Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 182,906 (bp)   Positions: 392
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.05
.0
.0
.0
.0
.0
.628
.003
.868
.004
.001
.003
.948
.006
.002
.001
.802
.482
.196
.052
.002
.0
.0
.001
.001
.0
.002
.0
.0
.992
.0
.0
.0
.013
.001
.0
.0
.0
.001
.012
.007
.002
.999
.001
.001
.025
.043
.0
.001
.786
.438
.108
.058
.084
.001
.002
.067
.014
.003
.001
.287
.992
.019
.001
.02
.0
.001
.027
.0
.003
.003
.014
.001
.296
.03
.003
.001
--
--
--
.0
.009
.002
.014
.014
1.0
.219
.051
.002
.066
.306
.001
--
.988
.0
.222
.001
.045
.0
.0
.017
.225
.001
.0
.0
.02
.0
.001
.016
.039
--
--
--
.01
.047
.055
.056
.094
.001
.0
.869
.116
.119
.018
.028
.001
.0
.019
.645
.022
.014
.002
.002
.008
.0
.002
.006
.025
.02
.004
.0
.578
.041
.055
.018
.0
.076
.003
.004
.001
.015
.0
.112
.002
--
--
--
--
.0
.001
.193
.004
.005
.0
.044
.001
.001
.0
.012
.001
.003
.0
.011
.0
.001
.001
.644
.329
.0
.001
.003
.001
.0
.121
.034
.061
.02
.012
.005
.01
.001
.016
.0
.001
.332
.112
.0
.014
.077
.018
.001
.0
.001
.001
.007
.006
.435
.076
.001
.043
.003
.0
.001
.0
.018
.028
.002
.005
.001
.001
.04
.024
.473
.087
.011
.001
.001
.002
.031
.0
.0
.002
.001
.002
.053
.012
.258
.256
.253
.25
.0
--
--
--
.021
--
--
--
.002
.058
.0
.036
.043
.157
.02
.175
.004
.001
.168
.001
.0
.019
.007
.0
.011
.004
.006
.889
.561
.001
.0
.004
.0
.0
.0
.089
.037
.155
.002
.0
.001
.005
.237
.496
.999
.963
.438
.001
.0
.098
.018
.024
.001
.381
.001
.003
.0
.0
.212
.232
.002
.001
.004
.0
.0
.009
.0
.015
.001
.188
.006
--
--
.014
.001
.031
.006
.004
.631
.036
.001
.003
.058
.092
.0
.006
.0
.956
.006
--
.034
.071
.037
.014
.001
.003
--
--
.0
.0
.025
.599
.001
.001
.001
.006
.006
.001
.002
.0
.008
.005
.093
.175
.0
.014
.0
.001
.002
.001
.0
.0
.003
.21
.015
.003
.006
--
--
--
.44
.0
.788
.0
.0
.001
.001
--
.027
.012
.002
.006
.0
.001
.098
.0
.1
.016
.247
.994
.122
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atp5mgl1
Atp5mgl1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
Lingo1
T
T
T
G
T
A
G
G
G
A
G
G
G
G
T
G
C
T
G
T
C
A
T
G
A
T
G
G
G
G
T
A
G
G
T
G
T
T
A
C
G
A
G
A
G
G
C
C
G
2
T
T
C
A
C
A
G
C
C
A
G
A
C
C
C
G
A
G
C
C
T
A
G
G
C
A
A
2
A
A
T
T
G
2
G
G
A
A
T
A
G
G
G
T
C
C
G
A
G
C
G
G
G
G
A
A
C
G
4
A
G
2
C
A
A
G
G
2
T
G
A
A
G
T
C
G
G
A
T
G
G
A
C
A
G
C
A
G
G
G
C
A
2
A
A
T
C
7
A
C
A
T
A
G
T
T
G
G
A
T
T
A
C
G
A
C
A
T
G
G
G
T
C
A
A
G
G
C
T
G
C
C
A
G
T
A
A
A
G
A
G
T
A
G
3
G
C
G
C
A
A
G
C
G
C
C
T
G
T
A
T
A
T
T
A
A
T
T
T
A
T
A
G
T
C
T
A
T
T
C
T
C
T
A
G
G
C
C
C
C
G
4
C
4
T
C
A
C
C
G
A
G
8
2
T
G
G
G
2
A
12
A
A
A
C
A
C
G
C
C
C
C
T
T
A
6
C
G
A
T
A
C
6
T
A
6
C
C
C
A
C
G
G
A
4
A
C
G
C
T
A
G
T
C
A
C
T
A
G
C
2
T
A
T
T
C
T
10
C
T
A
G
T
C
A
G
G
C
C
A
A
A
T
12
T
C
C
T
G
C
G
T
T
2
C
3
2
T
2
G
T
C
A
T
A
A
G
G
2
C
A
C
T
G
T
T
T
G
C
4
6
T
C
T
T
A
G
C
T
C
G
T
G
A
C
C
A
G
G
G
G
T
  59,843,237
  59,847,065
  59,847,117
  59,847,582
  59,848,286
  59,848,591
  59,850,485
  59,850,514
  59,852,214
  59,853,063
