Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 250,132 (bp)   Positions: 456
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.645
.002
.002
.03
.028
.558
.562
.0
.029
.046
.991
1.0
.995
.995
.0
.014
.004
.005
.123
.0
.001
.0
.003
.001
.002
.0
.104
.006
.009
.976
.005
.002
.051
.001
.003
.018
.975
.508
.048
.004
.001
.546
.003
.004
.001
.0
.0
.068
.007
.002
.0
.001
.604
.0
.188
.01
.001
.283
.003
.0
.002
.158
.002
.0
.0
.024
.0
.004
.022
.0
.004
--
--
.116
.001
.001
.91
.467
.003
--
.002
.0
.001
.001
.001
.002
.094
--
.068
.749
.002
.066
.062
.08
.664
.105
.067
.028
.126
.059
.607
.594
.047
.008
.001
.001
.008
.002
.001
.005
.002
.002
.968
.046
.0
.001
.001
.046
.033
.005
.001
.001
.001
.015
.0
.003
.002
.013
.042
.892
.579
.006
.004
.001
.0
.002
.014
.016
.0
.006
.001
.027
.004
.008
.018
.05
.693
.185
.09
.0
.156
.036
.494
.158
.005
.05
.012
.082
.001
.015
.035
.07
--
.013
.023
--
.012
.007
.342
.041
.002
.098
.007
.0
.023
.033
.0
.007
.005
.133
.013
.001
.242
.244
.244
.081
.005
.006
.001
.093
.002
.068
.068
.225
.055
.22
.746
.0
.006
.001
.0
--
.0
.01
.001
.064
.047
.001
.002
.002
.659
.136
.011
--
.047
.742
.007
--
.052
.013
.005
.019
.001
.333
.079
.001
.0
.0
.006
.786
.001
.002
.001
.001
.018
.017
--
--
--
.001
.098
.999
.161
.121
.001
--
.02
.04
.001
.0
.0
.589
.01
.004
.009
.0
--
--
.088
.756
.001
.017
.039
.0
.035
.017
.005
.137
.0
.004
.105
.003
.332
.012
.002
.297
.705
.0
.0
.0
.001
.018
.077
.0
.004
.195
.147
.002
.011
.0
.014
.259
.05
.001
.001
.003
.999
.004
.684
.0
.001
.057
--
.318
.016
.003
.594
.0
.071
.001
.763
.992
.024
.033
.001
.009
.361
.33
.0
.011
.0
.06
.0
.227
.012
.212
.011
.035
.0
.044
--
--
--
--
--
.245
.006
.002
.99
.002
.017
.006
.853
.889
.66
.042
.282
.009
.001
.16
.002
.001
.001
.002
.0
.754
.003
.022
.419
.002
.006
.006
.003
.023
.7
.525
.868
.001
.024
.299
.754
.71
.032
.023
.015
.078
.0
.006
.0
.322
.104
.003
.0
.001
.0
.003
.026
.042
.042
.002
.0
.033
.001
.003
.0
.002
.003
.0
.811
.002
.003
.0
.058
.007
.003
.004
.273
.0
.017
.001
.123
.02
.0
.0
.372
.0
.101
.006
.001
.0
.0
.02
.086
.008
.0
.003
.021
.0
.054
.158
.251
.001
.053
.001
.0
.005
.029
.003
.165
.068
.041
.155
.004
.006
--
.004
.848
.856
.005
.063
.004
.0
.099
.0
.32
.084
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
Maml3
2
T
G
G
T
A
T
A
T
C
6
C
A
C
G
A
A
A
T
C
C
G
G
T
C
A
G
G
G
A
A
C
C
A
A
T
T
C
G
A
G
T
C
C
C
G
T
A
T
C
A
A
T
T
G
C
T
G
G
G
A
G
C
A
C
C
G
G
T
C
T
T
G
C
A
A
T
T
G
A
G
G
C
T
G
G
G
A
C
T
C
G
T
T
G
A
A
G
A
G
T
4
C
C
T
A
32
T
G
C
A
C
A
A
A
C
A
T
4
55
T
C
C
A
T
C
G
A
T
G
C
G
C
A
C
4
T
A
A
A
A
G
T
C
T
A
A
G
T
G
A
T
G
2
A
A
T
A
G
C
C
A
111
G
G
T
C
A
T
T
C
T
T
T
C
A
G
T
G
A
C
G
G
A
A
A
