
.002
.003
.09
--
.001
.0
.001
.001
.001
.007
.019
.001
.004
.004
.0
.004
.003
.134
.294
.344
.021
.009
.013
.01
.009
.048
--
.008
.0
.025
.013
.002
.003
.036
.001
.014
.037
.255
.003
.003
.002
.088
.796
.153
.001
.037
.001
.214
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
G
G
C
C
T
A
G
T
G
A
C
C
A
C
G
T
T
T
T
T
T
C
G
C
A
G
T
G
A
C
A
T
A
T
C
G
A
C
G
A
A
C
C
C
C
A
A
C
C
T
A
C
4
G
T
T
T
C
T
C
C
C
T
C
A
T
T
20
A
A
A
C
T
C
G
G
T
A
G
T
T
C
G
G
A
G
C
T
T
T
C
C
C
T
C
5
A
A
C
T
T
C
A
C
T
C
A
A
3
10
G
C
G
C
A
G
A
A
C
T
G
A
C
A
G
A
G
C
G
A
A
T
A
C
G
T
C
C
G
G
T
A
T
C
C
G
A
A
3
T
C
G
A
G
T
A
G
C
C
A
G
T
A
C
A
G
A
C
T
C
C
C
G
A
C
G
C
G
T
C
A
G
C
G
G
A
G
A
G
C
T
C
G
3
G
G
A
C
C
T
T
T
T
G
T
T
T
G
A
C
C
A
C
T
4
T
T
G
C
A
T
G
C
2
2
13
A
2
A
G
A
A
C
G
T
T
A
A
T
T
T
C
T
A
A
C
C
A
C
C
C
A
T
C
G
A
A
9
T
3
3
A
G
T
A
G
G
C
G
T
A
A
A
A
T
G
T
A
A
T
C
C
A
T
T
T
A
A
C
A
G
C
C
T
T
C
G
C
A
C
G
C
T
C
T
C
A
A
T
G
G
C
  37,015,151
  37,015,155
  37,015,463
  37,015,816
  37,016,202
  37,016,994
  37,017,094
  37,017,384
  37,017,517
  37,017,553
  37,017,783
  37,017,989
  37,018,216
  37,018,983
  37,021,788
  37,022,034
  37,023,749
  37,023,857
  37,024,024
  37,024,070
  37,024,114
  37,024,260
  37,024,261
  37,024,313
  37,024,321
  37,024,440
  37,024,683
  37,025,043
  37,025,462
  37,025,527
  37,025,731
  37,026,143
  37,026,545
  37,027,229
  37,028,379
  37,029,413
  37,029,496
  37,029,623
  37,029,759
  37,029,814
  37,030,004
  37,030,069
  37,030,403
  37,030,454
  37,030,466
  37,030,665
  37,030,832
  37,031,070
  37,031,403
  37,031,483
  37,031,694
  37,032,496
  37,032,667
  37,033,035
  37,033,267
  37,033,314
  37,035,251
  37,035,684
  37,036,207
  37,036,846
  37,037,002
  37,037,705
  37,037,848
  37,038,008
  37,041,119
  37,041,137
  37,041,169
  37,043,587
  37,044,729
  37,049,193
  37,049,207
  37,049,901
  37,050,907
  37,051,072
  37,051,224
  37,052,907
  37,053,405
  37,053,927
  37,054,041
  37,055,442
  37,055,781
  37,056,063
  37,056,208
  37,056,265
  37,056,431
  37,056,500
  37,056,542
  37,057,137
  37,057,388
  37,057,792
  37,057,898
  37,058,552
  37,059,731
  37,060,230
  37,060,281
  37,060,291
  37,060,337
  37,060,593
  37,060,757
  37,060,776
  37,060,808
  37,060,838
  37,061,873
  37,062,060
  37,062,086
  37,062,318
  37,062,537
  37,062,588
  37,063,405
  37,063,410
  37,063,801
  37,063,927
  37,063,940
  37,064,962
  37,065,180
  37,066,766
  37,066,795
  37,067,032
  37,068,384
  37,068,669
  37,069,702
  37,070,553
  37,071,066
  37,071,580
  37,071,720
  37,073,217
  37,073,295
  37,074,886
  37,075,773
  37,076,576
  37,076,997
  37,079,685
  37,081,969
  37,083,638
  37,088,413
  37,089,010
  37,089,402
  37,089,862
  37,090,452
  37,090,692
  37,091,042
  37,091,146
  37,091,333
  37,092,496
  37,092,891
  37,093,344
  37,093,354
  37,093,360
