Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 189,902 (bp)   Positions: 334
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.001
.097
1.0
.006
.329
.053
.0
.0
.003
.0
.018
.004
--
--
.513
.008
.011
.009
.017
.348
.003
.146
.025
.003
.021
.011
.362
.104
.046
.002
.009
.002
.001
.061
.013
.104
--
.014
.028
.002
.021
.002
.001
.0
.0
.028
.013
.964
.044
.004
.027
.004
.167
.005
.083
.854
.052
.046
.092
.003
.006
.001
.006
.668
.001
.001
.007
.0
.796
.779
.975
.057
.001
.003
.815
.38
.244
.002
.116
.002
.001
.001
--
.058
.456
.752
.001
.002
.001
.001
.0
.04
.009
.012
.003
.006
.029
.001
.009
.227
.004
.069
.061
.004
.028
.003
.011
.054
.02
.937
.048
.002
.158
.013
.017
.002
.184
.022
.004
.0
.0
.006
.005
.015
.0
.055
.008
.299
.003
.036
.003
.007
.024
.014
.013
--
--
--
--
--
--
--
.306
.028
--
--
.01
.017
.061
.011
.001
.055
.01
.045
.004
.016
.004
.542
.002
.071
.026
.98
.054
.0
.002
--
--
--
--
.023
.068
.038
.009
.019
.006
.001
.005
.009
.019
.0
.006
.001
.02
.0
.001
.042
.01
.014
.004
.0
.059
.865
.001
.16
.0
.004
.001
.0
.001
.006
.0
.001
.001
.001
.001
.0
.008
.001
.002
.006
.007
.005
.625
.006
.001
.001
.001
.002
.0
.092
.006
.011
.015
.017
.113
--
--
--
--
--
--
.002
.001
.032
--
--
--
--
--
.007
--
--
.0
.001
.002
.341
.0
.001
.001
.011
.004
.022
.004
.157
.167
.202
.007
.048
--
--
--
.011
.124
.007
.002
.001
.014
.035
.017
.048
.002
.078
.002
--
--
--
.001
--
--
.05
.767
.005
.001
.0
.106
.001
.006
.0
.003
.157
.0
.0
.001
.011
.051
--
--
--
--
.011
.896
.117
.122
.004
.02
.373
.072
.179
.008
.001
.0
.002
.019
.002
.142
.018
--
--
--
--
.021
.008
.006
.021
.003
.003
.002
.021
.344
.337
.059
.008
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
Man1a1
C
G
T
T
G
A
G
T
G
A
C
C
A
T
8
C
T
C
C
C
T
G
T
T
T
T
G
T
G
C
C
A
A
T
A
C
T
G
5
T
A
G
C
G
C
C
A
C
G
T
G
C
T
C
6
A
C
C
A
C
A
G
T
C
T
A
3
C
A
T
20
18
A
A
A
T
C
A
A
C
T
G
T
C
2
C
8
4
T
T
C
A
G
G
A
A
T
T
C
C
G
A
3
C
T
T
G
G
A
C
T
T
T
C
C
C
T
C
5
A
A
C
C
C
T
T
C
20
A
C
T
C
A
A
3
10
G
4
6
A
C
G
A
C
4
A
G
A
T
A
G
G
C
C
18
C
G
16
C
T
A
C
A
G
C
A
C
20
16
A
A
T
T
C
A
T
C
A
C
A
C
C
A
3
A
G
T
C
16
2
A
C
T
T
C
T
G
A
A
A
3
T
2
A
A
A
G
G
A
C
C
A
C
A
T
C
T
2
A
A
T
A
C
T
C
C
C
G
C
A
G
T
C
A
G
A
T
T
C
C
C
G
C
C
C
C
A
C
G
A
G
T
G
C
C
C
C
3
T
T
T
C
4
T
T
T
T
T
C
A
C
C
T
4
C
A
A
A
T
T
G
C
A
C
T
G
C
C
2
2
13
A
2
A
G
A
G
A
A
A
A
C
G
2
T
T
T
A
A
T
T
T
C
T
C
A
G
A
16
T
3
29
A
C
C
11
3
4
A
C
T
2
2
6
  37,015,816
  37,015,820
  37,016,202
  37,016,244
  37,016,753
  37,016,994
  37,017,094
  37,017,384