G
A
G
C
C
T
A
G
T
G
T
G
T
C
A
T
C
G
T
A
T
T
C
G
C
G
G
A
A
T
A
T
T
T
C
G
G
T
A
A
C
A
A
A
2
A
C
G
20
A
G
T
A
C
G
G
C
C
G
C
A
G
G
G
C
A
C
G
C
G
T
A
G
A
G
T
C
2
A
C
G
A
G
A
T
T
G
C
C
A
A
C
C
C
C
T
G
A
C
G
A
C
A
A
A
A
A
T
C
C
C
A
T
T
A
G
A
C
T
3
A
G
T
A
G
A
G
2
C
A
G
C
G
G
A
A
C
T
A
A
T
C
G
A
A
A
A
G
G
C
G
C
T
A
A
G
T
A
G
C
T
A
C
A
A
G
A
T
A
T
A
G
C
C
C
A
T
G
T
A
G
G
G
A
C
T
A
A
C
7
G
G
T
G
4
C
A
A
A
C
G
12
A
T
C
C
C
G
A
A
G
G
G
2
T
C
G
G
C
C
G
T
G
C
12
C
G
T
T
T
T
A
T
A
G
A
G
G
G
C
A
T
T
T
C
T
T
A
T
G
A
4
A
T
A
4
A
T
G
C
G
T
T
C
T
T
T
A
A
A
  160,210,612
  160,210,915
  160,211,094
  160,211,121
  160,211,503
  160,211,967
  160,211,986
  160,212,329
  160,212,777
  160,213,418
  160,217,723
  160,717,161
  160,717,687
  160,717,930
  160,717,991
  160,718,300
  160,719,261
  160,719,471
  160,720,078
  160,721,611
  160,722,183
  160,722,548
  160,722,862
  160,722,880
  160,724,241
  160,726,495
  160,726,985
  160,727,103
  160,728,329
  160,728,911
  160,731,493
  160,731,593
  160,731,625
  160,731,892
  160,732,117
  160,733,635
  160,734,183
  160,734,270
  160,734,554
  160,734,712
  160,734,716
  160,735,830
  160,736,311
  160,736,450
  160,736,490
  160,736,592
  160,737,313
  160,737,630
  160,737,806
  160,738,100
  160,738,329
  160,738,474
  160,740,448
  160,740,501
  160,741,192
  160,743,165
  160,743,968
  160,744,382
  160,744,402
  160,744,560
  160,744,868
  160,744,965
  160,745,630
  160,745,692
  160,746,049
  160,746,343
  160,747,756
  160,747,767
  160,747,899
  160,749,145
  160,749,171
  160,751,229
  160,751,230
  160,753,590
  160,754,112
  160,755,300
  160,755,560
  160,755,909
  160,756,108
  160,757,211
  160,758,374
  160,759,562
  160,761,104
  160,761,226
  160,761,235
  160,764,201
  160,768,863
  160,770,384
  160,773,976
  160,776,201
  160,777,599
  160,780,096
  160,781,435
  160,781,515
  160,781,548
  160,781,675
  160,781,738
  160,781,742
  160,781,770
  160,781,977
  160,782,552
  160,782,553
  160,782,642
  160,782,713
  160,782,772
  160,782,805
  160,783,014
  160,783,090
  160,783,165
  160,783,181
  160,783,526
  160,783,696
  160,783,798
  160,784,007
  160,784,058
  160,784,130
  160,784,326
  160,784,885
  160,784,973
  160,784,979
  160,786,277
  160,786,416
  160,786,446
  160,786,696
  160,787,174
  160,787,229
  160,787,269
  160,787,562
  160,787,577
  160,787,663
  160,787,686
  160,787,911
  160,788,335
  160,788,447
  160,788,451
  160,788,495
  160,788,564
  160,788,567
  160,788,619
  160,788,962
  160,789,190
  160,789,396
  160,789,423
  160,789,477
  160,790,170
  160,790,192
  160,790,595
  160,790,712
  160,790,997
  160,791,503
  160,791,603