  59,853,259
  59,854,899
  59,855,196
  59,855,676
  59,857,643
  59,864,965
  59,865,210
  59,865,301
  59,865,310
  59,866,201
  59,866,344
  59,866,570
  59,866,751
  59,867,229
  59,867,473
  59,867,779
  59,868,296
  59,868,876
  59,869,792
  59,871,317
  59,871,652
  59,871,653
  59,872,388
  59,872,597
  59,872,853
  59,874,194
  59,874,284
  59,874,373
  59,874,478
  59,874,489
  59,875,958
  59,876,209
  59,876,278
  59,876,553
  59,876,732
  59,876,936
  59,877,008
  59,877,811
  59,878,064
  59,878,529
  59,878,538
  59,878,550
  59,878,560
  59,879,510
  59,879,693
  59,880,434
  59,880,512
  59,881,011
  59,881,855
  59,882,334
  59,882,556
  59,882,602
  59,883,290
  59,883,539
  59,883,942
  59,885,265
  59,885,648
  59,885,762
  59,886,121
  59,886,517
  59,887,549
  59,887,552
  59,888,242
  59,889,159
  59,889,343
  59,889,640
  59,890,533
  59,891,047
  59,891,049
  59,891,056
  59,892,802
  59,893,104
  59,893,998
  59,894,361
  59,894,604
  59,894,822
  59,895,340
  59,896,325
  59,896,461
  59,896,532
  59,896,865
  59,897,844
  59,898,475
  59,899,068
  59,899,367
  59,899,543
  59,900,615
  59,901,104
  59,902,173
  59,902,437
  59,902,531
  59,903,009
  59,903,130
  59,903,463
  59,903,514
  59,903,653
  59,903,751
  59,903,983
  59,904,006
  59,904,144
  59,904,195
  59,904,272
  59,904,299
  59,904,309
  59,904,314
  59,904,325
  59,904,326
  59,904,332
  59,904,414
  59,904,462
  59,904,555
  59,904,770
  59,905,111
  59,905,590
  59,905,591
  59,905,717
  59,905,878
  59,906,197
  59,906,245
  59,906,341
  59,906,357
  59,906,894
  59,906,990
  59,907,393
  59,907,416
  59,908,053
  59,908,541
  59,908,819
  59,908,820
  59,909,082
  59,909,134
  59,909,362
  59,909,371
  59,909,372
  59,909,381
  59,909,568
  59,910,118
  59,910,169
  59,910,180
  59,910,183
  59,910,393
  59,910,716
  59,910,990
  59,911,034
  59,911,495
  59,911,497
  59,911,586
  59,911,679
  59,912,362
  59,912,493
  59,912,888
  59,913,277
  59,913,427
  59,913,439
  59,913,445
  59,913,592
  59,913,997
  59,914,114
  59,914,432
  59,914,451
  59,914,795
  59,915,462
  59,915,802
  59,916,289
  59,916,637
  59,916,858
  59,917,181
  59,917,258
  59,917,739
  59,919,245
  59,919,661
  59,919,912
  59,920,150
  59,920,349
  59,920,406
  59,920,426
  59,920,868
  59,922,130
  59,922,228
  59,922,291
  59,922,376
  59,923,106
  59,923,226
  59,923,341
  59,923,431
  59,923,821
  59,924,009
  59,924,204
  59,924,413
  59,924,428
  59,924,434
  59,924,435
  59,924,437
  59,924,438
  59,924,535
  59,924,563
  59,924,679
  59,924,688
  59,924,857
  59,924,977
  59,925,000
  59,925,027
  59,925,389
  59,925,514
  59,925,557
  59,926,069
  59,926,528
  59,926,603
  59,926,654
  59,926,738
  59,926,786
  59,926,807
  59,926,835
  59,927,138
  59,927,338
  59,928,068
  59,928,189
  59,928,190
  59,928,556
  59,928,629
  59,928,792
  59,928,966
  59,929,005
  59,929,128
  59,929,592