  37,093,667
  37,093,749
  37,094,958
  37,095,235
  37,095,246
  37,096,417
  37,097,475
  37,097,951
  37,098,093
  37,099,411
  37,102,138
  37,102,931
  37,103,370
  37,103,416
  37,103,511
  37,104,108
  37,104,570
  37,104,741
  37,105,382
  37,105,522
  37,105,764
  37,105,999
  37,106,272
  37,106,333
  37,106,604
  37,107,406
  37,107,457
  37,107,541
  37,115,141
  37,115,404
  37,115,427
  37,116,009
  37,116,193
  37,116,317
  37,116,573
  37,116,575
  37,116,694
  37,116,709
  37,116,984
  37,116,993
  37,117,025
  37,117,123
  37,117,180
  37,117,313
  37,117,519
  37,117,667
  37,117,693
  37,117,711
  37,117,731
  37,117,794
  37,117,876
  37,117,920
  37,118,010
  37,118,805
  37,119,063
  37,119,176
  37,120,402
  37,120,471
  37,120,680
  37,120,704
  37,121,250
  37,121,717
  37,122,339
  37,122,428
  37,123,308
  37,124,081
  37,124,779
  37,126,298
  37,128,690
  37,128,811
  37,130,428
  37,131,790
  37,134,880
  37,135,063
  37,136,632
  37,137,231
  37,138,269
  37,138,579
  37,138,689
  37,138,936
  37,139,911
  37,140,459
  37,142,982
  37,143,556
  37,144,217
  37,145,255
  37,145,828
  37,146,338
  37,146,919
  37,149,208
  37,149,283
  37,149,307
  37,150,036
  37,150,294
  37,151,398
  37,153,928
  37,154,253
  37,154,523
  37,154,568
  37,156,888
  37,156,889
  37,156,891
  37,156,904
  37,157,006
  37,157,699
  37,158,150
  37,158,452
  37,158,614
  37,159,879
  37,159,891
  37,160,706
  37,161,621
  37,162,523
  37,163,203
  37,163,727
  37,163,859
  37,164,035
  37,164,667
  37,165,317
  37,175,478
  37,175,889
  37,177,095
  37,178,059
  37,178,180
  37,178,275
  37,178,608
  37,178,639
  37,179,472
  37,179,490
  37,181,099
  37,181,173
  37,182,698
  37,183,215
  37,183,761
  37,183,787
  37,183,901
  37,184,031
  37,184,044
  37,184,049
  37,185,379
  37,186,269
  37,187,402
  37,187,761
  37,188,078
  37,189,521
  37,189,640
  37,189,713
  37,190,172
  37,190,376
  37,191,277
  37,194,342
  37,194,672
  37,194,995
  37,195,599
  37,196,726
  37,197,238
  37,197,798
  37,200,261
  37,200,314
  37,200,931
  37,201,419
  37,201,485
  37,202,047
  37,204,205
A
T
T
T
C
G
C
T/C
C
A/8
A
G
G
T
2
C
A
T/-
C
G
C
C/T
G/A
A
A/2
A
A
2
G
T
T
2
C
C
A
A
T
T
T
G
G
T
C/T
8
T
-
G
T
T
A
C
C/T
-
A
C
C
C
T
C
C/T
T
T
C
T
A/3
T/C
T/C
-
G
-
-
C/2
C
A
C
A
C
G
2
C
C
T
C
C
G
A
A
G
A
G
T
2
T
C
G
-
G
G
A
C
C
-
A/G
T
C
A
2
G
3/-
-
A
C/-
G/3
G
G
C
G
G
T
C
A
G
A
G
-
G
G/A
T
A
G
A/-
C
G
3
2
C
T
G
T
A
C
G
C
C/T
G
A
C
G
-
C
T
T
G
A
G
A/2
G/2
T
C/3
G
-
G
A/G
3
3
G/2
G
T
T/2
T
C/T
A
T
A/G
T
A
T
A
A
T
G
3
C/A
G/A
A
T
C
G
G/7
T
C
T
A
-
A
C
G
C/T
G
C
C
T/A
C
A
C
C
C
A
A/G
19
T
A/G
A
C
4/-
C
C
T
T
T
G
G/-
T
-
2/-
-
G
-
-
A
C
G
T
-
C
T/C
T
C
G
C
C
T
C
A/T
T
C/A
G
G
A
A
T
G
G
T
5
T
-
-
C
3/-
-
G
A
C
G
A
G/A
21
T
C
G
C
G
G
4
T
C
G
G
A
T
T
C
2
C
C
G
G
T
G
A
A
A
-
4
T
A
T
G
T
A
C/T
C
T
C
C/T
T
G
C
T
T
3