  160,791,793
  160,791,830
  160,791,842
  160,791,876
  160,792,173
  160,792,440
  160,792,448
  160,792,603
  160,792,727
  160,793,017
  160,793,261
  160,793,265
  160,793,459
  160,793,648
  160,793,703
  160,794,091
  160,794,161
  160,794,544
  160,794,624
  160,794,832
  160,794,857
  160,795,089
  160,795,094
  160,795,541
  160,795,672
  160,795,850
  160,796,157
  160,796,461
  160,796,826
  160,797,069
  160,797,206
  160,797,644
  160,797,645
  160,797,849
  160,797,867
  160,797,997
  160,798,235
  160,798,408
  160,798,683
  160,798,918
  160,799,226
  160,799,227
  160,799,586
  160,799,868
  160,800,020
  160,800,095
  160,800,502
  160,800,514
  160,801,267
  160,801,517
  160,802,204
  160,802,419
  160,803,279
  160,803,534
  160,803,983
  160,803,991
  160,804,026
  160,804,436
  160,804,483
  160,804,613
  160,804,731
  160,804,891
  160,805,272
  160,805,423
  160,805,636
  160,807,754
  160,808,503
  160,809,101
  160,809,876
  160,810,244
  160,810,474
  160,810,576
  160,810,710
  160,812,527
  160,813,065
  160,813,207
  160,813,308
  160,813,594
  160,814,357
  160,814,623
  160,814,625
  160,814,708
  160,816,243
  160,816,770
  160,816,849
  160,817,063
  160,817,125
  160,817,491
  160,818,510
  160,819,970
  160,820,443
  160,822,681
  160,823,402
  160,823,429
  160,824,314
  160,824,873
  160,825,503
  160,825,783
  160,825,813
  160,825,837
  160,826,130
  160,826,339
  160,826,437
  160,826,976
  160,827,626
  160,828,663
  160,828,740
  160,829,237
  160,829,611
  160,829,777
  160,830,691
  160,830,692
  160,830,710
  160,831,173
  160,831,216
  160,831,218
  160,831,302
  160,831,993
  160,832,765
  160,832,979
  160,833,102
  160,833,567
  160,833,978
  160,834,270
  160,834,399
  160,834,418
  160,834,505
  160,834,582
  160,834,766
  160,834,878
  160,835,020
  160,835,178
  160,836,060
  160,836,361
  160,836,442
  160,836,656
  160,839,032
  160,839,045
  160,839,220
  160,839,871
  160,840,239
  160,840,400
  160,840,550
  160,840,732
  160,841,143
  160,842,194
  160,842,388
  160,842,665
  160,843,071
  160,843,207
  160,843,301
  160,843,434
  160,843,493
  160,843,803
  160,843,838
  160,846,104
  160,846,778
  160,847,427
  160,847,746
  160,848,018
  160,848,168
  160,848,572
  160,849,656
  160,849,682
  160,850,038
  160,850,553
  160,850,706
  160,850,864
  160,851,024
  160,851,222
  160,851,289
  160,851,304
  160,851,330
  160,851,538
  160,851,554
  160,851,650
  160,851,960
  160,852,476
  160,853,206
  160,853,525
  160,853,528
  160,854,647
  160,854,674
  160,854,697
  160,854,982
  160,855,372
  160,855,645
  160,856,098
  160,856,983
  160,857,090