  59,930,314
  59,932,918
  59,932,922
  59,932,926
  59,932,930
  59,934,430
  59,935,484
  59,935,515
  59,935,518
  59,936,620
  59,936,882
  59,937,057
  59,937,096
  59,937,297
  59,938,913
  59,940,687
  59,942,321
  59,943,296
  59,943,302
  59,946,953
  59,947,382
  59,947,949
  59,947,953
  59,948,062
  59,951,813
  59,952,733
  59,952,943
  59,953,031
  59,954,156
  59,954,431
  59,955,129
  59,955,130
  59,955,695
  59,955,934
  59,956,539
  59,957,443
  59,959,192
  59,959,924
  59,960,028
  59,960,430
  59,960,707
  59,961,026
  59,961,185
  59,961,949
  59,962,100
  59,962,321
  59,962,567
  59,963,358
  59,963,388
  59,963,582
  59,963,695
  59,963,711
  59,963,861
  59,964,385
  59,964,848
  59,966,407
  59,966,408
  59,966,437
  59,966,518
  59,967,415
  59,969,734
  59,969,779
  59,970,385
  59,970,409
  59,970,410
  59,970,675
  59,970,973
  59,971,739
  59,972,048
  59,972,428
  59,972,454
  59,972,976
  59,973,264
  59,973,776
  59,973,963
  59,976,298
  59,977,106
  59,977,151
  59,983,213
  59,984,237
  59,984,260
  59,984,427
  59,990,156
  59,990,940
  59,991,769
  59,992,011
  59,994,015
  59,994,120
  59,994,190
  59,994,593
  59,994,655
  59,995,013
  59,995,980
  59,996,598
  59,997,169
  59,997,227
  59,997,243
  59,997,598
  59,997,821
  59,997,861
  59,997,875
  59,998,105
  59,998,114
  59,998,479
  59,998,594
  59,999,371
  59,999,425
  60,000,748
  60,000,808
  60,000,809
  60,000,817
  60,000,818
  60,000,825
  60,003,617
  60,004,617
  60,004,741
  60,005,879
  60,006,310
  60,006,481
  60,007,414
  60,008,730
  60,008,887
  60,009,196
  60,009,197
  60,009,778
  60,010,201
  60,010,668
  60,011,451
  60,013,891
  60,014,287
  60,014,868
  60,015,674
  60,015,702
  60,015,893
  60,015,951
  60,016,098
  60,017,154
  60,017,584
  60,018,174
  60,018,510
  60,018,535
  60,018,843
  60,018,916
  60,019,031
  60,020,591
  60,021,197
  60,021,320
  60,021,322
  60,021,330
  60,021,446
  60,021,661
  60,022,453
  60,023,295
  60,023,447
  60,024,223
  60,024,415
  60,024,732
C
C
C
A
C
3
G/2
A
A
G
A
A
4
T
C
A
13/9
3
A
21
T
G
T/-
A
G
A
T
A
A
A
C
G
A
-
C
A
C
C
G
T
A
G
3
T
T
A
T
T
A
2/-
3
3
C/T
2
T
G
G/-
T
T
G
A
C
T
A
T
C
T
C
T
T
C
A/-
A
A
T
G
C
-
2
G
C
C
A
-
2
A
G
7
C
9
A
A
A
G
T
T
2
4
A
A
A
A
A
A
G
C
A
A
-
G
-
-
C/A
A/C
A/3
G/C
G/A
2/-
C
A
G
G
A
2
C/-
A
A
G
G
9
G/A
G
T
T
A
T
G
A
A
A
T
G
2/-
A/-
G
C
T
-
A/G
C/T
G
C
T
A
T/A
T/A
A
A
G
C
A
G
A
2
C
?
C
2
T
A
A
C
T
G
T
C
-
T
C
A
T
T
T
A
C
G
G
C
A
G
T
C
G
A
-
A
T
A
T
G
A/2
C
C/3
A
3
T
C
T
C
G
C
G
C
C
G
C
C
C
C
T
C
G
A
C
2
C
G
C
3
T
C
3
C
G
A
A
C/T
C/T
C/T
C/T
G/A
4/-
C/G
4/-
5
T
T
T
T
3
G
A
8/-
-
C
2
G/A
G/A
2/-
G
-
G
-
G
T
A/-
-
A
-
T
T
T
A
A
G
-
A
A
G
A
G
C/T
-
G
T
-
C/T
-
T
G
-
G/-
A
3/5
-
T
T
A
C/3
-
G
A
C
2
G
T
A
G
C
T
-
T/4
A/T
C
G
T
T/3
-
2
C
G
T
G
T
T
A
A
T
A
T
G
G
C
-
T/11
C/T
A
C
A
T
A
2
A
-
C/-
-
-
C
-
A
C
T
G
C
G
T
C
G/9
2/-
T
C
T
C
A
C
C
3/5
G/C
T
-
6/-
C
T
C
C
G
A
3
C
T
C
A
T
G
A
T
7
T
3
9
C
G