  37,017,517
  37,017,553
  37,017,783
  37,017,989
  37,018,216
  37,018,807
  37,018,828
  37,018,983
  37,019,271
  37,019,430
  37,021,511
  37,022,009
  37,022,034
  37,023,579
  37,023,749
  37,023,857
  37,023,972
  37,024,114
  37,024,440
  37,024,683
  37,025,043
  37,025,177
  37,025,349
  37,025,462
  37,025,731
  37,026,540
  37,026,545
  37,027,161
  37,027,229
  37,027,284
  37,027,568
  37,027,797
  37,028,158
  37,028,281
  37,028,541
  37,028,836
  37,029,014
  37,029,144
  37,029,814
  37,030,454
  37,031,110
  37,031,684
  37,032,373
  37,032,496
  37,033,314
  37,033,334
  37,033,652
  37,033,935
  37,033,945
  37,033,987
  37,034,277
  37,034,591
  37,034,947
  37,035,829
  37,036,207
  37,036,571
  37,036,748
  37,037,288
  37,037,858
  37,039,635
  37,041,119
  37,041,137
  37,043,587
  37,043,589
  37,044,729
  37,045,618
  37,047,376
  37,047,377
  37,048,544
  37,049,193
  37,049,207
  37,050,121
  37,050,524
  37,050,814
  37,050,907
  37,051,072
  37,051,659
  37,053,123
  37,053,155
  37,053,159
  37,053,264
  37,053,405
  37,053,487
  37,053,488
  37,053,628
  37,053,755
  37,053,800
  37,053,927
  37,053,978
  37,053,992
  37,054,187
  37,054,242
  37,054,274
  37,054,333
  37,054,695
  37,055,430
  37,055,442
  37,055,714
  37,056,208
  37,056,265
  37,056,431
  37,056,542
  37,057,137
  37,057,388
  37,057,792
  37,057,898
  37,058,552
  37,059,731
  37,060,230
  37,060,281
  37,060,291
  37,060,337
  37,060,593
  37,060,748
  37,060,751
  37,060,757
  37,060,776
  37,060,808
  37,060,838
  37,060,911
  37,061,873
  37,062,060
  37,062,086
  37,062,318
  37,062,537
  37,062,588
  37,063,405
  37,063,410
  37,063,801
  37,063,851
  37,063,852
  37,063,924
  37,063,927
  37,063,940
  37,064,514
  37,064,962
  37,065,132
  37,065,180
  37,066,766
  37,066,795
  37,066,945
  37,067,032
  37,067,238
  37,067,356
  37,067,523
  37,068,455
  37,068,589
  37,068,634
  37,069,088
  37,069,318
  37,069,880
  37,069,943
  37,070,553
  37,071,066
  37,071,580
  37,071,720
  37,071,780
  37,073,217
  37,077,716
  37,078,483
  37,078,513
  37,078,829
  37,078,880
  37,079,109
  37,079,685
  37,079,947
  37,080,457
  37,081,518
  37,081,804
  37,081,969
  37,082,948
  37,083,151
  37,083,638
  37,084,750
  37,084,996
  37,085,813
  37,087,274
  37,088,413
  37,089,010
  37,089,402
  37,089,686
  37,090,072
  37,090,432
  37,090,779
  37,090,893
  37,091,333
  37,092,266
  37,092,560
  37,093,344
  37,093,354
  37,093,360