  160,857,773
  160,858,322
  160,858,451
  160,858,605
  160,858,918
  160,859,207
  160,859,583
  160,859,587
  160,860,273
  160,860,604
  160,860,617
  160,860,619
  160,860,852
  160,861,171
  160,861,430
  160,862,045
  160,862,082
  160,862,168
  160,862,310
  160,862,695
  160,862,957
  160,863,195
  160,863,326
  160,863,947
  160,864,116
  160,864,120
  160,864,679
  160,865,262
  160,867,241
  160,869,607
  160,870,559
  160,871,867
  160,871,921
  160,871,922
  160,871,982
  160,872,549
  160,872,876
  160,872,925
  160,873,925
  160,874,932
  160,878,102
  160,879,466
  160,879,529
  160,879,815
  160,880,948
  160,881,820
  160,881,878
  160,882,026
  160,882,228
  160,882,627
  160,882,740
  160,883,868
  160,883,942
  160,883,997
  160,884,128
  160,884,240
  160,884,259
  160,884,384
  160,884,441
  160,884,513
  160,884,745
  160,885,161
  160,885,276
  160,885,282
  160,885,292
  160,885,446
  160,885,705
  160,885,993
  160,886,067
  160,886,413
  160,886,758
  160,886,828
  160,886,904
  160,887,431
  160,887,710
  160,890,493
  160,890,541
  160,890,746
  160,890,772
  160,891,123
  160,891,266
  160,891,720
  160,891,789
  160,891,833
  160,894,777
  160,895,540
  160,897,638
  160,900,272
  160,901,389
  160,902,387
  160,902,766
  160,902,789
  160,902,921
  160,903,598
  160,903,689
  160,903,708
  160,903,804
  160,905,666
  160,918,552
  160,920,377
  160,922,928
  160,926,729
  160,931,502
  160,931,681
  160,932,751
  160,937,940
  160,937,941
  160,938,384
  160,943,088
  160,943,607
  160,944,710
  160,945,837
  160,949,563
  160,955,901
  160,958,102
-
-
A
A
T/2
G
C
G
T/2
T
6/-
T
G
A
A
T
G
G
-
T
T
A
C
G
A
G
2
A
A
G
G
C/T
T
G
G
T/5
C
T
A
A/-
G/2
T/C
T
T
T
A
C
A/G
C
T
G
2
C
C
-
T
A
G/T
G/T
A
G
A
T
G
T
T
A
A
C
2
C
C
A
G
G
G
T/-
T/16
G/A
A/G
3
A
C/T
G
G/-
G/5
G/T
G
T
G
3
A
C
C
G/12
G
19
A
G
T
T/C
-
T
T
C
G
32/-
11
A
T
T
T
G
G
C
T
G
C
-
-
C
T
2
C
C
T
A
G
C
A
C/T
7
A
G
-
-
C
G
A/C
G
A/C
A
A
G
C
T
G
T
G
T
A/2
C
T
-
2
G
C
C
C
T
T
-
-
2
A
C
-
C
G
C
T
C
T/C
-
T
G
-
G
A
G
T
A
A
C
A/G
G
A
G
A
T
T
C
A/C
A
C
A
5
11
-
T
G
2
T
G/C
C
G
T/G
3
G
A
C/T
A
T
T
G
A
G
A
C
C
T
A
A
C
G
C
T
C
C
C
-
3
T
T
-
G
A
C
G
T
A
A
3
A
A
T
T
A
A
A
T
G
C/5
G/C
2
A
G
A/T
T
G
A
C
4
-
G
T
A
G
A
C
-
C
2
T
T
A/C
T
T
C/T
T
A
C
A
C
10
A
G
A
G
C
G
G
A/-
C
G
G
G
G
3
C
C
A
A/G
T
C
-
A/4
G/25
G
G
C
G
4
-
C/4
G
A
T
A
A
G
C
T
2
G
G
C
T
A
G
A/C
T
G
G/A
G/A
A
A
T
C
G
G
A
T/-
G
A
T
C
-
6
G
G
T
G
T/C
T
G
G
A
G
T
A
-
T/2
A
A
G
-
A
3
G
T
C
3
A/C
C/A
-
A
A
C
A
-
T
G
C
G
T
A
-
T
C
G
G
C/A
G/-
G
G
A
G/A
C
-
C
T
G/2
A
G
T
A
C
-
3
-
T
C
G
C
G
C
-
C
G
G/2
T
T
A
C
2
G
C
T/3
C
T
G
C
G
A
C
A/G
-
-
-
T
4/-
G
G
G/C
2
G/2
T/-
C
G
T/2
C
C
T
G
G