  37,093,384
  37,093,667
  37,093,749
  37,093,961
  37,093,972
  37,093,978
  37,093,986
  37,093,988
  37,093,990
  37,094,519
  37,094,883
  37,094,958
  37,095,125
  37,095,191
  37,095,246
  37,095,432
  37,096,505
  37,096,760
  37,096,764
  37,096,766
  37,096,991
  37,097,475
  37,097,951
  37,099,020
  37,099,089
  37,100,279
  37,101,187
  37,102,132
  37,103,370
  37,103,513
  37,103,820
  37,103,823
  37,103,839
  37,104,108
  37,104,570
  37,104,741
  37,105,382
  37,105,764
  37,106,012
  37,106,098
  37,106,272
  37,106,333
  37,106,604
  37,106,712
  37,106,725
  37,107,021
  37,107,023
  37,107,406
  37,107,457
  37,107,541
  37,115,225
  37,115,404
  37,115,427
  37,116,381
  37,116,964
  37,117,230
  37,117,312
  37,117,649
  37,117,667
  37,117,920
  37,118,010
  37,118,805
  37,119,670
  37,120,143
  37,120,319
  37,120,402
  37,120,443
  37,120,471
  37,120,680
  37,121,717
  37,122,428
  37,123,308
  37,123,990
  37,124,081
  37,124,779
  37,124,821
  37,125,192
  37,125,196
  37,125,199
  37,126,298
  37,128,690
  37,128,811
  37,130,428
  37,131,790
  37,133,549
  37,134,880
  37,135,063
  37,135,442
  37,136,632
  37,137,231
  37,138,269
  37,138,579
  37,138,689
  37,138,936
  37,138,937
  37,139,094
  37,139,911
  37,140,459
  37,142,022
  37,142,982
  37,143,055
  37,143,556
  37,144,217
  37,145,255
  37,145,557
  37,145,558
  37,145,828
  37,146,338
  37,146,919
  37,149,208
  37,149,283
  37,149,307
  37,150,036
  37,150,294
  37,151,398
  37,151,449
  37,152,616
  37,153,269
  37,153,928
  37,153,958
  37,154,044
  37,154,174
  37,154,188
  37,154,253
  37,154,523
  37,154,568
  37,156,488
  37,159,854
  37,161,624
  37,161,974
  37,162,123
  37,191,385
  37,197,014
  37,199,101
  37,201,574
T
A
C
C
2
G
C
C
C
8
A
G
G
5
-
T
C
G
T
T
C
A
A
-
2
C
A
A
2
T
T
G
T
G
C
2
C
2
5/-
C
G
A
T
A
T
T
G
8
A
2
G/19
T
C
T
-
2
2
T
G
T
G
9
C
T
19
9
-
G
3
C
20/-
-
G
2
A/2
T/-
2
-
-
6
C
A
C
A
2/-
A
8/-
4/-
G
C
T
G
C
A
T
G
2
4/6
A
T
A
T
-
T
C
C
C
C
G
A
G
A
G
T
2
T
C
G
-
G
G
2
T
A
C
C
-
20/-
G
T
C
A
3
G
-
-
A
4/-
6/-
-
-
3
-
G
-
G
C
G
C
G
2
4
T
A
-
T
A
-
T
C
G
A
G
-
T
G
A
-
-
2
G
-
C
T
G
3/4
C/5
G
2
G
3
7
G
-
G
2
C
T
-
-
G
G
2
C
T
C
A
C
G
G
-
C
-
C
7
11
A
A
27
T
T
-
A
G
C
T
A
-
4
G
G
2
A
A
T
T
9
-
T
G
C
C
3
2
3
G
-
C
T
T
A
T
C/2
5/CA
T
T
G
T
A
G
A
A
C
-
T
T
T
-
C
C
C
A
-
C
C
A
C
C
19
G
A
T
C
-
5/6
2
2
3
C
C
T
T
T
C/-
G
-
C/12
T
-
-
-
G
2/-
A/-
5
-
A
A/G
C
G
G
T
-
-
T/-
C
C
T
C
G
C
C
T
C
T
2
2
T
-
16
-
-
T
A
G
-
-
-
A/-
C/2
3
2/-
2/-
-